┌─ Escherichia coli (50-313/323) 83972 (5) ┌┴─ Escherichia coli (50-313/323) APEC O1 (7) ┌┴─ Escherichia coli (50-313/323) ED1a (3) ┌┴─ Escherichia coli (50-313/323) F11 (2) ┌┴─ Escherichia coli (50-313/323) 2362-75 (2) ┌┴─ Escherichia coli (50-313/323) M605 (1) ┌┴┬─ Escherichia coli (50-313/323) MS 146-1 (1) ┌┤ └─ Escherichia coli (50-313/323) K12 (16) ┌┤└─ Escherichia coli (50-313/323) E110019 (1) ┌┤└─ fig|1040638.4.peg.2153 O104:H4 (50-313/323) str. LB226692 (33) │└┬─ Escherichia coli (50-313/323) B185 │ └┬─ Escherichia coli (50-313/323) H299 │ └┬─ Escherichia coli (50-313/323) MS 21-1 (1) ┌┤ └┬─ Escherichia coli (50-313/323) TA143 ││ └┬─ Escherichia coli (50-313/323) IAI39 (2) ││ └┬─ Escherichia coli (50-313/323) B354 ┌┤│ └─ Escherichia coli (50-313/323) 042 (7) ││└─ Escherichia coli (50-313/323) 1044A (25) ┌───────────────────────┤└─ Escherichia coli (50-313/323) 53638 (1) ┌───┤ └─ Escherichia coli (50-313/323) 1827-70 (4) │ └────────┬─────────────────────────────── Escherichia coli (32-312/318) TA206 │ └─────────────────── Escherichia coli (25-283/294) O157:H7 str. EC4024 │ ┌─ Escherichia coli (29-290/294) 042 (1) ┌────────────┤ ┌┴─ Escherichia coli (29-290/294) B354 (8) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (29-290/294) B185 │ │ ┌─┴┬─ Escherichia coli (29-290/294) O55:H7 str. CB9615 │ │ ┌────────────────┤ └─ Escherichia coli (29-290/294) 1044A (23) │ └────────────┤ └──── Escherichia coli (30-291/295) 101-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (27-293/302) B171 (8) │ └───────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (27-293/302) TA271 ┌─────────┤ └┬┴─ Escherichia coli (27-293/302) SE11 │ │ └┬─ Escherichia coli (27-293/302) B088 (5) │ │ └┬─ Escherichia coli (27-293/302) EC4100B (10) │ │ └┬─ Escherichia coli (27-293/302) B7A (2) │ │ └┬─ Escherichia coli (27-293/302) 53638 (1) │ │ └─ Escherichia coli (27-293/302) K12 (21) │ │ ┌─ Escherichia coli (27-288/304) APEC O1 (10) │ └──────────────────────────┤┌─ Escherichia coli (27-288/304) 536 (11) │ └┤┌─ Escherichia coli (27-288/304) 2362-75 (4) │ ││ ┌─ Escherichia coli (27-288/304) M605 │ └┤┌┴─ Escherichia coli (27-288/304) SE15 │ ││ ┌─ Escherichia coli (27-288/304) E110019 (1) │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (27-288/304) H591 (5) │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (27-288/304) K12 (18) │ │ ┌┴─ fig|1040638.4.peg.5493 O104:H4 (27-288/304) str. LB226692 (12) │ │┌┴─ Escherichia coli (27-288/304) 53638 (1) │ └┤┌─ Escherichia coli (27-288/304) IAI39 (2) │ └┤┌─ Escherichia coli (27-288/304) B185 │ ││ ┌─ Escherichia coli (27-288/304) FVEC1302 (4) │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (27-288/304) TA280 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (27-288/304) 042 (1) │ │┌┴─ Escherichia coli (27-288/304) B354 (2) │ └┤┌─ Escherichia coli (27-288/304) MS 69-1 │ └┤┌─ Escherichia coli (27-288/304) 1044A (24) │ └┤┌─ Escherichia coli (27-288/304) M718 │ └┤ ┌─ Escherichia coli (27-288/304) O111:H- str. 11128 (1) │ └┬┴─ Escherichia coli (27-288/304) B088 │ └┬─ Escherichia coli (27-288/304) 101-1 (9) │ └─ Escherichia coli (27-288/304) HS (4) │ ┌─ Escherichia coli (25-292/293) B354 │ ┌┴─ Escherichia coli (25-292/293) TA280 │ ┌┴─ Escherichia coli (25-292/293) MS 69-1 │ ┌┴─ Escherichia coli (25-292/293) TA143 │ ┌┴┬─ Escherichia coli (25-292/293) SMS-3-5 │ ┌┤ └─ Escherichia coli (25-292/293) MS 21-1 ┤ │└─ Escherichia coli (40-298/308) EC4100B │ ┌┤┌─ Escherichia coli (25-283/293) K12 (24) │ │└┤ ┌─ Escherichia coli (25-292/293) ED1a (1) │ │ └┬┴─ Escherichia coli (25-292/293) H299 (3) │ │ └┬─ Escherichia coli (25-292/293) NC101 │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (25-292/293) 536 (12) │ ││ └┬─ Escherichia coli (25-292/293) APEC O1 (6) │ ││ └─ Escherichia coli (25-292/293) 2362-75 (2) │ ┌┤└┬─ Escherichia coli (40-307/308) 042 (1) │ ││ └─ Escherichia coli (25-292/293) FVEC1302 (3) │ ┌┤└┬─ Escherichia coli (25-292/293) MS 115-1 │ ││ └─ Escherichia coli (25-283/293) ETEC H10407 │ ┌┤└┬─ fig|1040638.4.peg.3008 O104:H4 (25-283/293) str. LB226692 (3) │ ││ └─ Escherichia coli (40-298/308) B7A (10) │ │└┬─ Escherichia coli (40-298/308) B171 (15) │ │ └┬─ Escherichia coli (40-298/308) B088 │ ┌────────────────────────────────┤ └┬─ Escherichia coli (25-292/293) B185 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (25-292/293) M718 │ │ │ └─ Escherichia coli (40-307/308) 1044A (25) │ │ └─ Escherichia coli (25-283/293) O26:H11 str. 11368 │ │ ┌─ Escherichia coli (25-292/316) 536 (18) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (25-292/316) MS 185-1 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (25-292/316) M605 (1) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (25-292/316) APEC O1 (1) │ │ │└┬─ Escherichia coli (25-292/316) ATCC 8739 (1) │ │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (25-292/316) FVEC1412 (1) │ │ ││ └─ Escherichia coli (25-292/316) TA280 │ │ │└┬─ Escherichia coli (25-292/316) B185 │ │ ┌┤ └┬─ fig|6666666.5357.peg.781 TY-2482 (25-292/316) strain (2) [2] │ │ ││ └─ Escherichia coli (25-292/316) 1827-70 (5) │ │ │└┬─ Escherichia coli (25-292/316) MS 69-1 │ │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (25-292/316) 1044A (21) │ │ ││ └─ Escherichia coli (25-292/316) MS 78-1 │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (25-292/316) 042 (3) │ │ ┌──────────────────────────────┤└─ Escherichia coli (25-292/316) MS 116-1 │ │ ┌───┤ └─ Escherichia coli (25-292/316) MS 124-1 (1) └─┤ │ └─────────────────────┬─ Escherichia coli (26-293/293) B354 │ │ └┬─ Escherichia coli (26-293/293) 042 (8) │ │ └┬─ Escherichia coli WV_060327 │ │ └┬─ Escherichia coli (1-267/268) B185 │ │ └┬─ Escherichia coli (26-293/293) O111:H- str. 11128 (1) │ │ └─ Escherichia coli (26-293/293) K12 (118) │ │ ┌─ Escherichia coli (27-297/297) E2348/69 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (27-297/297) ED1a (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (27-297/297) 2362-75 (23) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (27-297/297) FVEC1302 (5) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (27-297/297) O83:H1 str. NRG 857C (1) │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (27-297/297) MS 115-1 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (27-297/297) SMS-3-5 │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (27-297/297) B354 │ │ │└┬─ Escherichia coli (27-297/297) 53638 (1) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (27-297/297) K12 (22) │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (27-297/297) EC4100B │ │ │└┬┴─ Escherichia coli (27-297/297) E110019 (1) │ │ ┌┤ └┬─ fig|1040638.4.peg.3641 O104:H4 (27-297/297) str. LB226692 (3) │ │ ││ └─ Escherichia coli (27-297/297) 042 (48) │ │ ┌┤└┬─ Escherichia coli (27-297/297) KO11 (2) └───┤ ││ └─ Escherichia coli (27-297/297) O111:H- str. 11128 (1) │ ┌──────────────────┤└─ Escherichia coli (27-297/297) E22 (4) │ ┌────────────┤ └─ Escherichia coli (27-297/297) MS 21-1 │ │ └──────────────────────────────────┬─ Escherichia coli (26-292/295) B354 │ ┌────┤ └┬─ Escherichia coli (26-292/295) TA280 │ │ │ └─ Escherichia coli (26-292/295) FVEC1302 (5) │ │ └──────────────────────────────────────┬─ Escherichia coli (31-298/305) MS 196-1 │ │ └┬─ Escherichia coli (31-298/302) 1044A (25) │ │ └┬─ Escherichia coli (31-298/302) MS 21-1 (2) │ │ └─ Escherichia coli (31-298/302) E24377A (2) │ │ ┌─ Escherichia coli (32-291/307) 042 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (33-291/307) FVEC1302 (3) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (33-291/307) TA143 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (25-283/299) B354 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (33-291/307) MS 69-1 (19) │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (33-291/307) E22 (9) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (33-291/307) MS 119-7 (4) │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (25-283/299) IAI39 (3) │ │ │└┬─ Escherichia coli (37-296/311) MS 115-1 (2) │ │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (25-283/299) B185 (2) │ │ ││ └─ Escherichia coli (25-283/299) K12 (13) │ │ ┌───────────────────────┤└─ Escherichia coli (25-283/299) TA280 └────────┤ │ └┬─ Escherichia coli (33-291/307) O157:H7 str. EC4486 (24) │ ┌───┤ └─ Escherichia coli (25-283/299) O55:H7 str. CB9615 │ │ └──────┬──────────────────────────────────── Escherichia coli (25-287/294) 83972 (19) │ │ └─────────────────────────┬─ Escherichia coli (27-294/305) O55:H7 str. CB9615 │ │ └┬─ Escherichia coli (27-294/305) E110019 (2) │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (27-294/305) M718 │ ││ └─ Escherichia coli (27-294/305) K12 (128) │ ││ ┌────────────────────────────── Escherichia coli (27-301/311) MS 119-7 │ ││ │ ┌─ Escherichia coli (27-302/311) MS 69-1 │ │└─────────┤ ┌┴─ Escherichia coli (27-302/311) 042 (1) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (27-302/311) FVEC1302 (5) │ │ └─────────────────────────────────────┤┌─ Escherichia coli (27-302/311) MS 182-1 (1) │ │ └┤┌─ fig|1040638.4.peg.2736 O104:H4 (27-302/311) str. LB226692 (28) │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (27-302/311) M718 │ │ └┬┴─ Escherichia coli (27-302/311) B185 │ │ └┬─ Escherichia coli (27-302/311) E24377A (3) │ │ └┬─ Escherichia coli (27-302/311) O157:H7 EDL933 (1) │ │ └─ Escherichia coli (27-302/311) 1044A (23) │ │ ┌─ Escherichia coli (26-287/317) MS 187-1 └──┤ ┌┴─ Escherichia coli (26-287/317) B185 (1) │ ┌┴─ Escherichia coli (26-287/317) SMS-3-5 │ ┌┴─ Escherichia coli (26-287/317) MS 115-1 │ ┌┴─ Escherichia coli (26-287/317) E24377A (2) │ ┌┴─ Escherichia coli (26-287/317) IAI1 (1) │ ┌┤┌─ Escherichia coli (26-287/317) MS 21-1 │ │└┤ ┌─ fig|6666666.5357.peg.2190 TY-2482 (26-287/317) strain (96) │ │ └┬┴─ Escherichia coli (19-280/310) B354 │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (1-247/277) 536 (1) │ ││ └─ Escherichia coli (48-308/338) B171 (4) │ ┌─────────────────────┤└─ Escherichia coli (19-280/310) K12 (7) │ │ └┬─ Escherichia coli (19-280/310) M605 │ ┌────┤ └─ Escherichia coli (26-287/317) SE15 │ │ └─────────────────────────── Escherichia coli (27-290/296) B7A (7) │ │ ┌─ Escherichia coli (27-287/308) MS 21-1 └─────┤ ┌┴─ Escherichia coli (27-287/308) SMS-3-5 │ ┌┴┬─ Escherichia coli (27-287/308) TA280 │ │ └─ Escherichia coli (27-281/308) H299 └────────────────────┤┌─ Escherichia coli (27-287/308) 042 (6) ││ ┌─ Escherichia coli (27-287/308) 83972 (7) └┤┌┴─ Escherichia coli (27-287/308) MS 69-1 ││ ┌─ Escherichia coli (27-287/308) O157:H7 EDL933 └┤ ┌┴─ Escherichia coli (27-287/308) 1125A (17) │┌┴─ Escherichia coli (27-287/308) B185 (1) └┤ ┌─ Escherichia coli (27-287/308) APEC O1 (8) │ ┌┴─ Escherichia coli (27-287/308) B354 └┬┴─ Escherichia coli (27-287/308) MS 116-1 (1) └┬─ Escherichia coli (27-287/308) MS 145-7 └┬─ Escherichia coli (27-287/308) 101-1 (12) └┬─ Escherichia coli (27-287/308) 2362-75 (2) └─ Escherichia coli (27-287/308) K12 (52)
| LysR family transcriptional regulator YfiE | (25) |
| Transcriptional regulator LysR family, yafC | (21) |
| LysR family transcriptional regulator YnfL | (20) |
| LysR family transcriptional regulator YhjC | (19) |
| LysR family transcriptional regulator YfeR | (17) |
| Alkanesulfonate utilization operon LysR-family regulator CbI | (14) |
| Cyn operon transcriptional activator | (14) |
| LysR family transcriptional regulator YbhD | (13) |
| Transcriptional activator protein LysR | (9) |
| Putative LysR-like transcriptional regulator | (8) |
| Transcriptional regulator, LysR family | (7) |
| LysR family transcriptional regulator YeiE | (6) |
| Hydrogen peroxide-inducible genes activator | (4) |
| Putative transcriptional regulator | (4) |
| Hypothetical transcriptional regulator yafC | (1) |
| LysR family regulatory protein CidR | (1) |
| transcriptional regulator, LysR family | (1) |
| putative transcriptional regulator LYSR-type | (1) |
| LysR family transcriptional regulator near succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase | (1) |
| Cys regulator cbl | (1) |
| Others | (7) |