┌─── Escherichia coli (112-246/258) SE15 ┌──┴───── Escherichia coli (293-417/439) 536 (4) ┌─────────────────────────────────┴─ Escherichia coli (225-348/372) E24377A (1) ┌─────────┴─────────────────────────────┬─ Escherichia coli (296-420/438) O103:H2 str. 12009 │ └─ Escherichia coli (296-420/438) B171 (3) │ ┌─ Escherichia coli (284-407/419) 2362-75 (2) │ ┌┴─ Escherichia coli (312-435/447) 042 (1) │ ┌┴─ Escherichia coli (284-407/419) MS 182-1 │ ┌┴─ Escherichia coli (284-402/417) 83972 (1) │ ┌┴─┬─ Escherichia coli (304-427/440) O157:H7 str. EC4501 (1) │ ┌─┤ └─ Escherichia coli (284-407/420) 1125A (2) │ ┌────────────────────┤ └── Escherichia coli (318-442/453) E2348/69 (2) │ ┌───────┤ └──────────── Escherichia coli (287-408/423) E2348/69 (1) ┤ ┌──┤ └─────────────────────── Escherichia coli (276-389/396) MS 21-1 │ │ └──────────────────────────── Escherichia coli (677-792/807) 042 (1) │ │ ┌─ Escherichia coli (272-395/405) E2348/69 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (216-339/346) MS 119-7 (1) │ │ ┌┴─ fig|6666666.5357.peg.1533 TY-2482 (272-395/405) strain │ │ ┌────────┴┬─ Escherichia coli (272-395/400) 1044A (28) │ │ ┌────────────────┤ └─ Escherichia coli (272-395/400) 83972 (14) │ │ │ └───────────────┬── Escherichia coli (225-343/345) 2362-75 (2) │ │ │ └─ Escherichia coli (225-343/343) 536 (8) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (293-422/423) B088 (13) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (107-229/240) O111:H- str. 11128 └─────┤ │ ┌┴─ Escherichia coli (293-422/423) O55:H7 str. CB9615 │ │ ┌─┴┬─ Escherichia coli (293-415/423) ETEC H10407 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (279-399/409) 101-1 (6) │ │ ┌────┤ └─ Escherichia coli (162-282/292) MS 182-1 (1) │ │ ┌───────────┤ └──── Escherichia coli (293-421/423) 042 (2) │ │ │ └────── Escherichia coli (207-343/346) FVEC1302 (3) │ │ │ ┌─── Escherichia coli (274-393/397) MS 175-1 │ │ ┌┤ ┌┴─── Escherichia coli (218-337/342) ATCC 8739 (1) │ │ ││ ┌───┴─ Escherichia coli (274-393/403) M605 │ │ │└─┤ ┌─ Escherichia coli (275-413/413) 53638 (2) │ │ ┌─────┤ └─────┬┴── Escherichia coli (275-411/414) 042 (1) │ │ │ │ └┬─ Escherichia coli (275-413/413) ED1a (3) └───────┤ │ │ └─ Escherichia coli (275-413/413) O111:H- str. 11128 │ │ └───┬── fig|6666666.5357.peg.4073 TY-2482 (274-413/413) strain (6) │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (274-413/413) K12 (7) │ ││ └┬─ Escherichia coli (274-413/413) MS 115-1 │ ││ └┬─── Escherichia coli (274-413/413) MS 146-1 │ ││ └─ Escherichia coli (274-395/396) WV_060327 │ │└──────────────────────── Escherichia coli (272-410/412) 1125A (3) │ │ ┌─ Escherichia coli (264-383/391) WV_060327 │ │ ┌─────────────────┴─ Escherichia coli (264-383/391) SE15 │ │ │ ┌── Escherichia coli (267-390/390) MS 185-1 │ │ │ ┌┴── Escherichia coli (267-386/391) ATCC 8739 (1) │ │ │ ┌┴── Escherichia coli (267-387/395) F11 (2) │ │ │ ┌┴── Escherichia coli (248-368/369) E110019 (1) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (267-386/395) O157:H7 str. EC869 (2) │ │ │ ┌──┴─ Escherichia coli (267-386/393) 042 (1) │ │ │ ┌┴─┬── Escherichia coli (299-418/439) KO11 (2) │ │ │ │ └── Escherichia coli (267-386/399) MS 145-7 │ │ │ ┌───┤ ┌─ Escherichia coli (267-399/404) B7A (1) └───┤ │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (267-386/393) 536 (1) │ │ │ └─┤ ┌─ Escherichia coli (267-386/394) TA280 │ │ │ └┬┴─ fig|1040638.4.peg.393 O104:H4 (267-386/394) str. LB226692 (13) │ │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (291-410/417) 1044A (25) │ │ ││ └┬─ Escherichia coli (267-386/396) ETEC H10407 (1) │ │ ││ └── Escherichia coli (291-424/427) 83972 (2) │ │ ┌┤└─────── Escherichia coli (283-402/407) SE15 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (280-415/415) HS (3) │ │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (267-386/394) SMS-3-5 │ │ │└┬─────┴─ Escherichia coli (267-386/396) SE11 │ │ ┌┤ └┬─── Escherichia coli (269-388/396) TA206 │ │ ││ └┬───── Escherichia coli (280-411/417) ED1a (1) │ │ ││ └┬─ Escherichia coli (267-395/404) 83972 (5) │ │ ││ └─ fig|1040638.4.peg.5408 O104:H4 (267-398/404) str. LB226692 (3) │ │ ┌─┤└──┬─── Escherichia coli (284-403/410) 1044A (25) │ │ │ │ └──── Escherichia coli (267-386/392) MS 145-7 └───┤ │ │ ┌─ Escherichia coli (34-155/163) O26:H11 str. 11368 │ │ │ ┌──────┴─ Escherichia coli (267-388/396) MS 124-1 (1) │ ┌──┤ └─┤ ┌─ Escherichia coli (267-386/396) MS 124-1 (1) │ │ │ └─┬┴─ Escherichia coli (267-386/392) MS 21-1 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (267-386/394) E24377A (2) │ │ │ └─ Escherichia coli (267-386/396) TA280 │ │ └───────────── Escherichia coli (265-386/393) ED1a (1) │ │ ┌─ Escherichia coli (297-415/428) ATCC 8739 (1) │ ┌─┤ ┌┴─ Escherichia coli (222-340/353) MS 78-1 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (299-429/431) K12 (5) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (222-352/353) MS 146-1 │ │ │ ┌─────────┴─ Escherichia coli (270-399/402) MS 187-1 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (264-390/395) HS (1) │ │ └──────┤ ┌┴─ Escherichia coli (264-390/396) B354 (1) │ │ │ ┌─────┴┬─ Escherichia coli (264-390/395) 2362-75 │ │ └───────────────┤ └── Escherichia coli (264-390/402) B7A (1) │ ┌────┤ └─────────┬──── Escherichia coli (264-402/417) E2348/69 (1) │ │ │ └─┬─ Escherichia coli (264-390/415) M605 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (264-390/416) FVEC1302 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (264-402/418) APEC O1 (3) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (264-402/418) ETEC H10407 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (264-390/416) IAI39 (2) │ │ │ └─ Escherichia coli (264-402/416) IHE3034 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (260-380/385) B088 │ │ └─────────────┤ ┌─ Escherichia coli (260-380/385) FVEC1302 (5) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (272-392/397) B354 └─┤ └┬┴─ Escherichia coli (272-392/397) H591 │ └┬─ Escherichia coli (260-380/385) MS 119-7 │ └┬─ Escherichia coli (260-380/385) IAI39 (1) │ └┬─ Escherichia coli (260-380/385) K12 (23) │ └┬─ Escherichia coli (272-392/397) O55:H7 str. CB9615 │ └─ Escherichia coli (272-392/397) 1044A (24) │ ┌───────── Escherichia coli (307-427/445) M605 │ │ ┌─── Escherichia coli (138-262/283) M718 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (278-401/421) TA280 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (278-409/420) O26:H11 str. 11368 └───────────┤ │ ┌┴── Escherichia coli (278-403/424) O157:H7 str. EC869 (2) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (278-401/422) IHE3034 (1) │ │ ┌─┴── Escherichia coli (278-403/418) EC4100B │ │┌──┴────── Escherichia coli (285-416/427) MS 116-1 (1) └──┤│ ┌─ fig|1040638.4.peg.3509 O104:H4 (278-402/420) str. LB226692 (32) ││ ┌┴─ Escherichia coli (107-231/249) M605 (2) ││ ┌┴─ Escherichia coli (278-402/420) H299 ││ ┌┴─ Escherichia coli (107-231/249) TA206 ││ ┌┴┬─ Escherichia coli (205-329/347) ETEC H10407 ││ ┌─┤ └─ Escherichia coli (278-402/420) ED1a (1) ││ ┌┤ └─ Escherichia coli (278-402/420) FVEC1302 (1) └┤ │└┬───────── Escherichia coli (301-423/443) MS 145-7 │┌──┤ └─── Escherichia coli (278-400/423) 536 (15) ││ └┬─── Escherichia coli (70-198/212) ATCC 8739 (3) ││ └────┬── Escherichia coli (278-406/420) WV_060327 ││ └─ Escherichia coli (278-400/420) TA206 ││ ┌─ Escherichia coli (281-413/424) O111:H- str. 11128 ││ ┌┴── Escherichia coli (281-413/424) ED1a (1) ││ ┌──────┴─ Escherichia coli (281-413/422) 2362-75 (2) ││┌┴─── Escherichia coli (277-401/415) MS 115-1 └┤│ ┌─ Escherichia coli (277-399/421) ED1a (6) ││ ┌┴─ Escherichia coli (252-374/396) K12 (16) ││ ┌┴─ Escherichia coli (277-401/421) 55989 (6) ││ ┌┴┬─ Escherichia coli (277-401/420) 83972 (7) ││ ┌┤ └─ Escherichia coli (277-401/420) 536 (1) ││ │└┬─ Escherichia coli (1-124/144) M605 ││ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (102-226/246) KO11 (2) ││ ││ └─ Escherichia coli (154-278/298) MS 69-1 └┤ │└─┬── Escherichia coli (278-400/417) 042 (1) │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (278-400/422) B7A (1) │ ││ └┬─ Escherichia coli (277-401/414) O103:H2 str. 12009 │ ┌┤│ └─ Escherichia coli (277-401/414) TA271 │ ││└──── Escherichia coli (277-401/417) MS 115-1 │┌┤└──┬─ Escherichia coli (45-169/188) EC4100B │││ └─ Escherichia coli (278-402/421) KO11 (3) ││└─┬── Escherichia coli (278-402/416) IAI1 (1) ││ └─ Escherichia coli (278-400/416) MS 115-1 └┤ ┌───── Escherichia coli (277-401/420) MS 107-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (277-401/421) 1044A (39) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-124/144) 2362-75 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (277-401/420) 2362-75 └─┤ ┌┴─ fig|1040638.4.peg.832 O104:H4 (277-401/420) str. LB226692 (2) │ ┌┴─ Escherichia coli (277-401/420) MS 107-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (277-401/421) 83972 (10) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (277-401/421) MS 21-1 └──┤ ┌┴─ Escherichia coli (277-401/420) ATCC 8739 (5) │┌┴┬─ Escherichia coli (277-401/420) B185 ││ └─ Escherichia coli (277-401/421) M605 └┤ ┌─ Escherichia coli (277-401/420) ED1a (5) │ ┌┴─ Escherichia coli (277-401/421) 042 (1) │┌┴─ Escherichia coli (277-401/421) ATCC 8739 (1) └┤┌─ Escherichia coli (277-401/420) IAI39 (1) └┤┌─ Escherichia coli (277-401/420) M718 (4) └┤ ┌─ Escherichia coli (106-230/249) 101-1 │┌┴─ Escherichia coli (277-401/420) MS 187-1 └┤ ┌─ Escherichia coli (277-401/421) IAI39 (1) └┬┴─ Escherichia coli (277-401/421) 536 (3) └┬─ Escherichia coli (277-401/420) NC101 └─ fig|1040638.4.peg.2500 O104:H4 (277-401/420) str. LB226692 (14)
| Integrase | (80) |
| Phage integrase, Phage P4-associated | (20) |
| Phage integrase | (18) |
| Prophage CP4-57 integrase | (9) |
| COG0582: Integrase | (5) |
| FIG016809: Prophage P4 integrase | (5) |
| putative prophage integrase | (5) |
| Putative integrase | (3) |
| prophage P4 integrase | (2) |
| putative P4-type integrase | (2) |
| integrase-like protein | (2) |
| Prophage P4 integrase | (2) |
| site-specific recombinase, phage integrase family | (1) |
| Putative prophage Sf6-like integrase | (1) |
| Phage Integrase | (1) |
| phage integrase family protein | (1) |
| putative integrase prophage protein | (1) |
| Others | (7) |