┌─ Escherichia coli (293-417/439) 536 ├─ Escherichia coli (305-429/451) F11 ┌────┼─ Escherichia coli (293-417/439) MS 200-1 │ ├─ Escherichia coli (293-417/439) F11 ┌──┤ └─ Escherichia coli (293-417/439) 536 ┌─────────────────────────────────┤ └─── Escherichia coli (112-246/258) SE15 │ └┬─ Escherichia coli (293-416/440) E24377A ┌─────────┤ └─ Escherichia coli (225-348/372) E24377A │ │ ┌─ Escherichia coli (296-420/438) O103:H2 str. 12009 │ └─────────────────────────────┤┌─ Escherichia coli (228-352/370) B171 │ └┼─ Escherichia coli (228-352/370) MS 107-1 │ ├─ Escherichia coli (296-420/438) M718 │ └─ Escherichia coli (296-420/438) B171 │ ┌─ Escherichia coli (284-407/419) 2362-75 │ ┌┼─ Escherichia coli (284-407/417) MS 21-1 │ ┌┤└─ Escherichia coli (231-354/369) MS 196-1 │ │└┬─ Escherichia coli (284-407/419) 042 │ ┌┤ └─ Escherichia coli (312-435/447) 042 │ ┌┤└─ Escherichia coli (284-407/419) MS 182-1 │ │└┬─ Escherichia coli (284-402/417) ABU 83972 │ │ └─ Escherichia coli (284-402/417) 83972 │ ┌┤ ┌─ Escherichia coli (304-427/440) O157:H7 str. EC4501 │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (304-427/440) O157:H7 str. TW14588 │ │└─┤┌─ Escherichia coli (284-407/420) O103:H2 str. 12009 │ ┌─┤ └┼─ Escherichia coli (284-407/420) O157:H7 str. EC508 │ │ │ └─ Escherichia coli (284-407/420) 1125A │ │ │ ┌─ Escherichia coli (284-408/419) O127:H6 str. E2348/69 │ ┌────────────────────┤ └─┼─ Escherichia coli (284-408/419) TA206 │ │ │ └─ Escherichia coli (318-442/453) E2348/69 │ ┌───────┤ └───────────┬─ Escherichia coli (284-405/420) O127:H6 str. E2348/69 │ │ │ └─ Escherichia coli (287-408/423) E2348/69 │ ┌──┤ └─────────────────────── Escherichia coli (276-389/396) MS 21-1 │ │ └───────────────────────────┬─ Escherichia coli (677-792/807) 042 │ │ └─ Escherichia coli (677-792/807) 042 │ │ ┌─ Escherichia coli (272-395/400) 1044A │ │ ├─ Escherichia coli (272-395/400) 1212A │ │ ├─ Escherichia coli (34-157/162) E110019 │ │ ├─ Escherichia coli (272-395/400) O111:H- str. 11128 │ │ ├─ Escherichia coli (272-395/400) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (272-395/400) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (272-395/400) O157:H7 str. EC4024 │ │ ├─ Escherichia coli (272-395/400) O157:H7 str. EC4045 │ │ ├─ Escherichia coli (272-395/400) O157:H7 str. EC4113 │ │ ├─ Escherichia coli (272-395/400) O157:H7 str. EC4196 │ │ ├─ Escherichia coli (272-395/400) O157:H7 str. EC4401 │ │ ├─ Escherichia coli (272-395/400) O157:H7 str. EC4501 ┤ │ ├─ Escherichia coli (272-395/400) O157:H7 str. EC869 │ │ ├─ Escherichia coli (272-395/400) O157:H7 str. Sakai │ │ ┌┼─ Escherichia coli (272-395/400) O26:H11 str. 11368 │ │ │├─ Escherichia coli (272-395/400) O157:H7 str. TW14359 │ │ │├─ Escherichia coli (272-395/400) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │├─ Escherichia coli (272-395/400) O157:H7 str. EC508 │ │ │├─ Escherichia coli (272-395/400) O157:H7 str. EC4486 │ │ │├─ Escherichia coli (272-395/400) O157:H7 str. EC4206 │ │ │├─ Escherichia coli (272-395/400) O157:H7 str. EC4115 │ │ │├─ Escherichia coli (272-395/400) O157:H7 str. EC4076 │ │ │├─ Escherichia coli (272-395/400) O157:H7 str. EC4042 │ │ │├─ Escherichia coli (272-395/400) O157:H7 EDL933 │ │ │├─ Escherichia coli (272-395/400) O157:H7 EDL933 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (272-395/400) O157:H7 │ │ ││├─ Escherichia coli (1-124/129) E110019 │ │ ││├─ Escherichia coli (272-395/400) 536A │ │ ││└─ Escherichia coli (272-395/400) 1125A │ │ ││┌─ Escherichia coli (272-395/400) ABU 83972 │ │ ││├─ Escherichia coli (272-395/400) CFT073 │ │ ││├─ Escherichia coli (272-395/400) MS 116-1 │ │ ││├─ Escherichia coli (272-395/400) MS 45-1 │ │ ││├─ Escherichia coli (272-395/400) O157:H7 str. EC869 │ │ ││├─ Escherichia coli (272-395/400) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ ┌────────┤│├─ Escherichia coli (272-395/400) UTI89 │ │ │ │└┼─ Escherichia coli (272-395/400) UTI89 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (272-395/400) UM146 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (272-395/400) O157:H7 str. EC869 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (272-395/400) NC101 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (272-395/400) MS 200-1 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (272-395/400) IHE3034 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (272-395/400) CFT073 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (272-395/400) 83972 │ │ ┌────────────────┤ │┌─ fig|6666666.5357.peg.1533 TY-2482 (272-395/405) strain │ │ │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (216-339/346) MS 119-7 │ │ │ │ └┬┴─ Escherichia coli (272-395/402) SMS-3-5 │ │ │ │ └┬─ Escherichia coli (272-395/405) O127:H6 str. E2348/69 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (272-395/405) E2348/69 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (225-343/345) 2362-75 │ │ │ │ ┌─┼─ Escherichia coli (305-423/425) O127:H6 str. E2348/69 │ │ │ │ │ └─ Escherichia coli (305-423/425) E2348/69 └─────┤ │ │ │┌─ Escherichia coli (225-343/343) 536 │ │ └───────────────┤├─ Escherichia coli (225-343/343) CFT073 │ │ │├─ Escherichia coli (288-406/406) F11 │ │ │├─ Escherichia coli (288-406/406) MS 45-1 │ │ └┼─ Escherichia coli (225-343/343) NC101 │ │ ├─ Escherichia coli (288-406/406) MS 200-1 │ │ ├─ Escherichia coli (288-406/406) F11 │ │ ├─ Escherichia coli (288-406/406) CFT073 │ │ └─ Escherichia coli (225-343/343) 536 │ │ ┌─ Escherichia coli (293-422/423) B088 │ │ ├─ Escherichia coli (293-422/423) B171 │ │ ├─ Escherichia coli (293-422/423) B7A │ │ ├─ Escherichia coli (293-422/423) E22 │ │ ├─ Escherichia coli (293-422/423) MS 145-7 │ │ ├─ Escherichia coli (293-422/423) O26:H11 str. 11368 │ │ ├─ Escherichia coli (293-422/423) W │ │ ┌┼─ Escherichia coli (293-422/423) W │ │ │├─ Escherichia coli (293-422/423) SE11 │ │ │├─ Escherichia coli (293-422/423) O103:H2 str. 12009 │ │ │├─ Escherichia coli (293-422/423) KO11 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (293-422/423) E22 │ │ ││├─ Escherichia coli (293-422/423) B7A │ │ ┌┤│└─ Escherichia coli (293-422/423) B171 │ │ ││└─ Escherichia coli (107-229/240) O111:H- str. 11128 │ │ │└─ Escherichia coli (293-422/423) O55:H7 str. CB9615 │ │ ┌─┤┌─ Escherichia coli (293-415/423) ETEC H10407 │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (162-282/292) MS 182-1 │ │ │ └┤┌┴─ Escherichia coli (279-399/409) MS 78-1 │ │ │ ││┌─ Escherichia coli (279-399/409) B str. REL606 │ │ │ └┤├─ Escherichia coli (DE3 279-399/409) BL21(DE3) │ │ │ │├─ Escherichia coli (306-426/436) E24377A │ │ ┌────┤ └┼─ Escherichia coli (306-426/436) OP50 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (279-399/409) E24377A │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (279-399/409) BL21 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (279-399/409) 101-1 │ │ ┌───────────┤ │ ┌─ Escherichia coli (293-421/423) 042 │ │ │ │ └───┼─ Escherichia coli (293-421/423) MS 21-1 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (293-421/423) 042 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (207-343/346) FVEC1412 │ │ │ └─────┼─ Escherichia coli (207-343/346) UMN026 │ │ │ ├─ Escherichia coli (207-343/346) MS 198-1 │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (207-343/346) FVEC1302 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (218-337/342) ATCC 8739 │ │ ││ ┌──┴─ Escherichia coli (274-393/398) ATCC 8739 │ │ ││ ┌┴─── Escherichia coli (274-393/397) MS 175-1 │ │ ││ ┌───┴─ Escherichia coli (274-393/403) M605 │ │ ││ │ ┌─ Escherichia coli (275-413/413) 53638 │ │ │└─┤ ┌┼─ Escherichia coli (275-413/413) B185 │ │ │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (275-413/413) 53638 │ │ │ │ │└─┬─ Escherichia coli (275-411/414) 042 │ │ │ └─────┤ └─ Escherichia coli (275-411/414) 042 │ │ │ │┌─ Escherichia coli (275-413/413) O111:H- str. 11128 │ │ ┌─────┤ └┤┌─ Escherichia coli (275-413/413) ED1a │ │ │ │ └┼─ Escherichia coli (275-413/413) O26:H11 str. 11368 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (275-413/413) MS 21-1 └───────┤ │ │ └─ Escherichia coli (275-413/413) ED1a │ │ │ ┌─ fig|6666666.5357.peg.4073 TY-2482 (274-413/413) strain │ │ │ ├─ Escherichia coli (274-413/413) 55989 │ │ │ ├─ Escherichia coli (274-413/413) MS 119-7 │ │ │ ┌─┼─ fig|1040638.4.peg.3049 O104:H4 str. LB226692 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (274-413/413) TA271 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (274-413/413) H591 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (274-413/413) 55989 │ │ └───┤ ┌─ Escherichia coli (274-395/396) WV_060327 │ ┌┤ │ ┌┴─── Escherichia coli (274-413/413) MS 146-1 │ ││ │┌┴─ Escherichia coli (274-413/413) MS 115-1 │ ││ ││┌─ Escherichia coli (274-413/413) DH1 │ ││ └┤├─ Escherichia coli (274-413/413) W3110 │ ││ │├─ Escherichia coli (274-413/413) str. K-12 substr. DH10B │ ││ └┼─ Escherichia coli (274-413/413) str. K-12 substr. MG1655 │ ││ ├─ Escherichia coli (274-413/413) str. K-12 substr. MG1655 │ ││ ├─ Escherichia coli (274-413/413) str. K-12 substr. DH10B │ ││ ├─ Escherichia coli (274-413/413) K12 │ ││ └─ Escherichia coli (274-413/413) BW2952 │ ││ ┌─ Escherichia coli (272-410/412) O157:H7 str. EC4024 │ │└───────────────────────┼─ Escherichia coli (272-410/412) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (272-410/412) O157:H7 str. EC4401 │ │ └─ Escherichia coli (272-410/412) 1125A │ │ ┌─ Escherichia coli (264-383/391) WV_060327 │ │ ┌─────────────────┴─ Escherichia coli (264-383/391) SE15 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (291-410/417) 1044A │ │ │ ├─ Escherichia coli (267-386/393) 1212A │ │ │ ├─ Escherichia coli (267-386/393) O157:H7 │ │ │ ├─ Escherichia coli (291-410/417) O157:H7 EDL933 │ │ │ ├─ Escherichia coli (291-410/417) O157:H7 str. EC4042 │ │ │ ├─ Escherichia coli (291-410/417) O157:H7 str. EC4076 │ │ │ ├─ Escherichia coli (291-410/417) O157:H7 str. EC4115 │ │ │ ├─ Escherichia coli (291-410/417) O157:H7 str. EC4206 │ │ │ ├─ Escherichia coli (267-386/393) O157:H7 str. EC4486 │ │ │ ├─ Escherichia coli (291-410/417) O157:H7 str. EC508 │ │ │ ├─ Escherichia coli (267-386/393) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ │ ├─ Escherichia coli (291-410/417) O157:H7 str. Sakai │ │ │ ├─ Escherichia coli (291-410/417) O157:H7 str. TW14588 │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli (267-386/393) O55:H7 str. CB9615 │ │ │ │├─ Escherichia coli (291-410/417) O157:H7 str. TW14359 │ │ │ │├─ Escherichia coli (267-386/393) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │ │├─ Escherichia coli (291-410/417) O157:H7 str. EC869 │ │ │ │├─ Escherichia coli (291-410/417) O157:H7 str. EC4501 │ │ │ │├─ Escherichia coli (291-410/417) O157:H7 str. EC4401 │ │ │ │├─ Escherichia coli (291-410/417) O157:H7 str. EC4196 │ │ │ │├─ Escherichia coli (291-410/417) O157:H7 str. EC4113 │ │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (291-410/417) O157:H7 str. EC4045 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (291-410/417) O157:H7 str. EC4024 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (267-386/393) O157:H7 EDL933 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (291-410/417) 536A │ │ │ ││└─ Escherichia coli (291-410/417) 1125A │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (267-386/396) ETEC H10407 │ │ │ ││┌┴─ Escherichia coli (267-386/396) H299 │ │ │ ┌┤└┤ ┌─ Escherichia coli (291-424/427) ABU 83972 │ │ │ ││ └─┼─ Escherichia coli (267-400/403) MS 45-1 │ │ │ ││ └─ Escherichia coli (291-424/427) 83972 │ │ │ ││┌─ Escherichia coli (267-386/394) TA280 │ │ │ │││┌─ fig|6666666.5357.peg.4635 TY-2482 (242-361/369) strain │ │ │ │││├─ Escherichia coli (267-386/394) B str. REL606 │ │ │ │└┤├─ Escherichia coli (DE3 267-386/394) BL21(DE3) │ │ │ │ │├─ Escherichia coli (267-386/394) CFT073 │ │ │ │ │├─ Escherichia coli (267-386/394) IAI39 │ │ │ │ │├─ Escherichia coli (267-386/394) MS 182-1 └───┤ │ ┌─┤ └┼─ Escherichia coli (267-386/394) OP50 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (267-386/394) MS 187-1 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (267-386/394) M718 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (267-386/394) IAI39 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (267-386/394) CFT073 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (267-386/394) BL21 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (267-386/394) 101-1 │ │ │ │ └─ fig|1040638.4.peg.393 O104:H4 (267-386/394) str. LB226692 │ │ ┌───┤ │ ┌─ Escherichia coli (267-386/393) 536 │ │ │ │ └┬┴─ Escherichia coli (267-386/393) 536 │ │ │ │ └┬─ Escherichia coli (291-423/428) B7A │ │ │ │ └─ Escherichia coli (267-399/404) B7A │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (299-418/439) KO11 │ │ │ │ ┌─┼─ Escherichia coli (299-418/439) W │ │ │ │┌─┤ └─ Escherichia coli (267-386/407) W │ │ │ ││ └── Escherichia coli (267-386/399) MS 145-7 │ │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (267-386/393) 042 │ │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (267-386/393) 042 │ │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (267-386/395) O157:H7 str. EC869 │ │ ┌┤ └──┤┌┼─ Escherichia coli (267-386/395) O157:H7 str. FRIK966 │ │ ││ ││└─ Escherichia coli (267-386/395) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ ││ └┤ ┌─ Escherichia coli (248-368/369) E110019 │ │ ││ │┌─┴─ Escherichia coli (217-337/338) E110019 │ │ ││ ││ ┌─ Escherichia coli (267-386/391) ATCC 8739 │ │ ││ └┤ ┌─┴─ Escherichia coli (267-386/391) ATCC 8739 │ │ ││ │┌┴── Escherichia coli (267-390/390) MS 185-1 │ │ ││ └┤ ┌─ Escherichia coli (267-387/395) F11 │ │ ││ └─┼─ Escherichia coli (101-221/229) MS 200-1 │ │ ┌┤│ └─ Escherichia coli (267-387/395) F11 │ │ ││└─────── Escherichia coli (283-402/407) SE15 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (280-415/415) HS │ │ ││ ├─ Escherichia coli (9-144/144) MS 116-1 │ │ ││ ┌┼─ Escherichia coli MS 196-1 │ │ ││ ┌┤└─ Escherichia coli (267-402/402) HS │ │ ││┌─────┤└─ Escherichia coli (267-386/394) SMS-3-5 │ │ │││ └─ Escherichia coli (267-386/396) SE11 │ │ │└┤┌─── Escherichia coli (269-388/396) TA206 │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (280-411/417) ED1a │ │ │ └┤┌────┴─ Escherichia coli (280-411/417) ED1a │ │ │ ││ ┌─ fig|1040638.4.peg.5408 O104:H4 (267-398/404) str. LB226692 │ │ │ └┤ ├─ Escherichia coli (267-398/404) 55989 │ │ │ │┌┼─ Escherichia coli (267-398/404) 55989 │ │ ┌┤ ││└─ fig|6666666.5357.peg.3044 TY-2482 (267-398/404) strain │ │ ││ └┤┌─ Escherichia coli (267-395/404) ABU 83972 │ │ ││ │├─ Escherichia coli (267-395/404) MS 124-1 │ │ ││ └┼─ Escherichia coli (267-395/404) NC101 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (267-395/404) MS 84-1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (267-395/404) ETEC H10407 │ │ ││ └─ Escherichia coli (267-395/404) 83972 │ │ ││ ┌──── Escherichia coli (267-386/392) MS 145-7 │ │ ││ │ ┌─ Escherichia coli (284-403/410) 1125A │ │ ││ │ ├─ Escherichia coli (284-403/410) 536A │ │ ││ │ ├─ Escherichia coli (284-403/410) O157:H7 EDL933 │ │ ││ │ ├─ Escherichia coli (267-386/393) O157:H7 str. EC4024 │ │ ││ │ ├─ Escherichia coli (94-213/220) O157:H7 str. EC4045 └───┤ │└──┤ ├─ Escherichia coli (94-213/220) O157:H7 str. EC4113 │ │ │ ├─ Escherichia coli (94-213/220) O157:H7 str. EC4196 │ │ │ ├─ Escherichia coli (94-213/220) O157:H7 str. EC4401 │ │ │ ├─ Escherichia coli (267-386/393) O157:H7 str. EC4501 │ │ │ ├─ Escherichia coli (267-386/393) O157:H7 str. EC869 │ │ │ ├─ Escherichia coli (267-386/393) O157:H7 str. FRIK966 │ ┌─┤ │ ├─ Escherichia coli (94-213/220) O157:H7 str. TW14359 │ │ │ └──┼─ Escherichia coli (284-403/410) O55:H7 str. CB9615 │ │ │ ├─ Escherichia coli (267-386/393) O157:H7 str. TW14588 │ │ │ ├─ Escherichia coli (267-386/393) O157:H7 str. Sakai │ │ │ ├─ Escherichia coli (284-403/410) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ │ ├─ Escherichia coli (284-403/410) O157:H7 str. EC508 │ │ │ ├─ Escherichia coli (94-213/220) O157:H7 str. EC4486 │ │ │ ├─ Escherichia coli (94-213/220) O157:H7 str. EC4206 │ │ │ ├─ Escherichia coli (284-403/410) O157:H7 str. EC4115 │ │ │ ├─ Escherichia coli (94-213/220) O157:H7 str. EC4076 │ │ │ ├─ Escherichia coli (94-213/220) O157:H7 str. EC4042 │ │ │ ├─ Escherichia coli (267-386/393) O157:H7 EDL933 │ │ │ ├─ Escherichia coli (267-386/393) O157:H7 │ ┌──┤ │ ├─ Escherichia coli (284-403/410) 1212A │ │ │ │ └─ Escherichia coli (284-403/410) 1044A │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (267-388/396) MS 124-1 │ │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (267-388/396) MS 84-1 │ │ │ │ ┌──────┴─ Escherichia coli (34-155/163) O26:H11 str. 11368 │ │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (267-386/396) MS 124-1 │ │ │ └─┤ ┌┴─ Escherichia coli (267-386/396) MS 84-1 │ │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (267-386/392) MS 21-1 │ │ │ └─┤┌─ Escherichia coli (267-386/396) TA280 │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (277-396/404) E24377A │ │ │ └┼─ Escherichia coli (267-386/394) SMS-3-5 │ │ │ └─ Escherichia coli (267-386/394) E24377A │ │ └────────────┬─ Escherichia coli (265-386/393) ED1a │ │ └─ Escherichia coli (265-386/393) ED1a │ ┌─┤ ┌─ Escherichia coli (299-429/431) BW2952 │ │ │ ├─ Escherichia coli (299-429/431) str. K-12 substr. DH10B │ │ │ ├─ Escherichia coli (299-429/431) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli (299-429/431) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │ │├─ Escherichia coli (299-429/431) str. K-12 substr. DH10B │ │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (299-429/431) K12 │ │ │ │└┬─ Escherichia coli (222-340/353) MS 78-1 │ │ │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (297-415/428) ATCC 8739 │ │ │ ││ └─ Escherichia coli (297-415/428) ATCC 8739 │ │ │ ┌─────────┤└─ Escherichia coli (222-352/353) MS 146-1 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (270-399/402) MS 187-1 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (264-390/395) HS │ │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (264-390/395) HS │ │ └──────┤ ┌┴┬─ Escherichia coli (264-390/396) MS 115-1 │ │ │ ┌─────┤ └─ Escherichia coli (264-390/396) B354 │ │ │ │ └┬─ Escherichia coli (264-390/395) 2362-75 │ │ │ │ └─┬─ Escherichia coli (264-390/402) B7A │ │ └───────────────┤ └─ Escherichia coli (264-390/402) B7A │ ┌────┤ │ ┌─ Escherichia coli (264-402/417) E2348/69 │ │ │ │ ┌───┴─ Escherichia coli (264-402/417) O127:H6 str. E2348/69 │ │ │ └─────────┤ ┌─ Escherichia coli (264-390/415) M605 │ │ │ └─┤┌─ Escherichia coli (264-390/416) FVEC1302 │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (264-402/418) APEC O1 │ │ │ └┤ ├─ Escherichia coli (236-374/390) MS 185-1 │ │ │ │┌┼─ Escherichia coli (264-402/416) MS 198-1 │ │ │ └┤└─ Escherichia coli (264-402/418) APEC O1 │ │ │ │┌─ Escherichia coli (264-402/418) ETEC H10407 │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (264-402/416) IHE3034 │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (264-390/416) IAI39 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (264-390/418) MS 196-1 │ │ │ └─ Escherichia coli (264-390/416) IAI39 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (260-380/385) B088 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (260-380/385) FVEC1302 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (260-380/385) MS 198-1 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (260-380/385) W │ │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli (260-380/385) W │ │ └─────────────┤ │├─ Escherichia coli (272-392/397) TA143 │ │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (260-380/385) KO11 │ │ │┌┤└─ Escherichia coli (272-392/397) B354 │ │ ││└─ Escherichia coli (272-392/397) H591 │ │ ││┌─ Escherichia coli (260-380/385) MS 119-7 │ │ │││ ┌─ Escherichia coli (260-380/385) IAI39 │ │ └┤│┌┴─ Escherichia coli (260-380/385) IAI39 │ │ │││ ┌─ fig|6666666.5357.peg.3503 TY-2482 (260-380/385) strain │ │ │││ ├─ Escherichia coli (260-380/385) 55989 │ │ │││ ├─ Escherichia coli (260-380/385) APEC O1 │ │ └┤│ ├─ Escherichia coli (272-392/397) B7A │ │ ││ ├─ Escherichia coli (272-392/397) DH1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (272-392/397) IHE3034 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (260-380/385) O127:H6 str. E2348/69 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (272-392/397) S88 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (260-380/385) UM146 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (272-392/397) UTI89 │ │ └┤ ├─ Escherichia coli (260-380/385) str. K-12 substr. DH10B │ │ │ ├─ Escherichia coli (272-392/397) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │┌┼─ Escherichia coli (272-392/397) str. K-12 substr. MG1655 │ │ ││├─ Escherichia coli (272-392/397) str. K-12 substr. DH10B │ │ ││├─ Escherichia coli (260-380/385) W3110 │ │ ││├─ Escherichia coli (272-392/397) UTI89 │ │ ││├─ Escherichia coli (260-380/385) TA271 │ │ ││├─ Escherichia coli (260-380/385) O26:H11 str. 11368 └─┤ ││├─ Escherichia coli (260-380/385) K12 │ ││├─ Escherichia coli (260-380/385) E2348/69 │ ││├─ Escherichia coli (272-392/397) BW2952 │ └┤├─ Escherichia coli (260-380/385) B7A │ │├─ Escherichia coli (260-380/385) APEC O1 │ │└─ Escherichia coli (260-380/385) 55989 │ │┌─ Escherichia coli (272-392/397) O55:H7 str. CB9615 │ ││┌─ Escherichia coli (260-380/385) 1125A │ ││├─ Escherichia coli (260-380/385) 536A │ ││├─ Escherichia coli (272-392/397) O157:H7 EDL933 │ ││├─ Escherichia coli (260-380/385) O157:H7 str. EC4024 │ ││├─ Escherichia coli (272-392/397) O157:H7 str. EC4045 │ └┤├─ Escherichia coli (272-392/397) O157:H7 str. EC4113 │ │├─ Escherichia coli (260-380/385) O157:H7 str. EC4196 │ │├─ Escherichia coli (260-380/385) O157:H7 str. EC4401 │ │├─ Escherichia coli (260-380/385) O157:H7 str. EC4501 │ │├─ Escherichia coli (272-392/397) O157:H7 str. EC869 │ │├─ Escherichia coli (260-380/385) O157:H7 str. FRIK966 │ │├─ Escherichia coli (260-380/385) O157:H7 str. TW14359 │ └┼─ Escherichia coli (260-380/385) O157:H7 str. TW14588 │ ├─ Escherichia coli (272-392/397) O157:H7 str. Sakai │ ├─ Escherichia coli (260-380/385) O157:H7 str. FRIK2000 │ ├─ Escherichia coli (260-380/385) O157:H7 str. EC508 │ ├─ Escherichia coli (260-380/385) O157:H7 str. EC4486 │ ├─ Escherichia coli (260-380/385) O157:H7 str. EC4206 │ ├─ Escherichia coli (260-380/385) O157:H7 str. EC4115 │ ├─ Escherichia coli (272-392/397) O157:H7 str. EC4076 │ ├─ Escherichia coli (260-380/385) O157:H7 str. EC4042 │ ├─ Escherichia coli (272-392/397) O157:H7 EDL933 │ ├─ Escherichia coli (260-380/385) O157:H7 │ ├─ Escherichia coli (272-392/397) 1212A │ └─ Escherichia coli (272-392/397) 1044A │ ┌───────── Escherichia coli (307-427/445) M605 │ │ ┌─── Escherichia coli (138-262/283) M718 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (278-403/424) O157:H7 str. EC869 │ │ │ ┌─┼─ Escherichia coli (278-403/424) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (278-403/424) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ │ │└┬─ Escherichia coli (278-409/420) O26:H11 str. 11368 │ │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (278-401/421) TA280 │ │ │ │└┬─ Escherichia coli (278-401/422) WV_060327 │ │ │ ┌─┤ └─ Escherichia coli (278-401/422) IHE3034 │ │ │┌──┤ └── Escherichia coli (278-403/418) EC4100B │ │ ││ └─────┬─ Escherichia coli (285-416/427) MS 175-1 │ │ ││ └─ Escherichia coli (285-416/427) MS 116-1 └───────────┤ ││ ┌─ fig|1040638.4.peg.3509 O104:H4 (278-402/420) str. LB226692 │ ││ ├─ Escherichia coli (205-329/347) 042 │ ││ ├─ Escherichia coli (205-329/347) 536 │ ││ ├─ Escherichia coli (278-402/420) 53638 │ ││ ├─ Escherichia coli (278-402/420) 55989 │ ││ ├─ Escherichia coli (205-329/347) 83972 │ ││ ├─ Escherichia coli (205-329/347) CFT073 │ ││ ├─ Escherichia coli (278-402/420) E110019 │ ││ ├─ Escherichia coli (205-329/347) F11 │ ││ ├─ Escherichia coli (278-402/420) IAI39 │ ││ ├─ Escherichia coli (278-402/420) MS 124-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (205-329/347) MS 182-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (205-329/347) MS 196-1 └──┤│ ├─ Escherichia coli (205-329/347) MS 200-1 ││ ├─ Escherichia coli (205-329/347) MS 69-1 ││ ├─ Escherichia coli (205-329/347) NC101 ││ ┌┼─ Escherichia coli (278-402/420) O83:H1 str. NRG 857C ││ │├─ Escherichia coli (107-231/249) O26:H11 str. 11368 ││ │├─ Escherichia coli (278-402/420) MS 84-1 ││ │├─ Escherichia coli (46-170/188) MS 45-1 ││ │├─ Escherichia coli (278-402/420) MS 198-1 ││ │├─ Escherichia coli (205-329/347) MS 185-1 ││ │├─ Escherichia coli (107-231/249) MS 175-1 ││ │├─ Escherichia coli (278-402/420) IAI39 ││ │├─ Escherichia coli (205-329/347) F11 ││ ┌┤├─ Escherichia coli (278-402/420) E110019 ││ ││├─ Escherichia coli (205-329/347) CFT073 ││ ││├─ Escherichia coli (205-329/347) ABU 83972 ││ ││├─ Escherichia coli (278-402/420) 55989 ││ ││├─ Escherichia coli (278-402/420) 53638 ││ ││├─ Escherichia coli (205-329/347) 536 ││ ┌┤│├─ Escherichia coli (205-329/347) 042 ││ │││└─ fig|6666666.5357.peg.3288 TY-2482 (204-328/346) strain ││ │││┌─ Escherichia coli (178-302/320) MS 21-1 ││ ┌┤│└┼─ Escherichia coli (178-302/320) SE15 ││ │││ └─ Escherichia coli (107-231/249) M605 ││ ┌┤│└─ Escherichia coli (278-402/420) H299 ││ ││└─ Escherichia coli (107-231/249) TA206 └┤ │└┬─ Escherichia coli (205-329/347) ETEC H10407 │ ┌─┤ └┬─ Escherichia coli (278-402/420) ED1a │ │ │ └─ Escherichia coli (278-402/420) ED1a │ │ └┬─ Escherichia coli (278-402/420) UMN026 │ │ └─ Escherichia coli (278-402/420) FVEC1302 │ ┌┤┌───────── Escherichia coli (301-423/443) MS 145-7 │ │││ ┌─ Escherichia coli (278-400/423) 536 │ │││ ├─ Escherichia coli (278-400/423) ABU 83972 │ │││ ├─ Escherichia coli (278-400/423) CFT073 │ │└┤ ├─ Escherichia coli (205-327/350) F11 │ │ │ ├─ Escherichia coli (278-400/423) MS 185-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (278-400/423) MS 45-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (278-400/423) UM146 │ │ └──┼─ Escherichia coli (278-400/423) UTI89 │ │ ├─ Escherichia coli (278-400/423) UTI89 │┌──┤ ├─ Escherichia coli (278-400/423) NC101 ││ │ ├─ Escherichia coli (278-400/423) MS 200-1 ││ │ ├─ Escherichia coli (278-400/423) IHE3034 ││ │ ├─ Escherichia coli (205-327/350) F11 ││ │ ├─ Escherichia coli (278-400/423) CFT073 ││ │ ├─ Escherichia coli (278-400/423) 83972 ││ │ └─ Escherichia coli (278-400/423) 536 ││ │ ┌─ Escherichia coli (278-400/420) TA206 ││ │┌────┴── Escherichia coli (278-406/420) WV_060327 ││ └┤ ┌─ Escherichia coli (70-198/212) ATCC 8739 ││ └──┼─ Escherichia coli (70-198/212) ATCC 8739 ││ ├─ Escherichia coli (70-198/212) ATCC 8739 ││ └─ Escherichia coli (70-198/212) ATCC 8739 ││ ┌─ Escherichia coli (281-413/422) 2362-75 ││ ┌┼─ Escherichia coli (281-413/422) O127:H6 str. E2348/69 ││ ┌──────┤└─ Escherichia coli (303-435/444) E2348/69 ││ │ └┬─ Escherichia coli (281-413/424) O111:H- str. 11128 ││┌┤ └─┬─ Escherichia coli (281-413/424) ED1a ││││ └─ Escherichia coli (281-413/424) ED1a │││└─── Escherichia coli (277-401/415) MS 115-1 │││ ┌─ Escherichia coli (252-374/396) 2362-75 │││ ├─ Escherichia coli (252-374/396) BL21 │││ ├─ Escherichia coli (252-374/396) BW2952 │││ ├─ Escherichia coli (252-374/396) FVEC1302 │││ ├─ Escherichia coli (252-374/396) K12 │││ ├─ Escherichia coli (252-374/396) MS 198-1 │││ ├─ Escherichia coli (252-374/396) W3110 └┤│ ├─ Escherichia coli (252-374/396) str. K-12 substr. DH10B ││ ┌┼─ Escherichia coli (252-374/396) str. K-12 substr. MG1655 ││ │├─ Escherichia coli (252-374/396) str. K-12 substr. MG1655 ││ │├─ Escherichia coli (228-350/372) str. K-12 substr. DH10B ││ │├─ Escherichia coli (252-374/396) UMN026 ││ │├─ Escherichia coli (252-374/396) MS 196-1 ││ │├─ Escherichia coli (252-374/396) FVEC1412 ││ ┌┤├─ Escherichia coli (252-374/396) DH1 ││ ││├─ Escherichia coli (DE3 252-374/396) BL21(DE3) ││ ││└─ Escherichia coli (252-374/396) B str. REL606 ││ ││┌─ Escherichia coli (277-399/421) ED1a ││ ││├─ Escherichia coli (277-399/413) H736 ││ ││├─ Escherichia coli (277-399/421) IAI39 ││ │└┼─ Escherichia coli (277-399/421) MS 145-7 ││ ┌┤ ├─ Escherichia coli (277-399/421) IAI39 ││ ││ ├─ Escherichia coli (277-399/421) ETEC H10407 ││ ││ └─ Escherichia coli (277-399/421) ED1a ││ ││┌─ Escherichia coli (277-401/421) 55989 ││ ││├─ Escherichia coli (277-401/421) MS 124-1 ││ ││├─ Escherichia coli (277-401/421) MS 84-1 ││ │└┼─ Escherichia coli (277-401/421) SMS-3-5 ││ ┌┤ ├─ Escherichia coli (277-401/421) MS 45-1 ││ ││ ├─ Escherichia coli (277-401/421) M718 ││ ││ └─ Escherichia coli (277-401/421) 55989 ││ ││ ┌─ Escherichia coli (277-401/420) 536 ││ ││┌┴─ Escherichia coli (277-401/420) 536 ││ │││┌─ Escherichia coli (277-401/420) ABU 83972 └┤ │└┤├─ Escherichia coli (277-401/420) F11 │ ┌┤ │├─ Escherichia coli (277-401/420) UM146 │ ││ └┼─ Escherichia coli (277-401/420) UTI89 │ ││ ├─ Escherichia coli (277-401/420) UTI89 │ ││ ├─ Escherichia coli (277-401/420) MS 200-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (252-376/395) F11 │ ││ └─ Escherichia coli (277-401/420) 83972 │ ││┌─ Escherichia coli (1-124/144) M605 │ ┌┤└┤┌─ Escherichia coli (154-278/298) MS 69-1 │ ││ └┤┌─ Escherichia coli (278-402/422) W │ ││ └┼─ Escherichia coli (278-402/422) W │ ││ └─ Escherichia coli (102-226/246) KO11 │ ││ ┌─ Escherichia coli (278-400/417) 042 │ ┌┤│ ┌─┴─ Escherichia coli (278-400/417) 042 │ ││└─┤ ┌─ Escherichia coli (277-401/414) TA271 │ ││ └┬┴─ Escherichia coli (277-401/414) O103:H2 str. 12009 │ ││ └┬─ Escherichia coli (278-400/422) B7A │ ┌┤│ └─ Escherichia coli (278-400/422) B7A │ ││└──── Escherichia coli (277-401/417) MS 115-1 │ ││ ┌─ Escherichia coli (45-169/188) EC4100B │ │└──┤┌─ Escherichia coli (205-329/348) MS 107-1 │┌┤ └┼─ Escherichia coli (278-402/421) W │││ ├─ Escherichia coli (278-402/421) W │││ └─ Escherichia coli (278-402/421) KO11 ││└─┬─ Escherichia coli (278-400/416) MS 115-1 ││ └─┬─ Escherichia coli (278-402/416) IAI1 ││ └─ Escherichia coli (278-402/416) IAI1 ││ ┌───── Escherichia coli (277-401/420) MS 107-1 ││ │ ┌─ Escherichia coli (277-401/421) 1044A ││ │ ├─ Escherichia coli (277-401/421) 1212A ││ │ ├─ Escherichia coli (277-401/421) B171 ││ │ ├─ Escherichia coli (277-401/421) B171 ││ │ ├─ Escherichia coli (277-401/421) B171 ││ │ ├─ Escherichia coli (277-401/421) E22 ││ │ ├─ Escherichia coli (277-401/421) O103:H2 str. 12009 ││ │ ├─ Escherichia coli (277-401/421) O111:H- str. 11128 ││ │ ├─ Escherichia coli (277-401/421) O157:H7 ││ │ ├─ Escherichia coli (277-401/421) O157:H7 EDL933 └┤ │ ├─ Escherichia coli (277-401/421) O157:H7 str. EC4042 │ │ ├─ Escherichia coli (277-401/421) O157:H7 str. EC4076 │ │ ├─ Escherichia coli (277-401/421) O157:H7 str. EC4115 │ │ ├─ Escherichia coli (277-401/421) O157:H7 str. EC4206 │ │ ├─ Escherichia coli (277-401/421) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (277-401/421) O157:H7 str. EC508 │ │ ├─ Escherichia coli (277-401/421) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ ├─ Escherichia coli (277-401/421) O157:H7 str. Sakai │ │ ├─ Escherichia coli (277-401/421) O157:H7 str. TW14588 │ │ ├─ Escherichia coli (277-401/421) O55:H7 str. CB9615 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (106-230/249) TA271 │ │ │├─ Escherichia coli (277-401/421) O26:H11 str. 11368 │ │ │├─ Escherichia coli (277-401/421) O157:H7 str. TW14359 │ │ │├─ Escherichia coli (277-401/421) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │├─ Escherichia coli (277-401/421) O157:H7 str. EC869 │ │ │├─ Escherichia coli (277-401/421) O157:H7 str. EC4501 │ │ │├─ Escherichia coli (277-401/421) O157:H7 str. EC4401 └─┤ │├─ Escherichia coli (277-401/421) O157:H7 str. EC4196 │ │├─ Escherichia coli (277-401/421) O157:H7 str. EC4113 │ │├─ Escherichia coli (277-401/421) O157:H7 str. EC4045 │ ┌┤├─ Escherichia coli (277-401/421) O157:H7 str. EC4024 │ ││├─ Escherichia coli (277-401/421) O157:H7 EDL933 │ ││├─ Escherichia coli (277-401/421) O127:H6 str. E2348/69 │ ││├─ Escherichia coli (277-401/421) O103:H2 str. 12009 │ ││├─ Escherichia coli (277-401/421) E2348/69 │ ││├─ Escherichia coli (277-401/421) E22 │ ┌┤│├─ Escherichia coli (277-401/421) B171 │ │││├─ Escherichia coli (277-401/421) B171 │ │││├─ Escherichia coli (277-401/421) 536A │ │││└─ Escherichia coli (277-401/421) 1125A │ ┌┤│└─ Escherichia coli (1-124/144) 2362-75 │ ││└─ Escherichia coli (277-401/420) 2362-75 │ ││┌─ Escherichia coli (277-401/420) 55989 │ ┌┤└┼─ Escherichia coli (277-401/420) 55989 │ ││ └─ fig|1040638.4.peg.832 O104:H4 (277-401/420) str. LB226692 │ │└─ Escherichia coli (277-401/420) MS 107-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (277-401/421) 83972 │ │ ├─ Escherichia coli (277-401/421) APEC O1 │ │ ├─ Escherichia coli (277-401/421) CFT073 │ │ ├─ Escherichia coli (277-401/421) FVEC1302 │ │ ├─ Escherichia coli (277-401/421) MS 198-1 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (277-401/421) UMN026 │ │ │├─ Escherichia coli (277-401/421) S88 │ │ │├─ Escherichia coli (277-401/421) FVEC1412 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (277-401/421) CFT073 └──┤ ││├─ Escherichia coli (277-401/421) APEC O1 │ ││└─ Escherichia coli (277-401/421) ABU 83972 │ ┌┤└─ Escherichia coli (277-401/421) MS 21-1 │ ││┌─ Escherichia coli (277-401/420) ATCC 8739 │ ││├─ Escherichia coli (277-401/420) ED1a │ │└┼─ Escherichia coli (277-401/420) H591 │┌┤ ├─ Escherichia coli (252-376/395) ETEC H10407 │││ ├─ Escherichia coli (277-401/420) ED1a │││ └─ Escherichia coli (277-401/420) ATCC 8739 ││└┬─ Escherichia coli (277-401/420) B185 ││ └─ Escherichia coli (277-401/421) M605 ││ ┌─ Escherichia coli (277-401/420) ED1a ││ ├─ Escherichia coli (252-376/396) ETEC H10407 └┤ ├─ Escherichia coli (277-401/420) MS 107-1 │ ┌┼─ Escherichia coli (277-401/421) O26:H11 str. 11368 │ │├─ Escherichia coli (277-401/420) H299 │ ┌┤└─ Escherichia coli (277-401/420) ED1a │ │└┬─ Escherichia coli (277-401/421) 042 │┌┤ └─ Escherichia coli (277-401/421) 042 ││└┬─ Escherichia coli (277-401/421) ATCC 8739 ││ └─ Escherichia coli (277-401/421) ATCC 8739 └┤ ┌─ Escherichia coli (277-401/420) IAI39 │┌┴─ Escherichia coli (277-401/420) IAI39 ││ ┌─ Escherichia coli (277-401/420) M718 ││ ├─ Escherichia coli (277-401/421) MS 185-1 └┤┌┼─ Escherichia coli (277-401/421) MS 84-1 ││├─ Escherichia coli (277-401/421) MS 200-1 ││└─ Escherichia coli (277-401/421) MS 124-1 └┤ ┌─ Escherichia coli (106-230/249) 101-1 │┌┴─ Escherichia coli (277-401/420) MS 187-1 ││ ┌─ Escherichia coli (277-401/421) 536 ││ ├─ Escherichia coli (277-401/421) F11 └┤ ┌┼─ Escherichia coli (277-401/421) F11 │┌┤└─ Escherichia coli (277-401/421) 536 ││└┬─ Escherichia coli (277-401/421) IAI39 ││ └─ Escherichia coli (277-401/421) IAI39 └┤┌─ Escherichia coli (277-401/420) NC101 ││┌─ Escherichia coli (277-401/420) 042 ││├─ Escherichia coli (277-401/420) 55989 ││├─ Escherichia coli (277-401/420) APEC O1 └┤├─ Escherichia coli (277-401/420) CFT073 │├─ Escherichia coli (277-401/420) E24377A │├─ Escherichia coli (277-401/421) EC4100B │├─ Escherichia coli (275-399/419) O111:H- str. 11128 └┼─ Escherichia coli (277-401/420) S88 ├─ Escherichia coli (277-401/420) MS 119-7 ├─ Escherichia coli (277-401/420) E24377A ├─ Escherichia coli (277-401/420) CFT073 ├─ Escherichia coli (277-401/420) APEC O1 ├─ Escherichia coli (277-401/420) 55989 ├─ Escherichia coli (277-401/420) 042 └─ fig|1040638.4.peg.2500 O104:H4 (277-401/420) str. LB226692
| Integrase | (310) |
| Phage integrase | (110) |
| Phage integrase, Phage P4-associated | (58) |
| FIG016809: Prophage P4 integrase | (39) |
| Prophage CP4-57 integrase | (36) |
| COG0582: Integrase | (11) |
| putative prophage integrase | (6) |
| Putative integrase | (5) |
| prophage P4 integrase | (5) |
| putative P4-type integrase | (5) |
| integrase-like protein | (5) |
| Putative prophage Sf6-like integrase | (4) |
| putative enzyme; Integration, recombination | (4) |
| phage integrase family protein | (4) |
| putative integrase prophage protein | (4) |
| Prophage P4 integrase | (4) |
| IS, phage, Tn; Phage-related functions and prophages | (3) |
| phage and prophage-related functions; integration, recombination | (3) |
| putative integrase | (2) |
| CPZ-55 prophage; predicted integrase | (2) |
| Others | (19) |