┌─ Escherichia coli (2-203/418) APEC O1 (4) ┌┴─ Escherichia coli (2-203/418) ETEC H10407 (1) ┌┴─ Escherichia coli (2-203/418) MS 196-1 ┌┴┬─ Escherichia coli (2-203/416) FVEC1302 ┌──────────┤ └─ Escherichia coli (2-203/415) M605 ┌─────────────────────┤ └─ Escherichia coli (2-203/417) E2348/69 (1) ┌─┤ └──────── Escherichia coli (2-213/395) 2362-75 │ └──────────────┬─ Escherichia coli (2-198/391) WV_060327 │ └─ Escherichia coli (2-198/391) SE15 │ ┌─ Escherichia coli (15-233/423) B088 (13) │ ┌┴─ Escherichia coli (15-233/423) O55:H7 str. CB9615 │ ┌┴─ Escherichia coli (15-233/423) ETEC H10407 │ ┌┴┬─ Escherichia coli (1-219/409) MS 78-1 │ │ └┬─ Escherichia coli (1-219/254) MS 187-1 │ ┌──────────────┤ └─ Escherichia coli (1-219/409) 101-1 (6) │ ┌┤ └─ Escherichia coli (15-233/423) 042 (2) │ │└─────┬─ Escherichia coli (1-214/395) B185 │ │ └┬─ Escherichia coli (1-214/403) M605 │ │ └┬─ Escherichia coli (1-214/398) ATCC 8739 │ ┌───┤ └┬─ Escherichia coli (1-214/402) MS 124-1 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-214/397) MS 175-1 │ │ │ └─ Escherichia coli (1-214/395) MS 21-1 │ │ └─────┬─── fig|6666666.5357.peg.4073 TY-2482 (1-213/413) strain (5) [2] │ ┌──┤ └┬─ Escherichia coli (1-213/413) MS 115-1 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-213/413) K12 (7) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-213/396) WV_060327 │ ┌─────┤ │ └─ Escherichia coli (1-213/413) MS 146-1 │ │ │ └─────────────────────────── Escherichia coli (4-211/412) 1125A (3) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-213/413) O111:H- str. 11128 │ │ └──────┬─┴─ Escherichia coli (1-213/413) ED1a (3) │ │ └┬─ Escherichia coli (1-213/414) 042 (1) │ │ └──┬─ Escherichia coli (1-213/413) B185 │ ┌────┤ └─ Escherichia coli (1-213/413) 53638 (1) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (9-219/439) 536 (4) ┤ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (9-219/439) MS 175-1 │ │ │ ┌───────────────────────────────────┴─ Escherichia coli (21-231/451) F11 (1) │ │ │ │ ┌──────────── Escherichia coli (406-603/807) 042 (1) │ │ └─────┤ ┌────────┴─────────────── Escherichia coli (17-208/406) SMS-3-5 │ │ │ ┌─────┴────────────── Escherichia coli (31-220/416) E22 (4) │ │ └────────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (3-214/407) O157:H7 str. FRIK966 │ │ └────────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (3-214/407) O103:H2 str. 12009 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-214/407) MS 187-1 │ │ └┬┴─ Escherichia coli (3-214/412) MS 182-1 │ │ └┬─ Escherichia coli (3-214/279) MS 69-1 │ │ └┬─ Escherichia coli (3-214/407) ETEC H10407 (2) │ │ └─ Escherichia coli (3-214/404) APEC O1 (11) │ │ ┌─ Escherichia coli (7-205/394) IAI39 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (7-205/394) MS 182-1 │ │ ┌┴─ fig|1040638.4.peg.393 O104:H4 (7-205/394) str. LB226692 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (7-205/394) 101-1 (8) │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (7-205/396) ETEC H10407 │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (7-205/396) H299 │ │ │└┬─ Escherichia coli (7-205/393) 536 (1) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (31-229/427) 83972 (2) │ │ ┌──┤ └┬─ Escherichia coli (31-229/417) O157:H7 str. EC508 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (31-229/417) 1044A (24) │ │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (7-205/404) B7A (1) │ │ ││ └─ Escherichia coli (7-205/394) TA280 │ │ ┌┤└─┬─ Escherichia coli (35-237/439) KO11 (2) │ │ ││ └─ Escherichia coli (3-205/399) MS 145-7 │ │ │└──────── Escherichia coli (3-201/397) MS 115-1 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (19-222/410) 1044A (13) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (2-205/393) O157:H7 str. EC4024 (1) └────┤ ┌┤ ┌┴─ Escherichia coli (19-222/410) O55:H7 str. CB9615 │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (2-197/225) 53638 │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (2-205/391) WV_060327 │ ││ ┌──────┴─ Escherichia coli (2-205/392) MS 145-7 │ ││ ┌┴─────── Escherichia coli (16-225/417) ED1a (1) │ │└──┤┌──────── Escherichia coli (19-221/407) SE15 │ ┌┤ └┤ ┌─ Escherichia coli (7-205/389) O26:H11 str. 11368 │ ││ └───┬┴─ Escherichia coli (7-205/390) MS 185-1 │ ││ └┬─ Escherichia coli (7-205/341) MS 115-1 (3) │ ││ └┬─ Escherichia coli (7-205/395) F11 (1) │ ││ └┬─ Escherichia coli (7-205/393) 042 (2) │ ││ └─ Escherichia coli (3-205/391) ATCC 8739 (1) │ │└─────┬────────────── Escherichia coli (2-202/393) ED1a (1) │ │ └────┬─ Escherichia coli (3-205/392) MS 21-1 │ ┌───┤ └┬─ Escherichia coli (3-205/394) E24377A (1) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (3-205/396) MS 84-1 │ │ │ └─ Escherichia coli (3-205/396) MS 124-1 (2) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (3-205/394) SMS-3-5 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-205/396) SE11 │ │ │ ┌────┴─ Escherichia coli (8-218/415) HS (1) [2] │ │ │ ┌───┴──┬─ fig|1040638.4.peg.5408 O104:H4 (3-205/404) str. LB226692 (3) │ │ └─┤ └┬─ Escherichia coli (3-205/404) MS 124-1 (1) │ │ │ └─ Escherichia coli (3-205/404) 83972 (3) │ ┌──┤ └─┬──────── Escherichia coli (2-202/396) MS 124-1 (1) │ │ │ └──────────────┬─ Escherichia coli (2-198/385) B7A (1) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (14-210/397) H591 (2) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (14-210/397) 1044A (25) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (2-198/385) K12 (27) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (2-198/385) MS 119-7 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (2-198/385) O26:H11 str. 11368 │ │ │ └─ Escherichia coli (2-198/385) FVEC1302 (1) │ │ └──────────────────┬─ Escherichia coli (32-228/428) ATCC 8739 (1) └────┤ └──┬─ Escherichia coli (34-230/431) K12 (5) │ └─ Escherichia coli (5-221/402) MS 187-1 │ ┌─────────────── Escherichia coli (25-227/443) MS 145-7 │ │ ┌─ Escherichia coli (3-203/420) FVEC1302 (1) │ │ ┌┴─ fig|1040638.4.peg.3509 O104:H4 (3-203/420) str. LB226692 (10) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-203/420) IAI39 (2) │ │ ┌─┴─ Escherichia coli (3-203/420) ED1a (1) │ │ ┌──┴── Escherichia coli (3-202/423) 536 (13) │ │┌───────────┴────── Escherichia coli (3-204/357) O83:H1 str. NRG 857C └───┤│ ┌─ Escherichia coli (3-206/420) O26:H11 str. 11368 ││ ┌┴─ Escherichia coli (3-206/421) TA280 ││ ┌┴─ Escherichia coli (3-206/418) EC4100B ││ ┌┴─ Escherichia coli (3-206/422) IHE3034 (1) ││ ┌─┴─ Escherichia coli (3-206/424) O157:H7 str. EC869 (2) ││ ┌──────────┴───── Escherichia coli (10-226/427) MS 116-1 (1) ││ │ ┌─ Escherichia coli (3-206/236) O111:H- str. 11128 ││ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-206/357) 83972 (5) └┤ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-206/211) M605 │ │ ┌──┴┬─ Escherichia coli (3-206/422) W (1) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (3-206/275) 1044A (24) │ │ ┌───┤ └─ Escherichia coli (3-206/275) O55:H7 str. CB9615 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (3-206/422) B7A (1) │ │ │ └─ Escherichia coli (7-206/417) 042 (1) │ │ ┌┤ ┌─ Escherichia coli (7-204/414) TA271 │ │ ││┌┴─ Escherichia coli (7-204/414) O103:H2 str. 12009 (2) │ │ │└┤ ┌─ Escherichia coli (7-205/420) 536 (6) │ │ │ └──┬┴─ Escherichia coli (7-205/420) UTI89 (1) └──┤ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (7-205/421) M718 │ ││ └┬─ Escherichia coli (7-205/421) 55989 (5) │ ││ └─ Escherichia coli (7-205/421) ED1a (6) │ ││ ┌─ Escherichia coli (3-213/304) 101-1 (2) │ ┌┤└──┬┴─ Escherichia coli (3-213/304) B171 (1) │ ││ └┬─ Escherichia coli (3-213/379) WV_060327 │ ││ └┬─ Escherichia coli (7-206/396) MS 124-1 │ ┌┤│ └─ Escherichia coli (3-213/421) KO11 (2) │ ││└────┬─ Escherichia coli (7-213/416) IAI1 (1) │ ││ └─ Escherichia coli (7-213/416) MS 115-1 │┌─┤└──┬───── Escherichia coli (3-203/420) MS 107-1 ││ │ └─── Escherichia coli (7-212/415) MS 115-1 ││ └────────────┬─── Escherichia coli (1-209/424) ED1a (1) └┤ └──┬─ Escherichia coli (3-207/424) O111:H- str. 11128 │ └─ Escherichia coli (3-207/422) 2362-75 (2) │ ┌─── Escherichia coli (3-212/417) MS 115-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (3-205/319) B str. REL606 (1) └─────┤ │ ┌─ Escherichia coli (3-205/421) EC4100B │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-203/419) O111:H- str. 11128 └──┤ ┌┴─ Escherichia coli (3-205/421) MS 185-1 │┌┴─ Escherichia coli (3-205/421) MS 200-1 ││ ┌─ Escherichia coli (3-205/421) 1044A (25) └┤ ┌┴─ Escherichia coli (3-205/421) O26:H11 str. 11368 │┌┴─ Escherichia coli (3-205/421) B171 (16) └┤┌─ Escherichia coli (3-205/421) ATCC 8739 (1) ││ ┌─ Escherichia coli (3-205/420) H591 └┤ ┌┴─ Escherichia coli (3-205/420) 2362-75 │┌┴─ Escherichia coli (3-205/420) ATCC 8739 (1) ││ ┌─ Escherichia coli (3-205/421) 83972 (11) └┤┌┴─ Escherichia coli (3-205/421) MS 21-1 ││ ┌─ Escherichia coli (3-205/420) M718 └┤ ┌┴─ Escherichia coli (3-205/420) MS 187-1 │┌┴─ Escherichia coli (3-205/420) ED1a (1) └┤ ┌─ Escherichia coli (3-205/420) B185 │ ┌┴─ Escherichia coli (3-205/421) M605 └┬┴─ Escherichia coli (3-205/420) MS 107-1 └┬─ Escherichia coli (3-205/420) NC101 └┬─ Escherichia coli (3-205/420) APEC O1 (7) └┬─ Escherichia coli (3-205/421) MS 124-1 (1) └┬─ Escherichia coli (3-205/420) MS 107-1 └┬─ fig|1040638.4.peg.832 O104:H4 (3-205/420) str. LB226692 (4) └┬─ fig|1040638.4.peg.2500 O104:H4 (3-205/420) str. LB226692 (10) └─ Escherichia coli (3-205/420) E24377A (1)
| Integrase | (62) |
| Phage integrase, Phage P4-associated | (24) |
| Phage integrase | (23) |
| Prophage CP4-57 integrase | (8) |
| Putative integrase | (7) |
| COG0582: Integrase | (7) |
| FIG016809: Prophage P4 integrase | (6) |
| integrase-like protein | (6) |
| putative prophage integrase | (3) |
| putative P4-type integrase | (2) |
| Phage Integrase | (2) |
| phage integrase family protein | (2) |
| Prophage P4 integrase | (2) |
| site-specific recombinase, phage integrase family | (1) |
| putative integrase | (1) |
| prophage P4 integrase | (1) |
| FIG021166: Prophage P4 integrase | (1) |
| putative integrase prophage protein | (1) |
| Others | (6) |