┌─ Escherichia coli (2-203/418) APEC O1 ├─ Escherichia coli (2-203/416) IAI39 ┌┼─ Escherichia coli (2-203/416) IHE3034 │├─ Escherichia coli (2-203/416) IAI39 ┌┤└─ Escherichia coli (2-203/418) APEC O1 │└┬─ Escherichia coli (2-203/416) MS 198-1 ┌┤ └─ Escherichia coli (2-203/418) ETEC H10407 ┌┤└─ Escherichia coli (2-203/418) MS 196-1 │└┬─ Escherichia coli (2-203/416) FVEC1302 ┌──────────┤ └─ Escherichia coli (2-203/415) M605 │ └┬─ Escherichia coli (2-203/417) O127:H6 str. E2348/69 ┌─────────────────────┤ └─ Escherichia coli (2-203/417) E2348/69 ┌─┤ └──────── Escherichia coli (2-213/395) 2362-75 │ └──────────────┬─ Escherichia coli (2-198/391) WV_060327 │ └─ Escherichia coli (2-198/391) SE15 │ ┌─ Escherichia coli (15-233/423) B088 │ ├─ Escherichia coli (15-233/423) B171 │ ├─ Escherichia coli (15-233/423) B7A │ ├─ Escherichia coli (15-233/423) E22 │ ├─ Escherichia coli (15-233/423) MS 145-7 │ ├─ Escherichia coli (15-233/423) O26:H11 str. 11368 │ ├─ Escherichia coli (15-233/423) W │ ┌┼─ Escherichia coli (15-233/423) W │ │├─ Escherichia coli (15-233/423) SE11 │ │├─ Escherichia coli (15-233/423) O103:H2 str. 12009 │ │├─ Escherichia coli (15-233/423) KO11 │ ┌┤├─ Escherichia coli (15-233/423) E22 │ ││├─ Escherichia coli (15-233/423) B7A │ ┌┤│└─ Escherichia coli (15-233/423) B171 │ ││└─ Escherichia coli (15-233/423) O55:H7 str. CB9615 │ ┌┤└─ Escherichia coli (15-233/423) ETEC H10407 │ ││┌─ Escherichia coli (1-219/409) MS 78-1 │ │└┤┌─ Escherichia coli (1-219/254) MS 187-1 │ │ ││┌─ Escherichia coli (1-219/409) B str. REL606 │ │ └┤├─ Escherichia coli (DE3 1-219/409) BL21(DE3) │ │ │├─ Escherichia coli (28-246/436) E24377A │ ┌──────────────┤ └┼─ Escherichia coli (28-246/436) OP50 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-219/409) E24377A │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-219/409) BL21 │ │ │ └─ Escherichia coli (1-219/409) 101-1 │ ┌┤ │┌─ Escherichia coli (15-233/423) 042 │ ││ └┼─ Escherichia coli (15-233/423) MS 21-1 │ ││ └─ Escherichia coli (15-233/423) 042 │ │└─────┬─ Escherichia coli (1-214/395) B185 │ │ └┬─ Escherichia coli (1-214/403) M605 │ │ └┬─ Escherichia coli (1-214/398) ATCC 8739 │ │ └┬─ Escherichia coli (1-214/402) MS 124-1 │ │ └┬─ Escherichia coli (1-214/397) MS 175-1 │ ┌───┤ └─ Escherichia coli (1-214/395) MS 21-1 │ │ │ ┌─ fig|6666666.5357.peg.4073 TY-2482 (1-213/413) strain │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-213/413) 55989 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-213/413) MS 119-7 │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli (1-213/413) TA271 │ │ │ │├─ Escherichia coli (1-213/413) H591 │ │ │ ┌──┤└─ Escherichia coli (1-213/413) 55989 │ │ │ │ └─ fig|1040638.4.peg.3048 O104:H4 str. LB226692 │ │ └─────┤┌─ Escherichia coli (1-213/413) MS 115-1 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-213/413) MS 146-1 │ ┌──┤ └┤┌┴─ Escherichia coli (1-213/396) WV_060327 │ │ │ ││┌─ Escherichia coli (1-213/413) DH1 │ │ │ └┤├─ Escherichia coli (1-213/413) W3110 │ │ │ │├─ Escherichia coli (1-213/413) str. K-12 substr. DH10B │ │ │ └┼─ Escherichia coli (1-213/413) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-213/413) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-213/413) str. K-12 substr. DH10B │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-213/413) K12 │ │ │ └─ Escherichia coli (1-213/413) BW2952 │ ┌─────┤ │ ┌─ Escherichia coli (4-211/412) O157:H7 str. EC4024 │ │ │ └──────────────────────────┼─ Escherichia coli (4-211/412) O157:H7 str. EC4486 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-211/412) O157:H7 str. EC4401 │ │ │ └─ Escherichia coli (4-211/412) 1125A │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-213/413) 53638 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-213/413) 53638 │ │ │ ┌──┴─ Escherichia coli (1-213/413) B185 │ │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (1-213/414) 042 │ │ └──────┤ └─ Escherichia coli (1-213/414) 042 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-213/413) O111:H- str. 11128 │ │ └─┤┌─ Escherichia coli (1-213/413) ED1a │ │ └┼─ Escherichia coli (1-213/413) O26:H11 str. 11368 │ ┌────┤ ├─ Escherichia coli (1-213/413) MS 21-1 │ │ │ └─ Escherichia coli (1-213/413) ED1a │ │ │ ┌─ Escherichia coli (9-219/439) 536 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-219/439) H736 │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli (9-219/439) MS 200-1 │ │ │ │├─ Escherichia coli (9-219/439) MS 116-1 │ │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (9-219/439) 536 │ │ │ ┌───────────────────────────────────┤└─ Escherichia coli (9-219/439) MS 175-1 │ │ │ │ └┬─ Escherichia coli (9-219/439) F11 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (21-231/451) F11 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (31-220/416) E22 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (12-201/397) H736 │ │ └─────┤ ┌─────────────┼─ Escherichia coli (12-201/397) str. K-12 substr. DH10B │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (12-201/397) str. K-12 substr. DH10B │ │ │ ┌─────┤ └─ Escherichia coli (12-201/397) E22 │ │ │ │ └────────┬─────────────── Escherichia coli (17-208/406) SMS-3-5 │ │ │ │ └───────────┬─ Escherichia coli (406-603/807) 042 │ │ └────────────────────┤ └─ Escherichia coli (406-603/807) 042 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (3-214/407) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (3-214/407) O103:H2 str. 12009 ┤ │ └────────────────────┤ ┌┴─ Escherichia coli (3-214/407) MS 187-1 │ │ │┌┴─ Escherichia coli (3-214/412) MS 182-1 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (3-214/279) MS 69-1 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (3-214/407) ETEC H10407 │ │ └┤┌┼─ Escherichia coli (3-214/407) TA143 │ │ ││└─ Escherichia coli (3-214/407) O55:H7 str. CB9615 │ │ ││┌─ Escherichia coli (3-214/404) APEC O1 │ │ └┤├─ Escherichia coli (3-214/404) F11 │ │ │├─ Escherichia coli (3-214/407) IAI39 │ │ │├─ Escherichia coli (3-214/407) IHE3034 │ │ │├─ Escherichia coli (3-214/404) S88 │ │ └┼─ Escherichia coli (3-214/404) UTI89 │ │ ├─ Escherichia coli (3-214/404) UTI89 │ │ ├─ Escherichia coli (3-214/404) MS 200-1 │ │ ├─ Escherichia coli (3-214/407) IAI39 │ │ ├─ Escherichia coli (3-214/407) H591 │ │ ├─ Escherichia coli (3-214/404) F11 │ │ └─ Escherichia coli (3-214/404) APEC O1 │ │ ┌─ Escherichia coli (31-229/417) 1044A │ │ ├─ Escherichia coli (7-205/393) 1212A │ │ ├─ Escherichia coli (7-205/393) O157:H7 │ │ ├─ Escherichia coli (31-229/417) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (31-229/417) O157:H7 str. EC4042 │ │ ├─ Escherichia coli (31-229/417) O157:H7 str. EC4076 │ │ ├─ Escherichia coli (31-229/417) O157:H7 str. EC4115 │ │ ├─ Escherichia coli (31-229/417) O157:H7 str. EC4206 │ │ ├─ Escherichia coli (7-205/393) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (31-229/417) O157:H7 str. EC869 │ │ ├─ Escherichia coli (7-205/393) O157:H7 str. FRIK966 │ │ ├─ Escherichia coli (31-229/417) O157:H7 str. TW14359 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (7-205/393) O55:H7 str. CB9615 │ │ │├─ Escherichia coli (31-229/417) O157:H7 str. TW14588 │ │ │├─ Escherichia coli (31-229/417) O157:H7 str. Sakai │ │ │├─ Escherichia coli (7-205/393) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ │├─ Escherichia coli (31-229/417) O157:H7 str. EC4501 │ │ │├─ Escherichia coli (31-229/417) O157:H7 str. EC4401 │ │ │├─ Escherichia coli (31-229/417) O157:H7 str. EC4196 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (31-229/417) O157:H7 str. EC4113 │ │ ││├─ Escherichia coli (31-229/417) O157:H7 str. EC4045 │ │ ││├─ Escherichia coli (31-229/417) O157:H7 str. EC4024 │ │ ││├─ Escherichia coli (7-205/393) O157:H7 EDL933 │ │ ┌┤│├─ Escherichia coli (31-229/417) 536A │ │ │││└─ Escherichia coli (31-229/417) 1125A │ │ ││└─ Escherichia coli (31-229/417) O157:H7 str. EC508 │ │ ┌┤│┌─ Escherichia coli (31-229/427) ABU 83972 │ │ ││└┼─ Escherichia coli (7-205/403) MS 45-1 │ │ ││ └─ Escherichia coli (31-229/427) 83972 │ │ │└┬─ Escherichia coli (7-205/393) 536 │ │ │ └─ Escherichia coli (7-205/393) 536 │ │ ┌┤ ┌─ Escherichia coli (7-205/396) H299 │ │ ││┌┴─ Escherichia coli (7-205/396) ETEC H10407 │ │ │││ ┌─ Escherichia coli (7-205/394) IAI39 │ │ │││ ┌┴─ Escherichia coli (7-205/394) IAI39 │ │ │└┤ ┌┴─ Escherichia coli (7-205/394) MS 182-1 │ │ │ │┌┴─ fig|1040638.4.peg.393 O104:H4 (7-205/394) str. LB226692 │ │ │ ││┌─ Escherichia coli (7-205/394) B str. REL606 │ │ │ └┤├─ Escherichia coli (DE3 7-205/394) BL21(DE3) │ │ ┌──┤ │├─ Escherichia coli (7-205/394) CFT073 │ │ │ │ │├─ Escherichia coli (7-205/394) MS 187-1 │ │ │ │ └┼─ Escherichia coli (7-205/394) OP50 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-205/394) M718 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-205/394) CFT073 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-205/394) BL21 │ │ ┌┤ │ └─ Escherichia coli (7-205/394) 101-1 │ │ ││ └┬─ Escherichia coli (7-205/394) TA280 │ │ ││ └┬─ Escherichia coli (31-229/428) B7A │ │ ││ └─ Escherichia coli (7-205/404) B7A │ │ ┌┤│ ┌─ Escherichia coli (3-205/399) MS 145-7 │ │ ││└─┤┌─ Escherichia coli (3-205/407) W │ │ ││ └┼─ Escherichia coli (35-237/439) W │ │ ││ └─ Escherichia coli (35-237/439) KO11 │ │ │└──────── Escherichia coli (3-201/397) MS 115-1 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (7-205/393) 042 │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli (7-205/387) SMS-3-5 │ │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (7-205/393) 042 │ │ │ │└┬─ Escherichia coli (3-205/391) ATCC 8739 │ │ ┌┤ ┌┤ └─ Escherichia coli (3-205/391) ATCC 8739 │ │ ││ │└┬─ Escherichia coli (7-205/395) F11 │ │ ││ ┌┤ └─ Escherichia coli (7-205/395) F11 │ │ ││ ││┌─ Escherichia coli (7-205/395) O157:H7 str. EC869 │ │ ││ │└┼─ Escherichia coli (7-205/395) O157:H7 str. FRIK966 │ │ ││ ┌───┤ ├─ Escherichia coli (7-205/395) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ ││ │ │ └─ Escherichia coli (7-205/341) MS 115-1 │ │ ││ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (7-205/390) MS 185-1 │ │ ││ ││ └─ Escherichia coli (7-205/389) O26:H11 str. 11368 │ │ │└──┤└──────── Escherichia coli (19-221/407) SE15 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (16-225/417) ED1a └────┤ │ │┌──────┴─ Escherichia coli (16-225/417) ED1a │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (2-205/392) MS 145-7 │ │ └──────┤┌─ Escherichia coli (2-205/391) WV_060327 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (2-197/225) 53638 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (19-222/410) O55:H7 str. CB9615 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (2-205/393) O157:H7 str. EC4024 │ ┌┤ └┤┌┴─ Escherichia coli (19-222/410) O157:H7 str. EC4115 │ ││ ││┌─ Escherichia coli (19-222/410) 1125A │ ││ ││├─ Escherichia coli (19-222/410) 536A │ ││ └┤├─ Escherichia coli (19-222/410) O157:H7 EDL933 │ ││ │├─ Escherichia coli (2-205/393) O157:H7 str. EC4501 │ ││ │├─ Escherichia coli (2-205/393) O157:H7 str. EC869 │ ││ │├─ Escherichia coli (2-205/393) O157:H7 str. FRIK966 │ ││ └┼─ Escherichia coli (2-205/393) O157:H7 str. TW14588 │ ││ ├─ Escherichia coli (2-205/393) O157:H7 str. Sakai │ ││ ├─ Escherichia coli (19-222/410) O157:H7 str. FRIK2000 │ ││ ├─ Escherichia coli (19-222/410) O157:H7 str. EC508 │ ││ ├─ Escherichia coli (2-205/393) O157:H7 EDL933 │ ││ ├─ Escherichia coli (2-205/393) O157:H7 │ ││ ├─ Escherichia coli (19-222/410) 1212A │ ││ └─ Escherichia coli (19-222/410) 1044A │ ││ ┌─ Escherichia coli (2-202/393) ED1a │ ││ ┌─────────────┴─ Escherichia coli (2-202/393) ED1a │ │└─────┤ ┌─ Escherichia coli (3-205/392) MS 21-1 │ │ └────┤ ┌─ Escherichia coli (3-205/394) E24377A │ ┌───┤ │┌┴─ Escherichia coli (13-215/404) E24377A │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (3-205/396) MS 84-1 │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (3-205/394) SMS-3-5 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (3-205/396) TA280 │ │ │ └─ Escherichia coli (3-205/396) MS 124-1 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (3-205/404) 83972 │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-205/404) ETEC H10407 │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli (3-205/404) NC101 │ │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (3-205/404) ABU 83972 │ │ │ │└┬─ Escherichia coli (3-205/404) MS 84-1 │ │ │ ┌──┤ └─ Escherichia coli (3-205/404) MS 124-1 │ │ │ │ │┌─ fig|6666666.5357.peg.3044 TY-2482 (3-205/404) strain │ │ │ │ └┼─ Escherichia coli (3-205/404) 55989 │ │ │ ┌───┤ ├─ Escherichia coli (3-205/404) 55989 │ │ │ │ │ └─ fig|1040638.4.peg.5408 O104:H4 (3-205/404) str. LB226692 │ │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (3-205/394) SMS-3-5 │ │ │ │ └────┬┴─ Escherichia coli (3-205/396) SE11 │ │ │ │ └┬─ Escherichia coli (3-205/402) HS │ │ │ │ └┬─ Escherichia coli (8-218/253) MS 116-1 │ │ └─┤ └─ Escherichia coli (8-218/415) HS │ │ │ ┌─ Escherichia coli (2-202/396) MS 124-1 │ │ │ ┌───────┴─ Escherichia coli (2-202/396) MS 84-1 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (2-198/385) B7A │ │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (14-210/397) B7A │ │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (14-210/397) H591 │ │ └─┤ │┌┼─ Escherichia coli (2-198/385) TA271 │ │ │ ││└─ Escherichia coli (14-210/397) TA143 │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (14-210/397) 1044A │ │ │ ││ ├─ Escherichia coli (14-210/397) 1212A │ │ │ ││ ├─ Escherichia coli (2-198/385) O157:H7 │ │ └──────────────┤│ ├─ Escherichia coli (14-210/397) O157:H7 EDL933 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (2-198/385) O157:H7 str. EC4042 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (14-210/397) O157:H7 str. EC4076 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (2-198/385) O157:H7 str. EC4115 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (2-198/385) O157:H7 str. EC4206 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (2-198/385) O157:H7 str. EC4486 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (2-198/385) O157:H7 str. EC508 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (2-198/385) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ └┤ ├─ Escherichia coli (14-210/397) O157:H7 str. Sakai │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-198/385) O157:H7 str. TW14588 │ │ │┌┼─ Escherichia coli (14-210/397) O55:H7 str. CB9615 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-198/385) O157:H7 str. TW14359 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-198/385) O157:H7 str. FRIK966 │ │ ││├─ Escherichia coli (14-210/397) O157:H7 str. EC869 │ ┌──┤ ││├─ Escherichia coli (2-198/385) O157:H7 str. EC4501 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (2-198/385) O157:H7 str. EC4401 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (2-198/385) O157:H7 str. EC4196 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (14-210/397) O157:H7 str. EC4113 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (14-210/397) O157:H7 str. EC4045 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (2-198/385) O157:H7 str. EC4024 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (14-210/397) O157:H7 EDL933 │ │ │ └┤├─ Escherichia coli (2-198/385) 536A │ │ │ │└─ Escherichia coli (2-198/385) 1125A │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (2-198/385) FVEC1302 │ │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (2-198/385) MS 198-1 │ │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (2-198/385) O26:H11 str. 11368 │ │ │ │┌┴─ Escherichia coli (2-198/385) MS 119-7 │ │ │ ││┌─ fig|6666666.5357.peg.3503 TY-2482 (2-198/385) strain │ │ │ ││├─ Escherichia coli (2-198/385) 55989 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (2-198/385) APEC O1 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (14-210/397) B354 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (14-210/397) DH1 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (2-198/385) IAI39 │ │ │ └┤├─ Escherichia coli (14-210/397) IHE3034 │ │ │ │├─ Escherichia coli (2-198/385) KO11 │ │ │ │├─ Escherichia coli (14-210/397) S88 │ │ │ │├─ Escherichia coli (14-210/397) UTI89 │ │ │ │├─ Escherichia coli (2-198/385) W │ │ │ │├─ Escherichia coli (2-198/385) W3110 │ │ │ │├─ Escherichia coli (14-210/397) str. K-12 substr. DH10B │ │ │ └┼─ Escherichia coli (14-210/397) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │ ├─ Escherichia coli (14-210/397) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-198/385) str. K-12 substr. DH10B │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-198/385) W │ │ │ ├─ Escherichia coli (14-210/397) UTI89 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-198/385) UM146 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-198/385) O127:H6 str. E2348/69 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-198/385) K12 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-198/385) IAI39 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-198/385) E2348/69 │ │ │ ├─ Escherichia coli (14-210/397) BW2952 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-198/385) B088 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-198/385) APEC O1 └────┤ │ ├─ Escherichia coli (2-198/385) 55989 │ │ └─ fig|1040638.4.peg.3437 O104:H4 (14-210/394) str. LB226692 │ │ ┌─ Escherichia coli (32-228/428) ATCC 8739 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (32-228/428) ATCC 8739 │ └──────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (5-221/402) MS 187-1 │ └──┤┌─ Escherichia coli (34-230/431) K12 │ │├─ Escherichia coli (34-230/431) str. K-12 substr. DH10B │ └┼─ Escherichia coli (34-230/431) str. K-12 substr. MG1655 │ ├─ Escherichia coli (34-230/431) str. K-12 substr. MG1655 │ ├─ Escherichia coli (34-230/431) str. K-12 substr. DH10B │ └─ Escherichia coli (34-230/431) BW2952 │ ┌─────────────── Escherichia coli (25-227/443) MS 145-7 │ │ ┌─ fig|1040638.4.peg.3509 O104:H4 (3-203/420) str. LB226692 │ │ ├─ Escherichia coli (3-203/420) 53638 │ │ ├─ Escherichia coli (3-203/420) 55989 │ │ ├─ Escherichia coli (3-203/420) E110019 │ │ ├─ Escherichia coli (3-203/420) MS 124-1 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (3-203/420) MS 84-1 │ │ │├─ Escherichia coli (3-203/420) MS 198-1 │ │ │├─ Escherichia coli (3-203/420) H299 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (3-203/420) E110019 │ │ ││├─ Escherichia coli (3-203/420) 55989 │ │ ││└─ Escherichia coli (3-203/420) 53638 │ │ ┌┤└┬─ Escherichia coli (3-203/420) UMN026 │ │ ││ └─ Escherichia coli (3-203/420) FVEC1302 │ │ ││┌─ Escherichia coli (3-203/420) IAI39 │ │ ┌─┤└┼─ Escherichia coli (3-203/420) O83:H1 str. NRG 857C │ │ │ │ └─ Escherichia coli (3-203/420) IAI39 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (3-203/420) ED1a │ │ │ └─ Escherichia coli (3-203/420) ED1a │ │ │ ┌─ Escherichia coli (3-202/423) 536 │ │ ┌──┤ ├─ Escherichia coli (3-202/423) ABU 83972 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-202/423) CFT073 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-202/423) MS 185-1 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-202/423) MS 45-1 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-202/423) UM146 │ │ │ └─┼─ Escherichia coli (3-202/423) UTI89 │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-202/423) UTI89 │ │┌───────────┤ ├─ Escherichia coli (3-202/423) NC101 └───┤│ │ ├─ Escherichia coli (3-202/423) MS 200-1 ││ │ ├─ Escherichia coli (3-202/423) IHE3034 ││ │ ├─ Escherichia coli (3-202/423) CFT073 ││ │ ├─ Escherichia coli (3-202/423) 83972 ││ │ └─ Escherichia coli (3-202/423) 536 ││ └────── Escherichia coli (3-204/357) O83:H1 str. NRG 857C ││ ┌─ Escherichia coli (3-206/420) O26:H11 str. 11368 ││ ┌┴─ Escherichia coli (3-206/421) TA280 ││ ┌┴─ Escherichia coli (3-206/418) EC4100B ││ ┌┴┬─ Escherichia coli (3-206/422) WV_060327 ││ │ └─ Escherichia coli (3-206/422) IHE3034 ││ ┌─┤┌─ Escherichia coli (3-206/424) O157:H7 str. FRIK2000 ││ │ └┼─ Escherichia coli (3-206/424) O157:H7 str. FRIK966 ││ ┌──────────┤ └─ Escherichia coli (3-206/424) O157:H7 str. EC869 ││ │ └────┬─ Escherichia coli (10-226/427) MS 175-1 ││ │ └─ Escherichia coli (10-226/427) MS 116-1 ││ │ ┌─ Escherichia coli (3-206/275) 1044A ││ │ ├─ Escherichia coli (3-206/275) 1212A ││ │ ├─ Escherichia coli (3-206/275) O157:H7 ││ │ ├─ Escherichia coli (3-206/275) O157:H7 EDL933 ││ │ ├─ Escherichia coli (3-206/275) O157:H7 str. EC4042 ││ │ ├─ Escherichia coli (3-206/275) O157:H7 str. EC4076 ││ │ ├─ Escherichia coli (3-206/275) O157:H7 str. EC4115 ││ │ ├─ Escherichia coli (3-206/275) O157:H7 str. EC4206 ││ │ ├─ Escherichia coli (3-206/275) O157:H7 str. EC4486 ││ │ ├─ Escherichia coli (3-206/275) O157:H7 str. EC508 ││ │ ├─ Escherichia coli (3-206/275) O157:H7 str. FRIK2000 ││ │ ├─ Escherichia coli (3-206/275) O157:H7 str. Sakai └┤ │ ┌┼─ Escherichia coli (3-206/275) O157:H7 str. TW14588 │ │ │├─ Escherichia coli (3-206/275) O157:H7 str. TW14359 │ │ │├─ Escherichia coli (3-206/275) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │├─ Escherichia coli (3-206/275) O157:H7 str. EC869 │ │ │├─ Escherichia coli (3-206/275) O157:H7 str. EC4501 │ │ │├─ Escherichia coli (3-206/275) O157:H7 str. EC4401 │ │ │├─ Escherichia coli (3-206/275) O157:H7 str. EC4196 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (3-206/275) O157:H7 str. EC4113 │ │ ││├─ Escherichia coli (3-206/275) O157:H7 str. EC4045 │ │ ││├─ Escherichia coli (3-206/275) O157:H7 str. EC4024 │ │ ││├─ Escherichia coli (29-232/301) O157:H7 EDL933 │ │ ┌┤│├─ Escherichia coli (3-206/275) 536A │ │ │││└─ Escherichia coli (3-206/275) 1125A │ │ ││└─ Escherichia coli (3-206/275) O55:H7 str. CB9615 │ │ ┌──┤└┬─ Escherichia coli (3-206/422) W │ │ │ │ └─ Escherichia coli (3-206/422) W │ │ │ │┌─ Escherichia coli (3-206/211) M605 │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (3-206/236) O111:H- str. 11128 │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (3-206/357) ABU 83972 │ │ │ │├─ Escherichia coli (3-206/357) CFT073 │ │ ┌───┤ └┼─ Escherichia coli (3-206/357) MS 45-1 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-206/357) MS 185-1 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (29-232/383) CFT073 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (3-206/357) 83972 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (3-206/422) B7A │ │ │ └┬┴─ Escherichia coli (3-206/422) B7A │ │ │ └┬─ Escherichia coli (7-206/417) 042 │ │ │ └─ Escherichia coli (7-206/417) 042 │ │ ┌┤ ┌─ Escherichia coli (7-204/414) O103:H2 str. 12009 │ │ ││ ┌┼─ Escherichia coli (7-204/394) E22 └──┤ ││┌┤└─ Escherichia coli (7-204/394) E22 │ │││└─ Escherichia coli (7-204/414) TA271 │ │││ ┌─ Escherichia coli (7-205/420) 536 │ │││ ├─ Escherichia coli (7-205/420) 83972 │ │││ ├─ Escherichia coli (7-205/420) F11 │ │└┤ ┌┼─ Escherichia coli (7-205/420) UM146 │ │ │ │├─ Escherichia coli (7-205/420) MS 200-1 │ │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (7-205/420) ABU 83972 │ │ │ ││└─ Escherichia coli (7-205/420) 536 │ │ │ │└┬─ Escherichia coli (7-205/420) UTI89 │ │ └──┤ └─ Escherichia coli (7-205/420) UTI89 │ │ │┌─ Escherichia coli (7-205/421) M718 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (7-205/421) 55989 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (7-205/421) MS 124-1 │ ┌┤ └┤ ├─ Escherichia coli (7-205/421) MS 84-1 │ ││ │┌┼─ Escherichia coli (7-205/421) SMS-3-5 │ ││ ││├─ Escherichia coli (7-205/421) MS 45-1 │ ││ ││└─ Escherichia coli (7-205/421) 55989 │ ││ └┤┌─ Escherichia coli (7-205/421) ED1a │ ││ │├─ Escherichia coli (7-205/413) H736 │ ││ │├─ Escherichia coli (7-205/421) IAI39 │ ││ └┼─ Escherichia coli (7-205/421) MS 145-7 │ ││ ├─ Escherichia coli (7-205/421) IAI39 │ ││ ├─ Escherichia coli (7-205/421) ETEC H10407 │ ││ └─ Escherichia coli (7-205/421) ED1a │ ┌┤│ ┌─ Escherichia coli (3-213/421) KO11 │ │││ ┌┼─ Escherichia coli (3-213/421) W │ │││ ┌┤└─ Escherichia coli (3-213/421) W │ │││ ┌┤└─ Escherichia coli (7-206/396) MS 124-1 │ │││ │└─ Escherichia coli (3-213/379) WV_060327 │ ││└──┤ ┌─ Escherichia coli (3-213/304) B171 │ ││ │┌┴─ Escherichia coli (3-213/304) B171 │ ┌┤│ └┤┌─ Escherichia coli (3-213/304) MS 187-1 │ │││ └┼─ Escherichia coli (3-213/304) MS 21-1 │ │││ └─ Escherichia coli (3-213/304) 101-1 │ ││└────┬─ Escherichia coli (7-213/416) MS 115-1 │ ││ └┬─ Escherichia coli (7-213/416) IAI1 │┌─┤│ └─ Escherichia coli (7-213/416) IAI1 ││ │└──┬───── Escherichia coli (3-203/420) MS 107-1 ││ │ └─── Escherichia coli (7-212/415) MS 115-1 ││ │ ┌─ Escherichia coli (1-209/424) ED1a ││ │ ┌──┴─ Escherichia coli (1-209/424) ED1a ││ └────────────┤ ┌─ Escherichia coli (3-207/424) O111:H- str. 11128 ││ └──┤┌─ Escherichia coli (25-229/444) E2348/69 ││ └┼─ Escherichia coli (3-207/422) O127:H6 str. E2348/69 └┤ └─ Escherichia coli (3-207/422) 2362-75 │ ┌─── Escherichia coli (3-212/417) MS 115-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (3-205/319) B str. REL606 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-205/319) BL21 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (3-205/421) EC4100B │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-203/419) O111:H- str. 11128 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-205/421) MS 185-1 │ │ │┌┴─ Escherichia coli (3-205/421) MS 200-1 └─────┤ ││ ┌─ Escherichia coli (3-205/421) 1044A │ ││ ├─ Escherichia coli (3-205/421) 1212A │ ││ ├─ Escherichia coli (3-205/421) O157:H7 │ ││ ├─ Escherichia coli (3-205/421) O157:H7 EDL933 │ ││ ├─ Escherichia coli (3-205/421) O157:H7 str. EC4042 │ ││ ├─ Escherichia coli (3-205/421) O157:H7 str. EC4076 │ ││ ├─ Escherichia coli (3-205/421) O157:H7 str. EC4115 └──┤│ ├─ Escherichia coli (3-205/421) O157:H7 str. EC4206 ││ ├─ Escherichia coli (3-205/421) O157:H7 str. EC4486 ││ ├─ Escherichia coli (3-205/421) O157:H7 str. EC508 ││ ├─ Escherichia coli (3-205/421) O157:H7 str. FRIK2000 ││ ├─ Escherichia coli (3-205/421) O157:H7 str. Sakai ││ ├─ Escherichia coli (3-205/421) O157:H7 str. TW14588 ││ ┌┼─ Escherichia coli (3-205/421) O55:H7 str. CB9615 ││ │├─ Escherichia coli (3-205/421) O157:H7 str. TW14359 ││ │├─ Escherichia coli (3-205/421) O157:H7 str. FRIK966 ││ │├─ Escherichia coli (3-205/421) O157:H7 str. EC869 ││ │├─ Escherichia coli (3-205/421) O157:H7 str. EC4501 ││ │├─ Escherichia coli (3-205/421) O157:H7 str. EC4401 └┤ │├─ Escherichia coli (3-205/421) O157:H7 str. EC4196 │ ┌┤├─ Escherichia coli (3-205/421) O157:H7 str. EC4113 │ ││├─ Escherichia coli (3-205/421) O157:H7 str. EC4045 │ ││├─ Escherichia coli (3-205/421) O157:H7 str. EC4024 │ ││├─ Escherichia coli (3-205/421) O157:H7 EDL933 │ ││├─ Escherichia coli (3-205/421) 536A │ ││└─ Escherichia coli (3-205/421) 1125A │ │└─ Escherichia coli (3-205/421) O26:H11 str. 11368 │ │┌─ Escherichia coli (3-205/421) B171 │┌┤├─ Escherichia coli (3-205/421) B171 │││├─ Escherichia coli (3-205/420) CFT073 │││├─ Escherichia coli (3-205/421) E22 │││├─ Escherichia coli (3-205/421) E2348/69 │││├─ Escherichia coli (3-205/420) ED1a │││├─ Escherichia coli (3-205/421) O103:H2 str. 12009 │││├─ Escherichia coli (3-205/421) O127:H6 str. E2348/69 ││└┼─ Escherichia coli (3-205/421) O26:H11 str. 11368 ││ ├─ Escherichia coli (3-205/421) O111:H- str. 11128 ││ ├─ Escherichia coli (3-205/421) O103:H2 str. 12009 ││ ├─ Escherichia coli (3-205/420) ED1a └┤ ├─ Escherichia coli (3-205/421) E22 │ ├─ Escherichia coli (3-205/420) CFT073 │ ├─ Escherichia coli (3-205/421) B171 │ ├─ Escherichia coli (3-205/421) B171 │ └─ Escherichia coli (3-205/421) B171 │ ┌─ Escherichia coli (3-205/421) ATCC 8739 │┌┴─ Escherichia coli (3-205/421) ATCC 8739 ││ ┌─ Escherichia coli (3-205/420) ATCC 8739 ││ ┌┴─ Escherichia coli (3-205/420) ATCC 8739 ││┌┴┬─ Escherichia coli (3-205/420) 2362-75 │││ └─ Escherichia coli (3-205/420) H591 └┤│ ┌─ Escherichia coli (3-205/421) 83972 ││ ├─ Escherichia coli (3-205/421) APEC O1 ││ ├─ Escherichia coli (3-205/421) CFT073 ││ ├─ Escherichia coli (3-205/421) FVEC1302 ││ ├─ Escherichia coli (3-205/290) MS 116-1 └┤ ├─ Escherichia coli (3-205/421) S88 │ ┌┼─ Escherichia coli (3-205/421) UMN026 │ │├─ Escherichia coli (3-205/421) MS 198-1 │ │├─ Escherichia coli (3-205/421) FVEC1412 │┌┤├─ Escherichia coli (3-205/421) CFT073 │││├─ Escherichia coli (3-205/421) APEC O1 │││└─ Escherichia coli (3-205/421) ABU 83972 ││└─ Escherichia coli (3-205/421) MS 21-1 └┤ ┌─ Escherichia coli (3-205/420) ED1a │ ┌┴─ Escherichia coli (3-205/420) ED1a │┌┴┬─ Escherichia coli (3-205/420) MS 187-1 ││ └─ Escherichia coli (3-205/420) M718 ││ ┌─ Escherichia coli (3-205/420) B185 └┤ ┌┴─ Escherichia coli (3-205/421) M605 │┌┴─ Escherichia coli (3-205/420) MS 107-1 ││┌─ Escherichia coli (3-205/420) NC101 └┤│ ┌─ Escherichia coli (3-205/420) APEC O1 ││ ├─ Escherichia coli (3-205/421) IAI39 ││ ├─ Escherichia coli (3-205/421) IAI39 └┤ ├─ Escherichia coli (3-205/420) MS 119-7 │┌┼─ Escherichia coli (3-205/420) S88 ││├─ Escherichia coli (3-205/420) IAI39 ││├─ Escherichia coli (3-205/420) IAI39 └┤└─ Escherichia coli (3-205/420) APEC O1 │ ┌─ Escherichia coli (3-205/421) MS 124-1 │┌┴─ Escherichia coli (3-205/421) MS 84-1 ││┌─ Escherichia coli (3-205/420) MS 107-1 └┤│ ┌─ fig|1040638.4.peg.832 O104:H4 (3-205/420) str. LB226692 ││ ├─ Escherichia coli (3-205/420) 55989 └┤┌┼─ Escherichia coli (3-205/227) TA271 ││├─ Escherichia coli (3-205/420) H299 ││└─ Escherichia coli (3-205/420) 55989 └┤ ┌─ Escherichia coli (3-205/420) E24377A │┌┴─ Escherichia coli (3-205/420) E24377A ││┌─ Escherichia coli (3-205/420) 042 ││├─ Escherichia coli (3-205/421) 042 └┤├─ Escherichia coli (3-205/421) 536 │├─ Escherichia coli (3-205/420) 55989 │├─ Escherichia coli (3-205/421) F11 └┼─ Escherichia coli (3-205/421) F11 ├─ Escherichia coli (3-205/420) 55989 ├─ Escherichia coli (3-205/421) 536 ├─ Escherichia coli (3-205/420) 042 ├─ Escherichia coli (3-205/421) 042 └─ fig|1040638.4.peg.2500 O104:H4 (3-205/420) str. LB226692
| Integrase | (206) |
| Phage integrase | (112) |
| Phage integrase, Phage P4-associated | (50) |
| Putative integrase | (36) |
| FIG016809: Prophage P4 integrase | (25) |
| Prophage CP4-57 integrase | (25) |
| COG0582: Integrase | (15) |
| integrase-like protein | (15) |
| phage integrase family protein | (8) |
| Prophage P4 integrase | (6) |
| putative P4-type integrase | (4) |
| Putative prophage Sf6-like integrase | (4) |
| putative prophage integrase | (4) |
| putative integrase prophage protein | (4) |
| prophage P4 integrase | (3) |
| putative integrase | (2) |
| IS, phage, Tn; Phage-related functions and prophages | (2) |
| integrase | (2) |
| Phage Integrase | (2) |
| CPZ-55 prophage; predicted integrase | (2) |
| Others | (17) |