┌─ Escherichia coli (10-291/310) WV_060327 ┌┴─ Escherichia coli (10-291/310) 536 (4) ┌┴─ Escherichia coli (10-291/310) 2362-75 ┌┴─ Escherichia coli (10-291/310) 042 (37) ┌┴┬─ Escherichia coli (10-291/310) MS 185-1 ┌────────────────────────────────────────────────┤ └─ Escherichia coli (10-291/310) 83972 (4) │ └─ Escherichia coli (10-291/310) M605 (1) │ ┌─ Escherichia coli (3-288/297) 042 (50) │ ┌┴─ fig|1040638.4.peg.3641 O104:H4 (3-288/297) str. LB226692 (3) │ ┌┴─ Escherichia coli (3-288/297) KO11 (2) │ ┌┴─ Escherichia coli (3-288/297) EC4100B │ ┌┴┬─ Escherichia coli (3-288/297) O111:H- str. 11128 (1) │ │ └┬─ Escherichia coli (3-288/297) MS 21-1 │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (3-288/297) E22 (2) │ ││ └─ Escherichia coli (3-288/297) B171 (1) │ ┌┤└┬─ Escherichia coli (3-288/297) 53638 (1) │ ││ └─ Escherichia coli (3-288/297) K12 (22) │ ┌┤└─ Escherichia coli (3-288/297) B354 │ │└┬─ Escherichia coli (3-288/297) MS 115-1 │ ┌──────────────────────┤ └─ Escherichia coli (3-288/297) SMS-3-5 │ │ │┌─ Escherichia coli (3-288/297) O83:H1 str. NRG 857C (1) │ │ └┤┌─ Escherichia coli (3-288/297) FVEC1302 (5) │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (3-288/297) E2348/69 (1) │ ┌──────┤ └┬┴─ Escherichia coli (3-288/297) 83972 (12) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (3-288/297) 2362-75 (10) │ │ │ └─ Escherichia coli (3-288/297) ED1a (1) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (32-324/327) 042 (6) │ │ └─────────────────────┤┌─ Escherichia coli (2-294/297) TA280 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (1-293/296) B354 (2) │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (23-315/318) SMS-3-5 │ ┌─────┤ │┌┴─ Escherichia coli (2-290/297) IAI39 (2) │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (2-294/297) B185 │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (1-293/296) B7A (4) │ │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-289/296) B171 (7) │ │ │ └┬┴─ fig|1040638.4.peg.2965 O104:H4 (2-294/297) str. LB226692 (57) ┤ ┌─────────┤ │ └┬─ Escherichia coli (1-293/296) K12 (15) │ │ │ │ └─ Escherichia coli (1-289/296) E22 (1) │ │ │ └───────────────────────────────────────── Escherichia coli (1-287/294) 83972 (19) │ │ │ ┌───────────────────────────────────────────── Escherichia coli (16-297/303) TA143 │ │ └────────┤ ┌─ Escherichia coli (29-307/338) B171 (4) │ │ └────────────────────────┤┌─ Escherichia coli (1-279/310) K12 (7) │ │ └┤ ┌─ fig|6666666.5357.peg.2190 TY-2482 (8-286/317) strain (94) │ │ │┌┴─ Escherichia coli (8-286/317) SE15 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (8-286/317) IAI1 (1) │ │ └┤┌─ Escherichia coli (8-286/317) MS 115-1 │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (8-286/317) E24377A (2) │ │ └┬┴─ Escherichia coli (8-286/317) MS 21-1 │ │ └┬─ Escherichia coli (1-279/310) B354 │ │ └┬─ Escherichia coli (8-286/317) MS 187-1 │ │ └┬─ Escherichia coli (8-286/317) B185 (1) │ │ └┬─ Escherichia coli (25-307/338) 53638 (1) │ │ └─ Escherichia coli (8-286/317) SMS-3-5 │ │ ┌─ Escherichia coli (1-283/293) 2362-75 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-283/293) E2348/69 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-283/293) WV_060327 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-283/293) 536 (22) │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (1-283/293) K12 (18) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-283/293) 1827-70 (4) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-283/293) ETEC H10407 │ │ │└┬─ Escherichia coli (1-283/293) SMS-3-5 │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-283/293) MS 21-1 │ │ │└┬─ Escherichia coli (1-283/293) SE15 │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-283/293) B354 (1) │ │ ││┌─ Escherichia coli (1-283/293) 53638 (1) │ │ │└┤ ┌─ Escherichia coli (1-285/293) EC4100B └───┤ │ │┌┴─ fig|1040638.4.peg.4278 O104:H4 (1-283/293) str. LB226692 (12) │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-283/293) E110019 (8) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-283/293) B7A (2) │ ┌┤ └┬┴─ Escherichia coli (1-285/293) B171 (7) │ ││ └┬─ Escherichia coli (1-283/293) M718 │ ││ └┬─ Escherichia coli (1-283/293) B185 │ ││ └┬─ Escherichia coli (1-283/293) O157:H7 EDL933 (1) │ ┌┤│ └─ Escherichia coli (1-283/293) 1044A (23) │ ││└┬─ Escherichia coli (1-285/291) FVEC1302 (3) │ ┌──────────────────────────┤│ └─ Escherichia coli (1-285/291) MS 69-1 (2) │ │ │└─ Escherichia coli (1-285/291) H299 │ ┌──────────┤ └─ Escherichia coli (1-285/291) 042 (1) │ │ └──────────────────────┬─ Escherichia coli (3-283/293) B354 │ │ └┬─ Escherichia coli (3-283/293) 042 (6) │ │ └┬─ Escherichia coli (3-283/293) K12 (80) │ │ └┬─ Escherichia coli (3-283/293) MS 21-1 │ │ └─ Escherichia coli (3-283/293) O111:H- str. 11128 (1) │ │ ┌─ Escherichia coli (16-308/308) APEC O1 (6) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (16-308/308) E2348/69 (2) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (16-308/308) CFT073 (12) │ │ ┌┴─ Escherichia coli NC101 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli ED1a (1) │ │ │ └─ Escherichia coli H299 (3) │ │ ┌┤ ┌─ Escherichia coli SMS-3-5 │ │ │└┬┴─ Escherichia coli MS 21-1 │ │ │ └┬─ Escherichia coli TA143 │ │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli MS 69-1 │ │ ││ └┬─ Escherichia coli TA280 │ │ ││ └─ Escherichia coli B354 │ │ │└┬─ Escherichia coli FVEC1302 (3) └────┤ ┌┤ └─ Escherichia coli (16-308/308) 042 (1) │ ││ ┌─ Escherichia coli (16-308/308) EC4100B │ ││┌┴─ Escherichia coli K12 (24) │ │└┤ ┌─ fig|1040638.4.peg.3008 O104:H4 str. LB226692 (3) │ │ └┬┴─ Escherichia coli (16-308/308) B7A (10) │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (16-308/308) B171 (15) │ ││ └┬─ Escherichia coli ETEC H10407 │ ││ └┬─ Escherichia coli (16-308/308) B088 │ ││ └─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │ ┌────────────────────────────────┤└┬─ Escherichia coli (16-308/308) 1044A (25) │ │ │ └┬─ Escherichia coli M718 │ │ │ └─ Escherichia coli B185 │ │ └─ Escherichia coli MS 115-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (37-312/323) B354 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (37-312/323) 042 (7) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (37-312/323) TA143 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (37-312/323) IAI39 (2) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (37-312/323) B185 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (37-312/323) 1044A (25) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (37-312/323) H299 └───┤ ┌┤└─ Escherichia coli (37-312/323) 53638 (1) │ │└┬─ Escherichia coli (37-312/323) 2362-75 (2) │ │ └┬─ Escherichia coli (37-312/323) ED1a (3) │ ┌─────────────────────┤ └┬─ Escherichia coli (37-312/323) 83972 (5) │ │ │ └─ Escherichia coli (37-312/323) APEC O1 (7) │ ┌─────┤ └─ Escherichia coli (37-312/323) 1827-70 (4) │ ┌──┤ └──────────────────────── Escherichia coli (1-289/294) O157:H7 str. EC4024 │ │ └──────────────────────────────────┬─ Escherichia coli (2-285/298) B354 │ │ └┬─ Escherichia coli (2-285/298) FVEC1302 (4) │ │ └┬─ Escherichia coli (2-285/298) B185 │ │ └─ Escherichia coli (2-285/298) MS 21-1 └───────────┤ ┌─ Escherichia coli (16-293/294) B354 (8) │ ┌┴─ Escherichia coli (16-293/294) 042 (1) │ ┌┴─ Escherichia coli (16-293/294) B185 │ ┌─┴┬─ Escherichia coli (16-293/294) 1044A (23) │ ┌─────────────────────┤ └─ Escherichia coli (16-293/294) O55:H7 str. CB9615 │ │ └──── Escherichia coli (17-290/295) 101-1 └───┤ ┌─ Escherichia coli (13-291/304) 53638 (1) │ │ ┌─ Escherichia coli (13-291/304) E110019 (1) └─────────────────────┤┌┴─ Escherichia coli (13-291/304) H591 (5) ││ ┌─ Escherichia coli (13-291/304) K12 (18) ││┌┴─ fig|1040638.4.peg.5493 O104:H4 (13-291/304) str. LB226692 (12) └┤│ ┌─ Escherichia coli (13-291/304) 536 (11) ││ ┌┴─ Escherichia coli (13-286/304) APEC O1 (10) ││ ┌┴┬─ Escherichia coli (13-291/304) SE15 └┤ ┌┤ └─ Escherichia coli (13-291/304) M605 │┌┤└─ Escherichia coli (13-291/304) 2362-75 (3) ││└─ Escherichia coli (13-286/304) WV_060327 ││ ┌─ Escherichia coli (13-291/304) O111:H- str. 11128 (1) └┤ ┌┴─ Escherichia coli (13-291/304) B088 │ ┌┴┬─ Escherichia coli (13-291/304) HS (4) │┌┤ └─ Escherichia coli (13-291/304) 101-1 (9) └┤└─ Escherichia coli (13-291/304) M718 │┌─ Escherichia coli (13-291/304) IAI39 (2) └┤┌─ Escherichia coli (13-291/304) B185 └┤ ┌─ Escherichia coli (13-291/304) B354 (2) └┬┴─ Escherichia coli (13-291/304) MS 69-1 └┬─ Escherichia coli (13-291/304) 1044A (24) └┬─ Escherichia coli (13-291/304) 042 (1) └┬─ Escherichia coli (13-291/304) TA280 └─ Escherichia coli (13-291/304) FVEC1302 (4)
| LysR family transcriptional regulator YfiE | (25) |
| LysR family transcriptional regulator YneJ | (24) |
| Transcriptional regulator LysR family, yafC | (22) |
| LysR family transcriptional regulator YnfL | (18) |
| LysR family transcriptional regulator YhjC | (13) |
| LysR family transcriptional regulator YbhD | (12) |
| Hca operon (3-phenylpropionic acid catabolism) transcriptional activator HcaR | (10) |
| Hypothetical lysR-family transcriptional regulator YdhB | (7) |
| Transcriptional regulator, LysR family | (5) |
| LysR family transcriptional regulator YeiE | (5) |
| hypothetical protein | (4) |
| Hypothetical transcriptional regulator yafC | (1) |
| Putative transcriptional regulator LYSR-type | (1) |
| LysR family regulatory protein CidR | (1) |
| Putative LysR-like transcriptional regulator | (1) |
| transcriptional regulator, LysR family | (1) |
| Others | (6) |