┌─ Escherichia coli (20-287/296) 1827-70 ├─ Escherichia coli (20-287/296) 536 ├─ Escherichia coli (20-287/296) 53638 ├─ Escherichia coli (20-287/296) 83972 ├─ Escherichia coli (20-287/296) APEC O1 ├─ Escherichia coli (20-287/296) ATCC 8739 ├─ Escherichia coli (20-287/296) B str. REL606 ├─ Escherichia coli (20-287/296) B7A ├─ Escherichia coli (31-298/307) CFT073 ├─ Escherichia coli (20-287/296) DH1 ├─ Escherichia coli (20-287/296) ED1a ├─ Escherichia coli (20-287/296) ETEC H10407 ├─ Escherichia coli (20-287/296) F11 ├─ Escherichia coli (20-287/296) IAI39 ├─ Escherichia coli (20-287/296) IHE3034 ├─ Escherichia coli (20-287/296) KO11 ├─ Escherichia coli (20-287/296) MS 116-1 ├─ Escherichia coli (20-287/296) MS 145-7 ├─ Escherichia coli (20-287/296) MS 175-1 ├─ Escherichia coli (20-287/296) MS 196-1 ├─ Escherichia coli (20-287/296) MS 21-1 ├─ Escherichia coli (20-287/296) MS 84-1 ├─ Escherichia coli (20-287/296) O127:H6 str. E2348/69 ├─ Escherichia coli (20-287/296) S88 ├─ Escherichia coli (20-287/296) SE15 ├─ Escherichia coli (20-287/296) TA206 ├─ Escherichia coli (20-287/296) UTI89 ├─ Escherichia coli (20-287/296) W3110 ├─ Escherichia coli (20-287/296) str. K-12 substr. DH10B ┌┼─ Escherichia coli (20-287/296) str. K-12 substr. MG1655 │├─ Escherichia coli (20-287/296) str. K-12 substr. MG1655 │├─ Escherichia coli (20-287/296) str. K-12 substr. DH10B │├─ Escherichia coli (20-287/296) UTI89 │├─ Escherichia coli (20-287/296) UM146 │├─ Escherichia coli (20-287/296) SMS-3-5 │├─ Escherichia coli (20-287/296) SE11 │├─ Escherichia coli (20-287/296) O83:H1 str. NRG 857C │├─ Escherichia coli (20-287/296) NC101 │├─ Escherichia coli (20-287/296) MS 45-1 │├─ Escherichia coli (20-287/296) MS 200-1 │├─ Escherichia coli (20-287/296) MS 185-1 │├─ Escherichia coli (20-287/296) MS 146-1 │├─ Escherichia coli (20-287/296) MS 124-1 │├─ Escherichia coli (20-287/296) M605 │├─ Escherichia coli (20-287/296) K12 ┌┤├─ Escherichia coli (20-287/296) IAI39 ││├─ Escherichia coli (20-287/296) H736 ││├─ Escherichia coli (20-287/296) F11 ││├─ Escherichia coli (20-287/296) ED1a ││├─ Escherichia coli (31-298/307) E2348/69 ││├─ Escherichia coli (20-287/296) CFT073 ││├─ Escherichia coli (20-287/296) BW2952 ││├─ Escherichia coli (20-287/296) B7A ││├─ Escherichia coli (20-287/296) ATCC 8739 ││├─ Escherichia coli (20-287/296) APEC O1 ┌┤│├─ Escherichia coli (20-287/296) ABU 83972 │││├─ Escherichia coli (20-287/296) 53638 │││├─ Escherichia coli (20-287/296) 536 │││└─ Escherichia coli (20-287/296) 2362-75 │││┌─ Escherichia coli (20-287/296) BL21 ┌┤││├─ Escherichia coli (20-287/296) MS 187-1 │││└┼─ Escherichia coli (20-287/296) OP50 │││ ├─ Escherichia coli (DE3 20-287/296) BL21(DE3) │││ └─ Escherichia coli (20-287/296) 101-1 ┌───────────────────────────────────────────────────────┤│└─ Escherichia coli (20-287/296) H299 │ │└─ Escherichia coli (20-287/296) WV_060327 │ │┌─ Escherichia coli (20-287/296) B171 │ │├─ Escherichia coli (20-287/296) E22 │ └┼─ Escherichia coli (20-287/296) O103:H2 str. 12009 ┌─┤ ├─ Escherichia coli (20-287/296) E22 │ │ └─ Escherichia coli (20-287/296) B171 │ │ ┌─ Escherichia coli (11-267/287) H299 │ │ ┌───────────────────────────────────────────────────────┼─ Escherichia coli (11-267/287) SMS-3-5 │ │ │ └─ Escherichia coli (11-267/287) M718 │ └─────────┤ ┌─ Escherichia coli (6-255/274) M718 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (6-255/274) H299 │ └────────────────────────────────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (6-255/274) ED1a │ │┌┴─ Escherichia coli (6-255/274) ED1a │ └┤┌─ fig|6666666.5357.peg.3723 TY-2482 (6-255/274) strain │ │├─ Escherichia coli (6-255/274) 55989 │ └┼─ Escherichia coli (6-255/274) SE15 │ ├─ Escherichia coli (6-255/274) 55989 │ └─ fig|1040638.4.peg.657 O104:H4 (6-255/274) str. LB226692 │ ┌─ Escherichia coli (4-284/285) BW2952 │ ├─ Escherichia coli (4-284/285) ETEC H10407 │ ├─ Escherichia coli (4-284/285) K12 │ ├─ Escherichia coli (4-284/285) MS 146-1 │ ├─ Escherichia coli (4-284/285) MS 196-1 │ ├─ Escherichia coli (4-284/285) str. K-12 substr. DH10B │ ├─ Escherichia coli (4-284/285) str. K-12 substr. MG1655 │ ┌┼─ Escherichia coli (4-284/285) str. K-12 substr. MG1655 │ │├─ Escherichia coli (4-284/285) str. K-12 substr. DH10B │ │├─ Escherichia coli (4-284/285) W3110 │ │├─ Escherichia coli (4-284/285) MS 175-1 │ │├─ Escherichia coli (4-284/285) MS 116-1 │ │├─ Escherichia coli (4-284/285) H736 │ ┌┤└─ Escherichia coli (4-284/285) DH1 │ ││ ┌─ Escherichia coli (4-284/285) B7A │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (4-284/285) B7A │ ││┌┴─ fig|6666666.5357.peg.4677 TY-2482 (4-284/285) strain │ │││┌─ Escherichia coli (4-284/285) 55989 │ │└┤├─ Escherichia coli (4-284/285) EC4100B │ │ │├─ Escherichia coli (4-284/285) MS 107-1 │ │ │├─ Escherichia coli (4-284/285) W │ │ └┼─ Escherichia coli (4-284/285) W │ │ ├─ Escherichia coli (4-284/285) MS 145-7 │ ┌┤ ├─ Escherichia coli (4-284/285) KO11 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-284/285) 55989 │ ││ └─ fig|1040638.4.peg.2842 O104:H4 (4-284/285) str. LB226692 │ ││┌─ Escherichia coli (4-284/285) E110019 │ ││├─ Escherichia coli (4-284/285) E24377A │ ││├─ Escherichia coli (4-284/285) H591 │ ││├─ Escherichia coli (4-284/285) IAI1 │ ││├─ Escherichia coli (4-284/285) MS 124-1 │ ││├─ Escherichia coli (4-284/285) SE11 │ │└┼─ Escherichia coli (4-284/285) TA271 │ ┌┤ ├─ Escherichia coli (4-284/285) MS 84-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-284/285) MS 119-7 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-284/285) IAI1 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-284/285) E24377A │ ││ ├─ Escherichia coli (4-284/285) E110019 │ ││ └─ Escherichia coli (4-284/285) B088 │ ││ ┌─ Escherichia coli (4-284/285) MS 182-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-284/285) O111:H- str. 11128 │ ┌┤│┌┼─ Escherichia coli (4-284/285) O26:H11 str. 11368 │ ││└┤└─ Escherichia coli (4-284/285) MS 78-1 │ ││ │┌─ Escherichia coli (4-284/285) MS 187-1 │ ││ └┤┌─ Escherichia coli (4-284/285) B str. REL606 │ ││ │├─ Escherichia coli (DE3 4-284/285) BL21(DE3) │ ││ └┼─ Escherichia coli (4-284/285) OP50 ┤ ┌┤│ ├─ Escherichia coli (4-284/285) BL21 │ │││ └─ Escherichia coli (4-284/285) 101-1 │ ││└┬─ Escherichia coli (4-284/285) ATCC 8739 │ ││ └─ Escherichia coli (4-284/285) ATCC 8739 │ ┌┤│┌─ Escherichia coli (4-284/285) 53638 │ ││└┼─ Escherichia coli (4-284/285) 53638 │ ││ └─ Escherichia coli (4-284/285) 1827-70 │ │└┬─ Escherichia coli (4-284/285) MS 115-1 │ │ └┬─ Escherichia coli (4-284/285) HS │ │ └─ Escherichia coli (4-284/285) HS │ │┌─ Escherichia coli (4-284/285) 1125A │ │├─ Escherichia coli (4-284/285) 536A │ │├─ Escherichia coli (4-284/285) O157:H7 EDL933 │ ┌┤├─ Escherichia coli (4-284/285) O157:H7 str. EC4024 │ ││├─ Escherichia coli (4-284/285) O157:H7 str. EC4045 │ ││├─ Escherichia coli (4-284/285) O157:H7 str. EC4113 │ ││├─ Escherichia coli (4-284/285) O157:H7 str. EC4196 │ ││├─ Escherichia coli (4-284/285) O157:H7 str. EC4401 │ ││├─ Escherichia coli (4-284/285) O157:H7 str. EC4501 │ ││├─ Escherichia coli (4-284/285) O157:H7 str. EC869 │ ││├─ Escherichia coli (4-284/285) O157:H7 str. FRIK966 │ ││├─ Escherichia coli (4-284/285) O157:H7 str. TW14359 │ │└┼─ Escherichia coli (4-284/285) O55:H7 str. CB9615 │ │ ├─ Escherichia coli (4-284/285) O157:H7 str. TW14588 │ │ ├─ Escherichia coli (4-284/285) O157:H7 str. Sakai │ ┌┤ ├─ Escherichia coli (4-284/285) O157:H7 str. FRIK2000 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-284/285) O157:H7 str. EC508 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-284/285) O157:H7 str. EC4486 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-284/285) O157:H7 str. EC4206 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-284/285) O157:H7 str. EC4115 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-284/285) O157:H7 str. EC4076 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-284/285) O157:H7 str. EC4042 │ ┌┤│ ├─ Escherichia coli (4-284/285) O157:H7 EDL933 │ │││ ├─ Escherichia coli (4-284/285) O157:H7 │ │││ ├─ Escherichia coli (4-284/285) 1212A │ │││ └─ Escherichia coli (4-284/285) 1044A │ ││└─ Escherichia coli (4-284/285) M718 │ ││┌─ Escherichia coli (4-284/285) B171 │ ││├─ Escherichia coli (4-284/285) E22 │ ┌┤└┼─ Escherichia coli (4-284/285) O103:H2 str. 12009 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-284/285) E22 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-284/285) B185 │ ││ └─ Escherichia coli (4-284/285) B171 │ ││┌─ Escherichia coli (3-283/284) MS 69-1 │ │││ ┌─ Escherichia coli (4-284/285) IAI39 │ │└┤ ┌┴─ Escherichia coli (4-284/285) IAI39 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (4-284/285) SMS-3-5 │ ┌┤ │┌┴─ Escherichia coli (4-284/285) B354 │ ││ └┤┌─ Escherichia coli (4-284/285) MS 21-1 │ ││ └┤ ┌─ Escherichia coli (4-284/285) 042 │ ││ │┌┴─ Escherichia coli (4-284/285) 042 │ ││ └┤┌─ Escherichia coli (4-284/285) FVEC1412 │ ┌──────────────────────────────┤│ └┼─ Escherichia coli (4-284/285) UMN026 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (4-284/285) MS 198-1 │ │ ││ └─ Escherichia coli (4-284/285) FVEC1302 │ │ │└─ Escherichia coli (3-283/284) H299 │ │ └─ Escherichia coli (4-284/285) TA280 │ │ ┌─ Escherichia coli M718 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (25-306/306) 042 │ │ │ ├─ Escherichia coli (25-306/306) TA280 │ │ │ ├─ Escherichia coli 2362-75 └───────────────────┤ │ ├─ Escherichia coli ABU 83972 │ │ ├─ Escherichia coli H299 │ │ ├─ Escherichia coli IAI39 │ │ ├─ Escherichia coli MS 185-1 │ │ ├─ Escherichia coli SE15 │ │ ┌┼─ Escherichia coli WV_060327 │ │ │├─ Escherichia coli MS 45-1 │ │ │├─ Escherichia coli M605 │ │ │├─ Escherichia coli IAI39 │ │┌┤├─ Escherichia coli CFT073 └────────────────────────────────────────┤││├─ Escherichia coli 83972 │││├─ Escherichia coli 042 │││└─ Escherichia coli (25-306/306) CFT073 ││└┬─ Escherichia coli NC101 ││ └┬─ Escherichia coli (25-306/306) O127:H6 str. E2348/69 ││ └─ Escherichia coli (25-306/306) E2348/69 ││ ┌─ Escherichia coli (25-306/306) APEC O1 ││ ├─ Escherichia coli (25-306/306) UM146 ││ ├─ Escherichia coli 536 ││ ├─ Escherichia coli ED1a ││ ├─ Escherichia coli F11 ││ ├─ Escherichia coli MS 200-1 ││ ├─ Escherichia coli S88 ││ ├─ Escherichia coli UTI89 └┤ ┌┼─ Escherichia coli UTI89 │ │├─ Escherichia coli TA206 │ │├─ Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C │ │├─ Escherichia coli IHE3034 │ │├─ Escherichia coli ED1a │ │├─ Escherichia coli APEC O1 │ │├─ Escherichia coli 536 │┌┤└─ Escherichia coli (25-306/306) F11 │││┌─ Escherichia coli (25-306/306) B7A │││├─ Escherichia coli (25-306/306) E22 │││├─ Escherichia coli B171 │││├─ Escherichia coli E110019 │││├─ Escherichia coli E24377A ││└┼─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 ││ ├─ Escherichia coli MS 145-7 ││ ├─ Escherichia coli E22 └┤ ├─ Escherichia coli B7A │ ├─ Escherichia coli (25-306/306) E24377A │ ├─ Escherichia coli (25-306/306) E110019 │ └─ Escherichia coli (25-306/306) B171 │┌─ Escherichia coli ETEC H10407 ││ ┌─ Escherichia coli IAI1 ││ ┌┴─ Escherichia coli IAI1 ││┌┴─ Escherichia coli EC4100B │││ ┌─ Escherichia coli (25-306/306) ATCC 8739 │││┌┴─ Escherichia coli ATCC 8739 └┤││┌─ Escherichia coli (25-306/306) B088 │││├─ Escherichia coli (25-306/306) K12 │││├─ Escherichia coli (25-306/306) O157:H7 EDL933 │││├─ Escherichia coli (25-306/306) MS 69-1 │││├─ fig|6666666.5357.peg.2629 TY-2482 strain │││├─ Escherichia coli 1044A │││├─ Escherichia coli 1212A └┤│├─ Escherichia coli 53638 ││├─ Escherichia coli 55989 ││├─ Escherichia coli B str. REL606 ││├─ Escherichia coli B354 ││├─ Escherichia coli (DE3) BL21(DE3) ││├─ Escherichia coli DH1 ││├─ Escherichia coli FVEC1412 ││├─ Escherichia coli H736 ││├─ Escherichia coli KO11 ││├─ Escherichia coli MS 115-1 ││├─ Escherichia coli MS 119-7 └┤├─ Escherichia coli MS 146-1 │├─ Escherichia coli MS 187-1 │├─ Escherichia coli MS 198-1 │├─ Escherichia coli MS 78-1 │├─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 │├─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │├─ Escherichia coli SE11 │├─ Escherichia coli TA143 │├─ Escherichia coli UMN026 │├─ Escherichia coli W │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B └┼─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 ├─ Escherichia coli W3110 ├─ Escherichia coli W ├─ Escherichia coli TA271 ├─ Escherichia coli SMS-3-5 ├─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai ├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4486 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli MS 84-1 ├─ Escherichia coli MS 21-1 ├─ Escherichia coli MS 196-1 ├─ Escherichia coli MS 182-1 ├─ Escherichia coli MS 124-1 ├─ Escherichia coli MS 116-1 ├─ Escherichia coli MS 107-1 ├─ Escherichia coli HS ├─ Escherichia coli H591 ├─ Escherichia coli FVEC1302 ├─ Escherichia coli BW2952 ├─ Escherichia coli BL21 ├─ Escherichia coli B185 ├─ Escherichia coli 55989 ├─ Escherichia coli 536A ├─ Escherichia coli 1827-70 ├─ Escherichia coli 1125A ├─ Escherichia coli 101-1 ├─ fig|1040638.4.peg.2991 O104:H4 str. LB226692 ├─ Escherichia coli (25-306/306) str. K-12 substr. DH10B ├─ Escherichia coli (25-306/306) O157:H7 ├─ Escherichia coli (25-306/306) HS └─ Escherichia coli (25-306/306) 53638
| Putative transcriptional regulator | (126) |
| Sialic acid utilization regulator, RpiR family | (85) |
| Transcriptional regulator of D-allose utilization, RpiR family | (70) |
| Transcriptional regulator, RpiR family | (19) |
| RpiR family transcriptional regulator | (7) |
| hypothetical protein | (5) |
| Transcriptional regulator | (1) |
| Others | (6) |