┌─ Escherichia coli (21-63/75) 1125A ├─ Escherichia coli (21-63/75) O157:H7 ├─ Escherichia coli (21-63/75) O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli (21-63/75) O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli (21-63/75) O157:H7 str. EC4486 ├─ Escherichia coli (21-63/75) O103:H2 str. 12009 ├─ Escherichia coli (21-63/75) O26:H11 str. 11368 ├─ Escherichia coli (1-43/55) 1212A ├─ Escherichia coli (1-43/55) 536A ├─ Escherichia coli (1-43/55) E110019 ├─ Escherichia coli (1-43/55) O111:H- str. 11128 ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. EC4024 ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. EC4042 ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. EC4045 ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. EC4076 ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. EC4113 ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. EC4115 ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. EC4196 ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. EC4196 ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. EC4206 ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. EC4401 ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. EC4501 ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. EC508 ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. EC508 ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. EC869 ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. Sakai ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. TW14359 ┌────────────────────────────────────────────┼─ Escherichia coli (1-43/55) O55:H7 str. CB9615 │ ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. TW14359 │ ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. Sakai │ ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. Sakai │ ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. EC508 │ ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. EC508 │ ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. EC508 │ ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. EC4401 │ ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. EC4401 │ ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. EC4206 │ ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. EC4196 │ ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. EC4115 │ ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. EC4113 │ ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. EC4113 │ ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. EC4076 │ ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. EC4045 │ ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. EC4042 │ ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 str. EC4024 │ ├─ Escherichia coli (1-43/55) O157:H7 EDL933 ┌──────────┤ ├─ Escherichia coli (1-43/55) O111:H- str. 11128 │ │ ├─ Escherichia coli (1-43/55) O111:H- str. 11128 │ │ ├─ Escherichia coli (1-43/55) 536A │ │ ├─ Escherichia coli (1-43/55) 1212A │ │ ├─ Escherichia coli (1-43/55) 1044A │ │ ├─ Escherichia coli (21-63/75) O157:H7 str. EC869 │ │ ├─ Escherichia coli (21-63/75) E110019 │ │ ├─ Escherichia coli (21-63/75) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (21-63/75) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (21-63/75) O157:H7 │ │ └─ Escherichia coli (21-63/75) O157:H7 │ │┌─ Escherichia coli (21-52/61) O103:H2 str. 12009 │ ││ ┌─ Escherichia coli (21-52/61) E22 │ ││ ├─ Escherichia coli (21-52/61) S88 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-32/41) MS 21-1 │ ││┌────┼─ Escherichia coli (21-52/61) EC4100B │ │││ ├─ Escherichia coli (1-32/41) MS 145-7 │ │││ └─ Escherichia coli (21-52/61) O55:H7 str. CB9615 │ │││ ┌─ Escherichia coli (21-62/66) ED1a │ └┤│ ├─ Escherichia coli (21-62/66) ED1a │ ││ ├─ Escherichia coli (21-62/66) ED1a │ ││ ┌┼─ Escherichia coli (21-62/66) ED1a │ ││ │├─ Escherichia coli (21-62/66) ED1a │ ││ │└─ Escherichia coli (21-62/66) ED1a │ ││ ┌──┤┌─ Escherichia coli (21-56/66) 83972 │ ││ │ │├─ Escherichia coli (21-56/66) E2348/69 │ ││ │ └┼─ Escherichia coli (41-76/86) O127:H6 str. E2348/69 │ ││ │ ├─ Escherichia coli (21-56/66) ABU 83972 │ └┤ │ └─ Escherichia coli (21-56/66) 2362-75 │ │ ┌──┤ ┌─ Escherichia coli (21-56/66) E110019 │ │ │ │ ┌───┴─ Escherichia coli (21-56/66) E110019 │ │ │ │┌┴──── Escherichia coli (21-56/66) O55:H7 str. CB9615 │ │ │ ││┌─ Escherichia coli (21-56/66) E22 │ │ │ └┤├─ Escherichia coli (21-56/66) O111:H- str. 11128 │ │ │ │├─ Escherichia coli (21-56/66) O157:H7 str. EC4501 │ │ ┌──────────────────┤ └┼─ Escherichia coli (21-56/66) O157:H7 str. TW14588 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (21-56/66) O157:H7 EDL933 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (21-56/66) E22 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (21-56/66) E110019 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-42/46) B171 │ │ │ └──────────┬──┴─ Escherichia coli (1-42/46) B171 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-42/46) E2348/69 │ └─────────────┤ └─ Escherichia coli (1-42/46) 2362-75 │ │┌───── Escherichia coli (21-53/61) O26:H11 str. 11368 │ ││┌─ Escherichia coli (21-53/61) 1125A │ ││├─ Escherichia coli (21-53/61) 536A │ ││├─ Escherichia coli (21-53/61) O157:H7 str. EC4024 │ ││├─ Escherichia coli (21-53/61) O157:H7 str. EC4045 │ ││├─ Escherichia coli (21-53/61) O157:H7 str. EC4113 │ └┤├─ Escherichia coli (21-53/61) O157:H7 str. EC4196 │ │├─ Escherichia coli (21-53/61) O157:H7 str. EC4401 │ │├─ Escherichia coli (21-53/61) O157:H7 str. EC4501 │ │├─ Escherichia coli (21-53/61) O157:H7 str. TW14359 │ │├─ Escherichia coli (21-53/61) EC4100B ┤ │├─ Escherichia coli (21-53/61) O157:H7 str. EC869 │ │├─ Escherichia coli (21-53/61) O157:H7 str. FRIK966 │ └┼─ Escherichia coli (21-53/61) E110019 │ ├─ Escherichia coli (21-53/61) O157:H7 str. FRIK2000 │ ├─ Escherichia coli (21-53/61) O103:H2 str. 12009 │ ├─ Escherichia coli (21-53/61) O157:H7 str. TW14588 │ ├─ Escherichia coli (21-53/61) O157:H7 str. Sakai │ ├─ Escherichia coli (21-53/61) O157:H7 str. EC4486 │ ├─ Escherichia coli (21-53/61) O157:H7 str. EC4206 │ ├─ Escherichia coli (21-53/61) O157:H7 str. EC4115 │ ├─ Escherichia coli (21-53/61) O157:H7 str. EC4076 │ ├─ Escherichia coli (21-53/61) O157:H7 str. EC4042 │ ├─ Escherichia coli (21-53/61) O157:H7 │ ├─ Escherichia coli (21-53/61) 1212A │ └─ Escherichia coli (21-53/61) 1044A │ ┌─ Escherichia coli (21-53/77) CFT073 │ ├─ Escherichia coli (21-53/77) H591 │ ├─ Escherichia coli (1-33/57) FVEC1412 │ ├─ Escherichia coli (1-33/57) MS 45-1 │ ├─ fig|1040638.4.peg.4845 O104:H4 (1-33/57) str. LB226692 │ ├─ Escherichia coli (1-33/57) 55989 │ ┌┼─ Escherichia coli (1-33/57) MS 145-7 │ │├─ Escherichia coli (1-33/57) E24377A │ │├─ Escherichia coli (1-33/57) 55989 │ │├─ Escherichia coli (1-33/57) UMN026 │ ┌───────────────────┤├─ Escherichia coli (1-33/57) MS 187-1 │ │ │├─ Escherichia coli (1-33/57) FVEC1302 │ │ │└─ Escherichia coli (21-53/77) CFT073 │ │ └─ fig|1040638.4.peg.292 O104:H4 str. LB226692 │ │ ┌─ Escherichia coli (21-53/64) O103:H2 str. 12009 │ │ ├─ Escherichia coli (21-53/64) MS 124-1 │ │ ├─ Escherichia coli (21-53/64) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (21-53/64) O157:H7 str. EC4024 │ │ ├─ Escherichia coli (21-53/64) O157:H7 str. EC4045 │ │ ├─ Escherichia coli (21-53/64) O157:H7 str. EC4113 │ │ ├─ Escherichia coli (21-53/64) O157:H7 str. EC4196 │ │ ├─ Escherichia coli (21-53/64) O157:H7 str. EC4401 │ │ ├─ Escherichia coli (21-53/64) O157:H7 str. EC4501 │ │ ├─ Escherichia coli (21-53/64) O157:H7 str. EC869 │ │ ├─ Escherichia coli (21-53/64) O157:H7 str. TW14359 │ │ ├─ Escherichia coli (1-33/44) E22 │ │ ├─ Escherichia coli (1-33/44) 1125A │ │ ├─ Escherichia coli (1-33/44) 536A │ │ ├─ Escherichia coli (1-33/44) MS 84-1 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (1-33/43) TA143 │ │ │├─ Escherichia coli (1-33/44) MS 182-1 │ │ │├─ Escherichia coli (1-33/44) 1212A │ │ │├─ Escherichia coli (1-33/44) 1044A │ │ │├─ Escherichia coli (21-53/64) O157:H7 str. TW14588 │ │ │├─ Escherichia coli (21-53/64) O157:H7 str. Sakai │ │ │├─ Escherichia coli (21-53/64) O157:H7 str. EC508 │ │ │├─ Escherichia coli (21-53/64) O157:H7 str. EC4486 │ │ │├─ Escherichia coli (21-53/64) O157:H7 str. EC4206 │ │ │├─ Escherichia coli (21-53/64) O157:H7 str. EC4115 │ │ │├─ Escherichia coli (21-53/64) O157:H7 str. EC4076 └──────┤ │├─ Escherichia coli (21-53/64) O157:H7 str. EC4042 │ │├─ Escherichia coli (21-53/64) O157:H7 EDL933 │ │├─ Escherichia coli (21-53/64) O157:H7 │ │└─ Escherichia coli (21-53/64) B171 │ │ ┌─ Escherichia coli (1-33/54) O111:H- str. 11128 │ │ ├─ Escherichia coli (21-53/74) O157:H7 │ │ ├─ Escherichia coli (21-53/74) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (1-33/54) 1044A │ │ ├─ Escherichia coli (1-33/54) 1212A │ │ ├─ Escherichia coli (1-33/54) O111:H- str. 11128 │ │ ├─ Escherichia coli (1-33/54) O157:H7 str. EC4042 │ │ ├─ Escherichia coli (1-33/54) O157:H7 str. EC4076 │ │ ├─ Escherichia coli (1-33/54) O157:H7 str. EC4115 │ │ ├─ Escherichia coli (1-33/54) O157:H7 str. EC4206 │ │ ├─ Escherichia coli (1-33/54) O157:H7 str. EC869 │ │ ├─ Escherichia coli (1-33/54) O157:H7 str. TW14359 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (1-33/54) O157:H7 str. TW14588 │ │ │├─ Escherichia coli (1-33/54) O157:H7 str. Sakai │ │ │├─ Escherichia coli (1-33/54) O157:H7 str. EC508 │ │ │├─ Escherichia coli (1-33/54) O157:H7 str. EC4196 │ │ │├─ Escherichia coli (1-33/54) O157:H7 str. EC4113 │ │ │├─ Escherichia coli (1-33/54) O157:H7 str. EC4045 │ │ │├─ Escherichia coli (1-33/54) O157:H7 str. EC4024 │ │ │├─ Escherichia coli (1-33/54) 536A │ │ ┌────┤├─ Escherichia coli (1-33/54) 1125A │ │ │ │├─ Escherichia coli (21-53/74) O157:H7 str. EC4501 │ │ │ │├─ Escherichia coli (21-53/74) O157:H7 str. EC4401 │ │ │ │└─ Escherichia coli (1-33/54) O26:H11 str. 11368 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (21-53/74) B171 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (21-53/74) O103:H2 str. 12009 └───────────────────┤ │ │ ├─ Escherichia coli (21-53/74) O26:H11 str. 11368 │ │ └────┼─ Escherichia coli (19-51/72) WV_060327 │ │ ├─ Escherichia coli (21-53/74) O103:H2 str. 12009 │ ┌┤ ├─ Escherichia coli (21-53/74) B171 │ ││ └─ Escherichia coli (21-53/74) E110019 │ ││┌─ Escherichia coli (1-45/54) O55:H7 str. CB9615 │ │││┌─ Escherichia coli (21-53/74) O157:H7 EDL933 │ │││├─ Escherichia coli (21-53/74) O157:H7 str. EC4501 │ │││├─ Escherichia coli (1-33/54) 1125A │ │││├─ Escherichia coli (1-33/54) 536A │ │││├─ Escherichia coli (1-33/54) O157:H7 EDL933 │ │└┤├─ Escherichia coli (1-33/54) O157:H7 str. EC4042 │ │ │├─ Escherichia coli (1-33/54) O157:H7 str. EC4076 │ │ │├─ Escherichia coli (1-33/54) O157:H7 str. EC4115 │ │ │├─ Escherichia coli (1-33/54) O157:H7 str. EC4206 │ │ │├─ Escherichia coli (1-33/54) O157:H7 str. EC508 │ │ │├─ Escherichia coli (1-33/54) O157:H7 str. Sakai │┌──────────────────────────────┤ │├─ Escherichia coli (1-33/54) O157:H7 str. TW14588 ││ │ └┼─ Escherichia coli (1-33/54) O26:H11 str. 11368 ││ │ ├─ Escherichia coli (1-33/54) O157:H7 str. TW14359 ││ │ ├─ Escherichia coli (1-33/54) O157:H7 str. EC869 ││ │ ├─ Escherichia coli (1-33/54) O157:H7 str. EC4401 ││ │ ├─ Escherichia coli (1-33/54) O157:H7 str. EC4196 ││ │ ├─ Escherichia coli (1-33/54) O157:H7 str. EC4113 ││ │ ├─ Escherichia coli (1-33/54) O157:H7 str. EC4045 ││ │ ├─ Escherichia coli (1-33/54) O157:H7 str. EC4024 ││ │ ├─ Escherichia coli (1-33/54) E22 ││ │ ├─ Escherichia coli (1-33/54) 1212A ││ │ ├─ Escherichia coli (1-33/54) 1044A ││ │ ├─ Escherichia coli (21-53/74) O157:H7 str. EC4486 ││ │ └─ Escherichia coli (21-53/74) O55:H7 str. CB9615 ││ └────┬─ Escherichia coli (21-53/74) O26:H11 str. 11368 ││ └─ Escherichia coli (21-53/74) O103:H2 str. 12009 ││ ┌─ Escherichia coli (21-63/77) 042 ││ ├─ Escherichia coli (21-63/77) BW2952 ││ ├─ Escherichia coli (21-63/77) str. K-12 substr. DH10B ││ ├─ Escherichia coli (1-43/57) 101-1 ││ ├─ Escherichia coli (1-43/57) DH1 ││ ├─ Escherichia coli (1-43/57) IAI1 ││ ├─ Escherichia coli (1-43/57) IAI39 ││ ├─ Escherichia coli (1-43/57) KO11 ││ ├─ Escherichia coli (1-43/57) MS 146-1 └┤ ├─ Escherichia coli (1-43/57) W │ ├─ Escherichia coli (1-43/57) str. K-12 substr. DH10B │ ┌┼─ Escherichia coli (1-43/57) str. K-12 substr. MG1655 │ │├─ Escherichia coli (1-43/57) str. K-12 substr. MG1655 │ │├─ Escherichia coli (1-43/57) W │ │├─ Escherichia coli (1-43/57) TA271 │ │├─ Escherichia coli (1-43/57) MS 115-1 │ │├─ Escherichia coli (1-43/57) IAI39 │ │├─ Escherichia coli (1-43/57) IAI1 │ ┌───────────┤├─ Escherichia coli (1-43/57) H736 │ │ │├─ Escherichia coli (1-43/57) ATCC 8739 │ │ │├─ Escherichia coli (1-43/57) 042 │ │ │├─ Escherichia coli (21-63/77) W3110 │ │ │└─ Escherichia coli (21-63/77) ATCC 8739 │ │ │ ┌───── Escherichia coli (21-53/77) B171 │ │ │ │┌─ Escherichia coli (21-53/77) 042 │ │ └────┤├─ Escherichia coli (21-53/77) IHE3034 │ │ │├─ Escherichia coli (21-53/77) UM146 │ │ └┼─ Escherichia coli (21-53/77) UTI89 │ │ ├─ Escherichia coli (21-53/77) UTI89 │ │ ├─ Escherichia coli (21-53/77) S88 │ │ ├─ Escherichia coli (21-53/77) APEC O1 │ │ └─ Escherichia coli (21-53/77) 042 │ │┌─ Escherichia coli (21-53/64) B185 │ │├─ Escherichia coli (21-53/64) E110019 │ │├─ Escherichia coli (21-53/64) E22 └────────┤├─ Escherichia coli (21-53/64) IAI1 │├─ Escherichia coli (21-53/64) O127:H6 str. E2348/69 │├─ Escherichia coli (21-53/64) O26:H11 str. 11368 │├─ Escherichia coli (21-53/64) O55:H7 str. CB9615 │├─ Escherichia coli (19-51/62) WV_060327 │├─ Escherichia coli (21-53/64) O26:H11 str. 11368 │├─ Escherichia coli (21-53/64) 101-1 │├─ Escherichia coli (21-53/64) BL21 │├─ Escherichia coli (21-53/64) TA280 │├─ Escherichia coli (21-53/64) BL21 │├─ Escherichia coli (21-53/64) BW2952 │├─ Escherichia coli (21-53/64) str. K-12 substr. DH10B │├─ Escherichia coli (21-53/64) FVEC1302 │├─ Escherichia coli (21-53/64) M718 │├─ Escherichia coli (1-33/44) DH1 │├─ Escherichia coli (1-33/44) str. K-12 substr. DH10B │├─ Escherichia coli (1-33/44) str. K-12 substr. MG1655 └┼─ Escherichia coli (1-33/44) str. K-12 substr. MG1655 ├─ Escherichia coli (1-33/44) str. K-12 substr. DH10B ├─ Escherichia coli (1-33/44) EC4100B ├─ Escherichia coli (21-53/64) UMN026 ├─ Escherichia coli (21-53/64) FVEC1412 ├─ Escherichia coli (21-53/64) str. K-12 substr. DH10B ├─ Escherichia coli (21-53/64) BW2952 ├─ Escherichia coli (DE3 21-53/64) BL21(DE3) ├─ Escherichia coli (21-53/64) B171 ├─ Escherichia coli (DE3 21-53/64) BL21(DE3) ├─ Escherichia coli (21-53/64) B str. REL606 ├─ Escherichia coli (21-53/64) O26:H11 str. 11368 ├─ Escherichia coli (21-53/64) O103:H2 str. 12009 ├─ Escherichia coli (21-53/64) SE11 ├─ Escherichia coli (21-53/64) O26:H11 str. 11368 ├─ Escherichia coli (21-53/64) O26:H11 str. 11368 ├─ Escherichia coli (21-53/64) IAI1 ├─ Escherichia coli (21-53/64) E2348/69 ├─ Escherichia coli (21-53/64) E22 ├─ Escherichia coli (21-53/64) B7A └─ Escherichia coli (21-53/64) B088
| hypothetical protein | (227) |
| unknown protein encoded within prophage CP-933V | (54) |
| unknown protein encoded by cryptic prophage CP-933P | (1) |
| FIG00088145: hypothetical protein | (1) |
| unknown protein encoded by prophage CP-933X | (1) |
| unknown protein encoded within prophage CP-933R | (1) |
| unknown protein encoded by cryptic prophage CP-933M | (1) |
| Others | (7) |