┌─ Escherichia coli (19-280/281) 2362-75 ├─ Escherichia coli (19-280/281) 536 ├─ Escherichia coli (19-280/281) APEC O1 ├─ Escherichia coli (19-280/281) F11 ├─ Escherichia coli (19-280/281) H299 ├─ Escherichia coli (19-280/281) MS 200-1 ├─ Escherichia coli (19-280/281) O127:H6 str. E2348/69 ├─ Escherichia coli (19-280/281) TA206 ┌┼─ Escherichia coli (19-280/281) UTI89 │├─ Escherichia coli (19-280/281) UTI89 │├─ Escherichia coli (19-280/281) O83:H1 str. NRG 857C │├─ Escherichia coli (19-280/281) MS 69-1 │├─ Escherichia coli (19-280/281) IHE3034 │├─ Escherichia coli (19-280/281) F11 ┌┤├─ Escherichia coli (19-280/281) E2348/69 ││├─ Escherichia coli (19-280/281) APEC O1 ││└─ Escherichia coli (19-280/281) 536 ││ ┌─ Escherichia coli (19-280/281) M605 ││┌┼─ Escherichia coli (19-280/281) SE15 │││└─ Escherichia coli (19-280/281) NC101 │└┤ ┌─ Escherichia coli (19-280/281) 83972 │ │┌┴─ Escherichia coli (19-280/281) ABU 83972 ┌──────────────────────────────────────────────────────────┤ ││┌─ Escherichia coli (19-280/281) CFT073 │ │ └┤├─ Escherichia coli (19-280/281) ED1a │ │ │├─ Escherichia coli (19-280/281) MS 45-1 │ │ └┼─ Escherichia coli (19-280/281) WV_060327 │ │ ├─ Escherichia coli (19-280/281) MS 185-1 ┌───┤ │ ├─ Escherichia coli (19-280/281) ED1a │ │ │ └─ Escherichia coli (19-280/281) CFT073 │ │ └─ Escherichia coli (19-280/281) S88 │ │ ┌─ Escherichia coli (8-269/274) M718 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (8-269/274) H299 │ └───────────────────────────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (8-255/274) ED1a │ │┌┴─ Escherichia coli (8-255/274) ED1a │ └┤┌─ fig|6666666.5357.peg.3723 TY-2482 (8-255/274) strain │ │├─ Escherichia coli (8-255/274) 55989 │ └┼─ Escherichia coli (8-255/274) SE15 │ ├─ Escherichia coli (8-255/274) 55989 │ └─ fig|1040638.4.peg.657 O104:H4 (8-255/274) str. LB226692 │ ┌────────────────────────────────────────── Escherichia coli (9-285/285) O157:H7 str. EC4024 │ │ ┌─ Escherichia coli (18-268/287) H299 │ │ ┌────────────────────────────────────────────────┼─ Escherichia coli (18-268/287) SMS-3-5 │ │ │ └─ Escherichia coli (18-268/287) M718 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (28-272/296) 1827-70 │ │ │ ├─ Escherichia coli (28-272/296) 536 │ │ │ ├─ Escherichia coli (28-272/296) 53638 │ │ │ ├─ Escherichia coli (28-272/296) 83972 │ │ │ ├─ Escherichia coli (28-272/296) APEC O1 ┤ │ │ ├─ Escherichia coli (28-272/296) ATCC 8739 │ │ │ ├─ Escherichia coli (28-272/296) B str. REL606 │ │ │ ├─ Escherichia coli (28-272/296) B7A │ │ │ ├─ Escherichia coli (39-283/307) CFT073 │ │ │ ├─ Escherichia coli (28-272/296) DH1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (28-272/296) ED1a │ │ │ ├─ Escherichia coli (28-272/296) ETEC H10407 │ │ │ ├─ Escherichia coli (28-272/296) F11 │ │ │ ├─ Escherichia coli (28-272/296) IAI39 │ │ │ ├─ Escherichia coli (28-272/296) IHE3034 │ │ │ ├─ Escherichia coli (28-272/296) KO11 │ │ │ ├─ Escherichia coli (28-272/296) MS 116-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (28-272/296) MS 145-7 │ │ │ ├─ Escherichia coli (28-272/296) MS 175-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (28-272/296) MS 196-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (28-272/296) MS 21-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (28-272/296) MS 84-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (28-272/296) O127:H6 str. E2348/69 │ │ │ ├─ Escherichia coli (28-272/296) S88 │ │ │ ├─ Escherichia coli (28-272/296) SE15 │ │ │ ├─ Escherichia coli (28-272/296) TA206 │ │ │ ├─ Escherichia coli (28-272/296) UTI89 └─┤ │ ├─ Escherichia coli (28-272/296) W3110 │ │ ├─ Escherichia coli (28-272/296) str. K-12 substr. DH10B │ │ ┌┼─ Escherichia coli (28-272/296) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │├─ Escherichia coli (28-272/296) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │├─ Escherichia coli (28-272/296) str. K-12 substr. DH10B │ │ │├─ Escherichia coli (28-272/296) UTI89 │ │ │├─ Escherichia coli (28-272/296) UM146 │ │ │├─ Escherichia coli (28-272/296) SMS-3-5 │ │ │├─ Escherichia coli (28-272/296) SE11 │ │ │├─ Escherichia coli (28-272/296) O83:H1 str. NRG 857C │ │ │├─ Escherichia coli (28-272/296) NC101 │ │ │├─ Escherichia coli (28-272/296) MS 45-1 │ │ │├─ Escherichia coli (28-272/296) MS 200-1 │ │ │├─ Escherichia coli (28-272/296) MS 185-1 │ │ │├─ Escherichia coli (28-272/296) MS 146-1 │ │ │├─ Escherichia coli (28-272/296) MS 124-1 │ │ │├─ Escherichia coli (28-272/296) M605 │ │ │├─ Escherichia coli (28-272/296) K12 │ │ │├─ Escherichia coli (28-272/296) IAI39 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (28-272/296) H736 │ │ ││├─ Escherichia coli (28-272/296) F11 │ │ ││├─ Escherichia coli (28-272/296) ED1a │ │ ││├─ Escherichia coli (39-283/307) E2348/69 │ │ ││├─ Escherichia coli (28-272/296) CFT073 │ │ ││├─ Escherichia coli (28-272/296) BW2952 │ │ ││├─ Escherichia coli (28-272/296) B7A │ │ ││├─ Escherichia coli (28-272/296) ATCC 8739 │ │ ││├─ Escherichia coli (28-272/296) APEC O1 │ │ ││├─ Escherichia coli (28-272/296) ABU 83972 │ │ ││├─ Escherichia coli (28-272/296) 53638 │ │ ││├─ Escherichia coli (28-272/296) 536 └─┤ ┌─────────────────────────────────────────────┤│└─ Escherichia coli (28-272/296) 2362-75 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (28-272/296) 101-1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (DE3 28-272/296) BL21(DE3) │ │ ││┌┼─ Escherichia coli (28-272/296) OP50 │ │ │││├─ Escherichia coli (28-272/296) MS 187-1 │ │ │└┤└─ Escherichia coli (28-272/296) BL21 │ │ │ │┌─ Escherichia coli (28-272/296) H299 │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (28-272/296) B171 │ │ │ │├─ Escherichia coli (28-272/296) E22 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (28-272/296) O103:H2 str. 12009 │ │ │ ├─ Escherichia coli (28-272/296) E22 │ │ │ └─ Escherichia coli (28-272/296) B171 │ │ └─ Escherichia coli (28-272/296) WV_060327 │ │ ┌─ Escherichia coli B088 │ │ ├─ Escherichia coli E110019 │ │ ├─ Escherichia coli E24377A │ │ ├─ Escherichia coli IAI1 │ │ ├─ Escherichia coli MS 119-7 │ │ ├─ Escherichia coli MS 84-1 │ │ ┌┼─ Escherichia coli TA271 │ │ │├─ Escherichia coli SE11 │ │ │├─ Escherichia coli MS 124-1 │ │ │├─ Escherichia coli IAI1 │ │ │├─ Escherichia coli H591 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli E24377A │ │ ││└─ Escherichia coli E110019 │ │ ││┌─ fig|6666666.5357.peg.4677 TY-2482 strain │ │ │││ ┌─ Escherichia coli B7A │ │ │└┤┌┴─ Escherichia coli B7A │ │ │ ││┌─ Escherichia coli 55989 │ │ │ └┤├─ Escherichia coli EC4100B │ │ │ │├─ Escherichia coli MS 107-1 │ │ │ │├─ Escherichia coli W │ │ │ └┼─ Escherichia coli W │ │ ┌┤ ├─ Escherichia coli MS 145-7 │ │ ││ ├─ Escherichia coli KO11 │ │ ││ ├─ Escherichia coli 55989 │ │ ││ └─ fig|1040638.4.peg.2842 O104:H4 str. LB226692 │ │ ││┌─ Escherichia coli DH1 │ │ ││├─ Escherichia coli H736 │ │ ││├─ Escherichia coli MS 116-1 │ │ ││├─ Escherichia coli MS 175-1 │ │ ││├─ Escherichia coli W3110 │ │ ││├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B │ │ │└┼─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │ │ ┌┤ ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │ │ ││ ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B │ │ ││ ├─ Escherichia coli MS 196-1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli MS 146-1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli K12 │ │ ││ ├─ Escherichia coli ETEC H10407 │ │ ││ └─ Escherichia coli BW2952 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli MS 182-1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │ │ ││┌┼─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │ │ ┌┤└┤└─ Escherichia coli MS 78-1 │ │ ││ │┌─ Escherichia coli MS 187-1 │ │ ││ └┤┌─ Escherichia coli B str. REL606 │ │ ││ │├─ Escherichia coli (DE3) BL21(DE3) │ │ ││ └┼─ Escherichia coli OP50 │ │ ││ ├─ Escherichia coli BL21 └──┤ ││ └─ Escherichia coli 101-1 │ ││ ┌─ Escherichia coli ATCC 8739 │ ││┌┴─ Escherichia coli ATCC 8739 │ ┌┤└┤┌─ Escherichia coli 53638 │ ││ └┼─ Escherichia coli 53638 │ ││ └─ Escherichia coli 1827-70 │ ││┌─ Escherichia coli M718 │ │││┌─ Escherichia coli 1125A │ │││├─ Escherichia coli 536A │ │││├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 │ │││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 │ │└┤├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 │ ┌┤ └┼─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4486 │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 │ ┌┤│ ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │││ ├─ Escherichia coli O157:H7 │ │││ ├─ Escherichia coli 1212A │ │││ └─ Escherichia coli 1044A │ │││┌─ Escherichia coli B171 │ │││├─ Escherichia coli E22 │ ┌┤│└┼─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ │││ ├─ Escherichia coli E22 │ │││ ├─ Escherichia coli B185 │ │││ └─ Escherichia coli B171 │ ┌┤│└┬─ Escherichia coli HS │ │││ └─ Escherichia coli HS │ ││└─ Escherichia coli MS 115-1 │ ││┌─ Escherichia coli MS 21-1 │ │└┤ ┌─ Escherichia coli 042 │ ┌┤ │┌┴─ Escherichia coli 042 │ ││ └┤┌─ Escherichia coli FVEC1412 │ ││ └┼─ Escherichia coli UMN026 │ ││ ├─ Escherichia coli MS 198-1 │ ││ └─ Escherichia coli FVEC1302 │ ┌┤└┬─ Escherichia coli B354 │ ││ └┬─ Escherichia coli SMS-3-5 │ ││ └┬─ Escherichia coli IAI39 │ ┌───────────────────┤│ └─ Escherichia coli IAI39 │ │ │└─ Escherichia coli MS 69-1 │ │ └┬─ Escherichia coli H299 │ │ └─ Escherichia coli TA280 │ │ ┌─ Escherichia coli (4-281/282) M718 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (28-305/306) 042 │ │ │ ├─ Escherichia coli (28-305/306) TA280 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-281/282) 2362-75 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-281/282) ABU 83972 └────────────────────┤ │ ├─ Escherichia coli (4-281/282) H299 │ │ ├─ Escherichia coli (4-281/282) IAI39 │ │ ├─ Escherichia coli (4-281/282) MS 185-1 │ │ ├─ Escherichia coli (4-281/282) SE15 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (4-281/282) WV_060327 │ │ │├─ Escherichia coli (4-281/282) MS 45-1 │ │ │├─ Escherichia coli (4-281/282) M605 │ │ │├─ Escherichia coli (4-281/282) IAI39 │ │┌┤├─ Escherichia coli (4-281/282) CFT073 │ │││├─ Escherichia coli (4-281/282) 83972 └─────────────────────────────────────┤││├─ Escherichia coli (4-281/282) 042 │││└─ Escherichia coli (28-305/306) CFT073 ││└┬─ Escherichia coli (4-281/282) NC101 ││ └┬─ Escherichia coli (28-305/306) O127:H6 str. E2348/69 ││ └─ Escherichia coli (28-305/306) E2348/69 ││ ┌─ Escherichia coli (28-305/306) APEC O1 ││ ├─ Escherichia coli (28-305/306) UM146 ││ ├─ Escherichia coli (4-281/282) 536 ││ ├─ Escherichia coli (4-281/282) ED1a ││ ├─ Escherichia coli (4-281/282) F11 ││ ├─ Escherichia coli (4-281/282) MS 200-1 ││ ├─ Escherichia coli (4-281/282) S88 ││ ├─ Escherichia coli (4-281/282) UTI89 ││┌┼─ Escherichia coli (4-281/282) UTI89 │││├─ Escherichia coli (4-281/282) TA206 │││├─ Escherichia coli (4-281/282) O83:H1 str. NRG 857C └┤│├─ Escherichia coli (4-281/282) IHE3034 ││├─ Escherichia coli (4-281/282) ED1a ││├─ Escherichia coli (4-281/282) APEC O1 ││├─ Escherichia coli (4-281/282) 536 ││└─ Escherichia coli (28-305/306) F11 ││ ┌─ Escherichia coli (28-305/306) B171 ││ ├─ Escherichia coli (28-305/306) E110019 ││ ├─ Escherichia coli (28-305/306) E24377A ││ ├─ Escherichia coli (4-281/282) B7A ││ ├─ Escherichia coli (4-281/282) E22 ││ ├─ Escherichia coli (4-281/282) MS 145-7 ││ ┌┼─ Escherichia coli (4-281/282) O103:H2 str. 12009 ││ │├─ Escherichia coli (4-281/282) E24377A ││ │├─ Escherichia coli (4-281/282) E110019 ││ ┌┤├─ Escherichia coli (4-281/282) B171 ││ ││├─ Escherichia coli (28-305/306) E22 ││ ││└─ Escherichia coli (28-305/306) B7A ││┌┤└┬─ Escherichia coli (4-281/282) ATCC 8739 └┤││ └─ Escherichia coli (28-305/306) ATCC 8739 │││ ┌─ Escherichia coli (4-281/282) IAI1 ││└┬┴─ Escherichia coli (4-281/282) IAI1 ││ └┬─ Escherichia coli (4-281/282) EC4100B ││ └─ Escherichia coli (4-281/282) ETEC H10407 ││┌─ Escherichia coli (28-305/306) B088 ││├─ Escherichia coli (28-305/306) K12 ││├─ Escherichia coli (28-305/306) O157:H7 ││├─ Escherichia coli (28-305/306) str. K-12 substr. DH10B ││├─ fig|6666666.5357.peg.2629 TY-2482 (4-281/282) strain ││├─ Escherichia coli (4-281/282) 1044A ││├─ Escherichia coli (4-281/282) 1212A ││├─ Escherichia coli (4-281/282) 53638 ││├─ Escherichia coli (4-281/282) 55989 ││├─ Escherichia coli (4-281/282) B str. REL606 ││├─ Escherichia coli (4-281/282) B354 ││├─ Escherichia coli (DE3 4-281/282) BL21(DE3) ││├─ Escherichia coli (4-281/282) DH1 ││├─ Escherichia coli (4-281/282) FVEC1412 ││├─ Escherichia coli (4-281/282) H736 ││├─ Escherichia coli (4-281/282) KO11 └┤├─ Escherichia coli (4-281/282) MS 115-1 │├─ Escherichia coli (4-281/282) MS 119-7 │├─ Escherichia coli (4-281/282) MS 146-1 │├─ Escherichia coli (4-281/282) MS 187-1 │├─ Escherichia coli (4-281/282) MS 198-1 │├─ Escherichia coli (4-281/282) MS 78-1 │├─ Escherichia coli (4-281/282) O111:H- str. 11128 │├─ Escherichia coli (4-281/282) O157:H7 str. EC4024 │├─ Escherichia coli (4-281/282) O157:H7 str. EC4045 │├─ Escherichia coli (4-281/282) O157:H7 str. EC4113 │├─ Escherichia coli (4-281/282) O157:H7 str. EC4196 │├─ Escherichia coli (4-281/282) O157:H7 str. EC4401 │├─ Escherichia coli (4-281/282) O157:H7 str. EC4501 │├─ Escherichia coli (4-281/282) O157:H7 str. EC869 │├─ Escherichia coli (4-281/282) O157:H7 str. FRIK966 │├─ Escherichia coli (4-281/282) O157:H7 str. TW14359 │├─ Escherichia coli (4-281/282) O26:H11 str. 11368 │├─ Escherichia coli (4-281/282) SE11 │├─ Escherichia coli (4-281/282) TA143 │├─ Escherichia coli (4-281/282) UMN026 │├─ Escherichia coli (4-281/282) W │├─ Escherichia coli (4-281/282) str. K-12 substr. DH10B └┼─ Escherichia coli (4-281/282) str. K-12 substr. MG1655 ├─ Escherichia coli (4-281/282) str. K-12 substr. MG1655 ├─ Escherichia coli (4-281/282) W3110 ├─ Escherichia coli (4-281/282) W ├─ Escherichia coli (4-281/282) TA271 ├─ Escherichia coli (4-281/282) SMS-3-5 ├─ Escherichia coli (4-281/282) O55:H7 str. CB9615 ├─ Escherichia coli (4-281/282) O157:H7 str. TW14588 ├─ Escherichia coli (4-281/282) O157:H7 str. Sakai ├─ Escherichia coli (4-281/282) O157:H7 str. FRIK2000 ├─ Escherichia coli (4-281/282) O157:H7 str. EC508 ├─ Escherichia coli (4-281/282) O157:H7 str. EC4486 ├─ Escherichia coli (4-281/282) O157:H7 str. EC4206 ├─ Escherichia coli (4-281/282) O157:H7 str. EC4115 ├─ Escherichia coli (4-281/282) O157:H7 str. EC4076 ├─ Escherichia coli (4-281/282) O157:H7 str. EC4042 ├─ Escherichia coli (4-281/282) O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli (4-281/282) MS 84-1 ├─ Escherichia coli (4-281/282) MS 21-1 ├─ Escherichia coli (4-281/282) MS 196-1 ├─ Escherichia coli (4-281/282) MS 182-1 ├─ Escherichia coli (4-281/282) MS 124-1 ├─ Escherichia coli (4-281/282) MS 116-1 ├─ Escherichia coli (4-281/282) MS 107-1 ├─ Escherichia coli (4-281/282) HS ├─ Escherichia coli (4-281/282) H591 ├─ Escherichia coli (4-281/282) FVEC1302 ├─ Escherichia coli (4-281/282) BW2952 ├─ Escherichia coli (4-281/282) BL21 ├─ Escherichia coli (4-281/282) B185 ├─ Escherichia coli (4-281/282) 55989 ├─ Escherichia coli (4-281/282) 536A ├─ Escherichia coli (4-281/282) 1827-70 ├─ Escherichia coli (4-281/282) 1125A ├─ Escherichia coli (4-281/282) 101-1 ├─ fig|1040638.4.peg.2991 O104:H4 (4-281/282) str. LB226692 ├─ Escherichia coli (28-305/306) O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli (28-305/306) MS 69-1 ├─ Escherichia coli (28-305/306) HS └─ Escherichia coli (28-305/306) 53638
| Putative transcriptional regulator | (126) |
| Sialic acid utilization regulator, RpiR family | (110) |
| Transcriptional regulator of D-allose utilization, RpiR family | (70) |
| Transcriptional regulator, RpiR family | (21) |
| hypothetical protein | (9) |
| RpiR family transcriptional regulator | (7) |
| Transcriptional regulator | (1) |
| Others | (6) |