┌─ fig|6666666.5357.peg.3962 TY-2482 (12-293/312) strain ├─ Escherichia coli (12-293/312) 042 ├─ Escherichia coli (12-293/312) 1044A ├─ Escherichia coli (12-293/312) 1212A ├─ Escherichia coli (12-293/312) 2362-75 ├─ Escherichia coli (12-293/312) 536 ├─ Escherichia coli (12-293/312) 53638 ├─ Escherichia coli (12-293/312) 55989 ├─ Escherichia coli (12-293/312) 83972 ├─ Escherichia coli (12-293/312) APEC O1 ├─ Escherichia coli (12-293/312) ATCC 8739 ├─ Escherichia coli (12-293/312) B str. REL606 ├─ Escherichia coli (12-293/312) B171 ├─ Escherichia coli (12-293/312) B7A ├─ Escherichia coli (12-293/312) BL21 ├─ Escherichia coli (12-293/312) BW2952 ├─ Escherichia coli (12-293/312) CFT073 ├─ Escherichia coli (12-293/312) E110019 ├─ Escherichia coli (12-293/312) E22 ├─ Escherichia coli (12-293/312) E2348/69 ├─ Escherichia coli (12-293/312) E24377A ├─ Escherichia coli (12-293/312) ED1a ├─ Escherichia coli (12-293/312) ETEC H10407 ├─ Escherichia coli (12-293/312) F11 ├─ Escherichia coli (12-293/312) FVEC1412 ├─ Escherichia coli (12-293/312) H591 ├─ Escherichia coli (12-293/312) HS ├─ Escherichia coli (12-293/312) IAI39 ├─ Escherichia coli (12-293/312) IHE3034 ├─ Escherichia coli (12-293/312) KO11 ├─ Escherichia coli (12-293/312) MS 107-1 ├─ Escherichia coli (12-293/312) MS 124-1 ├─ Escherichia coli (12-293/312) MS 146-1 ├─ Escherichia coli (12-293/312) MS 185-1 ├─ Escherichia coli (12-293/312) MS 196-1 ├─ Escherichia coli (12-293/312) MS 200-1 ├─ Escherichia coli (12-293/312) MS 69-1 ├─ Escherichia coli (12-293/312) MS 84-1 ├─ Escherichia coli (12-293/312) O103:H2 str. 12009 ├─ Escherichia coli (12-293/312) O157:H7 ├─ Escherichia coli (12-293/312) O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli (12-293/312) O157:H7 str. EC4042 ├─ Escherichia coli (12-293/312) O157:H7 str. EC4076 ├─ Escherichia coli (12-293/312) O157:H7 str. EC4115 ├─ Escherichia coli (12-293/312) O157:H7 str. EC4206 ├─ Escherichia coli (12-293/312) O157:H7 str. EC4486 ├─ Escherichia coli (12-293/312) O157:H7 str. EC508 ├─ Escherichia coli (12-293/312) O157:H7 str. FRIK2000 ├─ Escherichia coli (12-293/312) O157:H7 str. Sakai ├─ Escherichia coli (12-293/312) O157:H7 str. TW14588 ├─ Escherichia coli (12-293/312) O83:H1 str. NRG 857C ├─ Escherichia coli (12-293/312) S88 ├─ Escherichia coli (12-293/312) SMS-3-5 ├─ Escherichia coli (12-293/312) TA206 ├─ Escherichia coli (12-293/312) TA280 ├─ Escherichia coli (12-293/312) UMN026 ├─ Escherichia coli (12-293/312) UTI89 ├─ Escherichia coli (12-293/312) W ├─ Escherichia coli (12-293/312) WV_060327 ├─ Escherichia coli (12-293/312) str. K-12 substr. DH10B ┌┼─ Escherichia coli (12-293/312) str. K-12 substr. MG1655 │├─ Escherichia coli (12-293/312) str. K-12 substr. MG1655 │├─ Escherichia coli (12-293/312) str. K-12 substr. DH10B │├─ Escherichia coli (12-293/312) W3110 │├─ Escherichia coli (12-293/312) W │├─ Escherichia coli (12-293/312) UTI89 │├─ Escherichia coli (12-293/312) UM146 │├─ Escherichia coli (12-293/312) TA271 │├─ Escherichia coli (12-293/312) TA143 │├─ Escherichia coli (12-293/312) SE11 │├─ Escherichia coli (12-293/312) OP50 │├─ Escherichia coli (12-293/312) O55:H7 str. CB9615 │├─ Escherichia coli (12-293/312) O157:H7 str. TW14359 │├─ Escherichia coli (12-293/312) O157:H7 str. FRIK966 │├─ Escherichia coli (12-293/312) O157:H7 str. EC869 │├─ Escherichia coli (12-293/312) O157:H7 str. EC4501 │├─ Escherichia coli (12-293/312) O157:H7 str. EC4401 │├─ Escherichia coli (12-293/312) O157:H7 str. EC4196 │├─ Escherichia coli (12-293/312) O157:H7 str. EC4113 │├─ Escherichia coli (12-293/312) O157:H7 str. EC4045 │├─ Escherichia coli (12-293/312) O157:H7 str. EC4024 │├─ Escherichia coli (12-293/312) O157:H7 EDL933 │├─ Escherichia coli (12-293/312) O127:H6 str. E2348/69 │├─ Escherichia coli (12-293/312) NC101 │├─ Escherichia coli (12-293/312) MS 78-1 │├─ Escherichia coli (12-293/312) MS 45-1 │├─ Escherichia coli (12-293/312) MS 198-1 │├─ Escherichia coli (12-293/312) MS 187-1 │├─ Escherichia coli (12-293/312) MS 182-1 │├─ Escherichia coli (12-293/312) MS 145-7 │├─ Escherichia coli (12-293/312) MS 119-7 ┌┤├─ Escherichia coli (12-293/312) M718 ││├─ Escherichia coli (12-293/312) K12 ││├─ Escherichia coli (12-293/312) IAI39 ││├─ Escherichia coli (12-293/312) HS ││├─ Escherichia coli (12-293/312) H736 ││├─ Escherichia coli (12-293/312) H299 ││├─ Escherichia coli (12-293/312) FVEC1302 ││├─ Escherichia coli (12-293/312) F11 ││├─ Escherichia coli (12-293/312) ED1a ││├─ Escherichia coli (12-293/312) EC4100B ││├─ Escherichia coli (12-293/312) E24377A ││├─ Escherichia coli (12-293/312) E22 ││├─ Escherichia coli (12-293/312) E110019 ││├─ Escherichia coli (12-293/312) DH1 ││├─ Escherichia coli (12-293/312) CFT073 ││├─ Escherichia coli (DE3 12-293/312) BL21(DE3) ┌┤│├─ Escherichia coli (12-293/312) B7A │││├─ Escherichia coli (12-293/312) B185 │││├─ Escherichia coli (12-293/312) B171 │││├─ Escherichia coli (12-293/312) ATCC 8739 │││├─ Escherichia coli (12-293/312) APEC O1 │││├─ Escherichia coli (12-293/312) ABU 83972 │││├─ Escherichia coli (12-293/312) 55989 │││├─ Escherichia coli (12-293/312) 536A ┌┤││├─ Escherichia coli (12-293/312) 53638 ││││├─ Escherichia coli (12-293/312) 536 ││││├─ Escherichia coli (12-293/312) 1827-70 ││││├─ Escherichia coli (12-293/312) 1125A ││││├─ Escherichia coli (12-293/312) 101-1 ││││└─ Escherichia coli (12-293/312) 042 ┌┤││└─ Escherichia coli (15-293/312) MS 115-1 │││└─ Escherichia coli (12-293/312) MS 21-1 ││└┬─ Escherichia coli (12-293/312) B088 ││ └┬─ Escherichia coli (12-293/312) IAI1 ┌┤│ └─ Escherichia coli (12-293/312) IAI1 ││└┬─ Escherichia coli (12-293/312) B354 ││ └┬─ Escherichia coli (12-293/312) SE15 ││ └─ Escherichia coli (12-293/312) M605 ┌────────────────────┤└┬─ Escherichia coli (12-293/312) O111:H- str. 11128 │ │ └┬─ Escherichia coli (12-293/312) MS 175-1 ┌──────────────────┤ │ └─ Escherichia coli (12-293/312) MS 116-1 │ │ └─ Escherichia coli (12-293/312) O26:H11 str. 11368 │ └────────────────── Escherichia coli (13-286/309) 53638 ┌───────────────┤ ┌─ Escherichia coli (3-289/302) DH1 │ │ ├─ Escherichia coli (3-289/302) W3110 │ │ ├─ Escherichia coli (3-289/302) str. K-12 substr. DH10B │ └────────────────────┼─ Escherichia coli (3-289/302) str. K-12 substr. MG1655 │ ├─ Escherichia coli (3-289/302) str. K-12 substr. MG1655 │ ├─ Escherichia coli (3-289/302) str. K-12 substr. DH10B │ ├─ Escherichia coli (3-289/302) K12 │ └─ Escherichia coli (3-289/302) BW2952 │ ┌─ fig|1040638.4.peg.1827 O104:H4 (1-278/303) str. LB226692 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) 042 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) 1044A │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) 1212A │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) 536 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) 53638 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) 55989 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) 83972 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) APEC O1 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) B str. REL606 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) B171 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) B354 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) BL21 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) BW2952 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) DH1 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) E22 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) EC4100B │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) F11 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) FVEC1412 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) H591 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) HS │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) IAI1 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) IAI39 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) KO11 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) MS 107-1 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) MS 119-7 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) MS 145-7 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) MS 182-1 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) MS 187-1 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) MS 198-1 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) MS 21-1 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) MS 69-1 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) MS 84-1 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) O103:H2 str. 12009 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) O127:H6 str. E2348/69 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) O157:H7 str. EC4042 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) O157:H7 str. EC4076 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) O157:H7 str. EC4115 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) O157:H7 str. EC4206 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) O157:H7 str. EC4486 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) O157:H7 str. EC508 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) O157:H7 str. FRIK2000 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) O157:H7 str. Sakai │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) O157:H7 str. TW14588 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) O83:H1 str. NRG 857C │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) S88 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) SE15 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) TA143 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) TA271 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) UM146 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) UTI89 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) W │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) WV_060327 │ ├─ Escherichia coli (1-278/303) str. K-12 substr. DH10B │ ┌┼─ Escherichia coli (1-278/303) str. K-12 substr. MG1655 │ │├─ Escherichia coli (1-278/303) str. K-12 substr. MG1655 │ │├─ Escherichia coli (1-278/303) str. K-12 substr. DH10B │ │├─ Escherichia coli (1-278/303) W │ │├─ Escherichia coli (1-278/303) UTI89 │ │├─ Escherichia coli (1-278/303) UMN026 │ │├─ Escherichia coli (1-278/303) TA280 │ │├─ Escherichia coli (1-278/303) TA206 │ │├─ Escherichia coli (1-278/303) SMS-3-5 │ │├─ Escherichia coli (1-278/303) SE11 │ │├─ Escherichia coli (1-278/303) OP50 │ │├─ Escherichia coli (1-278/303) O55:H7 str. CB9615 │ │├─ Escherichia coli (1-278/303) O157:H7 str. TW14359 │ │├─ Escherichia coli (1-278/303) O157:H7 str. FRIK966 │ │├─ Escherichia coli (1-278/303) O157:H7 str. EC869 │ │├─ Escherichia coli (1-278/303) O157:H7 str. EC4501 │ │├─ Escherichia coli (1-278/303) O157:H7 str. EC4401 │ │├─ Escherichia coli (1-278/303) O157:H7 str. EC4196 │ │├─ Escherichia coli (1-278/303) O157:H7 str. EC4113 │ │├─ Escherichia coli (1-278/303) O157:H7 str. EC4045 │ │├─ Escherichia coli (1-278/303) O157:H7 str. EC4024 │ │├─ Escherichia coli (1-278/303) O111:H- str. 11128 │ │├─ Escherichia coli (1-278/303) NC101 │ │├─ Escherichia coli (1-278/303) MS 78-1 │ │├─ Escherichia coli (1-278/303) MS 45-1 │ │├─ Escherichia coli (1-278/303) MS 200-1 │ │├─ Escherichia coli (1-278/303) MS 196-1 │ │├─ Escherichia coli (1-278/303) MS 185-1 │ │├─ Escherichia coli (1-278/303) MS 146-1 │ ┌┤├─ Escherichia coli (1-278/303) MS 124-1 │ ││├─ Escherichia coli (1-278/303) MS 115-1 │ ││├─ Escherichia coli (1-278/303) M718 │ ││├─ Escherichia coli (1-278/303) IHE3034 │ ││├─ Escherichia coli (1-278/303) IAI39 │ ││├─ Escherichia coli (1-278/303) IAI1 │ ││├─ Escherichia coli (1-278/303) H736 │ ││├─ Escherichia coli (1-278/303) H299 │ ││├─ Escherichia coli (1-278/303) FVEC1302 │ ││├─ Escherichia coli (1-278/303) ETEC H10407 │ ││├─ Escherichia coli (1-278/303) E24377A │ ││├─ Escherichia coli (1-278/303) E110019 │ ││├─ Escherichia coli (1-278/303) CFT073 │ ││├─ Escherichia coli (DE3 1-278/303) BL21(DE3) │ ││├─ Escherichia coli (1-278/303) B7A │ ││├─ Escherichia coli (1-278/303) B185 │ ││├─ Escherichia coli (1-278/303) B088 │ ││├─ Escherichia coli (1-278/303) ATCC 8739 │ ││├─ Escherichia coli (1-278/303) ABU 83972 │ ││├─ Escherichia coli (1-278/303) 55989 │ ││├─ Escherichia coli (1-278/303) 536A ┤ ││├─ Escherichia coli (1-278/303) 536 │ ││├─ Escherichia coli (1-278/303) 1827-70 │ ││├─ Escherichia coli (1-278/303) 1125A │ ┌───────────────────────────┤│├─ Escherichia coli (1-278/303) 101-1 │ │ ││└─ fig|6666666.5357.peg.2366 TY-2482 (1-278/303) strain │ │ ││┌─ Escherichia coli (1-278/303) O157:H7 EDL933 │ │ │││┌─ Escherichia coli (1-284/309) O157:H7 EDL933 │ │ ││││┌─ Escherichia coli (1-284/309) 2362-75 │ │ │└┤│├─ Escherichia coli (1-284/309) APEC O1 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (1-284/309) B171 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (1-284/309) CFT073 │ │ │ └┤├─ Escherichia coli (1-284/309) E22 │ │ │ │├─ Escherichia coli (1-284/309) E24377A │ │ │ │├─ Escherichia coli (1-284/309) HS │ │ │ │├─ Escherichia coli (1-284/309) M605 │ │ │ │├─ Escherichia coli (1-284/309) O26:H11 str. 11368 │ ┌────────────────────┤ │ └┼─ Escherichia coli (1-284/309) W3110 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-284/309) O157:H7 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-284/309) K12 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-284/309) F11 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-284/309) E2348/69 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-284/309) E110019 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-284/309) B7A │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-284/309) ATCC 8739 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-284/309) 53638 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (1-284/309) 042 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-278/303) ED1a │ │ │ └─ Escherichia coli (1-278/303) ED1a │ │ └─────────────────────────────── Escherichia coli (5-293/295) 101-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (33-320/327) ATCC 8739 │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/296) B171 │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/296) H591 │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/296) TA271 │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/296) 101-1 │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/296) 1212A │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/296) BL21 │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/296) ETEC H10407 │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/296) IAI1 │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/296) KO11 │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/296) O157:H7 │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/296) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/296) O157:H7 str. EC4045 │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/296) O157:H7 str. EC4196 │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/296) O157:H7 str. EC4401 │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/296) O157:H7 str. EC869 │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/296) O157:H7 str. Sakai │ │ ├─ fig|1040638.4.peg.2965 O104:H4 (3-290/297) str. LB226692 │ │ ├─ Escherichia coli (3-290/297) 1827-70 │ │ ├─ Escherichia coli (3-290/297) 536A │ │ ├─ Escherichia coli (3-290/297) 55989 │ │ ├─ Escherichia coli (3-290/297) B str. REL606 │ │ ├─ Escherichia coli (3-290/297) E24377A │ │ ├─ Escherichia coli (3-290/297) M718 │ │ ├─ Escherichia coli (3-290/297) MS 115-1 │ │ ├─ Escherichia coli (3-290/297) MS 145-7 │ │ ├─ Escherichia coli (3-290/297) O157:H7 str. EC4024 │ │ ├─ Escherichia coli (3-290/297) O157:H7 str. EC4115 │ │ ├─ Escherichia coli (3-290/297) O157:H7 str. EC508 │ │ ├─ Escherichia coli (3-290/297) O157:H7 str. TW14359 │ │ ├─ Escherichia coli (3-290/297) O55:H7 str. CB9615 │ │ ├─ Escherichia coli (3-290/297) W │ │ ├─ Escherichia coli (3-290/297) MS 78-1 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (3-290/297) O103:H2 str. 12009 │ │ │├─ Escherichia coli (3-290/297) MS 182-1 │ │ │├─ Escherichia coli (3-290/297) SE11 │ │ │├─ Escherichia coli (3-290/297) O157:H7 str. TW14588 │ │ │├─ Escherichia coli (3-290/297) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ │├─ Escherichia coli (3-290/297) O157:H7 str. EC4501 │ │ │├─ Escherichia coli (3-290/297) O157:H7 str. EC4113 │ │ │├─ Escherichia coli (3-290/297) MS 187-1 │ │ │├─ Escherichia coli (3-290/297) MS 124-1 │ │ │├─ Escherichia coli (3-290/297) MS 107-1 │ │ │├─ Escherichia coli (3-290/297) HS │ │ │├─ Escherichia coli (DE3 3-290/297) BL21(DE3) │ │ │├─ Escherichia coli (3-290/297) ATCC 8739 │ │ │├─ Escherichia coli (3-290/297) 55989 │ │ │├─ Escherichia coli (3-290/297) 53638 │ │ │├─ Escherichia coli (3-290/297) 1125A │ │ │├─ Escherichia coli (2-289/296) W │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (2-289/296) O157:H7 str. FRIK966 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-289/296) O157:H7 str. EC4486 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-289/296) O157:H7 str. EC4206 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-289/296) O157:H7 str. EC4076 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-289/296) O157:H7 str. EC4042 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-289/296) O157:H7 EDL933 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-289/296) MS 84-1 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-289/296) IAI1 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-289/296) HS │ │ ││├─ Escherichia coli (2-289/296) E24377A │ │ ││├─ Escherichia coli (2-289/296) 53638 │ │ ┌┤│├─ Escherichia coli (2-289/296) 1044A │ │ │││├─ fig|6666666.5357.peg.2605 TY-2482 (2-289/296) strain │ │ │││├─ Escherichia coli (2-289/296) MS 119-7 │ │ │││├─ Escherichia coli (2-289/296) B171 │ │ │││└─ Escherichia coli (24-311/318) B088 │ │ ││└┬─ Escherichia coli (2-289/296) E22 │ │ ││ └─ Escherichia coli (24-311/318) E22 │ │ ││┌─ Escherichia coli (3-290/297) B185 │ │ │││ ┌─ Escherichia coli (24-311/318) B7A │ │ │││ ├─ Escherichia coli (2-289/296) B7A │ │ │└┤┌┼─ Escherichia coli (3-290/297) B7A │ │ │ ││├─ Escherichia coli (2-289/296) B7A │ │ │ ││└─ Escherichia coli (2-289/296) B7A │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (33-320/327) 042 │ │ │ └┤ ├─ Escherichia coli (3-290/297) FVEC1302 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-290/297) MS 198-1 │ │ │ │┌┼─ Escherichia coli (3-290/297) UMN026 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (3-290/297) TA143 │ │ ┌──────────────────────┤ ││├─ Escherichia coli (3-290/297) FVEC1412 │ │ │ │ └┤└─ Escherichia coli (3-290/297) 042 │ │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (2-289/296) B354 │ │ │ │ │┌┼─ Escherichia coli (3-290/297) MS 69-1 │ │ │ │ └┤└─ Escherichia coli (3-290/297) H299 └──────┤ │ │ │┌─ Escherichia coli (3-290/297) TA280 │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (3-290/297) IAI39 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (3-290/297) MS 21-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-290/297) IAI39 │ │ │ └─ Escherichia coli (24-311/318) SMS-3-5 │ │ │┌─ Escherichia coli (3-290/297) BW2952 │ │ │├─ Escherichia coli (3-290/297) E110019 │ │ │├─ Escherichia coli (3-290/297) MS 146-1 │ │ │├─ Escherichia coli (3-290/297) O111:H- str. 11128 │ │ │├─ Escherichia coli (3-290/297) str. K-12 substr. MG1655 │ ┌────────┤ │├─ Escherichia coli (2-289/296) E110019 │ │ │ │├─ Escherichia coli (2-289/296) MS 116-1 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (2-289/296) W3110 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/296) O26:H11 str. 11368 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/296) K12 │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-290/297) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-290/297) str. K-12 substr. DH10B │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-290/297) MS 196-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-290/297) H736 │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-290/297) DH1 │ │ │ └─ Escherichia coli (24-311/318) str. K-12 substr. DH10B │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-292/294) IAI39 │ │ │ ┌───┴─ Escherichia coli (1-292/294) IAI39 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-283/294) 2362-75 │ │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-283/294) 83972 │ │ └────────────────────────┤ │ ├─ Escherichia coli (1-283/294) MS 185-1 │ │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli (1-283/294) MS 45-1 │ │ │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (1-283/294) ABU 83972 │ │ │ │ │└┬─ Escherichia coli (6-288/299) CFT073 │ │ └──┤ │ └─ Escherichia coli (1-283/294) CFT073 │ │ │┌┤┌─ Escherichia coli (1-283/294) 536 │ │ │││├─ Escherichia coli (1-283/294) MS 200-1 │ │ ││└┼─ Escherichia coli (6-288/299) F11 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-283/294) F11 │ │ ││ └─ Escherichia coli (1-283/294) 536 │ │ ││┌─ Escherichia coli (1-283/294) MS 21-1 │ │ └┤│ ┌─ Escherichia coli (1-283/294) APEC O1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-283/294) ED1a │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-283/294) M605 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-283/294) O83:H1 str. NRG 857C │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-283/294) SE15 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-283/294) TA206 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-283/294) UTI89 │ │ └┤ ├─ Escherichia coli (1-283/294) WV_060327 │ │ │┌┼─ Escherichia coli (6-288/299) APEC O1 │ │ ││├─ Escherichia coli (1-283/294) UTI89 │ │ ││├─ Escherichia coli (1-283/294) UM146 │ │ ││├─ Escherichia coli (1-283/294) SMS-3-5 │ │ ││├─ Escherichia coli (1-283/294) S88 │ │ ││├─ Escherichia coli (1-283/294) NC101 │ │ ││├─ Escherichia coli (1-283/294) IHE3034 │ │ ││└─ Escherichia coli (1-283/294) ED1a │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli TA143 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-283/294) B354 │ │ │┌┴─ Escherichia coli (1-283/294) H299 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli H591 │ │ ││ ├─ Escherichia coli MS 119-7 │ │ ││ ├─ Escherichia coli MS 84-1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │ │ ││ ┌┼─ Escherichia coli SE11 │ │ └┤ │├─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │ │ │ │├─ Escherichia coli MS 124-1 │ │ │┌┤└─ Escherichia coli MS 107-1 │ │ │││┌─ Escherichia coli 55989 │ │ ││└┼─ Escherichia coli 55989 │ │ ││ └─ fig|1040638.4.peg.2817 O104:H4 str. LB226692 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli E22 │ │ └┤ ┌┼─ Escherichia coli (6-299/299) E22 │ │ │┌┤└─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ │ ││└─ Escherichia coli TA271 │ │ ││┌─ Escherichia coli BW2952 │ │ ││├─ Escherichia coli ETEC H10407 │ │ └┤├─ Escherichia coli K12 │ │ │├─ Escherichia coli MS 146-1 │ │ │├─ Escherichia coli MS 196-1 │ │ │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B │ │ │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │ │ └┼─ Escherichia coli (6-299/299) 53638 │ │ ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │ │ ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B │ │ ├─ Escherichia coli W3110 │ │ ├─ Escherichia coli MS 175-1 │ │ ├─ Escherichia coli MS 116-1 │ │ ├─ Escherichia coli H736 │ │ ├─ Escherichia coli DH1 │ │ └─ Escherichia coli 53638 │ │ ┌─ Escherichia coli (2-269/297) 101-1 │ │ ├─ Escherichia coli (2-269/297) 53638 │ │ ├─ Escherichia coli (2-269/297) B str. REL606 │ │ ├─ Escherichia coli (DE3 2-269/297) BL21(DE3) │ │ ├─ Escherichia coli (2-269/297) DH1 │ │ ├─ Escherichia coli (2-269/297) H736 │ │ ├─ Escherichia coli (2-269/297) K12 │ │ ├─ Escherichia coli (2-269/297) MS 146-1 │ │ ├─ Escherichia coli (2-269/297) MS 187-1 │ │ ├─ Escherichia coli (2-269/297) W3110 │ │ ├─ Escherichia coli (2-269/297) str. K-12 substr. DH10B │ │ ├─ Escherichia coli (2-269/297) str. K-12 substr. MG1655 └─────┤ ├─ Escherichia coli (2-269/296) MS 182-1 │ ├─ Escherichia coli (2-269/296) MS 78-1 │ ┌┼─ Escherichia coli (2-269/296) TA280 │ │├─ Escherichia coli (2-269/296) SE11 │ │├─ Escherichia coli (2-269/296) MS 69-1 │ │├─ Escherichia coli (2-269/296) E24377A │ │├─ Escherichia coli (2-269/297) str. K-12 substr. MG1655 │ │├─ Escherichia coli (2-269/297) str. K-12 substr. DH10B │ │├─ Escherichia coli (2-269/297) MS 196-1 │ │├─ Escherichia coli (2-269/297) MS 175-1 │ ┌┤├─ Escherichia coli (2-269/297) MS 116-1 │ ││├─ Escherichia coli (2-269/297) HS │ ││├─ Escherichia coli (2-269/297) ETEC H10407 │ ││├─ Escherichia coli (2-269/297) BW2952 │ ││├─ Escherichia coli (2-269/297) BL21 │ ││├─ Escherichia coli (2-269/297) ATCC 8739 │ ┌┤│└─ Escherichia coli (2-269/297) 1827-70 │ │││┌─ Escherichia coli (2-269/297) H299 │ ││└┤┌─ Escherichia coli (25-297/325) ATCC 8739 │ ││ └┼─ Escherichia coli (25-297/325) HS │ ││ └─ Escherichia coli (25-297/325) 53638 │ ┌┤│┌─ Escherichia coli (2-269/296) MS 21-1 │ ││└┤┌─ Escherichia coli (2-269/296) IAI1 │ ││ └┼─ Escherichia coli (2-269/296) MS 115-1 │ ┌┤│ └─ Escherichia coli (2-269/296) IAI1 │ ││└─ Escherichia coli (2-269/296) B354 │ ┌┤└─ Escherichia coli (25-297/324) E24377A │ │└┬─ Escherichia coli (25-297/324) 042 │ │ └┬─ Escherichia coli (2-269/296) TA143 │ ┌┤ └─ Escherichia coli (2-269/296) 042 │ ││┌─ Escherichia coli (25-297/324) CFT073 │ │└┤┌─ Escherichia coli (2-269/296) ABU 83972 │ │ │├─ Escherichia coli (2-269/296) MS 185-1 │ │ └┼─ Escherichia coli (2-269/296) O83:H1 str. NRG 857C │ │ ├─ Escherichia coli (2-269/296) MS 45-1 │ │ ├─ Escherichia coli (2-269/296) CFT073 │ │ └─ Escherichia coli (2-269/296) 83972 │ │ ┌─ Escherichia coli (25-297/324) APEC O1 │ ┌┤ ├─ Escherichia coli (25-297/324) F11 │ ││ ├─ Escherichia coli (25-297/324) TA206 │ ││ ├─ Escherichia coli (20-292/319) UTI89 │ ││┌┼─ Escherichia coli (20-292/319) SE15 │ │││├─ Escherichia coli (20-292/319) UTI89 │ │││├─ Escherichia coli (25-297/324) M605 │ │││└─ Escherichia coli (25-297/324) E2348/69 │ │││┌─ Escherichia coli (2-269/296) IHE3034 │ │└┤├─ Escherichia coli (2-269/296) UM146 │ │ │├─ Escherichia coli (2-269/296) 536 │ │ │├─ Escherichia coli (2-269/296) ED1a │ │ │├─ Escherichia coli (2-269/296) F11 │ │ │├─ Escherichia coli (2-269/296) IAI39 │ ┌┤ │├─ Escherichia coli (2-269/296) NC101 │ ││ └┼─ Escherichia coli (2-269/296) WV_060327 │ ││ ├─ Escherichia coli (2-269/296) O127:H6 str. E2348/69 │ ││ ├─ Escherichia coli (2-269/296) MS 200-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (2-269/296) IAI39 │ ││ ├─ Escherichia coli (2-269/296) ED1a │ ││ ├─ Escherichia coli (2-269/296) 536 │ ││ ├─ Escherichia coli (2-269/296) 2362-75 │ ││ ├─ Escherichia coli (2-269/296) S88 │ ││ └─ Escherichia coli (2-269/296) APEC O1 │ ││┌─ Escherichia coli (2-269/297) O111:H- str. 11128 │ ┌┤││┌─ Escherichia coli (2-269/297) 55989 │ ││└┤├─ Escherichia coli (2-269/297) B7A │ ││ │├─ Escherichia coli (2-269/297) KO11 │ ││ │├─ Escherichia coli (2-269/297) O26:H11 str. 11368 │ ││ └┼─ Escherichia coli (2-269/297) W │ ││ ├─ Escherichia coli (2-269/297) W │ ┌─────────────────────────┤│ ├─ Escherichia coli (2-269/297) MS 145-7 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (2-269/297) E110019 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (2-269/297) 55989 │ │ ││ └─ fig|1040638.4.peg.1392 O104:H4 (2-269/297) str. LB226692 │ │ │└┬─ Escherichia coli (25-297/325) E110019 │ │ │ └─ Escherichia coli (25-297/325) B7A │ │ └─ fig|6666666.5357.peg.1115 TY-2482 (25-297/325) strain │ │ ┌─ Escherichia coli (5-291/311) 83972 │ │ ├─ Escherichia coli (5-291/311) APEC O1 │ │ ├─ Escherichia coli (5-291/311) CFT073 │ │ ├─ Escherichia coli (5-291/311) IHE3034 │ │ ├─ Escherichia coli (5-291/311) S88 │ │ ├─ Escherichia coli (5-291/311) UTI89 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (5-291/311) UTI89 │ │ │├─ Escherichia coli (5-291/311) UM146 │ │ │├─ Escherichia coli (5-291/311) MS 45-1 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (5-291/311) CFT073 │ │ ││├─ Escherichia coli (5-291/311) APEC O1 │ │ ││└─ Escherichia coli (5-291/311) ABU 83972 │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (5-291/311) MS 185-1 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (5-291/311) 042 └──────────────┤ ││┌┴─ Escherichia coli (5-291/311) 042 │ │└┤┌─ Escherichia coli (5-291/311) MS 69-1 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (5-291/311) FVEC1412 │ │ │├─ Escherichia coli (5-291/311) SMS-3-5 │ │ └┼─ Escherichia coli (5-291/311) UMN026 │ │ ├─ Escherichia coli (5-291/311) TA280 │ ┌┤ ├─ Escherichia coli (5-291/311) MS 198-1 │ ││ └─ Escherichia coli (5-291/311) FVEC1302 │ ││┌─ Escherichia coli (5-291/311) WV_060327 │ │││┌─ Escherichia coli (5-291/311) 536 │ │││├─ Escherichia coli (5-291/311) E2348/69 │ │││├─ Escherichia coli (5-291/311) ED1a │ │││├─ Escherichia coli (5-291/311) F11 │ │└┤├─ Escherichia coli (5-291/311) IAI39 │ │ │├─ Escherichia coli (5-291/311) M605 │ │ │├─ Escherichia coli (5-291/311) MS 21-1 │ │ │├─ Escherichia coli (5-291/311) O127:H6 str. E2348/69 │ │ │├─ Escherichia coli (5-291/311) SE15 │ │ └┼─ Escherichia coli (5-291/311) TA206 │ │ ├─ Escherichia coli (5-291/311) O83:H1 str. NRG 857C │ │ ├─ Escherichia coli (5-291/311) NC101 │ │ ├─ Escherichia coli (5-291/311) MS 200-1 └───────────────────────────────────────┤ ├─ Escherichia coli (5-291/311) IAI39 │ ├─ Escherichia coli (5-291/311) H299 │ ├─ Escherichia coli (5-291/311) F11 │ ├─ Escherichia coli (5-291/311) ED1a │ ├─ Escherichia coli (5-291/311) 536 │ └─ Escherichia coli (5-291/311) 2362-75 │┌─ Escherichia coli (5-284/311) B354 ││ ┌─ Escherichia coli (5-291/311) MS 182-1 ││┌┴─ Escherichia coli (5-291/311) MS 78-1 │││ ┌─ Escherichia coli (5-291/311) 1044A │││ ├─ Escherichia coli (5-291/311) 1212A │││ ├─ Escherichia coli (5-291/311) O157:H7 │││ ├─ Escherichia coli (5-291/311) O157:H7 str. EC4042 │││ ├─ Escherichia coli (5-291/311) O157:H7 str. EC4076 │││ ├─ Escherichia coli (5-291/311) O157:H7 str. EC4115 │││ ├─ Escherichia coli (5-291/311) O157:H7 str. EC4206 │││ ├─ Escherichia coli (5-291/311) O157:H7 str. EC4486 └┤│ ├─ Escherichia coli (5-291/311) O157:H7 str. EC508 ││ ├─ Escherichia coli (5-291/311) O157:H7 str. FRIK2000 ││ ├─ Escherichia coli (5-291/311) O157:H7 str. Sakai ││ ├─ Escherichia coli (5-291/311) O157:H7 str. TW14588 ││ ┌┼─ Escherichia coli (5-291/311) O55:H7 str. CB9615 ││ │├─ Escherichia coli (5-291/311) O157:H7 str. TW14359 ││ │├─ Escherichia coli (5-291/311) O157:H7 str. FRIK966 ││ │├─ Escherichia coli (5-291/311) O157:H7 str. EC869 ││ │├─ Escherichia coli (5-291/311) O157:H7 str. EC4501 ││ │├─ Escherichia coli (5-291/311) O157:H7 str. EC4401 ││ ┌┤├─ Escherichia coli (5-291/311) O157:H7 str. EC4196 ││ ││├─ Escherichia coli (5-291/311) O157:H7 str. EC4113 └┤ ││├─ Escherichia coli (5-291/311) O157:H7 str. EC4045 │ ││├─ Escherichia coli (5-291/311) O157:H7 str. EC4024 │ ││├─ Escherichia coli (5-291/311) 536A │┌┤│└─ Escherichia coli (5-291/311) 1125A │││└┬─ Escherichia coli (5-291/311) O157:H7 EDL933 │││ └─ Escherichia coli (5-291/311) O157:H7 EDL933 │││┌─ Escherichia coli (5-291/311) E24377A ││└┼─ Escherichia coli (5-291/311) MS 119-7 ││ ├─ Escherichia coli (5-291/311) H591 ││ └─ Escherichia coli (5-291/311) E24377A ││ ┌─ Escherichia coli (5-291/311) 101-1 ││ ├─ Escherichia coli (5-291/311) 53638 ││ ├─ Escherichia coli (5-291/311) ATCC 8739 ││ ├─ Escherichia coli (5-291/311) B str. REL606 ││ ├─ Escherichia coli (DE3 5-291/311) BL21(DE3) ││ ├─ Escherichia coli (5-291/311) HS ││ ├─ Escherichia coli (5-291/311) MS 115-1 ││ ┌┼─ Escherichia coli (5-291/311) MS 187-1 ││ │├─ Escherichia coli (5-291/311) HS ││ │├─ Escherichia coli (5-291/311) ETEC H10407 ││ │├─ Escherichia coli (5-291/311) BL21 └┤ │├─ Escherichia coli (5-291/311) ATCC 8739 │ ┌┤├─ Escherichia coli (5-291/311) 53638 │ ││└─ Escherichia coli (5-291/311) 1827-70 │ ││ ┌─ Escherichia coli (5-291/311) H736 │ ││┌┴─ Escherichia coli (5-291/311) MS 146-1 │ │││┌─ Escherichia coli (5-291/311) DH1 │ │└┤├─ Escherichia coli (5-291/311) MS 116-1 │ │ │├─ Escherichia coli (5-291/311) W3110 │┌┤ │├─ Escherichia coli (5-291/311) str. K-12 substr. DH10B │││ └┼─ Escherichia coli (5-291/311) str. K-12 substr. MG1655 │││ ├─ Escherichia coli (5-291/311) str. K-12 substr. MG1655 │││ ├─ Escherichia coli (5-291/311) str. K-12 substr. DH10B │││ ├─ Escherichia coli (5-291/311) MS 196-1 │││ ├─ Escherichia coli (5-291/311) K12 │││ └─ Escherichia coli (5-291/311) BW2952 ││└┬─ Escherichia coli (5-291/311) B185 ││ └─ Escherichia coli (5-291/311) M718 ││┌─ fig|6666666.5357.peg.965 TY-2482 (5-291/311) strain ││├─ Escherichia coli (5-291/311) 55989 └┤├─ Escherichia coli (5-291/311) B171 │├─ Escherichia coli (5-291/311) B7A │├─ Escherichia coli (5-291/311) E110019 │├─ Escherichia coli (5-291/311) E22 │├─ Escherichia coli (5-291/311) EC4100B │├─ Escherichia coli (5-291/311) IAI1 │├─ Escherichia coli (5-291/311) MS 107-1 │├─ Escherichia coli (5-291/311) MS 145-7 │├─ Escherichia coli (5-291/311) O103:H2 str. 12009 │├─ Escherichia coli (5-291/311) O26:H11 str. 11368 │├─ Escherichia coli (5-291/311) TA143 │├─ Escherichia coli (5-291/311) W └┼─ Escherichia coli (5-291/311) W ├─ Escherichia coli (5-291/311) TA271 ├─ Escherichia coli (5-291/311) SE11 ├─ Escherichia coli (5-291/311) O111:H- str. 11128 ├─ Escherichia coli (5-291/311) MS 84-1 ├─ Escherichia coli (5-291/311) MS 124-1 ├─ Escherichia coli (5-291/311) KO11 ├─ Escherichia coli (5-291/311) IAI1 ├─ Escherichia coli (5-291/311) E22 ├─ Escherichia coli (5-291/311) E110019 ├─ Escherichia coli (5-291/311) B7A ├─ Escherichia coli (5-291/311) B171 ├─ Escherichia coli (5-291/311) B088 ├─ Escherichia coli (5-291/311) 55989 └─ fig|1040638.4.peg.2736 O104:H4 (5-291/311) str. LB226692
| Threonine catabolic operon transcriptional activator TdcA | (132) |
| Putative transcriptional regulator LYSR-type | (129) |
| Transcriptional activator protein LysR | (129) |
| Hca operon (3-phenylpropionic acid catabolism) transcriptional activator HcaR | (103) |
| HTH-type transcriptional regulator IlvY | (85) |
| Xanthosine operon regulatory protein XapR, LysR family | (64) |
| Regulatory protein (induces abgABT, used to catabolize p-aminobenzoyl-glutamate) | (8) |
| Transcriptional regulator, LysR family | (1) |
| Transcriptional regulator | (1) |
| Transcriptional activator protein lysR | (1) |
| HTH-type transcriptional regulator tdcA | (1) |
| Others | (10) |