┌─ Escherichia coli (11-59/59) 1044A   
                           ├─ Escherichia coli (11-59/59) 1212A   
                           ├─ Escherichia coli (11-59/59) O157:H7   
                           ├─ Escherichia coli (11-59/59) O157:H7 EDL933   
                           ├─ Escherichia coli (11-59/59) O157:H7 str. EC4042   
                           ├─ Escherichia coli (11-59/59) O157:H7 str. EC4076   
                           ├─ Escherichia coli (11-59/59) O157:H7 str. EC4115   
                           ├─ Escherichia coli (11-59/59) O157:H7 str. EC4206   
                           ├─ Escherichia coli (11-59/59) O157:H7 str. EC4486   
                           ├─ Escherichia coli (11-59/59) O157:H7 str. EC508   
                           ├─ Escherichia coli (11-59/59) O157:H7 str. FRIK2000   
                           ├─ Escherichia coli (11-59/59) O157:H7 str. Sakai   
                          ┌┼─ Escherichia coli (11-59/59) O157:H7 str. TW14588   
                          │├─ Escherichia coli (11-59/59) O157:H7 str. TW14359   
                          │├─ Escherichia coli (11-59/59) O157:H7 str. FRIK966   
                          │├─ Escherichia coli (11-59/59) O157:H7 str. EC869   
                          │├─ Escherichia coli (11-59/59) O157:H7 str. EC4501   
                          │├─ Escherichia coli (11-59/59) O157:H7 str. EC4401   
                          │├─ Escherichia coli (11-59/59) O157:H7 str. EC4196   
                         ┌┤├─ Escherichia coli (11-59/59) O157:H7 str. EC4113   
                         ││├─ Escherichia coli (11-59/59) O157:H7 str. EC4045   
                         ││├─ Escherichia coli (11-59/59) O157:H7 str. EC4024   
                         ││├─ Escherichia coli (11-59/59) O157:H7 EDL933   
       ┌─────────────────┤│├─ Escherichia coli (11-59/59) 536A   
       │                 ││└─ Escherichia coli (11-59/59) 1125A   
       │                 │└─ fig|1040638.4.peg.274 O104:H4 str. LB226692   
    ┌──┤                 └─ fig|1040638.4.peg.388 O104:H4 (11-39/42) str. LB226692   
    │  │┌─ Escherichia coli (11-45/256) O157:H7 str. TW14588   
   ┌┤  └┼─ Escherichia coli (11-45/75) O157:H7 str. FRIK2000   
   ││   └─ Escherichia coli (11-45/256) O157:H7 str. EC4501   
   │└─┬─ Escherichia coli (11-45/256) O55:H7 str. CB9615   
   │  └─ Escherichia coli (11-45/256) O103:H2 str. 12009   
   │┌─ Escherichia coli (11-45/256) ED1a   
   │├─ Escherichia coli (11-45/256) O103:H2 str. 12009   
┌──┤├─ Escherichia coli (11-45/256) O157:H7 str. EC4042   
│  │├─ Escherichia coli (11-45/256) O157:H7 str. EC4113   
│  │├─ Escherichia coli (11-45/256) O157:H7 str. EC4115   
│  │├─ Escherichia coli (11-45/256) O157:H7 str. EC4206   
│  │├─ Escherichia coli (11-45/252) O157:H7 str. FRIK966   
│  │├─ Escherichia coli (11-45/253) O26:H11 str. 11368   
│  └┼─ Escherichia coli (11-45/253) O26:H11 str. 11368   
│   ├─ Escherichia coli (11-45/256) O157:H7 str. TW14359   
│   ├─ Escherichia coli (11-45/256) O157:H7 str. EC508   
│   ├─ Escherichia coli (7-41/252) O157:H7 str. EC4196   
│   ├─ Escherichia coli (11-45/256) O157:H7 str. EC4115   
│   ├─ Escherichia coli (11-45/256) O157:H7 str. EC4045   
│   ├─ Escherichia coli (11-45/256) O157:H7 str. EC4024   
│   ├─ Escherichia coli (11-45/256) ED1a   
│   └─ fig|6666666.5357.peg.2984 TY-2482 (11-45/256) strain   
│     ┌─ Escherichia coli (17-51/262) 042   
│     ├─ Escherichia coli (11-45/253) 101-1   
│     ├─ Escherichia coli (11-45/256) 55989   
│     ├─ Escherichia coli (11-45/256) ABU 83972   
│     ├─ Escherichia coli (11-45/256) FVEC1412   
│     ├─ Escherichia coli (11-45/256) MS 69-1   
┤    ┌┼─ Escherichia coli (11-45/256) UMN026   
│    │├─ Escherichia coli (11-45/256) MS 198-1   
│    │├─ Escherichia coli (11-45/256) FVEC1302   
│    │├─ Escherichia coli (11-45/256) 83972   
│   ┌┤├─ Escherichia coli (11-45/256) 55989   
│   ││└─ Escherichia coli (11-45/256) 042   
│   ││  ┌─ Escherichia coli (11-45/256) MS 196-1   
│   ││  │                                                              ┌─ Escherichia coli (33-75/192) 53638   
│   │└──┤                                                             ┌┴─ Escherichia coli (11-53/170) 53638   
│   │   │                        ┌────────────────────────────────────┴─ Escherichia coli (11-54/241) MS 182-1   
│   │   └────────────────────────┤            ┌─ Escherichia coli (11-45/256) ED1a   
│┌──┤                            │          ┌─┼─ Escherichia coli (11-45/256) O26:H11 str. 11368   
││  │                            └──────────┤ └─ Escherichia coli (11-45/256) ED1a   
││  │                                       │┌─ Escherichia coli (11-45/224) E22   
││  │                                       └┼─ Escherichia coli (11-45/256) MS 21-1   
││  │                                        ├─ Escherichia coli (11-45/256) MS 145-7   
││  │                                        └─ Escherichia coli (11-45/224) E22   
││  └── Escherichia coli (11-45/256) SMS-3-5   
││     ┌─ Escherichia coli (11-47/244) O111:H- str. 11128   
││     │    ┌─ Escherichia coli (11-45/186) BW2952   
││     │    ├─ Escherichia coli (11-45/253) E24377A   
└┤     │    ├─ Escherichia coli (28-62/203) K12   
 │     │    ├─ Escherichia coli (11-45/253) M605   
 │     │    ├─ Escherichia coli (11-45/253) MS 124-1   
 │     │    ├─ Escherichia coli (11-45/253) MS 84-1   
 │     │    ├─ Escherichia coli (28-62/270) SE11   
 │     │    ├─ Escherichia coli (11-45/253) W   
 │     │    ├─ Escherichia coli (11-45/186) str. K-12 substr. DH10B   
 │     │    ├─ Escherichia coli (11-45/186) str. K-12 substr. MG1655   
 │     │   ┌┼─ Escherichia coli (11-45/186) str. K-12 substr. MG1655   
 │     │   │├─ Escherichia coli (11-45/186) str. K-12 substr. DH10B   
 └─────┤   │├─ Escherichia coli (11-45/186) W3110   
       │   │├─ Escherichia coli (11-45/253) W   
       │   │├─ Escherichia coli (11-45/253) O26:H11 str. 11368   
       │  ┌┤├─ Escherichia coli (11-45/253) MS 69-1   
       │  ││├─ Escherichia coli (28-62/270) M718   
       │  ││├─ Escherichia coli (11-45/253) KO11   
       │┌─┤│├─ Escherichia coli (11-45/253) E24377A   
       ││ ││└─ Escherichia coli (11-45/186) DH1   
       ││ │└─── Escherichia coli (11-45/253) TA143   
       ││ └──┬─ Escherichia coli (11-45/253) 53638   
       ││    └─ Escherichia coli (11-45/253) 53638   
       ││    ┌─ Escherichia coli (11-47/253) 1044A   
       ││    ├─ Escherichia coli (28-64/270) O157:H7 EDL933   
       ││    ├─ Escherichia coli (11-47/253) O157:H7 str. EC4501   
       └┤    ├─ Escherichia coli (11-47/253) O157:H7 str. TW14588   
        │   ┌┼─ Escherichia coli (11-47/248) WV_060327   
        │   │├─ Escherichia coli (11-47/253) O157:H7 str. Sakai   
        │ ┌─┤├─ Escherichia coli (11-47/253) O157:H7 EDL933   
        │ │ │└─ Escherichia coli (28-64/270) O157:H7   
        │┌┤ └───── Escherichia coli (11-45/256) TA280   
        ││└── Escherichia coli (11-47/248) O103:H2 str. 12009   
        ││┌─ Escherichia coli (11-47/253) 042   
        ││├─ Escherichia coli (11-47/253) 1212A   
        └┤├─ Escherichia coli (11-47/253) APEC O1   
         │├─ Escherichia coli (11-47/253) B088   
         │├─ Escherichia coli (28-64/270) E22   
         │├─ Escherichia coli (11-47/195) O26:H11 str. 11368   
         └┼─ Escherichia coli (11-47/253) TA280   
          ├─ Escherichia coli (11-47/244) O55:H7 str. CB9615   
          ├─ Escherichia coli (11-47/253) E22   
          ├─ Escherichia coli (11-47/199) B185   
          ├─ Escherichia coli (28-64/270) APEC O1   
          ├─ Escherichia coli (11-47/253) 536A   
          ├─ Escherichia coli (11-47/253) 101-1   
          └─ Escherichia coli (28-64/270) 042   
  
hypothetical protein (112)
Phage protein (4)
unknown protein encoded by cryptic prophage CP-933P (1)
Uncharacterized protein ydaW (1)
Others (3)