┌─ Escherichia coli (1-76/78) 042 ├─ Escherichia coli (1-76/78) E110019 ├─ Escherichia coli (1-76/78) H299 ┌┼─ Escherichia coli (1-76/78) MS 84-1 │├─ Escherichia coli (1-76/78) MS 45-1 ┌┤├─ Escherichia coli (1-76/78) E110019 ││└─ Escherichia coli (1-76/78) 042 │└────┬─ Escherichia coli (1-76/78) CFT073 ┌┤ └─ Escherichia coli (1-76/78) CFT073 ││ ┌─ Escherichia coli (1-76/78) E22 ││┌─────────────────────────────────────────────────────────┴─ Escherichia coli (1-76/78) E22 │└┤ ┌─ Escherichia coli (15-75/77) 042 ┌┤ └┬┴─ Escherichia coli (15-75/77) ATCC 8739 ││ └┬────── Escherichia coli (7-67/69) E22 ││ └────── Escherichia coli (41-101/103) MS 198-1 ││ ┌─ Escherichia coli (1-76/77) O26:H11 str. 11368 │└─────────┬─────────┴─ Escherichia coli (1-76/77) O26:H11 str. 11368 ┌────┤ └───┬───────────── Escherichia coli MS 119-7 │ │ └──┬───── Escherichia coli TA280 │ │ └─────────┬────── Escherichia coli (16-79/79) E110019 ┌────┤ │ └───── Escherichia coli ETEC H10407 │ │ └─ Escherichia coli (1-60/62) MS 124-1 │ └┬───── Escherichia coli (1-76/78) 101-1 │ └────────── Escherichia coli (1-76/78) SE11 │ ┌─ Escherichia coli (1-76/78) APEC O1 │ ├─ Escherichia coli (1-76/78) M718 │ ├─ Escherichia coli (1-76/78) UM146 │ ┌┼─ Escherichia coli (1-76/78) UTI89 │ │├─ Escherichia coli (1-76/78) UTI89 │ ┌┤├─ Escherichia coli (1-76/78) S88 │ ││└─ Escherichia coli (1-76/78) IHE3034 │ ┌────┤└─ Escherichia coli (7-67/69) E24377A ┤ │ └────┬────── Escherichia coli (20-80/82) E2348/69 │ ┌────┤ └┬───── Escherichia coli (1-76/78) O103:H2 str. 12009 │ │ │ └─ Escherichia coli (1-76/78) WV_060327 │ │ └┬────── Escherichia coli (5-67/69) 53638 │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (1-76/78) B7A │ ││ └─ Escherichia coli (1-76/78) B7A │┌┤└────────── Escherichia coli (1-76/78) TA271 ││└─ Escherichia coli (1-76/78) MS 119-7 ││ ┌──────────────────────── Escherichia coli (20-80/82) E24377A ││ │ ┌─ Escherichia coli 1125A ││ │ ├─ Escherichia coli 536A ││ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 └┤ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966 └────┤ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 │ ┌┼─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 │┌─────────┤├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 └┤ │└─ Escherichia coli 1212A │ └───── Escherichia coli 1044A │ ┌──────────────────── Escherichia coli B088 │ │ ┌─ Escherichia coli (5-68/68) 53638 │ │ ┌─────┴─ Escherichia coli (5-68/68) 53638 │ │┌┴─ Escherichia coli (41-88/295) TA280 └────┤│ ┌─ Escherichia coli IHE3034 ││ ┌─────────┴─ Escherichia coli MS 21-1 ││ ┌────┴─ Escherichia coli MS 145-7 ││ ┌┴───────────────────┬─ Escherichia coli E2348/69 └┤ ┌─────────┤ └─ Escherichia coli 2362-75 │ │ └────┬─ Escherichia coli ED1a │ │ └─ Escherichia coli ED1a │ │ ┌─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ │ ┌────┴─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 └────┤ ┌────┴────┬─ Escherichia coli E24377A │┌────┤ └─ Escherichia coli E24377A ││ └────┬─ fig|6666666.5357.peg.950 TY-2482 strain ││ └─ fig|1040638.4.peg.268 O104:H4 str. LB226692 ││ ┌─ Escherichia coli (13-70/71) 1212A ││ ┌────────────┴─ Escherichia coli (13-70/71) 536A └┤ │ ┌─ Escherichia coli 1125A │ │ ├─ Escherichia coli 536A │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 └────┤ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai └─────────┼─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli O157:H7 ├─ Escherichia coli 1212A └─ Escherichia coli 1044A
| ORF 1 | (90) |
| hypothetical protein | (9) |
| IS, phage, Tn; Transposon-related functions | (5) |
| unknown protein encoded by prophage CP-933N | (1) |
| unknown protein encoded within CP-933O | (1) |
| Others | (2) |