┌─ Escherichia coli 1044A ├─ Escherichia coli 1212A ├─ Escherichia coli O157:H7 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4486 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 ┌┼─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 ┌┤├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 ││├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 ││├─ Escherichia coli 536A ││└─ Escherichia coli 1125A ││┌─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │└┤┌─ Escherichia coli E22 │ └┼─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │ ├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ └─ Escherichia coli E22 ┌┤┌─ Escherichia coli 1125A ││├─ Escherichia coli 536A ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4486 ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai │└┼─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 ┌─┤ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 ┌──┤ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 │ │ │ ├─ Escherichia coli 1212A ┌─┤ │ │ └─ Escherichia coli 1044A │ │ │ └─── Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 │ │ └──────── Escherichia coli (1-51/53) B088 │ │ ┌─ Escherichia coli ED1a │ └┬┴─ Escherichia coli ED1a │ └┬─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 ┌────────────────────────────┤ └┬─ Escherichia coli (1-55/60) E22 │ │ └─ Escherichia coli (1-63/68) E22 │ │┌─ Escherichia coli 55989 │ │├─ Escherichia coli ED1a │ │├─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │ └┼─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 │ ├─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │ ├─ Escherichia coli ED1a │ └─ Escherichia coli 55989 │ ┌─ fig|1040638.4.peg.3922 O104:H4 (2-50/63) str. LB226692 │ ├─ Escherichia coli (30-78/91) 042 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) 101-1 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) 1125A │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) 2362-75 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) 536 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) 53638 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) 55989 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) APEC O1 │ ├─ Escherichia coli (30-78/91) B088 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) B171 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) B354 │ ├─ Escherichia coli (DE3 2-50/63) BL21(DE3) │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) E110019 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) E22 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) E24377A │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) EC4100B │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) F11 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) FVEC1412 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) IAI1 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) IAI39 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) KO11 │ ├─ Escherichia coli (30-78/91) MS 107-1 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) MS 124-1 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) MS 187-1 │ ├─ Escherichia coli (30-78/91) MS 200-1 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) MS 69-1 │ ├─ Escherichia coli (30-78/91) MS 84-1 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) O111:H- str. 11128 │ ├─ Escherichia coli (30-78/91) O157:H7 EDL933 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) O157:H7 str. EC4024 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) O157:H7 str. EC4045 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) O157:H7 str. EC4113 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) O157:H7 str. EC4196 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) O157:H7 str. EC4401 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) O157:H7 str. EC4501 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) O157:H7 str. EC869 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) O157:H7 str. FRIK966 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) O157:H7 str. TW14359 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) O26:H11 str. 11368 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) S88 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) SE15 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) TA143 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) TA271 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) UM146 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) UTI89 │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) W │ ┌┼─ Escherichia coli (2-50/63) W │ │├─ Escherichia coli (2-50/63) UTI89 │ │├─ Escherichia coli (2-50/63) UMN026 │ │├─ Escherichia coli (2-50/63) TA280 │ │├─ Escherichia coli (2-50/63) TA206 │ │├─ Escherichia coli (2-50/63) SMS-3-5 │ │├─ Escherichia coli (30-78/91) SE11 │ │├─ Escherichia coli (2-50/63) O55:H7 str. CB9615 │ │├─ Escherichia coli (2-50/63) O157:H7 str. TW14588 │ │├─ Escherichia coli (2-50/63) O157:H7 str. Sakai │ │├─ Escherichia coli (2-50/63) O157:H7 str. FRIK2000 │ │├─ Escherichia coli (30-78/91) O157:H7 str. EC508 │ │├─ Escherichia coli (30-78/91) O157:H7 str. EC4486 │ │├─ Escherichia coli (2-50/63) O157:H7 str. EC4206 │ │├─ Escherichia coli (2-50/63) O157:H7 str. EC4115 │ │├─ Escherichia coli (2-50/63) O157:H7 str. EC4076 │ │├─ Escherichia coli (2-50/63) O157:H7 str. EC4042 │ │├─ Escherichia coli (2-50/63) O157:H7 EDL933 ┤ │├─ Escherichia coli (30-78/91) O157:H7 │ │├─ Escherichia coli (2-50/63) O103:H2 str. 12009 │ │├─ Escherichia coli (2-50/63) MS 78-1 │ │├─ Escherichia coli (2-50/63) MS 21-1 │ │├─ Escherichia coli (2-50/63) MS 198-1 │ │├─ Escherichia coli (30-78/91) MS 182-1 │ │├─ Escherichia coli (2-50/63) MS 119-7 │ ┌┤├─ Escherichia coli (2-50/63) M605 │ ││├─ Escherichia coli (2-50/63) IHE3034 │ ││├─ Escherichia coli (2-50/63) IAI39 │ ││├─ Escherichia coli (2-50/63) IAI1 │ ││├─ Escherichia coli (2-50/63) FVEC1302 │ ││├─ Escherichia coli (30-78/91) F11 │ ││├─ Escherichia coli (30-78/91) E24377A │ ││├─ Escherichia coli (30-78/91) E2348/69 │ ││├─ Escherichia coli (30-78/91) E22 │ ││├─ Escherichia coli (30-78/91) E110019 │ ││├─ Escherichia coli (2-50/63) BL21 │ ││├─ Escherichia coli (2-50/63) B185 │ ││├─ Escherichia coli (30-78/91) B171 │ ││├─ Escherichia coli (2-50/63) B str. REL606 │ ││├─ Escherichia coli (2-50/63) 55989 │ ││├─ Escherichia coli (30-78/91) 536A │ ││├─ Escherichia coli (30-78/91) 53638 │ ┌┤│├─ Escherichia coli (2-50/63) 536 │ │││├─ Escherichia coli (2-50/63) 1212A │ │││├─ Escherichia coli (2-50/63) 1044A │ │││├─ Escherichia coli (2-50/63) 042 │ │││└─ fig|6666666.5357.peg.2258 TY-2482 (2-50/63) strain │ │││┌─ Escherichia coli (2-50/63) WV_060327 │ ││││┌─ Escherichia coli (2-50/63) ABU 83972 │ ││││├─ Escherichia coli (2-50/63) CFT073 │ ││└┤├─ Escherichia coli (2-50/63) ED1a │ ││ │├─ Escherichia coli (2-50/63) MS 185-1 │ ││ │├─ Escherichia coli (2-50/63) NC101 │ ││ └┼─ Escherichia coli (2-50/63) O83:H1 str. NRG 857C │ ┌───────────────────────────────────────────────────┤│ ├─ Escherichia coli (2-50/63) MS 45-1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (2-50/63) H299 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (2-50/63) ED1a │ │ ││ ├─ Escherichia coli (30-78/91) CFT073 │ │ ││ └─ Escherichia coli (2-50/63) 83972 │ │ │└┬─ Escherichia coli (30-78/91) MS 115-1 │ │ │ └─ Escherichia coli (2-50/63) M718 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (2-50/63) 1827-70 │ │ │ ├─ Escherichia coli (30-78/91) ATCC 8739 │ │ │┌┼─ Escherichia coli (2-50/63) ETEC H10407 │ │ ││└─ Escherichia coli (30-78/91) ATCC 8739 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (30-78/91) HS │ │ └┤┌┴─ Escherichia coli (2-50/63) HS │ │ ││┌─ Escherichia coli (2-50/63) B7A │ │ ││├─ Escherichia coli (2-50/63) DH1 │ ┌───────┤ ││├─ Escherichia coli (30-78/91) K12 │ │ │ └┤├─ Escherichia coli (2-50/63) MS 145-7 │ │ │ │├─ Escherichia coli (2-50/63) MS 175-1 │ │ │ │├─ Escherichia coli (2-50/63) W3110 │ │ │ │├─ Escherichia coli (2-50/63) str. K-12 substr. DH10B │ │ │ └┼─ Escherichia coli (2-50/63) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │ ├─ Escherichia coli (30-78/91) str. K-12 substr. DH10B │ │ │ ├─ Escherichia coli (30-78/91) MS 196-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) MS 146-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) MS 116-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) H736 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-50/63) BW2952 │ │ │ └─ Escherichia coli (30-78/91) B7A │ │ └────────── Escherichia coli (1-61/64) TA280 │ │ ┌──── Escherichia coli 53638 │ │ │ ┌─ Escherichia coli 1044A │ │ │ ├─ Escherichia coli 1212A │ │ │ ├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 └──┤ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 │ │ ┌───────┼─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4486 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 │ │ ┌┤ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 │ │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 │ │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 │ │ ││ ├─ Escherichia coli 536A │ │ ││ └─ Escherichia coli 1125A │ │ ││┌─ Escherichia coli (1-63/67) 101-1 │ │ │└┤┌─ Escherichia coli (1-63/67) B7A │ │┌─┤ └┼─ Escherichia coli (1-63/67) B7A │ ││ │ └─ Escherichia coli (1-63/67) 101-1 │ ││ │ ┌─ Escherichia coli (1-63/67) TA271 └───┤│ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-63/67) MS 119-7 ││ │ ┌──┴─ Escherichia coli (1-63/67) B185 ││ │ ┌┴┬─── Escherichia coli (1-63/67) O55:H7 str. CB9615 ││ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-63/67) E22 ││ │ │ └─ Escherichia coli (1-63/67) E22 ││ └──┤ ┌─ Escherichia coli (1-63/67) APEC O1 ││ │┌───┴─ Escherichia coli (1-63/67) APEC O1 ││ ││ ┌─ Escherichia coli (1-63/67) MS 198-1 ││ └┤ ├─ Escherichia coli (1-63/67) UMN026 ││ │ ├─ Escherichia coli (3-65/69) E24377A ││ │ ├─ Escherichia coli (3-65/69) FVEC1302 ││ └────────┼─ Escherichia coli (3-65/69) FVEC1412 ││ ├─ Escherichia coli (3-65/69) E24377A ││ ├─ Escherichia coli (3-65/69) 042 ││ ├─ Escherichia coli (1-63/67) MS 69-1 ││ └─ Escherichia coli (1-63/67) 042 ││ ┌─ Escherichia coli (19-81/81) ATCC 8739 ││ ├─ Escherichia coli 042 ││ ├─ Escherichia coli ATCC 8739 ││ ├─ Escherichia coli DH1 ││ ├─ Escherichia coli IAI1 ││ ├─ Escherichia coli KO11 ││ ├─ Escherichia coli TA271 ││ ├─ Escherichia coli W ││ ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B ││ ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 ││ ┌┼─ Escherichia coli (4-66/66) 042 ││ │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 ││ │├─ Escherichia coli W3110 ││ │├─ Escherichia coli W ││ │├─ Escherichia coli MS 145-7 ││ ┌┤├─ Escherichia coli K12 ││ ││├─ Escherichia coli IAI1 └┤ ││├─ Escherichia coli BW2952 │ ┌┤│├─ Escherichia coli 1827-70 │ │││└─ Escherichia coli (19-81/81) str. K-12 substr. DH10B │ ┌┤│└─ Escherichia coli E110019 │ ││└─ Escherichia coli MS 21-1 │ ┌┤└─ Escherichia coli (2-47/47) E110019 │ │└─ Escherichia coli MS 69-1 │ ┌┤┌─ Escherichia coli MS 107-1 │ │└┼─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │ │ └─ Escherichia coli E24377A │ ┌┤ ┌─ Escherichia coli FVEC1302 │ ││ ├─ Escherichia coli MS 198-1 │ ││┌┼─ Escherichia coli UMN026 │ │└┤└─ Escherichia coli FVEC1412 │ │ │┌─ Escherichia coli BL21 │ ┌┤ └┼─ Escherichia coli OP50 │ ││ ├─ Escherichia coli (DE3) BL21(DE3) │ ││ └─ Escherichia coli B str. REL606 │ ││ ┌─ Escherichia coli 55989 │ ││┌┴─ Escherichia coli 55989 │ ┌┤└┤┌─ Escherichia coli MS 78-1 │ ││ └┼─ Escherichia coli TA280 │ ││ ├─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │ ││ └─ Escherichia coli M718 │ ┌┤└┬─ Escherichia coli ETEC H10407 │ ││ └┬─ Escherichia coli MS 124-1 │ ││ └─ Escherichia coli EC4100B │ ┌┤└┬─ Escherichia coli E24377A │ ││ └─ Escherichia coli B7A │ ││ ┌─ Escherichia coli MS 45-1 │ │└───┤┌─ Escherichia coli SMS-3-5 │ │ ││┌─ Escherichia coli CFT073 │ │ └┤├─ Escherichia coli MS 116-1 │ │ │├─ Escherichia coli (4-66/66) 042 │ │ └┼─ Escherichia coli (4-66/66) CFT073 │ │ ├─ Escherichia coli MS 175-1 │ │ ├─ Escherichia coli M718 └──────┤ └─ Escherichia coli 042 │┌─ Escherichia coli MS 124-1 ││ ┌─ Escherichia coli 1125A ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 ││┌┼─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 │││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4486 └┤│├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 ││└─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 ││ ┌─ Escherichia coli APEC O1 ││ ├─ Escherichia coli S88 ││ ├─ Escherichia coli UTI89 ││┌┼─ Escherichia coli UTI89 │││├─ Escherichia coli UM146 └┤│└─ Escherichia coli IHE3034 ││┌─ Escherichia coli (4-66/66) O157:H7 EDL933 ││├─ fig|1040638.4.peg.265 O104:H4 str. LB226692 ││├─ Escherichia coli 1044A ││├─ Escherichia coli 1125A ││├─ Escherichia coli 1212A ││├─ Escherichia coli 536A ││├─ Escherichia coli 55989 ││├─ Escherichia coli ABU 83972 ││├─ Escherichia coli B171 ││├─ Escherichia coli E22 ││├─ Escherichia coli MS 145-7 └┤├─ Escherichia coli MS 84-1 │├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │├─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │├─ Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 │├─ Escherichia coli O157:H7 │├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai │├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 │├─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │├─ Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C └┼─ Escherichia coli WV_060327 ├─ Escherichia coli WV_060327 ├─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai ├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli O157:H7 ├─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 ├─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 ├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 ├─ Escherichia coli MS 196-1 ├─ Escherichia coli H299 ├─ Escherichia coli E110019 ├─ Escherichia coli B171 ├─ Escherichia coli 83972 ├─ Escherichia coli 55989 ├─ Escherichia coli 2362-75 ├─ Escherichia coli 1212A ├─ Escherichia coli 1044A ├─ fig|6666666.5357.peg.945 TY-2482 strain ├─ Escherichia coli (4-66/66) O157:H7 EDL933 └─ Escherichia coli (19-81/81) E2348/69
| hypothetical protein | (291) |
| Putative secreted protein | (56) |
| ORF 5 | (11) |
| FIG00637919: hypothetical protein | (4) |
| unknown protein encoded by cryptic prophage CP-933P | (1) |
| conserved hypothetical protein | (1) |
| unknown protein encoded by cryptic prophage CP-933M | (1) |
| unknown protein encoded by prophage CP-933O | (1) |
| Hypothetical protein ydfD | (1) |
| Others | (4) |