Alignment colored by consensus

fig\|340186.3.peg.5011	Escherichia coli E110019 (41-228/228)	`MEALQASGIDYTIFFYNPNIHPQKEYLIRKDENIRFAEQHGVPFIDADYDTDNWFERAKGMEWEPERGIRCTMCFDMRFERTALYAAENGFSVISSSLGISRWKNMQQVNECGRRAVAHYPGMVYWDYNWRKQGGSSRMIEISKREKFYQQEYCGCVYSLRDTNLHRKSQGRPLIKIGQLHYGKEEKE`
fig\|216592.1.peg.1873	Escherichia coli 042 (41-228/228)	`MEALQASGIDYTIFFYNPNIHPQKEYLIRKDENIRFAEQHGVPFIDADYDTDNWFERAKGMEWEPERGIRCTMCFDMRFERTALYAAENGFSVISSSLGISRWKNMQQVNDCGRRAVAHYPGMVYWDYNWRKQGGSSRMIEISKREKFYQQEYCGCVYSLRDTNLHRKSQGRPLIKIGQLHYGKEEKE`
fig\|405955.9.peg.1215	Escherichia coli APEC O1 (41-228/228)	`MEALQASGIDYTIFFYNPNIHPQKEYLIRKDENIRFAEQHGVPFIDADYDTDNWFERAKGMEWEPERGIRCTMCFDMRFERTALYAAENGFSVISSSLGISRWKNMQQVNDCGRRAVAHYPGMVYWDYNWRKQGGSSRMIEISKREKFYQQEYCGCVYSLRDTNLHRKSQGRPLIKIGQLHYGKEEKE`
fig\|1040638.4.peg.257	Escherichia coli O104:H4 str. LB226692	`MEALQASGIDYTIFFYNPNIHPQKEYLIRKDENIRFAEQHGVPFIDADYDTDNWFERAKGMEWEPERGIRCTMCFDMRFERTALYAAENGFSVISSSLGISRWKNMQQVNECGRRAVAHYPGMVYWDYNWRKQGGSSRMIEISKREKFYQQEYCGCVYSLRDTNLHRKSQGRPLIKIGQLHYGKEEKE`
fig\|6666666.5357.peg.956	Escherichia coli TY-2482	`MEALQASGIDYTIFFYNPNIHPQKEYLIRKDENIRFAEQHGVPFIDADYDTDNWFERAKGMEWEPERGIRCTMCFDMRFERTALYAAENGFSVISSSLGISRWKNMQQVNECGRRAVAHYPGMVYWDYNWRKQGGSSRMIEISKREKFYQQEYCGCVYSLRDTNLHRKSQGRPLIKIGQLHYGKEEKE`
fig\|340186.5.peg.5262	Escherichia coli E110019	`MEALQASGIDYTIFFYNPNIHPQKEYLIRKDENIRFAEQHGVPFIDADYDTDNWFERAKGMEWEPERGIRCTMCFDMRFERTALYAAENGFSVISSSLGISRWKNMQQVNECGRRAVAHYPGMVYWDYNWRKQGGSSRMIEISKREKFYQQEYCGCVYSLRDTNLHRKSQGRPLIKIGQLHYGKEEKE`
fig\|585397.7.peg.1752	Escherichia coli ED1a	`MEALQASGIDYTIFFYNPNIHPQKEYLIRKDENIRFAEQHGVPFIDADYDTDNWFERAKGMEWEPERGIRCTMCFDMRFERTALYAAENGFSVISSSLGISRWKNMQQVNECGRRAVAHYPGMVYWDYNWRKQGGSSRMIEISKREKFYQQEYCGCVYSLRDTNLHRKSQGRPLIKIGQLHYGKEEKE`
fig\|585397.9.peg.1747	Escherichia coli ED1a	`MEALQASGIDYTIFFYNPNIHPQKEYLIRKDENIRFAEQHGVPFIDADYDTDNWFERAKGMEWEPERGIRCTMCFDMRFERTALYAAENGFSVISSSLGISRWKNMQQVNECGRRAVAHYPGMVYWDYNWRKQGGSSRMIEISKREKFYQQEYCGCVYSLRDTNLHRKSQGRPLIKIGQLHYGKEEKE`
fig\|656393.3.peg.2933	Escherichia coli H299	`MEALQASGIDYTIFFYNPNIHPQKEYLIRKDENIRFAEQHGVPFIDADYDTDNWFERAKGMEWEPERGIRCTMCFDMRFERTALYAAENGFSVISSSLGISRWKNMQQVNECGRRAVAHYPGMVYWDYNWRKQGGSSRMIEISKREKFYQQEYCGCVYSLRDTNLHRKSQGRPLIKIGQLHYGKEEKE`
fig\|714962.3.peg.2166	Escherichia coli IHE3034	`MEALQASGIDYTIFFYNPNIHPQKEYLIRKDENIRFAEQHGVPFIDADYDTDNWFERAKGMEWEPERGIRCTMCFDMRFERTALYAAENGFSVISSSLGISRWKNMQQVNECGRRAVAHYPGMVYWDYNWRKQGGSSRMIEISKREKFYQQEYCGCVYSLRDTNLHRKSQGRPLIKIGQLHYGKEEKE`
fig\|679205.4.peg.5644	Escherichia coli MS 124-1	`MEALQASGIDYTIFFYNPNIHPQKEYLIRKDENIRFAEQHGVPFIDADYDTDNWFERAKGMEWEPERGIRCTMCFDMRFERTALYAAENGFSVISSSLGISRWKNMQQVNECGRRAVAHYPGMVYWDYNWRKQGGSSRMIEISKREKFYQQEYCGCVYSLRDTNLHRKSQGRPLIKIGQLHYGKEEKE`
fig\|679204.3.peg.5149	Escherichia coli MS 145-7	`MEALQASGIDYTIFFYNPNIHPQKEYLIRKDENIRFAEQHGVPFIDADYDTDNWFERAKGMEWEPERGIRCTMCFDMRFERTALYAAENGFSVISSSLGISRWKNMQQVNECGRRAVAHYPGMVYWDYNWRKQGGSSRMIEISKREKFYQQEYCGCVYSLRDTNLHRKSQGRPLIKIGQLHYGKEEKE`
fig\|749548.3.peg.180	Escherichia coli MS 196-1	`MEALQASGIDYTIFFYNPNIHPQKEYLIRKDENIRFAEQHGVPFIDADYDTDNWFERAKGMEWEPERGIRCTMCFDMRFERTALYAAENGFSVISSSLGISRWKNMQQVNECGRRAVAHYPGMVYWDYNWRKQGGSSRMIEISKREKFYQQEYCGCVYSLRDTNLHRKSQGRPLIKIGQLHYGKEEKE`
fig\|749527.3.peg.4937	Escherichia coli MS 21-1	`MEALQASGIDYTIFFYNPNIHPQKEYLIRKDENIRFAEQHGVPFIDADYDTDNWFERAKGMEWEPERGIRCTMCFDMRFERTALYAAENGFSVISSSLGISRWKNMQQVNECGRRAVAHYPGMVYWDYNWRKQGGSSRMIEISKREKFYQQEYCGCVYSLRDTNLHRKSQGRPLIKIGQLHYGKEEKE`
fig\|216592.3.peg.1534	Escherichia coli 042	`MEALQASGIDYTIFFYNPNIHPQKEYLIRKDENIRFAEQHGVPFIDADYDTDNWFERAKGMEWEPERGIRCTMCFDMRFERTALYAAENGFSVISSSLGISRWKNMQQVNDCGRRAVAHYPGMVYWDYNWRKQGGSSRMIEISKREKFYQQEYCGCVYSLRDTNLHRKSQGRPLIKIGQLHYGKEEKE`
fig\|405955.13.peg.1476	Escherichia coli APEC O1	`MEALQASGIDYTIFFYNPNIHPQKEYLIRKDENIRFAEQHGVPFIDADYDTDNWFERAKGMEWEPERGIRCTMCFDMRFERTALYAAENGFSVISSSLGISRWKNMQQVNDCGRRAVAHYPGMVYWDYNWRKQGGSSRMIEISKREKFYQQEYCGCVYSLRDTNLHRKSQGRPLIKIGQLHYGKEEKE`
fig\|679205.4.peg.5350	Escherichia coli MS 124-1	`MEALQASGIDYTIFFYNPNIHPQKEYLIRKDENIRFAEQHGVPFIDADYDTDNWFERAKGMEWEPERGIRCTMCFDMRFERTALYAAENGFSVISSSLGISRWKNMQQVNDCGRRAVAHYPGMVYWDYNWRKQGGSSRMIEISKREKFYQQEYCGCVYSLRDTNLHRKSQGRPLIKIGQLHYGKEEKE`
fig\|749533.3.peg.1959	Escherichia coli MS 84-1	`MEALQASGIDYTIFFYNPNIHPQKEYLIRKDENIRFAEQHGVPFIDADYDTDNWFERAKGMEWEPERGIRCTMCFDMRFERTALYAAENGFSVISSSLGISRWKNMQQVNDCGRRAVAHYPGMVYWDYNWRKQGGSSRMIEISKREKFYQQEYCGCVYSLRDTNLHRKSQGRPLIKIGQLHYDKEEKE`
fig\|413997.3.peg.1609	Escherichia coli B str. REL606	`MEALQASGIDYTIFFYNPNIHPQKEYLIRKDENIRFAKQHGVPFIDADYDTDNWFERAKGMEWEPERGIRCTMCFDMRFERTALYAAENGFSVISSSLGISRWKNMQQVNDCGRRAVAYYPGMVYWDYNWRKQGGSSRMIEISKREQFYQQEYCGCVYSLRDTNLHRKSQGRPLIKIGQLHYGKEGQE`
fig\|637912.3.peg.2962	Escherichia coli OP50	`MEALQASGIDYTIFFYNPNIHPQKEYLIRKDENIRFAKQHGVPFIDADYDTDNWFERAKGMEWEPERGIRCTMCFDMRFERTALYAAENGFSVISSSLGISRWKNMQQVNDCGRRAVAYYPGMVYWDYNWRKQGGSSRMIEISKREQFYQQEYCGCVYSLRDTNLHRKSQGRPLIKIGQLHYGKEGQE`
fig\|749545.3.peg.4523	Escherichia coli MS 182-1 (1-188/189)	`MEALQASGIDYTIFFYNPNIHPQKEYLIRKNENIRYAEQHGVPFIDADYDTDNWFERAKGMEWEPERGRRCTMCFDMRFERTALYAAENGFSVISSSLGISRWKNMQQVNDSGRRAVAHYPGMVYWDYNWRKQGGSSRMIEISKREQFYQQEYCGCVYSLRDTNLHRKSQGRPLIKIGQLHYGKEEGQ`
Consen1	Primary consensus	`MEALQASGIDYTIFFYNPNIHPQKEYLIRKDENIRFAEQHGVPFIDADYDTDNWFERAKGMEWEPERGIRCTMCFDMRFERTALYAAENGFSVISSSLGISRWKNMQQVNeCGRRAVAHYPGMVYWDYNWRKQGGSSRMIEISKREkFYQQEYCGCVYSLRDTNLHRKSQGRPLIKIGQLHYGKEEkE`
Consen2	Secondary consensus	`d q q`

Consensus 1 (when a gap)

Conservative difference

Consensus 2 (when a gap)

Nonconservative diff.

Other character