┌─ Escherichia coli (12-315/352) E24377A ┌────────────────────────────────────────────┴─ Escherichia coli (27-330/367) E24377A │ ┌─ Escherichia coli (42-359/387) BW2952 │ ├─ Escherichia coli (42-359/387) E110019 │ ├─ Escherichia coli (42-359/387) FVEC1412 │ ├─ Escherichia coli (42-359/387) MS 124-1 │ ├─ Escherichia coli (42-359/387) MS 198-1 │ ├─ Escherichia coli (42-359/387) SE11 │ ├─ Escherichia coli (42-359/387) W3110 │ ├─ Escherichia coli (42-359/387) str. K-12 substr. DH10B │ ┌┼─ Escherichia coli (42-359/387) str. K-12 substr. MG1655 │ │├─ Escherichia coli (42-359/387) str. K-12 substr. MG1655 │ │├─ Escherichia coli (42-359/387) str. K-12 substr. DH10B │ │├─ Escherichia coli (42-359/387) UMN026 │ │├─ Escherichia coli (42-359/387) MS 84-1 │ │├─ Escherichia coli (42-359/387) MS 187-1 │ ┌┤├─ Escherichia coli (42-359/387) K12 │ ││├─ Escherichia coli (42-359/387) FVEC1302 │ ││└─ Escherichia coli (42-359/387) E110019 │ ││ ┌─ Escherichia coli (42-359/387) WV_060327 │ ││┌┴─ Escherichia coli (66-359/387) B185 │ │││┌─ Escherichia coli (66-359/387) H299 │ │└┤│┌─ Escherichia coli (42-359/387) B088 │ │ ││├─ Escherichia coli (42-359/387) E22 │ │ └┤├─ Escherichia coli (42-359/387) IHE3034 │ │ │├─ Escherichia coli (42-359/387) MS 78-1 │ ┌───────────────────────────────────────────────┤ │├─ Escherichia coli (42-359/387) O26:H11 str. 11368 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (42-359/387) S88 │ │ │ ├─ Escherichia coli (42-359/387) O55:H7 str. CB9615 │ │ │ ├─ Escherichia coli (42-359/387) O103:H2 str. 12009 │ │ │ ├─ Escherichia coli (42-359/387) MS 182-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (42-359/387) EC4100B │ │ │ ├─ Escherichia coli (42-359/387) E22 │ ┌──────────────┤ │ └─ Escherichia coli (42-359/387) 101-1 │ │ │ │┌─ Escherichia coli (42-359/387) BL21 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (42-359/387) OP50 │ │ │ ├─ Escherichia coli (DE3 42-359/387) BL21(DE3) │ │ │ └─ Escherichia coli (42-359/387) B str. REL606 │ │ │ ┌──────────────── Escherichia coli (56-312/334) B185 │ │ └───────────────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (57-312/330) ED1a │ │ └───────────┬───┴─ Escherichia coli (57-312/330) ED1a │ │ └─┬─ Escherichia coli (57-311/330) MS 198-1 │ │ └┬─ Escherichia coli (57-312/330) UTI89 │ │ └─ Escherichia coli (57-312/330) UTI89 │ │ ┌─ fig|1040638.4.peg.1433 O104:H4 (8-294/298) str. LB226692 │ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) 53638 │ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) 55989 │ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) 83972 │ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) ATCC 8739 │ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) B171 │ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) B354 ┤ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) B7A │ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) CFT073 │ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) DH1 │ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) E22 │ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) ED1a │ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) ETEC H10407 │ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) FVEC1412 │ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) H591 │ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) HS │ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) IAI39 │ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) K12 │ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) MS 107-1 │ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) MS 119-7 │ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) MS 175-1 │ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) MS 196-1 │ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) MS 21-1 │ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) MS 69-1 │ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) O111:H- str. 11128 │ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) SE11 │ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) TA206 │ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) UMN026 │ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) W │ │ ├─ Escherichia coli (8-294/298) str. K-12 substr. DH10B │ │ ┌┼─ Escherichia coli (8-294/298) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │├─ Escherichia coli (8-294/298) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │├─ Escherichia coli (8-294/298) W3110 │ │ │├─ Escherichia coli (8-294/298) W │ │ │├─ Escherichia coli (8-294/298) TA271 │ │ │├─ Escherichia coli (8-294/298) SMS-3-5 │ │ │├─ Escherichia coli (8-294/298) O26:H11 str. 11368 │ │ │├─ Escherichia coli (8-294/298) O103:H2 str. 12009 │ │ │├─ Escherichia coli (8-294/298) MS 45-1 │ │ │├─ Escherichia coli (8-294/298) MS 198-1 │ │ │├─ Escherichia coli (8-294/298) MS 185-1 │ │ │├─ Escherichia coli (8-294/298) MS 146-1 │ │ │├─ Escherichia coli (8-294/298) MS 116-1 │ │ │├─ Escherichia coli (8-294/298) KO11 │ │ │├─ Escherichia coli (8-294/298) IAI39 │ │ │├─ Escherichia coli (8-294/298) HS │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (8-294/298) H736 │ │ ││├─ Escherichia coli (8-294/298) H299 │ │ ││├─ Escherichia coli (8-294/298) FVEC1302 │ │ ││├─ Escherichia coli (8-294/298) ED1a │ │ ││├─ Escherichia coli (8-294/298) EC4100B │ │ ││├─ Escherichia coli (8-294/298) E22 │ │ ││├─ Escherichia coli (8-294/298) CFT073 │ │ ││├─ Escherichia coli (8-294/298) BW2952 │ │ ┌┤│├─ Escherichia coli (8-294/298) B7A │ │ │││├─ Escherichia coli (8-294/298) B171 │ │ │││├─ Escherichia coli (8-294/298) ATCC 8739 │ │ │││├─ Escherichia coli (8-294/298) ABU 83972 └────┤ │││├─ Escherichia coli (8-294/298) 55989 │ │││├─ Escherichia coli (8-294/298) 53638 │ │││└─ fig|6666666.5357.peg.3158 TY-2482 (8-294/298) strain │ ││└─ Escherichia coli (8-294/298) MS 145-7 │ ┌┤└─ Escherichia coli (8-294/298) TA143 │ ││ ┌─ Escherichia coli (8-294/298) E110019 │ ││┌┴─ Escherichia coli (8-294/298) E110019 │ │││ ┌─ Escherichia coli (8-294/298) 101-1 │ │││ ├─ Escherichia coli (8-294/298) B str. REL606 │ │││ ├─ Escherichia coli (8-294/298) BL21 │ │││ ├─ Escherichia coli (8-294/298) M718 │ │││ ├─ Escherichia coli (8-294/298) MS 124-1 │ │└┤ ├─ Escherichia coli (8-294/298) MS 84-1 │ │ │┌┼─ Escherichia coli (8-294/298) OP50 │ │ ││├─ Escherichia coli (8-294/298) MS 187-1 │ │ ││├─ Escherichia coli (8-294/298) MS 115-1 │ │ ││├─ Escherichia coli (DE3 8-294/298) BL21(DE3) │ │ ││├─ Escherichia coli (8-294/298) B185 │ │ ││└─ Escherichia coli (8-294/298) 1827-70 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (8-294/298) O157:H7 str. EC869 │ │ ││┌─ Escherichia coli (8-294/298) 1125A │ │ ││├─ Escherichia coli (8-294/298) 536A │ │ ││├─ Escherichia coli (8-294/298) O157:H7 EDL933 │ │ ││├─ Escherichia coli (8-294/298) O157:H7 str. EC4024 │ │ ││├─ Escherichia coli (8-294/298) O157:H7 str. EC4045 │ │ └┤├─ Escherichia coli (8-294/298) O157:H7 str. EC4113 │ │ │├─ Escherichia coli (8-294/298) O157:H7 str. EC4196 │ ┌┤ │├─ Escherichia coli (8-294/298) O157:H7 str. EC4401 │ ││ │├─ Escherichia coli (8-294/298) O157:H7 str. EC508 │ ││ │├─ Escherichia coli (8-294/298) O157:H7 str. FRIK966 │ ││ │├─ Escherichia coli (8-294/298) O157:H7 str. TW14359 │ ││ └┼─ Escherichia coli (8-294/298) O55:H7 str. CB9615 │ ││ ├─ Escherichia coli (8-294/298) O157:H7 str. TW14588 │ ││ ├─ Escherichia coli (8-294/298) O157:H7 str. Sakai │ ││ ├─ Escherichia coli (8-294/298) O157:H7 str. FRIK2000 │ ││ ├─ Escherichia coli (8-294/298) O157:H7 str. EC4501 │ ││ ├─ Escherichia coli (8-294/298) O157:H7 str. EC4206 │ ││ ├─ Escherichia coli (8-294/298) O157:H7 str. EC4115 │ ││ ├─ Escherichia coli (8-294/298) O157:H7 str. EC4076 │ ││ ├─ Escherichia coli (8-294/298) O157:H7 str. EC4042 │ ││ ├─ Escherichia coli (8-294/298) O157:H7 EDL933 │ ││ ├─ Escherichia coli (8-294/298) O157:H7 │ ││ ├─ Escherichia coli (8-294/298) 1212A │ ││ └─ Escherichia coli (8-294/298) 1044A │ ││ ┌─ Escherichia coli (8-294/298) 042 │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (8-294/298) 042 │ ││┌┴─ Escherichia coli (8-294/298) TA280 │ │││ ┌─ Escherichia coli (8-294/298) E24377A │ │││ ├─ Escherichia coli (8-294/298) IAI1 │ ┌┤└┤ ├─ Escherichia coli (8-294/298) MS 182-1 │ ││ │┌┼─ Escherichia coli (8-294/298) MS 78-1 │ ││ ││├─ Escherichia coli (8-294/298) IAI1 │ ││ └┤└─ Escherichia coli (8-294/298) E24377A │ ││ │┌─ Escherichia coli (8-294/298) NC101 │ ││ ││ ┌─ Escherichia coli (8-294/298) F11 │ ││ └┤ ┌┼─ Escherichia coli (8-294/298) MS 200-1 │ ││ │┌┤└─ Escherichia coli (8-294/298) F11 │ ││ ││└┬─ Escherichia coli (8-294/298) 536 │ ││ └┤ └─ Escherichia coli (8-294/298) 536 │ ││ │┌─ Escherichia coli (8-294/298) O83:H1 str. NRG 857C │ ││ ││┌─ Escherichia coli (8-294/298) APEC O1 │ ┌────────────────────────────┤│ └┤├─ Escherichia coli (8-294/298) M605 │ │ ││ │├─ Escherichia coli (8-294/298) SE15 │ │ ││ │├─ Escherichia coli (8-294/298) UTI89 │ │ ││ └┼─ Escherichia coli (8-294/298) UTI89 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (8-294/298) UM146 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (8-294/298) S88 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (8-294/298) IHE3034 │ │ ││ └─ Escherichia coli (8-294/298) APEC O1 └───────────┤ ││┌─ Escherichia coli (8-294/298) E2348/69 │ │└┼─ Escherichia coli (8-294/298) WV_060327 │ │ └─ Escherichia coli (8-294/298) 2362-75 │ └─ Escherichia coli (1-278/282) O127:H6 str. E2348/69 │ ┌─ Escherichia coli NC101 │ │ ┌─ Escherichia coli 1044A │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 └───────────────────┤┌┼─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai ││├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 ││└─ Escherichia coli O157:H7 ││ ┌─ Escherichia coli FVEC1302 └┤ ├─ Escherichia coli MS 198-1 │┌┼─ Escherichia coli UMN026 ││├─ Escherichia coli MS 69-1 ││└─ Escherichia coli FVEC1412 ││┌─ Escherichia coli M718 └┤│ ┌─ Escherichia coli IAI39 ││ ┌┴─ Escherichia coli IAI39 ││┌┴─ Escherichia coli MS 145-7 │││ ┌─ Escherichia coli ATCC 8739 │││┌┴─ Escherichia coli ATCC 8739 └┤││ ┌─ Escherichia coli APEC O1 │││ ├─ Escherichia coli IHE3034 │││ ├─ Escherichia coli UM146 │││ ┌┼─ Escherichia coli UTI89 │││ │├─ Escherichia coli UTI89 │││ ┌┤├─ Escherichia coli S88 └┤│ ││└─ Escherichia coli APEC O1 ││┌┤└─ Escherichia coli (4-282/283) 1827-70 │││└┬─ Escherichia coli (1-297/298) HS │││ └─ Escherichia coli (1-297/298) HS │││┌─ fig|6666666.5357.peg.1498 TY-2482 strain │││├─ Escherichia coli 042 │││├─ Escherichia coli 1125A │││├─ Escherichia coli 2362-75 │││├─ Escherichia coli 536 │││├─ Escherichia coli 53638 └┤│├─ Escherichia coli 55989 ││├─ Escherichia coli 83972 ││├─ Escherichia coli B str. REL606 ││├─ Escherichia coli B171 ││├─ Escherichia coli B185 ││├─ Escherichia coli B7A ││├─ Escherichia coli BL21 ││├─ Escherichia coli BW2952 ││├─ Escherichia coli CFT073 ││├─ Escherichia coli E110019 ││├─ Escherichia coli E22 ││├─ Escherichia coli E2348/69 ││├─ Escherichia coli E24377A ││├─ Escherichia coli ED1a ││├─ Escherichia coli ETEC H10407 ││├─ Escherichia coli F11 ││├─ Escherichia coli H591 ││├─ Escherichia coli IAI1 └┤├─ Escherichia coli K12 │├─ Escherichia coli M605 │├─ Escherichia coli MS 115-1 │├─ Escherichia coli MS 119-7 │├─ Escherichia coli MS 146-1 │├─ Escherichia coli MS 182-1 │├─ Escherichia coli MS 187-1 │├─ Escherichia coli MS 200-1 │├─ Escherichia coli MS 45-1 │├─ Escherichia coli MS 84-1 │├─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 │├─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 │├─ Escherichia coli OP50 │├─ Escherichia coli SE15 │├─ Escherichia coli TA143 │├─ Escherichia coli TA271 │├─ Escherichia coli W │├─ Escherichia coli W3110 │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 └┼─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B ├─ Escherichia coli WV_060327 ├─ Escherichia coli W ├─ Escherichia coli TA280 ├─ Escherichia coli TA206 ├─ Escherichia coli SMS-3-5 ├─ Escherichia coli SE11 ├─ Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C ├─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4486 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 ├─ Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 ├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 ├─ Escherichia coli MS 78-1 ├─ Escherichia coli MS 21-1 ├─ Escherichia coli MS 196-1 ├─ Escherichia coli MS 185-1 ├─ Escherichia coli MS 175-1 ├─ Escherichia coli MS 124-1 ├─ Escherichia coli MS 116-1 ├─ Escherichia coli MS 107-1 ├─ Escherichia coli KO11 ├─ Escherichia coli IAI1 ├─ Escherichia coli H736 ├─ Escherichia coli H299 ├─ Escherichia coli F11 ├─ Escherichia coli ED1a ├─ Escherichia coli EC4100B ├─ Escherichia coli E24377A ├─ Escherichia coli E22 ├─ Escherichia coli E110019 ├─ Escherichia coli DH1 ├─ Escherichia coli CFT073 ├─ Escherichia coli (DE3) BL21(DE3) ├─ Escherichia coli B7A ├─ Escherichia coli B354 ├─ Escherichia coli B171 ├─ Escherichia coli B088 ├─ Escherichia coli ABU 83972 ├─ Escherichia coli 55989 ├─ Escherichia coli 536A ├─ Escherichia coli 53638 ├─ Escherichia coli 536 ├─ Escherichia coli 1212A ├─ Escherichia coli 101-1 ├─ Escherichia coli 042 └─ fig|1040638.4.peg.2558 O104:H4 str. LB226692
| Tyrosine recombinase XerC | (129) |
| Tyrosine recombinase XerD | (109) |
| Phage integrase | (33) |
| Site-specific recombinase XerD | (23) |
| Integrase | (7) |
| COG0582: Integrase | (2) |
| putative phage integrase | (1) |
| integrase | (1) |
| Others | (4) |