┌─ Escherichia coli (9-50/225) E110019 ├─ Escherichia coli (9-50/225) 1044A ├─ Escherichia coli (9-50/225) 1212A ├─ Escherichia coli (9-50/225) MS 107-1 ├─ Escherichia coli (9-50/225) MS 84-1 ├─ Escherichia coli (1-42/217) E110019 ├─ Escherichia coli (9-50/225) H299 ├─ Escherichia coli (1-42/217) FVEC1412 ├─ Escherichia coli (1-42/217) MS 198-1 ├─ Escherichia coli (1-42/217) O157:H7 ├─ Escherichia coli (1-42/217) UMN026 ├─ Escherichia coli (32-73/248) MS 69-1 ├─ Escherichia coli (32-73/248) O157:H7 str. EC4024 ├─ Escherichia coli (32-73/248) O157:H7 str. EC4045 ├─ Escherichia coli (32-73/248) O157:H7 str. EC4113 ├─ Escherichia coli (32-73/248) O157:H7 str. EC4196 ├─ Escherichia coli (32-73/248) O157:H7 str. EC4401 ├─ Escherichia coli (32-73/248) O157:H7 str. EC4501 ├─ Escherichia coli (32-73/248) O157:H7 str. EC869 ├─ Escherichia coli (32-73/248) O157:H7 str. FRIK966 ├─ Escherichia coli (32-73/248) O157:H7 str. TW14359 ├─ Escherichia coli (32-73/248) O55:H7 str. CB9615 ├─ Escherichia coli (32-73/248) O55:H7 str. CB9615 ├─ Escherichia coli (32-73/248) O55:H7 str. CB9615 ├─ Escherichia coli (132-173/348) SMS-3-5 ┌┼─ Escherichia coli (32-73/248) MS 187-1 │├─ Escherichia coli (32-73/248) 101-1 │├─ Escherichia coli (32-73/248) O55:H7 str. CB9615 │├─ Escherichia coli (32-73/248) O55:H7 str. CB9615 │├─ Escherichia coli (32-73/248) O55:H7 str. CB9615 │├─ Escherichia coli (32-73/248) O157:H7 str. TW14588 │├─ Escherichia coli (32-73/248) O157:H7 str. Sakai │├─ Escherichia coli (32-73/248) O157:H7 str. FRIK2000 │├─ Escherichia coli (32-73/248) O157:H7 str. EC508 │├─ Escherichia coli (133-174/349) O157:H7 str. EC4486 │├─ Escherichia coli (32-73/248) O157:H7 str. EC4206 │├─ Escherichia coli (32-73/248) O157:H7 str. EC4115 │├─ Escherichia coli (32-73/248) O157:H7 str. EC4076 │├─ Escherichia coli (32-73/248) O157:H7 str. EC4042 │├─ Escherichia coli (32-73/248) O157:H7 EDL933 ┌─┤├─ Escherichia coli (1-42/217) UMN026 │ │├─ Escherichia coli (1-42/217) UMN026 │ │├─ Escherichia coli (1-42/217) MS 78-1 │ │├─ Escherichia coli (1-42/217) M605 │ │├─ Escherichia coli (9-50/225) MS 182-1 │ │├─ Escherichia coli (1-42/217) E110019 │ │├─ Escherichia coli (9-50/225) O157:H7 EDL933 │ │├─ Escherichia coli (9-50/225) MS 124-1 │ │├─ Escherichia coli (9-50/225) 536A │ │├─ Escherichia coli (9-50/225) 1125A │ │└─ Escherichia coli (9-50/225) E110019 │ │ ┌─ Escherichia coli (25-66/159) E2348/69 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (25-66/159) E2348/69 │ │┌──┴─┬─ Escherichia coli (9-50/149) 536 │ ││ └─ Escherichia coli (9-50/149) 536 │ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-42/217) SMS-3-5 │ │ ├─ Escherichia coli (32-73/110) IAI39 │ └─┼─ Escherichia coli (64-105/115) SMS-3-5 │ ├─ Escherichia coli (32-73/110) IAI39 ┌─┤ └─ Escherichia coli (1-42/217) SMS-3-5 │ │┌─ Escherichia coli (9-50/225) B7A │ │├─ Escherichia coli (9-50/225) B7A │ │├─ Escherichia coli (9-50/225) E110019 │ │├─ Escherichia coli (9-50/225) SMS-3-5 │ │├─ fig|1040638.4.peg.3060 O104:H4 (1-42/217) str. LB226692 │ │├─ Escherichia coli (1-42/217) 55989 │ │├─ Escherichia coli (1-42/217) E110019 │ │├─ Escherichia coli (1-42/217) EC4100B │ │├─ Escherichia coli (1-42/217) MS 145-7 │ │├─ Escherichia coli (1-42/217) O111:H- str. 11128 │ │├─ Escherichia coli (1-42/217) TA271 │ │├─ Escherichia coli (1-42/217) W │ │├─ Escherichia coli (1-42/217) EC4100B │ │├─ Escherichia coli (1-42/217) O111:H- str. 11128 │ │├─ Escherichia coli (32-73/248) B7A │ │├─ Escherichia coli (32-73/248) O103:H2 str. 12009 │ │├─ Escherichia coli (32-73/248) B7A │ │├─ Escherichia coli (32-73/248) 101-1 │ └┼─ Escherichia coli (32-73/207) B7A ┌────────────────────────────────────┤ ├─ Escherichia coli (9-50/184) B7A │ │ ├─ Escherichia coli (32-73/248) E110019 │ │ ├─ Escherichia coli (32-73/248) SE11 │ │ ├─ Escherichia coli (32-73/248) B7A │ │ ├─ Escherichia coli (32-73/248) B7A │ │ ├─ Escherichia coli (1-42/217) H591 │ │ ├─ Escherichia coli (1-42/217) W │ │ ├─ Escherichia coli (1-42/217) W │ │ ├─ Escherichia coli (1-42/217) O111:H- str. 11128 │ │ ├─ Escherichia coli (1-42/217) O111:H- str. 11128 │ │ ├─ Escherichia coli (1-42/217) KO11 │ │ ├─ Escherichia coli (1-42/217) E110019 │ │ ├─ Escherichia coli (1-42/217) E110019 │ │ ├─ fig|6666666.5357.peg.1274 TY-2482 (1-42/217) strain │ │ ├─ Escherichia coli (9-50/225) E110019 ┤ │ ├─ Escherichia coli (9-50/225) E110019 │ │ ├─ Escherichia coli (9-50/225) B7A │ │ ├─ Escherichia coli (9-50/225) B7A │ │ └─ Escherichia coli (9-50/225) 55989 │ └─ Escherichia coli (32-73/248) TA280 │ ┌── Escherichia coli (59-100/275) MS 107-1 │ ┌─────┴─ Escherichia coli (1-33/60) MS 196-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (9-50/143) 536 │ │ ┌────────┴─ Escherichia coli (9-50/143) 536 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (9-50/225) 536 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-50/225) 536 │ │ │ ├─ Escherichia coli (57-98/273) WV_060327 │ │ │ ├─ Escherichia coli (63-104/197) E2348/69 │ │ │ ├─ Escherichia coli (63-104/279) O157:H7 str. Sakai │ │ │ ├─ Escherichia coli (63-104/279) 536 │ │ │ ├─ Escherichia coli (63-104/279) O157:H7 str. EC4024 └───┤ │ ├─ Escherichia coli (63-104/279) O157:H7 str. EC4045 │ │ ├─ Escherichia coli (63-104/279) O157:H7 str. EC4113 │ │ ├─ Escherichia coli (63-104/279) O157:H7 str. EC4196 │ │ ├─ Escherichia coli (63-104/279) O157:H7 str. EC4401 │ │ ├─ Escherichia coli (63-104/279) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (63-104/279) O157:H7 str. EC4501 │ │ ├─ Escherichia coli (63-104/279) O157:H7 str. EC869 │ │ ├─ Escherichia coli (63-104/279) O157:H7 str. FRIK966 │ │ ├─ Escherichia coli (57-98/273) O157:H7 │ │ ├─ Escherichia coli (57-98/273) 1125A └────────────────┤ ├─ Escherichia coli (57-98/273) 536A │ ├─ Escherichia coli (57-98/273) O157:H7 str. TW14588 │ ┌──────┼─ Escherichia coli (57-98/191) 2362-75 │ │ ├─ Escherichia coli (57-98/273) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (57-98/273) 1212A │ │ ├─ Escherichia coli (57-98/273) 1044A │ │ ├─ Escherichia coli (63-104/279) O157:H7 str. TW14359 │ │ ├─ Escherichia coli (63-104/279) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ ├─ Escherichia coli (63-104/279) O157:H7 str. EC508 │ │ ├─ Escherichia coli (63-104/279) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (63-104/279) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (63-104/279) O157:H7 str. EC4206 │ │ ├─ Escherichia coli (63-104/279) O157:H7 str. EC4115 │ │ ├─ Escherichia coli (63-104/279) O157:H7 str. EC4076 │ │ ├─ Escherichia coli (63-104/279) O157:H7 str. EC4042 │ │ ├─ Escherichia coli (63-104/279) 536 │ │ ├─ Escherichia coli (63-104/279) 536 │ │ ├─ Escherichia coli (63-104/197) O127:H6 str. E2348/69 └─────────────┤ ├─ Escherichia coli (57-98/273) WV_060327 │ ├─ Escherichia coli (57-98/273) WV_060327 │ └─ Escherichia coli (9-50/225) 536 │ ┌─ Escherichia coli (63-104/199) ATCC 8739 │┌─┴─ Escherichia coli (63-104/199) ATCC 8739 ││ ┌─ Escherichia coli (63-104/199) 042 ││ ├─ Escherichia coli (63-104/199) 101-1 ││ ├─ Escherichia coli (63-104/169) 042 ││ ├─ Escherichia coli (1-42/79) BW2952 ││ ├─ Escherichia coli (1-42/79) H736 ││ ├─ Escherichia coli (1-42/79) str. K-12 substr. MG1655 ││ ├─ Escherichia coli (63-104/141) 55989 ││ ├─ Escherichia coli (63-104/141) B171 ││ ├─ Escherichia coli (63-104/141) E24377A ││ ├─ Escherichia coli (63-104/141) K12 ││ ├─ Escherichia coli (63-104/141) str. K-12 substr. DH10B └┤┌┼─ Escherichia coli (63-104/141) str. K-12 substr. DH10B ││├─ Escherichia coli (63-104/141) W3110 ││├─ Escherichia coli (63-104/141) E24377A ││├─ Escherichia coli (63-104/141) B171 ││├─ Escherichia coli (63-104/141) 55989 ││├─ fig|1040638.4.peg.696 O104:H4 (63-104/141) str. LB226692 ││├─ Escherichia coli (1-42/79) str. K-12 substr. MG1655 ││├─ Escherichia coli (1-42/79) DH1 ││├─ Escherichia coli (63-104/156) MS 175-1 ││├─ Escherichia coli (63-104/279) MS 115-1 ││└─ Escherichia coli (63-104/199) 042 ││ ┌─ Escherichia coli (1-42/137) MS 78-1 ││ ├─ Escherichia coli (63-104/199) IAI39 └┤ ├─ Escherichia coli (63-104/199) E110019 │ ┌┼─ Escherichia coli (1-42/79) 1827-70 │ │├─ Escherichia coli (63-104/199) IAI39 │┌┤└─ Escherichia coli (1-42/137) O26:H11 str. 11368 │││┌─ Escherichia coli (1-33/128) S88 ││└┼─ Escherichia coli (1-33/70) ED1a ││ ├─ Escherichia coli (1-33/70) ED1a ││ └─ Escherichia coli (1-33/128) E110019 ││ ┌─ Escherichia coli (1-33/126) 042 ││ ┌┴─ fig|1040638.4.peg.288 O104:H4 (1-33/70) str. LB226692 ││ ┌─┴─ Escherichia coli (63-104/197) 042 ││ │ ┌─ Escherichia coli (51-84/88) MS 107-1 ││ │ ├─ Escherichia coli (1-34/38) ED1a └┤ │ ├─ Escherichia coli (1-34/38) M718 │ │ ├─ Escherichia coli (1-34/38) S88 │ │ ┌────────────────────────┼─ Escherichia coli (1-34/38) SMS-3-5 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-34/38) MS 119-7 │ │ ┌─────┤ ├─ Escherichia coli (1-34/38) ED1a │ │ │ │ └─ Escherichia coli (1-34/38) APEC O1 │ │ │ └┬───────── fig|1040638.4.peg.2513 O104:H4 str. LB226692 │ │ │ └┬──── Escherichia coli E24377A │ │ ┌┤ └───┬──── Escherichia coli (9-50/97) MS 21-1 │ │ ││ └───────┬─ Escherichia coli (63-104/383) 55989 └─┤ ││ └─ Escherichia coli (9-50/329) 55989 │ ┌┤└─┬─ Escherichia coli (1-42/79) ED1a │ ││ └─ Escherichia coli (1-33/70) ED1a │┌┤└─ Escherichia coli (1-41/216) TA271 │││┌─ Escherichia coli (1-39/214) FVEC1302 ││└┤┌────── Escherichia coli (15-53/90) MS 119-7 ││ └┤┌─── Escherichia coli (67-108/157) MS 196-1 ││ └┤┌─ Escherichia coli (DE3 1-33/128) BL21(DE3) ││ └┼─ Escherichia coli (1-33/70) MS 124-1 ││ ├─ Escherichia coli (1-33/70) E24377A ││ └─ Escherichia coli (1-33/128) BL21 ││┌─ Escherichia coli (1-42/137) B str. REL606 ││├─ Escherichia coli (1-42/137) DH1 ││├─ Escherichia coli (1-42/137) FVEC1412 └┤├─ Escherichia coli (1-42/137) UMN026 │├─ Escherichia coli (1-42/137) str. K-12 substr. MG1655 │├─ Escherichia coli (1-42/135) O127:H6 str. E2348/69 │├─ Escherichia coli (62-103/198) K12 │├─ Escherichia coli (11-52/227) FVEC1412 │├─ Escherichia coli (63-104/279) B str. REL606 │├─ Escherichia coli (DE3 63-104/279) BL21(DE3) │├─ Escherichia coli (63-104/279) M718 │├─ Escherichia coli (57-98/273) 2362-75 │├─ Escherichia coli (1-42/79) B171 │├─ Escherichia coli (63-104/197) E2348/69 │├─ Escherichia coli (63-104/272) 042 └┼─ Escherichia coli (63-104/230) O26:H11 str. 11368 ├─ Escherichia coli (169-210/232) TA271 ├─ Escherichia coli (63-104/272) 042 ├─ Escherichia coli (1-42/79) TA271 ├─ Escherichia coli (1-42/79) B171 ├─ Escherichia coli (63-104/279) MS 124-1 ├─ Escherichia coli (63-104/279) UMN026 ├─ Escherichia coli (63-104/279) BL21 ├─ Escherichia coli (63-104/279) TA143 ├─ Escherichia coli (62-103/198) str. K-12 substr. DH10B ├─ Escherichia coli (1-42/217) H299 ├─ Escherichia coli (1-42/137) str. K-12 substr. MG1655 ├─ Escherichia coli (1-42/137) str. K-12 substr. DH10B ├─ Escherichia coli (1-42/137) MS 145-7 ├─ Escherichia coli (1-42/137) FVEC1302 ├─ Escherichia coli (1-42/137) BW2952 └─ Escherichia coli (1-42/137) 2362-75
| Transposase | (80) |
| Putative transposase | (75) |
| COG2801: Transposase and inactivated derivatives | (31) |
| hypothetical protein | (9) |
| IS911 ORF2 | (7) |
| partial transposase of insertion element IS911A | (5) |
| putative transposase | (4) |
| Putative uncharacterized protein (Putative InsF transposase) | (4) |
| IS911 orfB | (2) |
| KpLE2 phage-like element; partial transposase of insertion element IS911B | (2) |
| CP4-6 prophage; partial transposase of insertion element IS911A | (2) |
| transposase ORF B (fragment), IS3 family | (1) |
| IS3 Transposase ORF2 | (1) |
| IS, phage, Tn; Transposon-related functions | (1) |
| putative reverse transcriptase | (1) |
| IS911, transposase orfB | (1) |
| Others | (7) |