┌─ Escherichia coli (8-396/413) 53638 (1) ┌─┴─ Escherichia coli (8-396/413) B185 ┌┴─ Escherichia coli (8-396/414) 042 (1) ┌────────┴─┬─ Escherichia coli (8-396/413) O111:H- str. 11128 ┌─┤ └─ Escherichia coli (8-396/413) ED1a (3) │ └─────┬── Escherichia coli (8-397/398) ATCC 8739 ┌──┤ └─ Escherichia coli (8-400/403) M605 │ └──────┬── fig|6666666.5357.peg.4073 TY-2482 (8-395/413) strain (5) │ └┬─ Escherichia coli (8-396/396) WV_060327 │ └┬─ Escherichia coli (8-395/413) MS 146-1 ┌──┤ └┬─ Escherichia coli (8-395/413) MS 115-1 │ │ └┬─ Escherichia coli (8-395/413) str. K-12 substr. DH10B (1) │ │ └─ Escherichia coli (8-395/413) K12 (5) │ │ ┌── Escherichia coli (22-422/423) 042 (2) │ └────────────┤ ┌─ Escherichia coli (8-408/409) MS 78-1 ┌────┤ └┬┴─ Escherichia coli (8-408/409) 101-1 (6) │ │ └┬─ Escherichia coli (22-422/423) ETEC H10407 │ │ └─┬─ Escherichia coli (22-417/423) B088 (13) ┌─┤ │ └─ Escherichia coli (22-417/423) O55:H7 str. CB9615 │ │ └────────────────────────── Escherichia coli (6-399/412) 1125A (3) │ └─────────────────┬─────────────────── Escherichia coli (35-424/425) E2348/69 (1) │ └─────────────── fig|6666666.5357.peg.1533 TY-2482 (4-404/405) strain │ ┌─ Escherichia coli (1-420/421) FVEC1302 (3) │ ┌┴─ Escherichia coli (1-420/421) MS 21-1 │ ┌┴─ Escherichia coli (1-420/421) 83972 (4) │ ┌┴─ Escherichia coli (1-420/421) CFT073 (1) │ ┌┴┬─ Escherichia coli ATCC 8739 (1) │ │ └┬─ Escherichia coli ED1a (1) │ ┌┤ └─ Escherichia coli H591 │ │└┬─ Escherichia coli (1-420/421) M605 │ │ └─ Escherichia coli B185 │ ┌┤ ┌─ fig|1040638.4.peg.832 O104:H4 str. LB226692 (2) │ ││ ┌┴─ Escherichia coli 2362-75 │ ││┌┴─ Escherichia coli H299 │ │└┤┌─ Escherichia coli MS 187-1 │ │ └┤┌─ Escherichia coli MS 107-1 │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-420/421) MS 124-1 (1) │ ┌┤ └┬┴─ Escherichia coli M718 │ ││ └┬─ Escherichia coli (1-420/421) MS 200-1 │ ││ └─ Escherichia coli (1-420/421) MS 185-1 │ ││┌─ Escherichia coli (1-420/421) O26:H11 str. 11368 │ │││ ┌─ Escherichia coli (1-420/421) B171 (12) │ │└┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-420/421) 1044A (25) │ │ │┌┴─ Escherichia coli (1-420/421) ATCC 8739 (1) │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli ED1a (1) │ ┌───┤ └┬┴─ Escherichia coli MS 107-1 │ │ │ └┬─ Escherichia coli CFT073 (1) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-420/421) IAI39 (1) │ │ │ └┬─ Escherichia coli IAI39 (1) │ │ │ └─ Escherichia coli APEC O1 (3) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-420/421) EC4100B │ ┌──┤ │┌┴─ Escherichia coli (1-418/419) O111:H- str. 11128 │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli NC101 │ │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-420/421) 536 (3) │ │ │ └┬┴─ Escherichia coli (1-420/421) 042 (1) │ │ │ └┬─ Escherichia coli E24377A (1) │ │ │ └─ fig|1040638.4.peg.2500 O104:H4 str. LB226692 (4) │ ┌─┤ └──── Escherichia coli (1-414/417) MS 115-1 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (23-444/444) E2348/69 (2) │ │ │ ┌─┴─ Escherichia coli (1-422/424) O111:H- str. 11128 │ │ │ ┌─────────┴─── Escherichia coli (1-421/424) ED1a (1) │ │ │┌─┴┬────── Escherichia coli (1-414/420) MS 107-1 ┤ │ ││ └─── Escherichia coli (1-413/415) MS 115-1 │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-415/416) MS 115-1 │ │ │┌───┴─ Escherichia coli (1-413/416) IAI1 (1) │ │ └┤┌──── Escherichia coli KO11 (2) │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-421/422) B7A (1) │ │ └┤ ┌┴── Escherichia coli (1-415/417) 042 (1) │ ┌─┤ │┌─┴─── Escherichia coli (1-417/422) W (1) │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli TA271 │ │ │ └┤┌─┴─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli 83972 (4) │ │ │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli UTI89 (1) │ │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli 536 (1) │ │ │ └──┤ ┌─ Escherichia coli (1-420/421) 55989 (5) │ │ │ └┬┴─ Escherichia coli (1-420/421) M718 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-420/421) ED1a (1) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-405/413) H736 │ ┌───────┤ │ └─ Escherichia coli (1-420/421) ETEC H10407 (3) │ │ │ └─────┬─────────── Escherichia coli (26-440/445) M605 │ │ │ └─┬────── Escherichia coli (8-425/427) MS 116-1 (1) │ │ │ └──┬─ Escherichia coli (1-416/418) EC4100B │ │ │ └┬── Escherichia coli (1-419/424) O157:H7 str. EC869 (2) │ │ │ └┬─ Escherichia coli IHE3034 (1) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-416/420) O26:H11 str. 11368 │ │ │ └─ Escherichia coli (1-419/421) TA280 │ │ │┌──────────── Escherichia coli (25-440/443) MS 145-7 │ │ └┤ ┌─── Escherichia coli (1-415/420) WV_060327 │ │ └───┬──────┴──── Escherichia coli (2-415/420) TA206 │ │ └─────┬─── Escherichia coli (1-417/423) 536 (13) │ │ └──┬─ Escherichia coli (1-415/420) ED1a (1) │ │ └┬─ Escherichia coli (1-415/420) FVEC1302 (1) │ │ └┬─ Escherichia coli (1-415/420) IAI39 (2) │ │ └┬─ Escherichia coli (1-415/420) H299 │ │ └─ fig|1040638.4.peg.3509 O104:H4 (1-415/420) str. LB226692 (9) │ │ ┌─ Escherichia coli (8-401/412) IHE3034 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (8-401/412) TA280 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (8-401/412) 53638 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (8-401/412) F11 (2) │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (8-401/412) O157:H7 str. EC4401 (1) │ │ ┌──┤ └─ Escherichia coli (8-391/407) O157:H7 str. EC4501 (1) │ │ ┌──┤ └─ Escherichia coli (8-401/412) MS 175-1 │ │ ┌─────────────┤ └─── Escherichia coli (8-391/409) E110019 (1) │ │ ┌────────┤ └───── Escherichia coli (8-390/406) SMS-3-5 │ │ │ └────┬────────────── Escherichia coli (406-793/807) 042 (1) │ │ ┌──────────┤ └───────────── Escherichia coli (7-396/413) MS 124-1 (1) └─┤ ┌──────────┤ └───────────────────────────── Escherichia coli (1-397/412) MS 182-1 │ │ └───────────────────────┬── Escherichia coli (4-408/417) 83972 (1) │ │ └┬─ Escherichia coli (32-446/447) 042 (1) │ │ └┬─ Escherichia coli (4-403/417) MS 21-1 │ │ └┬─ Escherichia coli (4-418/419) 2362-75 │ │ └─ Escherichia coli (4-418/419) MS 182-1 │ ┌────┤ ┌─ Escherichia coli (2-391/396) B354 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (2-391/396) MS 115-1 │ │ │ ┌─┴─ Escherichia coli (2-391/395) HS (1) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (2-391/395) 2362-75 │ │ │ ┌──────┴── Escherichia coli (2-391/402) B7A (1) │ │ └───────────────┤ ┌── Escherichia coli (2-392/417) E2348/69 (1) │ │ └──────────┤┌─ Escherichia coli (2-392/415) M605 │ ┌────┤ └┤┌─ Escherichia coli (2-392/418) APEC O1 (1) │ │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (2-392/418) MS 196-1 │ │ │ └┬┴─ Escherichia coli (2-392/416) IAI39 (2) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (2-392/416) FVEC1302 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (2-392/418) ETEC H10407 │ │ │ └─ Escherichia coli (2-392/416) MS 198-1 │ │ └────────────────────┬─ Escherichia coli (2-384/391) SE15 │ │ └─ Escherichia coli (2-391/391) WV_060327 │ │ ┌─ Escherichia coli (14-393/397) TA143 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (14-393/397) H591 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (2-385/385) B7A (1) │ │ ┌┴─ fig|6666666.5357.peg.3503 TY-2482 (2-382/385) strain (2) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (2-381/385) MS 119-7 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (2-381/385) B088 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (2-381/385) E2348/69 (1) └─┤ ┌┴┬─ Escherichia coli (14-397/397) B354 │ ┌┤ └─ Escherichia coli (2-385/385) K12 (14) │ │└┬─ Escherichia coli (2-385/385) KO11 (2) │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (2-385/385) IAI39 (1) │ ││ └─ Escherichia coli (2-385/385) O26:H11 str. 11368 │ ┌┤└─ Escherichia coli (2-381/385) TA271 │ │└┬─ Escherichia coli (14-397/397) O55:H7 str. CB9615 │ ┌───────────────┤ └─ Escherichia coli (14-397/397) 1044A (24) │ ┌───┤ └─ Escherichia coli (2-381/385) FVEC1302 (1) │ │ └─────────────────┬─ Escherichia coli (33-416/428) ATCC 8739 (1) │ │ └─┬─ Escherichia coli (6-400/402) MS 187-1 │ │ └─ Escherichia coli (35-419/431) K12 (5) │ │ ┌─ Escherichia coli (1-388/396) MS 124-1 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-388/396) MS 84-1 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (1-388/394) E24377A (1) └───┤ ┌────┤ └─ Escherichia coli (1-388/394) SMS-3-5 │ │ └┬─ Escherichia coli (1-388/392) MS 21-1 │ ┌───┤ └─ Escherichia coli (1-388/396) TA280 │ │ └──────────────── Escherichia coli (1-392/393) ED1a (1) │ │ ┌─ Escherichia coli (1-388/404) ETEC H10407 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-388/404) MS 124-1 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-388/404) NC101 └─┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-388/404) 83972 (1) │ ┌──┴─ fig|1040638.4.peg.5408 O104:H4 (1-388/404) str. LB226692 (3) │ ┌───┴───┬─ Escherichia coli (1-387/396) SE11 │┌┤ └─ Escherichia coli (14-408/415) HS (1) ││└─────────── Escherichia coli (1-391/396) MS 124-1 (1) └┤ ┌───────── Escherichia coli (17-403/407) SE15 │ ┌─┴──────── Escherichia coli (14-401/417) ED1a (1) └─┤ ┌────── Escherichia coli O26:H11 str. 11368 └──┤ ┌──── Escherichia coli (33-438/439) KO11 (2) │ │ ┌─ Escherichia coli (1-388/396) H299 └─┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-388/396) ETEC H10407 │ │ ┌─ Escherichia coli (25-415/417) 1044A (24) └─┤ ┌┴─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. EC508 │ ┌┴─ Escherichia coli (25-419/427) 83972 (2) │┌┴─ Escherichia coli (1-388/393) 536 (1) └┤┌─ Escherichia coli (1-392/394) TA280 └┤ ┌─ fig|1040638.4.peg.393 O104:H4 (1-388/394) str. LB226692 └┬┴─ Escherichia coli (1-388/394) 101-1 (8) └┬─ Escherichia coli (1-388/394) MS 182-1 └─ Escherichia coli (1-388/394) IAI39 (1)
| Integrase | (85) |
| Phage integrase | (24) |
| Phage integrase, Phage P4-associated | (12) |
| FIG016809: Prophage P4 integrase | (9) |
| Phage Integrase | (8) |
| Prophage CP4-57 integrase | (7) |
| Putative integrase | (5) |
| COG0582: Integrase | (4) |
| putative prophage integrase | (3) |
| integrase-like protein | (2) |
| site-specific recombinase, phage integrase family | (1) |
| prophage P4 integrase | (1) |
| putative P4-type integrase | (1) |
| putative phage integrase | (1) |
| Putative prophage Sf6-like integrase | (1) |
| IS, phage, Tn; Phage-related functions and prophages | (1) |
| putative integrase prophage protein | (1) |
| Putative P4-family integrase | (1) |
| Prophage P4 integrase | (1) |
| Others | (8) |