┌─ fig|1040638.4.peg.3341 O104:H4 (30-278/285) str. LB226692 ├─ Escherichia coli (30-278/285) 042 ├─ Escherichia coli (30-278/285) 101-1 ├─ Escherichia coli (30-278/285) 2362-75 ├─ Escherichia coli (30-278/285) 536 ├─ Escherichia coli (30-278/285) 53638 ├─ Escherichia coli (30-278/285) 55989 ├─ Escherichia coli (30-278/285) ABU 83972 ├─ Escherichia coli (30-278/285) APEC O1 ├─ Escherichia coli (30-278/285) ATCC 8739 ├─ Escherichia coli (30-278/285) B088 ├─ Escherichia coli (30-278/285) B171 ├─ Escherichia coli (30-278/285) BL21 ├─ Escherichia coli (30-278/285) BW2952 ├─ Escherichia coli (30-278/285) CFT073 ├─ Escherichia coli (30-278/285) E110019 ├─ Escherichia coli (30-278/285) E22 ├─ Escherichia coli (30-278/285) E2348/69 ├─ Escherichia coli (30-278/285) E24377A ├─ Escherichia coli (30-278/285) ED1a ├─ Escherichia coli (30-278/285) ETEC H10407 ├─ Escherichia coli (30-278/285) F11 ├─ Escherichia coli (30-278/285) H591 ├─ Escherichia coli (30-278/285) HS ├─ Escherichia coli (30-278/285) IAI1 ├─ Escherichia coli (30-278/285) IHE3034 ├─ Escherichia coli (30-278/285) KO11 ├─ Escherichia coli (30-278/285) MS 107-1 ├─ Escherichia coli (30-278/285) MS 116-1 ├─ Escherichia coli (30-278/285) MS 124-1 ├─ Escherichia coli (30-278/285) MS 182-1 ├─ Escherichia coli (30-278/285) MS 187-1 ├─ Escherichia coli (30-278/285) MS 200-1 ├─ Escherichia coli (30-278/285) MS 78-1 ├─ Escherichia coli (30-278/285) O103:H2 str. 12009 ├─ Escherichia coli (30-278/285) O127:H6 str. E2348/69 ├─ Escherichia coli (30-278/285) O83:H1 str. NRG 857C ├─ Escherichia coli (30-278/285) SE11 ├─ Escherichia coli (30-278/285) TA206 ├─ Escherichia coli (30-278/285) TA280 ├─ Escherichia coli (30-278/285) UTI89 ├─ Escherichia coli (30-278/285) W ├─ Escherichia coli (30-278/285) W3110 ├─ Escherichia coli (30-278/285) str. K-12 substr. DH10B ├─ Escherichia coli (30-278/285) str. K-12 substr. MG1655 ┌┼─ Escherichia coli (30-278/285) str. K-12 substr. MG1655 │├─ Escherichia coli (30-278/285) str. K-12 substr. DH10B │├─ Escherichia coli (30-278/285) WV_060327 │├─ Escherichia coli (30-278/285) W │├─ Escherichia coli (30-278/285) UTI89 │├─ Escherichia coli (30-278/285) UM146 │├─ Escherichia coli (30-278/285) TA271 │├─ Escherichia coli (30-278/285) SE15 │├─ Escherichia coli (30-278/285) S88 │├─ Escherichia coli (30-278/285) O26:H11 str. 11368 │├─ Escherichia coli (30-278/285) O111:H- str. 11128 │├─ Escherichia coli (30-278/285) MS 84-1 │├─ Escherichia coli (30-278/285) MS 45-1 │├─ Escherichia coli (30-278/285) MS 196-1 │├─ Escherichia coli (30-278/285) MS 185-1 │├─ Escherichia coli (30-278/285) MS 146-1 │├─ Escherichia coli (30-278/285) MS 119-7 │├─ Escherichia coli (30-278/285) MS 115-1 │├─ Escherichia coli (30-278/285) M718 │├─ Escherichia coli (30-278/285) K12 │├─ Escherichia coli (30-278/285) IAI1 │├─ Escherichia coli (30-278/285) HS │├─ Escherichia coli (30-278/285) H736 ┌┤├─ Escherichia coli (30-278/285) H299 ││├─ Escherichia coli (30-278/285) F11 ││├─ Escherichia coli (30-278/285) ED1a ││├─ Escherichia coli (30-278/285) EC4100B ││├─ Escherichia coli (30-278/285) E24377A ││├─ Escherichia coli (30-278/285) E22 ││├─ Escherichia coli (30-278/285) E110019 ││├─ Escherichia coli (30-278/285) DH1 ││├─ Escherichia coli (30-278/285) CFT073 ││├─ Escherichia coli (DE3 30-278/285) BL21(DE3) ││├─ Escherichia coli (30-278/285) B354 ││├─ Escherichia coli (30-278/285) B171 ││├─ Escherichia coli (30-278/285) B str. REL606 ││├─ Escherichia coli (30-278/285) ATCC 8739 ┌┤│├─ Escherichia coli (30-278/285) APEC O1 │││├─ Escherichia coli (30-278/285) 83972 │││├─ Escherichia coli (30-278/285) 55989 │││├─ Escherichia coli (30-278/285) 53638 │││├─ Escherichia coli (30-278/285) 536 │││├─ Escherichia coli (30-278/285) 1827-70 │││├─ Escherichia coli (30-278/285) 042 │││└─ fig|6666666.5357.peg.2133 TY-2482 (30-278/285) strain ││└─ Escherichia coli (30-278/285) NC101 ││┌─ Escherichia coli (34-278/285) FVEC1412 ││├─ Escherichia coli (34-278/285) IAI39 ││├─ Escherichia coli (34-278/285) MS 198-1 ││├─ Escherichia coli (34-278/285) MS 69-1 ││├─ Escherichia coli (34-278/285) TA143 ┌───────────────────────────────────────────────────────┤└┼─ Escherichia coli (34-278/285) UMN026 │ │ ├─ Escherichia coli (34-278/285) SMS-3-5 │ │ ├─ Escherichia coli (34-278/285) MS 21-1 │ │ ├─ Escherichia coli (34-278/285) M605 │ │ ├─ Escherichia coli (34-278/285) IAI39 │ │ └─ Escherichia coli (34-278/285) FVEC1302 │ │ ┌─ Escherichia coli (30-278/285) O157:H7 EDL933 │ │┌┴─ Escherichia coli (30-278/285) O157:H7 EDL933 │ ││┌─ Escherichia coli (30-278/285) 1125A │ ││├─ Escherichia coli (30-278/285) 536A │ ││├─ Escherichia coli (30-278/285) B7A │ ││├─ Escherichia coli (30-278/285) MS 145-7 │ ││├─ Escherichia coli (30-278/285) O157:H7 str. EC4024 │ ││├─ Escherichia coli (30-278/285) O157:H7 str. EC4045 │ └┤├─ Escherichia coli (30-278/285) O157:H7 str. EC4113 │ │├─ Escherichia coli (30-278/285) O157:H7 str. EC4196 │ │├─ Escherichia coli (30-278/285) O157:H7 str. EC4401 │ │├─ Escherichia coli (30-278/285) O157:H7 str. EC4501 │ │├─ Escherichia coli (30-278/285) O157:H7 str. EC869 │ │├─ Escherichia coli (30-278/285) O157:H7 str. FRIK966 │ │├─ Escherichia coli (30-278/285) O157:H7 str. TW14359 ┌─────┤ └┼─ Escherichia coli (30-278/285) O55:H7 str. CB9615 │ │ ├─ Escherichia coli (30-278/285) O157:H7 str. TW14588 │ │ ├─ Escherichia coli (30-278/285) O157:H7 str. Sakai │ │ ├─ Escherichia coli (30-278/285) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ ├─ Escherichia coli (30-278/285) O157:H7 str. EC508 │ │ ├─ Escherichia coli (30-278/285) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (30-278/285) O157:H7 str. EC4206 │ │ ├─ Escherichia coli (30-278/285) O157:H7 str. EC4115 │ │ ├─ Escherichia coli (30-278/285) O157:H7 str. EC4076 │ │ ├─ Escherichia coli (30-278/285) O157:H7 str. EC4042 │ │ ├─ Escherichia coli (30-278/285) O157:H7 │ │ ├─ Escherichia coli (30-278/285) B7A │ │ ├─ Escherichia coli (30-278/285) B185 │ │ ├─ Escherichia coli (30-278/285) 1212A │ │ └─ Escherichia coli (30-278/285) 1044A │ │ ┌─ Escherichia coli M718 │ │ │ ┌─ Escherichia coli B171 │ │ │ ├─ Escherichia coli B185 │ │ │ ├─ Escherichia coli E22 │ │ │ ├─ Escherichia coli SE11 │ └───────────────────────────────────────────┤┌┼─ Escherichia coli W │ ││├─ Escherichia coli W │ ││├─ Escherichia coli KO11 │ ││├─ Escherichia coli E22 │ ││└─ Escherichia coli B171 │ └┤┌─ Escherichia coli OP50 │ ││ ┌─ Escherichia coli IAI1 │ ││┌┴─ Escherichia coli IAI1 │ │││ ┌─ Escherichia coli FVEC1302 │ │││ ├─ Escherichia coli MS 198-1 │ └┤│ ┌┼─ Escherichia coli UMN026 │ ││┌┤└─ Escherichia coli FVEC1412 │ │││└─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ │││ ┌─ Escherichia coli B7A │ │││ ┌┴─ Escherichia coli B7A │ └┤│ ┌┴─ Escherichia coli ETEC H10407 │ ││┌┴─ Escherichia coli TA271 │ │││┌─ fig|6666666.5357.peg.3331 TY-2482 strain │ │││├─ Escherichia coli 042 │ │││├─ Escherichia coli 1044A │ │││├─ Escherichia coli 1212A │ │││├─ Escherichia coli 53638 │ │││├─ Escherichia coli 536A │ └┤│├─ Escherichia coli 55989 │ ││├─ Escherichia coli ATCC 8739 │ ││├─ Escherichia coli B088 │ ││├─ Escherichia coli BL21 │ ││├─ Escherichia coli BW2952 │ ││├─ Escherichia coli E110019 │ ││├─ Escherichia coli E24377A │ ││├─ Escherichia coli EC4100B │ ││├─ Escherichia coli H591 │ ││├─ Escherichia coli HS │ ││├─ Escherichia coli IAI39 │ ││├─ Escherichia coli K12 │ ││├─ Escherichia coli MS 115-1 │ └┤├─ Escherichia coli MS 119-7 │ │├─ Escherichia coli MS 145-7 │ │├─ Escherichia coli MS 175-1 │ │├─ Escherichia coli MS 187-1 │ │├─ Escherichia coli MS 21-1 │ │├─ Escherichia coli MS 78-1 │ │├─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │ │├─ Escherichia coli (15-275/275) O157:H7 EDL933 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 │ │├─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 │ │├─ Escherichia coli TA143 │ │├─ Escherichia coli W3110 │ │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B ┤ └┼─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │ ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │ ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B │ ├─ Escherichia coli TA280 │ ├─ Escherichia coli SMS-3-5 │ ├─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4486 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 │ ├─ Escherichia coli MS 84-1 │ ├─ Escherichia coli MS 69-1 │ ├─ Escherichia coli MS 196-1 │ ├─ Escherichia coli MS 182-1 │ ├─ Escherichia coli MS 146-1 │ ├─ Escherichia coli MS 124-1 │ ├─ Escherichia coli MS 116-1 │ ├─ Escherichia coli MS 107-1 │ ├─ Escherichia coli IAI39 │ ├─ Escherichia coli HS │ ├─ Escherichia coli H736 │ ├─ Escherichia coli H299 │ ├─ Escherichia coli E24377A │ ├─ Escherichia coli E110019 │ ├─ Escherichia coli DH1 │ ├─ Escherichia coli (DE3) BL21(DE3) │ ├─ Escherichia coli B354 │ ├─ Escherichia coli B str. REL606 │ ├─ Escherichia coli ATCC 8739 │ ├─ Escherichia coli 55989 │ ├─ Escherichia coli 53638 │ ├─ Escherichia coli 1827-70 │ ├─ Escherichia coli 1125A │ ├─ Escherichia coli 101-1 │ ├─ Escherichia coli (15-275/275) 042 │ └─ fig|1040638.4.peg.2442 O104:H4 str. LB226692 │ ┌─ Escherichia coli (11-254/255) 1827-70 │ ├─ Escherichia coli (11-254/255) 53638 │ ┌┼─ Escherichia coli (11-254/255) ATCC 8739 │ │├─ Escherichia coli (11-254/255) ATCC 8739 │ ┌───────────────────────────────────────┤└─ Escherichia coli (11-254/255) 53638 │ │ │┌─ Escherichia coli (11-254/255) B7A │ │ └┼─ Escherichia coli (11-254/255) MS 145-7 │ │ └─ Escherichia coli (11-254/255) B7A │ │ ┌─ Escherichia coli (13-261/262) BW2952 │ │ ├─ Escherichia coli (13-261/262) ETEC H10407 │ │ ├─ Escherichia coli (13-261/262) HS │ │ ├─ Escherichia coli (13-261/262) K12 │ │ ├─ Escherichia coli (13-261/262) MS 146-1 │ │ ├─ Escherichia coli (13-261/262) MS 196-1 │ │ ├─ Escherichia coli (13-261/262) str. K-12 substr. DH10B │ │ ├─ Escherichia coli (13-261/262) str. K-12 substr. MG1655 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (13-261/262) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │├─ Escherichia coli (13-261/262) str. K-12 substr. DH10B │ │ │├─ Escherichia coli (13-261/262) W3110 │ │ │├─ Escherichia coli (13-261/262) MS 175-1 │ │ │├─ Escherichia coli (13-261/262) MS 116-1 │ │ │├─ Escherichia coli (13-261/262) HS │ │ │├─ Escherichia coli (13-261/262) H736 │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (13-261/262) DH1 │ │ ││┌─ Escherichia coli (13-261/262) B7A │ │ ││├─ Escherichia coli (13-261/262) E24377A │ │ ││├─ Escherichia coli (13-261/262) MS 115-1 │ │ ││├─ Escherichia coli (13-261/262) MS 145-7 │ │ ││├─ Escherichia coli (13-261/262) O111:H- str. 11128 │ │ ││├─ Escherichia coli (13-261/262) W │ │ ┌┤└┼─ Escherichia coli (13-261/262) W │ │ ││ ├─ Escherichia coli (13-261/262) O26:H11 str. 11368 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (13-261/262) MS 84-1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (13-261/262) MS 124-1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (13-261/262) KO11 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (13-261/262) E24377A └────┤ ││ └─ Escherichia coli (13-261/262) B7A │ ┌┤└─ Escherichia coli (13-261/262) MS 182-1 │ ││ ┌─ Escherichia coli (13-261/262) B088 │ ││ ├─ Escherichia coli (13-261/262) H591 │ ││ ├─ Escherichia coli (13-261/262) MS 78-1 │ ││┌┼─ Escherichia coli (13-261/262) TA271 │ │││├─ Escherichia coli (13-261/262) MS 119-7 │ │││└─ Escherichia coli (13-261/262) EC4100B │ │└┤ ┌─ Escherichia coli (13-261/262) IAI1 │ │ │┌┴─ Escherichia coli (13-261/262) IAI1 │ │ ││┌─ Escherichia coli (13-261/262) B171 │ ┌────────────────────────────────────┤ └┤├─ Escherichia coli (13-261/262) E110019 │ │ │ │├─ Escherichia coli (13-261/262) E22 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (13-261/262) O103:H2 str. 12009 │ │ │ ├─ Escherichia coli (13-261/262) E22 │ │ │ ├─ Escherichia coli (13-261/262) E110019 │ │ │ └─ Escherichia coli (13-261/262) B171 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (13-261/262) SE11 │ │ │┌┴─ Escherichia coli (13-261/262) MS 69-1 │ │ ││ ┌─ fig|1040638.4.peg.4134 O104:H4 (13-261/262) str. LB226692 │ │ └┤ ├─ Escherichia coli (13-261/262) 55989 │ │ │┌┼─ Escherichia coli (13-261/262) 55989 │ │ ││└─ fig|6666666.5357.peg.3634 TY-2482 (13-261/262) strain │ │ └┤┌─ Escherichia coli (13-261/262) 53638 │ │ │├─ Escherichia coli (13-261/262) ATCC 8739 │ │ └┼─ Escherichia coli (13-261/262) ATCC 8739 │ │ ├─ Escherichia coli (13-261/262) 53638 │ │ └─ Escherichia coli (13-261/262) 1827-70 │ │ ┌─ Escherichia coli (14-256/259) APEC O1 │ │ ├─ Escherichia coli (14-256/259) IHE3034 │ │ ├─ Escherichia coli (14-256/259) UM146 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (14-256/259) UTI89 └────┤ │├─ Escherichia coli (14-256/259) UTI89 │ ┌┤├─ Escherichia coli (14-256/259) S88 │ ││└─ Escherichia coli (14-256/259) APEC O1 │ │└┬─ Escherichia coli (14-256/259) SE15 │ ┌──────────────────────────┤ └─ Escherichia coli (14-256/259) M605 │ │ │┌─ Escherichia coli (14-256/259) ABU 83972 │ │ │├─ Escherichia coli (14-256/259) CFT073 │ │ └┼─ Escherichia coli (14-256/259) MS 45-1 │ │ ├─ Escherichia coli (14-256/259) MS 185-1 │ │ ├─ Escherichia coli (14-256/259) CFT073 │ │ └─ Escherichia coli (14-256/259) 83972 │ │ ┌─ Escherichia coli (17-255/258) 536 │ │ ├─ Escherichia coli (19-257/260) F11 │ │ ├─ Escherichia coli (17-255/258) H299 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (17-255/258) TA206 │ │ │├─ Escherichia coli (17-255/258) MS 200-1 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (17-255/258) F11 │ │ ││└─ Escherichia coli (17-255/258) 536 │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (17-255/258) WV_060327 │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (17-255/258) S88 │ │ │└┬─ Escherichia coli (17-255/258) SE15 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (19-257/260) E2348/69 └──────────┤ │ └┬─ Escherichia coli (17-255/258) M605 │ │ └┬─ Escherichia coli (17-255/258) NC101 │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (17-255/258) ED1a │ ││ └─ Escherichia coli (17-255/258) ED1a │ ││┌─ Escherichia coli (17-255/258) APEC O1 │ ││├─ Escherichia coli (17-255/258) UM146 │ │└┼─ Escherichia coli (17-255/258) UTI89 │ ┌┤ ├─ Escherichia coli (17-255/258) UTI89 │ ││ ├─ Escherichia coli (17-255/258) IHE3034 │ ││ └─ Escherichia coli (17-255/258) APEC O1 │ ││┌─ Escherichia coli (17-255/258) O83:H1 str. NRG 857C │ │└┤┌─ Escherichia coli (17-255/258) ABU 83972 │ ┌┤ │├─ Escherichia coli (17-255/258) CFT073 │ ││ └┼─ Escherichia coli (17-255/258) MS 45-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (17-255/258) MS 185-1 │ ┌┤│ ├─ Escherichia coli (17-255/258) CFT073 │ │││ └─ Escherichia coli (17-255/258) 83972 │ ││└─ Escherichia coli (17-255/258) MS 21-1 │ │└─ Escherichia coli (17-255/258) MS 115-1 └──────────────────────────────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (17-255/258) IAI39 │┌┴─ Escherichia coli (17-255/258) IAI39 ││┌─ Escherichia coli (17-255/258) SMS-3-5 │││ ┌─ Escherichia coli (17-255/258) 101-1 └┤│ ├─ Escherichia coli (17-255/258) ATCC 8739 ││ ├─ Escherichia coli (17-255/258) BL21 ││ ├─ Escherichia coli (17-255/258) E110019 ││ ├─ Escherichia coli (17-255/258) MS 146-1 └┤ ├─ Escherichia coli (17-255/258) MS 187-1 │┌┼─ Escherichia coli (17-255/258) MS 196-1 ││├─ Escherichia coli (17-255/258) MS 182-1 ││├─ Escherichia coli (17-255/258) E110019 ││├─ Escherichia coli (DE3 17-255/258) BL21(DE3) ││├─ Escherichia coli (17-255/258) B str. REL606 └┤└─ Escherichia coli (17-255/258) ATCC 8739 │ ┌─ Escherichia coli (19-257/260) 53638 │┌┼─ Escherichia coli (17-255/258) ETEC H10407 ││└─ Escherichia coli (17-255/258) 53638 ││ ┌─ Escherichia coli (1-255/258) HS ││ ┌┼─ Escherichia coli (1-255/258) MS 107-1 └┤ ┌┤└─ Escherichia coli (1-255/258) HS │ │└┬─ Escherichia coli (1-255/258) MS 119-7 │┌┤ └─ Escherichia coli (1-255/258) H591 │││┌─ Escherichia coli (1-255/258) E22 ││└┼─ Escherichia coli (1-255/258) O103:H2 str. 12009 └┤ └─ Escherichia coli (1-255/258) E22 │ ┌─ Escherichia coli (1-255/258) B171 │┌┴─ Escherichia coli (1-255/258) B171 └┤┌─ Escherichia coli (1-255/258) 2362-75 ││┌─ Escherichia coli (1-255/258) B7A └┤├─ Escherichia coli (1-255/258) E24377A │├─ Escherichia coli (1-255/258) MS 78-1 └┼─ Escherichia coli (1-255/258) SE11 ├─ Escherichia coli (1-255/258) MS 84-1 ├─ Escherichia coli (1-255/258) MS 124-1 ├─ Escherichia coli (1-255/258) E24377A └─ Escherichia coli (1-255/258) B7A
| Naphthoate synthase (EC 4.1.3.36) | (130) |
| Methylmalonyl-CoA decarboxylase (EC 4.1.1.41) | (100) |
| 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase (EC 4.2.1.55) | (82) |
| Phenylacetate degradation enoyl-CoA hydratase PaaB (EC 4.2.1.17) | (53) |
| Phenylacetate degradation enoyl-CoA hydratase PaaA (EC 4.2.1.17) | (7) |
| Probable enoyl-CoA hydratase paaG (EC 4.2.1.17) | (1) |
| Probable enoyl-CoA hydratase paaF (EC 4.2.1.17) | (1) |
| Others | (6) |