fig|1040638.4.peg.2426   Escherichia coli O104:H4 str. LB226692     MSRIFDLVFFDIFSALNIALFKLTFSSHHLYIKTCVFFGFLFCCDFGVF
fig|562.373.peg.4443   Escherichia coli 1125A     MSRIFDLVFFDIFSALNIALFKLTFSSHHLYIETCVFFGFLFCCDFGVF
fig|562.372.peg.2371   Escherichia coli 1212A     MSRIFDLVFFDIFSALNIALFKLTFSSHHLYIETCVFFGFLFCCDFGVF
fig|444454.5.peg.2823   Escherichia coli O157:H7 str. EC4024     MSRIFDLVFFDIFSALNIALFKLTFSSHHLYIETCVFFGFLFCCDFGVF
fig|562.375.peg.1275   Escherichia coli EC4100B (1-42/44)            MFFDIFSALNIALFKLTFSSHHLYIKTCVFFGFLFCCDFGVF
fig|562.374.peg.3749   Escherichia coli 536A            MFFDIFSALNIALFKLTFSSHHLYIETCVFFGFLFCCDFGVF
fig|749549.3.peg.515   Escherichia coli MS 198-1     MPRIFDLVFFHIFSALNIALFKLISSSHHFSIEIGVFFGFLFCCDFGVF
fig|670897.3.peg.558   Escherichia coli 2362-75     MLWVFDLVFFDIFLALNIVLFKLTFSSHHLFIEKGVFFGFLFCCDFCIF
fig|216592.1.peg.3709   Escherichia coli 042            MFFDIFSALNIALFKLTFSSHHLSIETGVFFGFLFCCDFGVF
fig|216592.3.peg.3247   Escherichia coli 042            MFFDIFSALNIALFKLTFSSHHLSIETGVFFGFLFCCDFGVF
fig|585397.7.peg.3370   Escherichia coli ED1a     MLWFFDLVFFDIFLALNIVLFKLTFSSHHLFIEKGVFFGFLFCCDFCIF
fig|585397.9.peg.3366   Escherichia coli ED1a     MLWFFDLVFFDIFLALNIVLFKLTFSSHHLFIEKGVFFGFLFCCDFCIF
fig|753642.3.peg.216   Escherichia coli NC101     MLWFFDLVFFDIFLALNIVLFKLTFSSHHLFIEKGVFFGFLFCCDFCIF
fig|199310.1.peg.3405   Escherichia coli CFT073     MPRIFDLVFFDIFLVLNVVLFKLTFSSIYLYIEICSFFGFLFCYDFGVF
fig|749546.3.peg.3327   Escherichia coli MS 185-1     MPRIFDLVFFDIFLVLNVVLFKLTFSSIYLYIEICSFFGFLFCYDFGVF
fig|685038.3.peg.2911   Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C     MPRIFDLVFFDIFLVLNVVLFKLTFSSIYLYIEICSFFGFLFCYDFGVF
fig|656417.3.peg.3681   Escherichia coli M605     MPQIFDLVFFDIFLVLNVVLFKLTFSSIYLYIEICSFFGFLFCYDFGVF
Consen1   Primary consensus     M riFDLvFFDIFsaLNiaLFKLTFSShhL Ie cvFFGFLFCcDFgvF
Consen2   Secondary consensus       wf   m     lv  vv        iy   k gs       y  ci 

Consensus 1 (when a gap)
Conservative difference
Consensus 2 (when a gap)
Nonconservative diff.
Other character