fig|585055.8.peg.3331   Escherichia coli 55989     MN--KIETDTLLLPVIGESPAGDDIEYDPVYSEIREARQNDPDYMSQGEWAVSEPRRADWRKVRKLCEVTLRNKSKDLQISCWYVESLTHLYALEGMHCGLEYLAKFISQYWTTCWPSQEEGQEIRYSKLVRLDIDLSEYLKAYPLLEDKEITLSEWYKVLSFEHGASLSEAGKERLIESEGDHSVESFKRAVGKYNPRKVSEQLLQLYDLPDKIDEIESSYFFHTHEDIHHIFAKTRHIISEITELLSRFLPQETLDHSSVSQFLGKPDSR--DTRTALPEEKKEFYSALTPSTDK----EMSREKAIEQLEKIAIFFRQSEPTSPVPYLLERAIRWSTMTMSEWLEELLKDNDSMEQINRVLKG  
fig|216592.1.peg.2523   Escherichia coli 042     MN--KIETDTLLLPVIGESPAGDDIEYDPVYSEIREARQNDPDYMSQGEWAVSEPRRADWRKVRKLCEVTLRNKSKDLQISCWYVESLTHLYALEGMHCGLEYLAKFISQYWTTCWPSQEEGQEIRYSKLVRLDIDLSEYLKAYPLLEDKEITLSEWYKVLSFEHGASLSEAGKERLIESEGDHSVESFKRAVGKYNPRKVSEQLLQLYDLPDKIDEIESSYFFHTHEDIHHIFAKTRHIISEITELLSRFLPQETLDHSSVSQFLGKPDSR--DTRTALPEEKKEFYSALTPSTDK----EMSREKAIEQLEKIAIFFRQSEPTSPVPYLLERAIRWSTMTMSEWLEELLKDNDSMEQINRVLKG  
fig|585055.6.peg.3327   Escherichia coli 55989     MN--KIETDTLLLPVIGESPAGDDIEYDPVYSEIREARQNDPDYMSQGEWAVSEPRRADWRKVRKLCEVTLRNKSKDLQISCWYVESLTHLYALEGMHCGLEYLAKFISQYWTTCWPSQEEGQEIRYSKLVRLDIDLSEYLKAYPLLEDKEITLSEWYKVLSFEHGASLSEAGKERLIESEGDHSVESFKRAVGKYNPRKVSEQLLQLYDLPDKIDEIESSYFFHTHEDIHHIFAKTRHIISEITELLSRFLPQETLDHSSVSQFLGKPDSR--DTRTALPEEKKEFYSALTPSTDK----EMSREKAIEQLEKIAIFFRQSEPTSPVPYLLERAIRWSTMTMSEWLEELLKDNDSMEQINRVLKG  
fig|6666666.5357.peg.1845   Escherichia coli TY-2482     MN--KIETDTLLLPVIGESPAGDDIEYDPVYSEIREARQNDPDYMSQGEWAVSEPRRADWRKVRKLCEVTLRNKSKDLQISCWYVESLTHLYALEGMHCGLEYLAKFISQYWTTCWPSQEEGQEIRYSKLVRLDIDLSEYLKAYPLLEDKEITLSEWYKVLSFEHGASLSEAGKERLIESEGDHSVESFKRAVGKYNPRKVSEQLLQLYDLPDKIDEIESSYFFHTHEDIHHIFAKTRHIISEITELLSRFLPQETLDHSSVSQFLGKPDSR--DTRTALPEEKKEFYSALTPSTDK----EMSREKAIEQLEKIAIFFRQSEPTSPVPYLLERAIRWSTMTMSEWLEELLKDNDSMEQINRVLKG  
fig|216592.3.peg.4746   Escherichia coli 042     MN--KIETDTLLLPVIGESPAGDDIEYDPVYSEIREARQNDPDYMSQGEWAVSEPRRADWRKVRKLCEVTLRNKSKDLQISCWYVESLTHLYALEGMHCGLEYLAKFISQYWTTCWPSQEEGQEIRYSKLVRLDIDLSEYLKAYPLLEDKEITLSEWYKVLSFEHGASLSEAGKERLIESEGDHSVESFKRAVGKYNPRKVSEQLLQLYDLPDKIDEIESSYFFHTHEDIHHIFAKTRHIISEITELLSRFLPQETLDHSSVSQFLGKPDSR--DTRTALPEEKKEFYSALTPSTDK----EMSREKAIEQLEKIAIFFRQSEPTSPVPYLLERAIRWSTMTMSEWLEELLKDNDSMEQINRVLKG  
fig|1040638.4.peg.2409   Escherichia coli O104:H4 str. LB226692     MN--KIETDTLLLPVIGESPAGDDIEYDPVYSEIREARQNDPDYMSQGEWAVSEPRRADWRKVRKLCEVTLRNKSKDLQISCWYVESLTHLYALEGMHCGLEYLAKFISQYWTTCWPSQEEGQEIRYSKLVRLDIDLSEYLKAYPLLEDKEITLSEWYKVLSFEHGASLSEAGKERLIESEGDHSVESFKRAVGKYNPRKVSEQLLQLYDLPDKIDEIESSYFFHTHEDIHHIFAKTRHIISEITELLSRFLPQETLDHSSVSQFLGKPDSR--DTRTALPEEKKEFYSALTPSTDK----EMSREKAIEQLEKIAIFFRQSEPTSPVPYLLERAIRWSTMTMSEWLEELLKDNDSMEQINRVLKG  
fig|550672.3.peg.535   Escherichia coli B088     MN--KIETDTLLLPVIGESPAGDDIEYDPVYSEIREARQNDPDYMFQGEWAVSEPRRADWRKVRKLCEVTLRNKSKDLQISCWYVESLTHLYALEGMRCGLEYLAKFISQHWTACWPSQEEGLEIRYSKLVRLDIELSEYLKAYPLLDDKEITLSKWYKALAFEHGASLSEDGKEKLIESEGDHSVESFKKIVGKYNTRKINEQFLQFSDLPDKIDEVESFYFFHTHENIHHIFAKTRNTISEIIELLSRFLPQEIQDNNSVSQFSVEPESR--VTRKAFPEEQKEFYTALTPSIEK----EMSREKAIEQLEKIAIFFRQSEPTSPVPYLLERAVRWSTMTMSEWLEELLKDNDSMEQINRVLKG  
fig|656444.3.peg.1102   Escherichia coli TA280     MTLKNINIEILLQPVNSKSPAGENIEYELIYNEIRQARESDPEYLSDGEWSITEPRSADWQKVRKLCEQVLRYQSKDFQISCWYVESLTYIYGPEGLAVGCDYLSEFISRFWQNCWPSIDEGLEMRYGKLIKLDKDIARCLKEYPILKRKDISLSYWYKVLSFEHNLSINPDRRDEIIASDGDYSMKTFKKITSNLSPSDISAKLHLLLDIPDKLDELESCYFFNSKEIIHSIFGKTRECIKDLTDFLHRLVPTMMSINNS------QPDSNLVVEDSAIP-----YISNLAAEINEPFKGNMNREVALKRLKEIADFFRETEPSSPVPYLIDRAIRWANMSVTDWLNELLPDKEVIHKINEVLKGND
fig|358709.5.peg.2630   Escherichia coli 101-1     M---NINIEVLLQPIDSKSPVGENIEYELVYNEIRQARESDPEYLSGGEWSITEPRSANWKKVRNLCEQVLRYQSKDFQISCWYVESLSYIYGPEGLAVGCDYLSEFISRFWENCWPSIDEGPEMRYSKLIKLDKDIARCLNEYPILKRKDINLSYWYKVRSFEHNLSINPERRDEIIESEGDYSIKTFEKLTSNISPSDISAKLHHLVDIPHKLDELESCYFFNSKDIIHCVFKKTRECISDLTVFLNKLAPAMMRVNKS------QLDSEVLIEEPVAP-----CISNLSVGDNKALKNNMSRELALKQMKEIADFFRETEPSSPVPYLIERAVRWANMSVTDWLNELLPDKEAIHKINEVLKGNN
Consen1   Primary consensus     M --kIetd LLlPV geSPAGddIEYdpVYsEIReARqnDPdYmS GEWavsEPRrADWrKVRKLCEvtLRnkSKDlQISCWYVESLThlYalEGmhcGleYLakFISqyW tCWPSqeEGqEiRYSKLvrLDiDlseyLKaYPlLedKeItLSeWYKVLSFEHgaSlseagkerlIESEGDhSvesFKravgk nPrkvSeqLl L DlPDKiDEiESsYFFhthEdIH IF KTRhiISeiTelLsRflP et  hsSvsqflgkPDS   dt  A PeekkefySaLt  tdK  - eMSRE AieQLekIAiFFRqsEPtSPVPYLlERAiRWstMtmseWLeELLkDndsmeqINrVLKGN 
Consen2   Secondary consensus         n nie   q   sk    en   el  n   q  es  e l     sit   s           qv  yq   f           yi gp  lav cd  se   rf  n    id  l m     ik  k iarc  e  i kr d    y         nl inpdrrdei      y  kt  kitsn s sdi ak h    i   l  l  c   nsk i         ec  dl  f   l   mm  nn ------q      ve     ----- i n    in   k n      lk  ke  d   et  s      i   v  an svtd  n   p ke ihk  e      

Consensus 1 (when a gap)
Conservative difference
Consensus 2 (when a gap)
Nonconservative diff.
Other character