┌─ Escherichia coli (17-78/86) 1044A ├─ Escherichia coli (17-78/86) 1212A ├─ Escherichia coli (17-78/86) O157:H7 ├─ Escherichia coli (17-78/86) O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli (17-78/86) O157:H7 str. EC4042 ├─ Escherichia coli (17-78/86) O157:H7 str. EC4076 ├─ Escherichia coli (17-78/86) O157:H7 str. EC4115 ├─ Escherichia coli (17-78/86) O157:H7 str. EC4206 ├─ Escherichia coli (17-78/86) O157:H7 str. EC4501 ├─ Escherichia coli (17-78/86) O157:H7 str. EC869 ├─ Escherichia coli (17-78/86) O157:H7 str. FRIK966 ├─ Escherichia coli (17-78/86) O157:H7 str. TW14359 ┌─────┼─ Escherichia coli (17-78/86) O55:H7 str. CB9615 │ ├─ Escherichia coli (17-78/86) O157:H7 str. TW14588 │ ├─ Escherichia coli (17-78/86) O157:H7 str. Sakai │ ├─ Escherichia coli (17-78/86) O157:H7 str. FRIK2000 │ ├─ Escherichia coli (17-78/86) O157:H7 str. EC508 │ ├─ Escherichia coli (17-78/86) O157:H7 str. EC4401 │ ├─ Escherichia coli (17-78/86) O157:H7 str. EC4196 ┌───┤ ├─ Escherichia coli (17-78/86) O157:H7 str. EC4113 │ │ ├─ Escherichia coli (17-78/86) O157:H7 str. EC4045 │ │ ├─ Escherichia coli (17-78/86) O157:H7 str. EC4024 │ │ ├─ Escherichia coli (17-78/86) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (17-78/86) 536A │ │ └─ Escherichia coli (17-78/86) 1125A ┌───────────────┤ └┬─ Escherichia coli (17-78/86) MS 145-7 │ │ └┬─ Escherichia coli (17-78/86) O26:H11 str. 11368 │ │ └─ Escherichia coli (17-78/86) MS 175-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (22-80/88) MS 185-1 │ │ │┌─ Escherichia coli (22-80/88) TA280 │ │ ││┌─ Escherichia coli (6-64/72) ATCC 8739 │ └─────┤│├─ Escherichia coli (6-64/72) O157:H7 str. EC869 │ ││├─ Escherichia coli (22-80/88) 042 │ ││├─ Escherichia coli (22-80/88) 53638 │ ││├─ Escherichia coli (22-80/88) B185 │ └┤├─ Escherichia coli (22-80/88) E110019 │ │├─ Escherichia coli (22-80/88) F11 │ │├─ Escherichia coli (22-80/88) M605 │ │├─ Escherichia coli (22-80/88) MS 200-1 │ │├─ Escherichia coli (22-80/88) MS 84-1 │ │├─ Escherichia coli (22-80/88) O26:H11 str. 11368 ┌────┤ │├─ Escherichia coli (22-80/88) WV_060327 │ │ └┼─ Escherichia coli (22-80/88) WV_060327 │ │ ├─ Escherichia coli (22-80/88) SMS-3-5 │ │ ├─ Escherichia coli (22-80/88) O157:H7 str. EC869 │ │ ├─ Escherichia coli (22-80/88) MS 21-1 │ │ ├─ Escherichia coli (22-80/88) MS 124-1 │ │ ├─ Escherichia coli (22-80/88) IHE3034 │ │ ├─ Escherichia coli (22-80/88) F11 │ │ ├─ Escherichia coli (22-80/88) E110019 │ │ ├─ Escherichia coli (22-80/88) ATCC 8739 │ │ ├─ Escherichia coli (22-80/88) 53638 │ │ ├─ Escherichia coli (22-80/88) 042 ┌────┤ │ ├─ Escherichia coli (6-64/72) ATCC 8739 │ │ │ └─ Escherichia coli (22-80/88) ATCC 8739 │ │ │ ┌───────────────── Escherichia coli (12-61/65) WV_060327 │ │ └───────┤ ┌─ Escherichia coli (4-65/74) SMS-3-5 │ │ └──────────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (6-60/69) F11 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (6-60/69) MS 200-1 │ │ └────┤ ┌─ Escherichia coli (6-60/69) O157:H7 str. EC4486 │ │ └───────┼─ Escherichia coli (6-60/69) TA280 │ │ └─ Escherichia coli (6-60/69) O157:H7 str. EC4401 │ │ ┌────────────────────────────── Escherichia coli (5-59/61) TA206 │ │ │ ┌────────────── Escherichia coli (6-73/77) MS 21-1 │ └──┤ │ ┌─ Escherichia coli (5-63/67) ABU 83972 │ │ │ ├─ Escherichia coli (5-63/67) MS 124-1 │ │ │ ┌────┼─ Escherichia coli (5-63/67) NC101 │ └────┤ │ ├─ Escherichia coli (5-63/67) MS 84-1 │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (5-63/67) ETEC H10407 │ │ ┌───┤└───────── Escherichia coli (1-61/63) M605 │ │ │ └───────┬─ Escherichia coli (4-63/67) ED1a │ │ │ └─ Escherichia coli (4-63/67) ED1a │ └──┤ ┌─ Escherichia coli (5-64/68) E24377A │ │ ┌─┴─ Escherichia coli (16-75/79) E24377A │ │ │┌────────────── Escherichia coli (11-68/72) MS 115-1 │ └───────┤│ ┌─ Escherichia coli (13-78/82) 1044A │ ││ ├─ Escherichia coli (13-78/82) 1212A │ └┤ ┌┼─ Escherichia coli (13-78/82) 536A │ │ ┌───────┤└─ Escherichia coli (13-78/82) 1125A │ │ │ └┬─ Escherichia coli (5-64/68) O157:H7 EDL933 │ └──┤ └─ Escherichia coli (5-64/68) O157:H7 │ │ ┌─ Escherichia coli (7-64/68) ETEC H10407 │ │┌───┼─ Escherichia coli (7-64/68) MS 78-1 │ └┤ └─ Escherichia coli (7-64/68) MS 182-1 │ │┌────── Escherichia coli (7-64/68) MS 107-1 │ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-64/68) IAI1 │ └─┼─ Escherichia coli (1-64/68) MS 115-1 │ └─ Escherichia coli (1-64/68) IAI1 │ ┌─ Escherichia coli (16-74/78) 042 │ ├─ Escherichia coli (16-74/78) 2362-75 │ ├─ Escherichia coli (16-74/78) 55989 │ ├─ Escherichia coli (16-74/78) TA271 │ ├─ Escherichia coli (16-74/76) E24377A │ ├─ Escherichia coli (16-74/78) IAI39 │ ├─ Escherichia coli (16-74/78) MS 69-1 │ ├─ Escherichia coli (15-73/77) MS 116-1 │ ├─ Escherichia coli (15-73/76) ETEC H10407 │ ├─ Escherichia coli (15-73/77) 536 │ ├─ Escherichia coli (15-73/77) APEC O1 │ ├─ Escherichia coli (15-73/77) CFT073 │ ├─ Escherichia coli (15-73/77) CFT073 │ ├─ Escherichia coli (15-73/77) ED1a │ ├─ Escherichia coli (15-73/77) H299 │ ├─ Escherichia coli (15-73/77) MS 182-1 │ ├─ Escherichia coli (15-73/77) SMS-3-5 │ ┌┼─ Escherichia coli (15-73/77) MS 124-1 │ │├─ Escherichia coli (15-73/77) MS 21-1 │ │├─ Escherichia coli (15-73/77) H591 │ │├─ Escherichia coli (15-73/77) H299 │ │├─ Escherichia coli (15-73/77) ED1a │ │├─ Escherichia coli (15-73/77) CFT073 │ │├─ Escherichia coli (15-73/77) CFT073 │ │├─ Escherichia coli (15-73/77) APEC O1 │ │├─ Escherichia coli (15-73/77) 536 │ │├─ Escherichia coli (16-74/78) MS 84-1 │ │├─ Escherichia coli (16-74/78) S88 │ ┌┤├─ Escherichia coli (16-74/78) IAI39 │ ││├─ Escherichia coli (16-74/78) APEC O1 │ ││├─ Escherichia coli (16-74/76) E24377A │ ││├─ Escherichia coli (16-74/78) MS 182-1 │ ││├─ Escherichia coli (16-74/78) 55989 │ ││└─ Escherichia coli (16-74/78) 042 │ ││ ┌─ Escherichia coli (16-74/78) MS 185-1 │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (15-73/77) MS 84-1 │ ││┌┴┬─ Escherichia coli (14-73/77) MS 84-1 │ │││ └─ Escherichia coli (14-73/77) MS 124-1 │ │└┤┌─── Escherichia coli (5-63/67) MS 21-1 ┤ ┌┤ ││┌─ Escherichia coli (15-73/77) B171 │ ││ └┤├─ Escherichia coli (42-100/104) MS 200-1 │ ││ │├─ Escherichia coli (15-73/77) 536 │ ││ │├─ Escherichia coli (15-73/77) UM146 │ ││ └┼─ Escherichia coli (15-73/77) UTI89 │ ││ ├─ Escherichia coli (15-73/77) UTI89 │ ││ ├─ Escherichia coli (15-73/77) F11 │ ││ ├─ Escherichia coli (15-73/77) 536 │ ││ ├─ Escherichia coli (42-100/104) F11 │ ┌┤│ └─ Escherichia coli (15-73/77) B171 │ ││└┬─ Escherichia coli (16-74/78) ABU 83972 │ ││ └─ Escherichia coli (16-74/78) 83972 │ ││ ┌─ Escherichia coli (16-74/78) MS 124-1 │ ││┌┴─ Escherichia coli (16-74/78) SMS-3-5 │ │││ ┌─ Escherichia coli (16-74/78) M718 │ │││┌┴─ Escherichia coli (16-74/78) MS 119-7 │ ││││ ┌─ Escherichia coli (15-64/65) 83972 │ │└┤│ ├─ Escherichia coli (15-64/65) CFT073 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (15-64/65) MS 185-1 │ │ ││ ┌┼─ Escherichia coli (15-64/65) TA206 │ │ ││ │├─ Escherichia coli (15-64/65) MS 45-1 │ │ ││┌┤├─ Escherichia coli (15-64/65) H299 │ │ └┤││└─ Escherichia coli (15-64/65) ABU 83972 │ │ ││└─ Escherichia coli (1-44/45) CFT073 │ │ ││┌─ fig|6666666.5357.peg.1290 TY-2482 (15-64/65) strain │ │ ││├─ Escherichia coli (15-64/65) 1125A │ │ ││├─ Escherichia coli (15-64/65) 536A │ │ ││├─ Escherichia coli (15-64/65) E110019 │ │ ││├─ Escherichia coli (15-64/65) O157:H7 │ │ ││├─ Escherichia coli (15-64/65) O157:H7 EDL933 │ │ └┤├─ Escherichia coli (15-64/65) O157:H7 EDL933 │ │ │├─ Escherichia coli (15-64/65) O157:H7 str. EC4042 │ │ │├─ Escherichia coli (15-64/65) O157:H7 str. EC4076 │ ┌──┤ │├─ Escherichia coli (15-64/65) O157:H7 str. EC4115 │ │ │ │├─ Escherichia coli (15-64/65) O157:H7 str. EC4206 │ │ │ │├─ Escherichia coli (15-64/65) O157:H7 str. EC4486 │ │ │ │├─ Escherichia coli (15-64/65) O157:H7 str. EC508 │ │ │ │├─ Escherichia coli (15-64/65) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ │ │├─ Escherichia coli (15-64/65) O157:H7 str. Sakai │ │ │ │├─ Escherichia coli (15-64/65) O157:H7 str. TW14588 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (15-64/65) O26:H11 str. 11368 │ │ │ ├─ Escherichia coli (15-64/65) O157:H7 str. TW14359 │ │ │ ├─ Escherichia coli (15-64/65) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │ ├─ Escherichia coli (15-64/65) O157:H7 str. EC869 │ │ │ ├─ Escherichia coli (15-64/65) O157:H7 str. EC4501 │ │ │ ├─ Escherichia coli (15-64/65) O157:H7 str. EC4401 │ │ │ ├─ Escherichia coli (15-64/65) O157:H7 str. EC4196 │ ┌──────────┤ │ ├─ Escherichia coli (15-64/65) O157:H7 str. EC4113 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (15-64/65) O157:H7 str. EC4045 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (15-64/65) O157:H7 str. EC4024 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (15-64/65) O157:H7 EDL933 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (15-64/65) O157:H7 EDL933 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (15-64/65) O111:H- str. 11128 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (15-64/65) E110019 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (15-64/65) 1212A │ ┌┤ │ │ ├─ Escherichia coli (15-64/65) 1044A │ ││ │ │ └─ fig|1040638.4.peg.76 O104:H4 (15-64/65) str. LB226692 │ ││ │ └┬─ Escherichia coli (15-73/77) S88 │ ││ │ └┬─ Escherichia coli (1-53/57) IAI39 │ ││ │ └─ Escherichia coli (1-53/57) IAI39 │ ││ └──┬───────────────────────────── Escherichia coli (16-64/96) TA206 │ ││ └────── Escherichia coli (15-72/104) M605 │ ┌──────┤│┌─ Escherichia coli (5-71/72) ABU 83972 │ │ │└┼─ Escherichia coli (5-71/72) MS 69-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (5-71/72) MS 45-1 │ │ │ └─ Escherichia coli (5-71/72) 83972 │ │ │┌─ Escherichia coli (6-71/72) B7A │ │ │├─ Escherichia coli (6-71/72) M605 │ ┌┤ └┼─ Escherichia coli (6-71/72) W │ ││ ├─ Escherichia coli (6-71/72) W │ ││ ├─ Escherichia coli (6-71/72) KO11 │ ││ └─ Escherichia coli (6-71/72) B7A │ ││ ┌─ Escherichia coli (2-66/67) W │ │└─────────────┼─ Escherichia coli (2-66/67) W │ │ └─ Escherichia coli (2-66/67) KO11 └────────────────┤ ┌──────── Escherichia coli (1-67/69) SE11 │ │ ┌─ Escherichia coli (1-67/68) E22 │ │ ┌────┴─ Escherichia coli (1-67/68) O103:H2 str. 12009 │ │┌────┴───── Escherichia coli (6-67/68) MS 115-1 │ ││ ┌─ Escherichia coli 83972 │ ││ ├─ Escherichia coli CFT073 │ ││ ├─ Escherichia coli H299 └───────┤│ ┌┼─ Escherichia coli TA206 ││ │├─ Escherichia coli CFT073 ││ ┌┤└─ Escherichia coli ABU 83972 ││ ┌┤└─ Escherichia coli MS 45-1 ││ │└┬─ fig|6666666.5357.peg.4262 TY-2482 strain ││ │ └─ Escherichia coli MS 107-1 ││ ┌┤ ┌─ Escherichia coli ABU 83972 └┤ ││ ├─ Escherichia coli FVEC1412 │ ││ ├─ Escherichia coli MS 45-1 │ │└─┼─ Escherichia coli UMN026 │ │ ├─ Escherichia coli MS 198-1 │ │ ├─ Escherichia coli FVEC1302 │ │ └─ Escherichia coli 83972 │ │ ┌─ fig|1040638.4.peg.2275 O104:H4 str. LB226692 │ │ ├─ Escherichia coli 55989 │ │ ├─ Escherichia coli ED1a │ │ ├─ Escherichia coli M605 │ │ ┌┼─ Escherichia coli TA280 └──┤ │├─ Escherichia coli MS 21-1 │ │├─ Escherichia coli ED1a │ ┌┤├─ Escherichia coli 55989 │ ││└─ Escherichia coli 042 │┌┤└┬─ Escherichia coli 101-1 │││ └─ Escherichia coli ETEC H10407 ││└┬─ Escherichia coli 042 ││ └─ Escherichia coli B185 ││ ┌─ fig|1040638.4.peg.86 O104:H4 str. LB226692 ││ ├─ Escherichia coli 536 ││ ├─ Escherichia coli F11 ││┌┼─ Escherichia coli SE15 │││├─ Escherichia coli F11 └┤│└─ Escherichia coli 536 ││ ┌─ fig|1040638.4.peg.721 O104:H4 (66-133/133) str. LB226692 ││ ├─ Escherichia coli (25-92/92) E110019 ││ ├─ Escherichia coli 55989 ││ ├─ Escherichia coli E110019 ││ ├─ Escherichia coli MS 21-1 ││ ┌┼─ Escherichia coli S88 ││ │├─ Escherichia coli ETEC H10407 ││ │├─ Escherichia coli 55989 ││ ┌┤├─ Escherichia coli 042 └┤ ││└─ Escherichia coli (66-133/133) 042 │ │└┬─ Escherichia coli MS 78-1 │ ┌┤ └─ Escherichia coli B171 │ ││┌─ Escherichia coli MS 116-1 │ │└┤┌─ Escherichia coli E24377A │┌┤ └┼─ Escherichia coli HS │││ └─ Escherichia coli (25-92/92) HS │││┌─ Escherichia coli CFT073 ││└┼─ Escherichia coli MS 69-1 ││ └─ Escherichia coli (19-86/86) CFT073 ││ ┌─ Escherichia coli E24377A ││ ┌┴─ Escherichia coli E24377A └┤┌┴─ Escherichia coli MS 116-1 ││ ┌─ Escherichia coli B171 ││ ├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 ││┌─┼─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 │││ ├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │││ └─ Escherichia coli B171 │││ ┌─ Escherichia coli ETEC H10407 └┤│ ├─ Escherichia coli MS 145-7 ││ ├─ Escherichia coli MS 84-1 ││ ┌┼─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 ││ │├─ Escherichia coli NC101 ││ ┌┤├─ Escherichia coli MS 196-1 ││ ││└─ Escherichia coli MS 107-1 ││ │└─ Escherichia coli MS 200-1 ││ ┌┤┌─ Escherichia coli 042 └┤ ││├─ Escherichia coli MS 198-1 │ │└┼─ Escherichia coli TA271 │┌┤ ├─ Escherichia coli MS 124-1 │││ └─ Escherichia coli (25-92/92) 042 ││└─ Escherichia coli MS 182-1 ││ ┌─ Escherichia coli (25-92/92) CFT073 ││ ├─ Escherichia coli 536 ││ ├─ Escherichia coli 83972 ││ ├─ Escherichia coli CFT073 ││ ├─ Escherichia coli IHE3034 ││ ├─ Escherichia coli MS 146-1 ││ ├─ Escherichia coli MS 200-1 └┤ ├─ Escherichia coli UM146 │ ┌┼─ Escherichia coli UTI89 │ │├─ Escherichia coli UTI89 │ │├─ Escherichia coli SE15 │ │├─ Escherichia coli MS 185-1 │ │├─ Escherichia coli M605 │┌┤├─ Escherichia coli F11 │││├─ Escherichia coli ABU 83972 │││├─ Escherichia coli 536 │││└─ Escherichia coli (25-92/92) F11 ││└─ Escherichia coli MS 45-1 └┤ ┌─ Escherichia coli (25-92/92) B7A │┌┼─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 ││└─ Escherichia coli B7A ││ ┌─ Escherichia coli 2362-75 ││ ├─ Escherichia coli FVEC1412 ││ ├─ Escherichia coli MS 198-1 └┤┌┼─ Escherichia coli UMN026 ││├─ Escherichia coli M718 ││└─ Escherichia coli FVEC1302 ││┌─ Escherichia coli (25-92/92) E22 ││├─ Escherichia coli 1827-70 └┤├─ Escherichia coli 55989 │├─ Escherichia coli APEC O1 │├─ Escherichia coli H299 │├─ Escherichia coli M718 │├─ Escherichia coli MS 175-1 │├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 └┼─ Escherichia coli SMS-3-5 ├─ Escherichia coli S88 ├─ Escherichia coli MS 69-1 ├─ Escherichia coli MS 119-7 ├─ Escherichia coli H591 ├─ Escherichia coli E22 ├─ Escherichia coli 55989 ├─ Escherichia coli 53638 ├─ fig|1040638.4.peg.3555 O104:H4 str. LB226692 └─ Escherichia coli (25-92/92) 53638
| hypothetical protein | (233) |
| FIG033266: Phage DNA binding protein | (55) |
| Transcriptional regulator, AlpA like | (13) |
| COG3311: Predicted transcriptional regulator | (8) |
| putative DNA binding protein | (4) |
| phage transcriptional regulator, AlpA | (2) |
| orf; Unknown function | (2) |
| putative transcriptional regulator | (1) |
| FIG00638000: hypothetical protein | (1) |
| FIG00643076: hypothetical protein | (1) |
| Others | (7) |