┌─────────────────────────────────────────────────── Escherichia coli (7-338/356) 101-1 (8) │ ┌─ Escherichia coli APEC O1 (9) │ ┌┴─ Escherichia coli ED1a (2) │ ┌┴─ Escherichia coli 2362-75 (2) │ ┌┴┬─ Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C │ │ └┬─ Escherichia coli H299 │ ┌┤ └─ Escherichia coli F11 (3) │ ┌┤└─ Escherichia coli 83972 (5) │ ┌┤└─ Escherichia coli NC101 │ ┌┤└─ Escherichia coli 536 (1) │ ┌┤└─ Escherichia coli TA280 │ ┌┤└─ Escherichia coli B354 │ ┌┤└─ Escherichia coli MS 115-1 │ ┌┤└─ Escherichia coli 1044A (23) │ ┌┤└─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 [2] │ ┌┤└─ Escherichia coli M718 │ │└┬─ Escherichia coli MS 69-1 │ │ └┬─ Escherichia coli 042 (6) │ ┌┤ └─ Escherichia coli B185 │ ││ ┌─ fig|1040638.4.peg.2229 O104:H4 str. LB226692 (20) │ │└┬┴─ Escherichia coli MS 124-1 (1) │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli B171 (1) ┤ ││ └─ Escherichia coli TA271 │ ┌┤└─ Escherichia coli 53638 (1) │ ┌┤└─ Escherichia coli K12 (22) │ ┌──────────────────────────────────────┤└─ Escherichia coli (13-339/339) 1827-70 (6) │ ┌───┤ └─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │ │ └─────────────────────────────────┬── Escherichia coli (7-332/334) MS 115-1 │ │ └───┬─ Escherichia coli (8-333/335) MS 124-1 (1) │ │ └┬─ Escherichia coli (8-333/335) IAI39 (1) │ │ └─ Escherichia coli (8-333/335) 2362-75 (12) │ │ ┌─ Escherichia coli (4-332/332) M605 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (4-332/332) SE15 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (4-332/332) NC101 │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (4-332/332) 2362-75 (14) │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (4-332/332) APEC O1 (6) │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (4-332/332) WV_060327 │ │ │└┬─ Escherichia coli (4-332/332) SMS-3-5 │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (4-332/332) MS 21-1 │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (4-332/332) ED1a (2) │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (4-332/332) H299 │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (4-332/332) IAI39 (1) │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (4-332/332) M718 │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (4-332/332) MS 69-1 │ │ ┌┤└─ fig|1040638.4.peg.4084 O104:H4 (4-332/332) str. LB226692 (5) └─────┤ │└┬─ Escherichia coli (4-332/332) E110019 (1) │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (4-332/332) O111:H- str. 11128 │ ││ └─ Escherichia coli (4-332/332) B088 (23) │ ┌───┤└┬─ Escherichia coli (4-332/332) MS 196-1 │ │ │ └─ Escherichia coli (4-332/332) K12 (25) │ ┌──────────────────────────────┤ └┬─ Escherichia coli (4-332/332) O55:H7 str. CB9615 │ │ │ └─ Escherichia coli (4-332/332) 1044A (24) │ │ └────── Escherichia coli (4-327/336) O157:H7 str. EC4024 │ │ ┌─ Escherichia coli (10-338/341) MS 69-1 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-327/330) SE15 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (10-338/341) M605 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (10-338/341) ED1a (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (10-338/341) K12 (64) │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (1-327/330) 101-1 (48) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-327/330) H736 (1) │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (10-338/341) 2362-75 (2) │ │ │└┬─ fig|1040638.4.peg.1350 O104:H4 (1-327/330) str. LB226692 (3) │ │ ┌──────────────────┤ └─ Escherichia coli (10-338/341) 55989 (2) │ │ ┌────┤ └─ Escherichia coli (10-338/341) MS 115-1 └───┤ │ └───────────────────────┬─ Escherichia coli (1-325/341) E24377A (1) │ │ └┬─ Escherichia coli (1-308/324) B088 │ │ └┬─ Escherichia coli (1-325/341) K12 (75) │ │ └┬─ Escherichia coli (1-325/341) ABU 83972 (3) │ │ └─ Escherichia coli (1-325/341) 2362-75 (13) │ │ ┌─ Escherichia coli (1-325/343) TA206 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-325/343) NC101 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-325/343) 2362-75 (27) │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (1-325/343) MS 21-1 │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-325/343) B185 (4) │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (1-325/343) K12 (20) │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (1-325/343) 1044A (24) │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (1-325/343) 53638 (1) │ │ │└┬─ fig|1040638.4.peg.2734 O104:H4 (1-325/343) str. LB226692 (36) │ │ ┌────────────┤ └┬─ Escherichia coli (1-325/343) MS 124-1 (1) └────┤ │ │ └─ Escherichia coli (1-325/343) IAI1 (4) │ │ └─ Escherichia coli (1-325/343) MS 115-1 │ ┌─────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (1-324/346) B str. REL606 (3) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-308/346) 101-1 │ │ └─────────┤ ┌─ Escherichia coli (1-324/346) B185 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-324/346) 1044A (25) │ │ └┬┴─ Escherichia coli (1-324/346) B171 (4) │ ┌──┤ └┬─ Escherichia coli (1-324/346) K12 (12) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-324/346) B7A (6) │ │ │ └┬─ fig|1040638.4.peg.3225 O104:H4 (1-324/346) str. LB226692 (3) │ │ │ └─ Escherichia coli (3-326/348) 042 (36) │ │ └──────────────────────────── Escherichia coli (12-339/344) 83972 (13) │ │ ┌─ Escherichia coli (8-319/331) 1044A (41) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-309/321) O157:H7 EDL933 (1) │ │ ┌┴─ fig|1040638.4.peg.2021 O104:H4 (8-319/331) str. LB226692 (13) │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (8-319/331) MS 185-1 └──┤ ┌┤ └─ Escherichia coli (8-319/331) MS 21-1 │ │└┬─ Escherichia coli (8-319/331) 101-1 (7) │ ┌┤ └─ Escherichia coli (8-319/331) 042 (53) │ ┌────────────────────────────────────┤└─ Escherichia coli (8-319/331) APEC O1 (6) │ │ └─ Escherichia coli (8-319/331) M718 │ │ ┌─ Escherichia coli (6-314/315) ED1a (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (6-314/315) MS 145-7 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (6-314/315) 536 (12) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (6-314/315) K12 (8) │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (6-314/315) TA280 └──┤ ┌┤ └─ fig|1040638.4.peg.942 O104:H4 (6-314/315) str. LB226692 (54) │ │└┬─ Escherichia coli (6-314/315) 101-1 (2) │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (6-314/315) TA143 │ ││ └─ Escherichia coli (6-314/315) 042 (1) │ │└┬─ Escherichia coli (6-314/315) 1125A (21) │ ┌─────────────────────────────────────┤ └┬─ Escherichia coli (6-314/315) O157:H7 EDL933 (1) │ │ │ └─ Escherichia coli (6-314/315) 1044A (4) │ │ └─ Escherichia coli (6-314/315) B088 (16) └──┤ ┌─ Escherichia coli (6-330/356) MS 116-1 │ ┌─────────────┴─ Escherichia coli (6-330/356) H736 │ ┌──┴───────────────────── Escherichia coli (6-330/358) TA206 └───────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (5-329/360) SMS-3-5 └───────────────┤┌─ Escherichia coli (5-329/360) MS 21-1 └┤┌─ Escherichia coli (5-329/360) FVEC1302 (3) ││ ┌─ Escherichia coli (8-332/363) K12 (31) └┤ ┌┴─ Escherichia coli (5-329/360) E24377A (1) │┌┴─ Escherichia coli (8-332/363) HS (1) └┤ ┌─ Escherichia coli (8-332/363) 042 (1) │┌┴─ Escherichia coli (5-329/360) TA143 └┤┌─ Escherichia coli (5-329/360) 2362-75 (25) ││ ┌─ Escherichia coli (5-329/360) B088 (6) └┤ ┌┴─ fig|1040638.4.peg.5358 O104:H4 (5-329/360) str. LB226692 (5) │┌┴─ Escherichia coli (5-329/360) MS 115-1 └┤┌─ Escherichia coli (5-329/360) O83:H1 str. NRG 857C └┤ ┌─ Escherichia coli (5-329/360) TA206 └┬┴─ Escherichia coli (5-329/360) 83972 (7) └┬─ Escherichia coli (5-329/360) 536 (9) └┬─ Escherichia coli (5-329/360) M605 └─ Escherichia coli (5-329/360) H299
| Evolved beta-D-galactosidase transcriptional repressor | (25) |
| Transcriptional repressor of the lac operon | (20) |
| Transcriptional regulator YcjW, LacI family, possibly involved in maltodextrin utilization pathway | (20) |
| Trehalose operon transcriptional repressor | (12) |
| Galactose operon repressor, GalR-LacI family of transcriptional regulators | (11) |
| Transcriptional (co)regulator CytR | (10) |
| Gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor | (8) |
| Mgl repressor and galactose ultrainduction factor GalS, HTH-type transcriptional regulator | (8) |
| Purine nucleotide synthesis repressor | (5) |
| Sucrose operon repressor ScrR, LacI family | (4) |
| Transcriptional regulator, LacI family | (2) |
| hypothetical transcriptional regulator YcjW | (1) |
| Others | (8) |