┌─ Escherichia coli (1-540/613) 101-1   
                        ├─ Escherichia coli (1-540/613) ATCC 8739   
                        ├─ Escherichia coli (1-540/613) B str. REL606   
                        ├─ Escherichia coli (DE3 1-540/613) BL21(DE3)   
                        ├─ Escherichia coli (1-540/613) H736   
                        ├─ Escherichia coli (1-540/613) HS   
                        ├─ Escherichia coli (1-540/613) MS 124-1   
                        ├─ Escherichia coli (1-540/613) MS 187-1   
                        ├─ Escherichia coli (1-540/613) MS 84-1   
                        ├─ Escherichia coli (1-540/613) DH1   
                        ├─ Escherichia coli (1-540/613) W3110   
                        ├─ Escherichia coli (1-540/613) str. K-12 substr. DH10B   
┌───────────────────────┼─ Escherichia coli (1-540/613) str. K-12 substr. MG1655   
│                       ├─ Escherichia coli (1-540/613) str. K-12 substr. MG1655   
│                       ├─ Escherichia coli (1-540/613) str. K-12 substr. DH10B   
│                       ├─ Escherichia coli (1-540/613) K12   
│                       ├─ Escherichia coli (1-540/613) BW2952   
│                       ├─ Escherichia coli (1-540/613) MS 196-1   
│                       ├─ Escherichia coli (1-540/613) MS 146-1   
│                       ├─ Escherichia coli (1-540/613) MS 116-1   
│                       ├─ Escherichia coli (1-540/613) HS   
│                       ├─ Escherichia coli (1-540/613) ETEC H10407   
│                       ├─ Escherichia coli (1-540/613) BL21   
│                       ├─ Escherichia coli (1-540/613) ATCC 8739   
│                       └─ Escherichia coli (1-540/613) 1827-70   
│                                                                   ┌─ Escherichia coli (1-540/613) 83972   
│                                                                   ├─ Escherichia coli (1-540/613) APEC O1   
│                                                                   ├─ Escherichia coli (1-540/613) ED1a   
┤                                                                   ├─ Escherichia coli (1-540/613) IHE3034   
│                                                                   ├─ Escherichia coli (1-540/613) MS 185-1   
│                                                                   ├─ Escherichia coli (1-540/613) NC101   
│                                                                   ├─ Escherichia coli (1-540/613) S88   
│                                                                   ├─ Escherichia coli (1-540/613) TA206   
│                                                                   ├─ Escherichia coli (1-540/613) UTI89   
│      ┌────────────────────────────────────────────────────────────┼─ Escherichia coli (1-540/613) WV_060327   
│      │                                                            ├─ Escherichia coli (1-540/613) UTI89   
│      │                                                            ├─ Escherichia coli (1-540/613) UM146   
│      │                                                            ├─ Escherichia coli (1-540/613) SE15   
│      │                                                            ├─ Escherichia coli (1-540/613) O83:H1 str. NRG 857C   
│      │                                                            ├─ Escherichia coli (1-540/613) MS 45-1   
│      │                                                            ├─ Escherichia coli (1-540/613) M605   
│      │                                                            ├─ Escherichia coli (1-540/613) ED1a   
│      │                                                            ├─ Escherichia coli (1-540/613) APEC O1   
│      │                                                            └─ Escherichia coli (1-540/613) ABU 83972   
└──────┤ ┌────────────────────────────── Escherichia coli (1-540/613) MS 78-1   
       │ │ ┌── fig|1040638.4.peg.2220 O104:H4 str. LB226692   
       │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-540/613) 042   
       │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) 1044A   
       │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) 1212A   
       │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) 536   
       │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) 53638   
       │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) 536A   
       │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) 55989   
       │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) B171   
       │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) B185   
       └─┤ │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) B7A   
         │ │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) E110019   
         │ │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) E22   
         │ │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) E2348/69   
         │ │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) E24377A   
         │ │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) F11   
         │ │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) FVEC1302   
         │ │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) H299   
         │ │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) IAI1   
         │ │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) IAI39   
         │ │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) KO11   
         └─┤ ├─ Escherichia coli (1-540/613) MS 107-1   
           │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) MS 119-7   
           │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) MS 182-1   
           │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) MS 200-1   
           │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) MS 69-1   
           │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) O111:H- str. 11128   
           │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) O157:H7   
           │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) O157:H7 EDL933   
           │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) O157:H7 str. EC4042   
           │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) O157:H7 str. EC4076   
           │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) O157:H7 str. EC4115   
           │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) O157:H7 str. EC4401   
           │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) O157:H7 str. EC4501   
           │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) O157:H7 str. EC869   
           │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) O157:H7 str. FRIK966   
           │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) O157:H7 str. TW14359   
           │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) O26:H11 str. 11368   
           │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) SE11   
           │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) TA143   
           │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) TA280   
           │ ├─ Escherichia coli (1-540/613) W   
           └─┼─ Escherichia coli (1-540/613) W   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) UMN026   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) TA271   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) SMS-3-5   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) O55:H7 str. CB9615   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) O157:H7 str. TW14588   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) O157:H7 str. Sakai   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) O157:H7 str. FRIK2000   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) O157:H7 str. EC508   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) O157:H7 str. EC4486   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) O157:H7 str. EC4206   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) O157:H7 str. EC4113   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) O157:H7 str. EC4045   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) O157:H7 str. EC4024   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) O157:H7 EDL933   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) O127:H6 str. E2348/69   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) O103:H2 str. 12009   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) MS 21-1   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) MS 198-1   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) MS 145-7   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) MS 115-1   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) M718   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) IAI39   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) IAI1   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) H591   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) FVEC1412   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) F11   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) EC4100B   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) E24377A   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) E22   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) E110019   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) B7A   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) B354   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) B171   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) B088   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) 55989   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) 53638   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) 536   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) 2362-75   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) 1125A   
             ├─ Escherichia coli (1-540/613) 042   
             └─ fig|6666666.5357.peg.4449 TY-2482 (1-540/613) strain   
  
RNA polymerase sigma factor RpoD (127)
Others (2)