┌─ fig|1040638.4.peg.3303 O104:H4 (4-197/216) str. LB226692 ├─ Escherichia coli (19-212/231) 042 ├─ Escherichia coli (4-197/216) 101-1 ├─ Escherichia coli (4-197/216) 1125A ├─ Escherichia coli (4-197/216) 1827-70 ├─ Escherichia coli (4-197/216) 536 ├─ Escherichia coli (4-197/216) 53638 ├─ Escherichia coli (4-197/216) 536A ├─ Escherichia coli (4-197/216) 55989 ├─ Escherichia coli (4-197/216) ABU 83972 ├─ Escherichia coli (19-212/231) APEC O1 ├─ Escherichia coli (4-197/216) ATCC 8739 ├─ Escherichia coli (4-197/216) B171 ├─ Escherichia coli (4-197/216) B354 ├─ Escherichia coli (4-197/216) B7A ├─ Escherichia coli (19-212/231) CFT073 ├─ Escherichia coli (4-197/216) DH1 ├─ Escherichia coli (4-197/216) E110019 ├─ Escherichia coli (4-197/216) E22 ├─ Escherichia coli (4-197/216) E24377A ├─ Escherichia coli (4-197/216) EC4100B ├─ Escherichia coli (4-197/216) ED1a ├─ Escherichia coli (4-197/216) F11 ├─ Escherichia coli (4-197/216) FVEC1302 ├─ Escherichia coli (4-197/216) H299 ├─ Escherichia coli (4-197/216) H736 ├─ Escherichia coli (4-197/216) HS ├─ Escherichia coli (4-197/216) IAI1 ├─ Escherichia coli (4-197/216) IAI39 ├─ Escherichia coli (4-197/216) K12 ├─ Escherichia coli (4-197/216) M605 ├─ Escherichia coli (4-197/216) MS 107-1 ├─ Escherichia coli (4-197/216) MS 116-1 ├─ Escherichia coli (4-197/216) MS 124-1 ├─ Escherichia coli (4-197/216) MS 146-1 ├─ Escherichia coli (4-197/216) MS 185-1 ├─ Escherichia coli (4-197/216) MS 196-1 ├─ Escherichia coli (4-197/216) MS 200-1 ├─ Escherichia coli (4-197/216) MS 45-1 ├─ Escherichia coli (4-197/216) MS 78-1 ├─ Escherichia coli (4-197/216) NC101 ├─ Escherichia coli (4-197/216) O111:H- str. 11128 ├─ Escherichia coli (4-197/216) O157:H7 ├─ Escherichia coli (4-197/216) O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli (4-197/216) O157:H7 str. EC4042 ├─ Escherichia coli (4-197/216) O157:H7 str. EC4076 ├─ Escherichia coli (4-197/216) O157:H7 str. EC4115 ├─ Escherichia coli (4-197/216) O157:H7 str. EC4206 ├─ Escherichia coli (4-197/216) O157:H7 str. EC4486 ├─ Escherichia coli (4-197/216) O157:H7 str. EC508 ├─ Escherichia coli (4-197/216) O157:H7 str. FRIK2000 ├─ Escherichia coli (4-197/216) O157:H7 str. Sakai ├─ Escherichia coli (4-197/216) O157:H7 str. TW14588 ├─ Escherichia coli (4-197/216) O55:H7 str. CB9615 ├─ Escherichia coli (4-197/216) S88 ├─ Escherichia coli (4-197/216) SE15 ├─ Escherichia coli (4-197/216) TA143 ├─ Escherichia coli (4-197/216) TA271 ├─ Escherichia coli (4-197/216) UM146 ├─ Escherichia coli (4-197/216) UTI89 ├─ Escherichia coli (4-197/216) W ├─ Escherichia coli (4-197/216) W3110 ├─ Escherichia coli (4-197/216) str. K-12 substr. DH10B ┌──────────────────────────────────────┼─ Escherichia coli (4-197/216) str. K-12 substr. MG1655 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) str. K-12 substr. MG1655 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) WV_060327 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) W │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) UTI89 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) UMN026 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) TA280 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) TA206 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) SMS-3-5 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) SE11 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) O83:H1 str. NRG 857C │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) O26:H11 str. 11368 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) O157:H7 str. TW14359 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) O157:H7 str. FRIK966 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) O157:H7 str. EC869 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) O157:H7 str. EC4501 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) O157:H7 str. EC4401 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) O157:H7 str. EC4196 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) O157:H7 str. EC4113 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) O157:H7 str. EC4045 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) O157:H7 str. EC4024 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) O157:H7 EDL933 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) O127:H6 str. E2348/69 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) O103:H2 str. 12009 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) MS 84-1 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) MS 69-1 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) MS 21-1 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) MS 198-1 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) MS 187-1 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) MS 182-1 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) MS 145-7 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) MS 119-7 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) MS 115-1 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) M718 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) KO11 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) IHE3034 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) IAI39 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) IAI1 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) HS │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) H591 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) FVEC1412 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) F11 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) ETEC H10407 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) ED1a │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) E24377A │ ├─ Escherichia coli (19-212/231) E2348/69 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) E22 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) E110019 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) CFT073 │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) BW2952 ┌────────────────────┤ ├─ Escherichia coli (4-197/216) B7A │ │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) B185 │ │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) B171 │ │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) ATCC 8739 │ │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) APEC O1 │ │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) 83972 │ │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) 55989 │ │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) 53638 │ │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) 536 │ │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) 2362-75 │ │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) 1212A │ │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) 1044A │ │ ├─ Escherichia coli (4-197/216) 042 │ │ └─ fig|6666666.5357.peg.566 TY-2482 (4-197/216) strain │ │ ┌─ fig|1040638.4.peg.3445 O104:H4 (2-194/218) str. LB226692 │ │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) 1827-70 │ │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) 53638 │ │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) B171 │ │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) B7A │ │ ├─ Escherichia coli (DE3 2-194/218) BL21(DE3) │ │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) DH1 │ │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) E110019 │ │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) E22 │ │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) EC4100B │ │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) H736 │ │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) KO11 │ │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) MS 115-1 │ │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) MS 182-1 │ │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) O103:H2 str. 12009 │ │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) TA271 │ │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) W3110 │ │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) str. K-12 substr. MG1655 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (2-194/218) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) str. K-12 substr. DH10B │ │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) W │ │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) SE11 │ │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) MS 78-1 │ │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) MS 145-7 │ │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) M718 │ │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) K12 │ │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) H591 │ │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) E24377A │ │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) E22 │ │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) E110019 │ │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) BW2952 │ │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) B7A │ │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) B171 │ │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) 55989 │ │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) 53638 │ │ │└─ Escherichia coli (2-194/218) 101-1 │ └──────────────────────────────────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (2-194/218) ATCC 8739 │ │┌┴─ Escherichia coli (2-194/218) ATCC 8739 │ ││┌─ Escherichia coli (2-194/218) 042 │ ││├─ Escherichia coli (2-194/218) 1125A │ ││├─ Escherichia coli (2-194/218) 2362-75 │ ││├─ Escherichia coli (2-194/218) 83972 │ ││├─ Escherichia coli (2-194/218) APEC O1 │ ││├─ Escherichia coli (2-194/218) B185 │ ││├─ Escherichia coli (2-194/218) CFT073 │ ││├─ Escherichia coli (2-194/218) E2348/69 │ ││├─ Escherichia coli (2-194/218) ED1a │ ││├─ Escherichia coli (2-194/218) F11 │ ││├─ Escherichia coli (2-194/218) FVEC1412 │ ││├─ Escherichia coli (2-194/218) HS │ ││├─ Escherichia coli (2-194/218) IAI39 │ ││├─ Escherichia coli (2-194/218) M605 │ ││├─ Escherichia coli (2-194/218) MS 124-1 │ ││├─ Escherichia coli (2-194/218) MS 185-1 │ └┤├─ Escherichia coli (2-194/218) MS 198-1 │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) MS 21-1 │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) MS 69-1 │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) NC101 │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) O157:H7 EDL933 │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) O157:H7 str. EC4024 │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) O157:H7 str. EC4045 │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) O157:H7 str. EC4113 ┤ │├─ Escherichia coli (2-194/218) O157:H7 str. EC4196 │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) O157:H7 str. EC4401 │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) O157:H7 str. FRIK2000 │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) O157:H7 str. Sakai │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) O157:H7 str. TW14588 │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) O55:H7 str. CB9615 │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) S88 │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) TA206 │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) UM146 │ │├─ Escherichia coli (2-194/218) UTI89 │ └┼─ Escherichia coli (2-194/218) WV_060327 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) UTI89 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) UMN026 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) TA280 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) SE15 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) O83:H1 str. NRG 857C │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) O26:H11 str. 11368 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) O157:H7 str. TW14359 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) O157:H7 str. FRIK966 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) O157:H7 str. EC869 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) O157:H7 str. EC4206 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) O157:H7 str. EC4115 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) O157:H7 str. EC4076 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) O157:H7 str. EC4042 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) O157:H7 EDL933 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) O157:H7 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) MS 84-1 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) MS 45-1 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) MS 200-1 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) MS 187-1 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) MS 175-1 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) MS 116-1 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) IHE3034 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) IAI39 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) HS │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) FVEC1302 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) F11 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) ED1a │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) CFT073 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) B354 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) APEC O1 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) ABU 83972 │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) 536A │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) 1212A │ ├─ Escherichia coli (2-194/218) 1044A │ └─ Escherichia coli (2-194/218) 042 │ ┌─ Escherichia coli B171 │ ├─ Escherichia coli E22 │ ├─ Escherichia coli KO11 │ ├─ Escherichia coli SE11 │ ├─ Escherichia coli W │ ┌┼─ Escherichia coli W │ │├─ Escherichia coli TA271 │ │├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ │├─ Escherichia coli E22 │ │└─ Escherichia coli B171 │ │ ┌─ Escherichia coli 536 │ │ ├─ Escherichia coli 83972 │ │ ├─ Escherichia coli CFT073 │ │ ├─ Escherichia coli F11 │ │ ├─ Escherichia coli MS 185-1 │ │ ├─ Escherichia coli MS 45-1 │ │ ┌┼─ Escherichia coli SE15 │ │ │├─ Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C │ │ │├─ Escherichia coli MS 200-1 │ │ │├─ Escherichia coli F11 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli CFT073 │ │ ││├─ Escherichia coli ABU 83972 │ │ ││└─ Escherichia coli 536 │ │ ││┌─ Escherichia coli M605 │ │ │└┤┌─ Escherichia coli WV_060327 │ │ │ ││┌─ Escherichia coli IHE3034 │ │ │ └┤├─ Escherichia coli S88 │ │ ┌┤ │├─ Escherichia coli UTI89 │ │ ││ └┼─ Escherichia coli UTI89 │ │ ││ ├─ Escherichia coli UM146 └──────────────────────────────────────────────────────────────┤ ││ ├─ Escherichia coli NC101 │ ││ └─ Escherichia coli APEC O1 │┌┤│┌─ Escherichia coli E2348/69 │││└┼─ Escherichia coli ED1a │││ ├─ Escherichia coli ED1a │││ └─ Escherichia coli 2362-75 ││└─ Escherichia coli B354 ││ ┌─ Escherichia coli 1044A ││ ├─ Escherichia coli 1212A ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 ││ ┌┼─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 └┤ ┌┤├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 │ ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 │ ││├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ ││├─ Escherichia coli 536A │ ││└─ Escherichia coli 1125A │ ││┌─ Escherichia coli SMS-3-5 │ │││┌─ Escherichia coli 042 │┌┤└┤├─ Escherichia coli FVEC1412 │││ │├─ Escherichia coli MS 21-1 │││ └┼─ Escherichia coli UMN026 │││ ├─ Escherichia coli MS 69-1 │││ ├─ Escherichia coli MS 198-1 │││ ├─ Escherichia coli FVEC1302 │││ └─ Escherichia coli 042 ││└─ Escherichia coli EC4100B ││┌─ fig|6666666.5357.peg.619 TY-2482 strain ││├─ Escherichia coli 1827-70 ││├─ Escherichia coli 53638 ││├─ Escherichia coli 55989 ││├─ Escherichia coli ATCC 8739 ││├─ Escherichia coli B185 ││├─ Escherichia coli B7A ││├─ Escherichia coli (DE3) BL21(DE3) ││├─ Escherichia coli DH1 ││├─ Escherichia coli E110019 └┤├─ Escherichia coli E24377A │├─ Escherichia coli H299 │├─ Escherichia coli H736 │├─ Escherichia coli HS │├─ Escherichia coli IAI1 │├─ Escherichia coli IAI39 │├─ Escherichia coli M718 │├─ Escherichia coli MS 115-1 │├─ Escherichia coli MS 119-7 │├─ Escherichia coli MS 145-7 │├─ Escherichia coli MS 175-1 │├─ Escherichia coli MS 187-1 │├─ Escherichia coli MS 78-1 │├─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │├─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 │├─ Escherichia coli TA143 │├─ Escherichia coli W3110 │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 └┼─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B ├─ Escherichia coli TA206 ├─ Escherichia coli OP50 ├─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 ├─ Escherichia coli MS 84-1 ├─ Escherichia coli MS 196-1 ├─ Escherichia coli MS 182-1 ├─ Escherichia coli MS 146-1 ├─ Escherichia coli MS 124-1 ├─ Escherichia coli MS 116-1 ├─ Escherichia coli MS 107-1 ├─ Escherichia coli K12 ├─ Escherichia coli IAI39 ├─ Escherichia coli IAI1 ├─ Escherichia coli HS ├─ Escherichia coli H591 ├─ Escherichia coli ETEC H10407 ├─ Escherichia coli E24377A ├─ Escherichia coli E110019 ├─ Escherichia coli BW2952 ├─ Escherichia coli BL21 ├─ Escherichia coli B7A ├─ Escherichia coli B str. REL606 ├─ Escherichia coli ATCC 8739 ├─ Escherichia coli 55989 ├─ Escherichia coli 53638 ├─ Escherichia coli 101-1 └─ fig|1040638.4.peg.2152 O104:H4 str. LB226692
| Putative regulator | (126) |
| DNA-binding capsular synthesis response regulator RcsB | (125) |
| BarA-associated response regulator UvrY (= GacA = SirA) | (107) |
| Others | (5) |