fig|1040638.4.peg.20   Escherichia coli O104:H4 str. LB226692     MQHVPEGVIQAPESPDAPEALPGCRSISDDDLCTWCTRLLYRSGELSLCRLSTGNGI
fig|1040638.4.peg.1191   Escherichia coli O104:H4 str. LB226692 (1-52/271)     MQHVPEGVIQAPESPDAPEALPGCRSISDDDLCAWCTRLLYRPGEISLCRLS     
fig|216592.1.peg.4532   Escherichia coli 042 (14-65/284)     MQHVPEGVIQAPESPDAPEALPGCRSISDDDLCAWCTRLLYRPGEISLCRLS     
fig|525281.3.peg.2698   Escherichia coli 83972 (1-57/81)     MQHVPEGVIQAPESPDAPEALPGCRSISDDDLCAWCTRLLYRPGEISLCRLSTGNGI
fig|655817.3.peg.262   Escherichia coli ABU 83972 (1-57/81)     MQHVPEGVIQAPESPDAPEALPGCRSISDDDLCAWCTRLLYRPGEISLCRLSTGNGI
fig|199310.4.peg.261   Escherichia coli CFT073 (1-57/81)     MQHVPEGVIQAPESPDAPEALPGCRSISDDDLCAWCTRLLYRPGEISLCRLSTGNGI
fig|656393.3.peg.856   Escherichia coli H299 (1-57/81)     MQHVPEGVIQAPESPDAPEALPGCRSISDDDLCAWCTRLLYRPGEISLCRLSTGNGI
fig|714962.3.peg.1148   Escherichia coli IHE3034 (1-57/81)     MQHVPEGVIQAPESPDAPEALPGCRSISDDDLCAWCTRLLYRPGEISLCRLSTGNGI
fig|656440.3.peg.27   Escherichia coli TA206 (1-57/81)     MQHVPEGVIQAPESPDAPEALPGCRSISDDDLCAWCTRLLYRPGEISLCRLSTGNGI
fig|869729.3.peg.2604   Escherichia coli UM146 (1-57/81)     MQHVPEGVIQAPESPDAPEALPGCRSISDDDLCAWCTRLLYRPGEISLCRLSTGNGI
fig|364106.7.peg.1220   Escherichia coli UTI89 (1-57/81)     MQHVPEGVIQAPESPDAPEALPGCRSISDDDLCAWCTRLLYRPGEISLCRLSTGNGI
fig|364106.8.peg.1219   Escherichia coli UTI89 (1-57/81)     MQHVPEGVIQAPESPDAPEALPGCRSISDDDLCAWCTRLLYRPGEISLCRLSTGNGI
fig|316401.4.peg.2431   Escherichia coli ETEC H10407 (1-57/81)     MKHIPEGVIQVPESPDAPEALPGCRSISDDDLCAWCTRLLYRPGELSLCRLSTGNGI
fig|749544.3.peg.2080   Escherichia coli MS 175-1 (1-57/81)     MKHIPEGVIQVPESPDAPEALPGCRSISDDDLCAWCTRLLYRPGELSLCRLSTDNGI
fig|585395.4.peg.3924   Escherichia coli O103:H2 str. 12009 (1-57/81)     MKHIPEGVIQVPESPDAPEALPGSRSISDDDLCAWCTRLLYRPGEISLCRLSTGNGI
fig|199310.1.peg.264   Escherichia coli CFT073 (1-50/74)            MIQAPESPDAPEALPGCRSISDDDLCAWCTRLLYRPGEISLCRLSTGNGI
Consen1   Primary consensus     MqHvPEGVIQaPESPDAPEALPGCRSISDDDLCAWCTRLLYRPGEiSLCRLSTGNGI
Consen2   Secondary consensus      k i      v                                  l           

Consensus 1 (when a gap)
Conservative difference
Consensus 2 (when a gap)
Nonconservative diff.
Other character