┌─ Escherichia coli (5-77/304) B185 (10) ┌┴─ Escherichia coli (5-77/304) APEC O1 (10) ┌┴─ Escherichia coli (5-77/304) K12 (109) ┌──────────┴─ Escherichia coli (5-77/304) M605 ┌─┴────────────────────────────────┬─ Escherichia coli (1-71/303) ED1a (1) │ └┬─ fig|1040638.4.peg.1827 O104:H4 (1-71/303) str. LB226692 (109) ┌─┤ └┬─ Escherichia coli (1-77/309) O157:H7 EDL933 │ │ └─ Escherichia coli (1-77/309) K12 (18) ┌────┤ └──────────────────────────────────────── Escherichia coli (9-74/248) O157:H7 str. EC4024 │ │ ┌─ Escherichia coli (10-74/294) 042 (10) │ └─────────────────┬┴────── Escherichia coli (11-75/295) 101-1 ┌─┤ └┬─ Escherichia coli (10-74/294) B185 │ │ └─ Escherichia coli (10-74/294) 1044A (25) │ └──────────────────────────┬─ Escherichia coli (12-70/308) 536 (23) │ └┬─ Escherichia coli (33-91/329) 042 (16) │ └┬─ Escherichia coli (12-70/308) O55:H7 str. CB9615 │ └┬─ Escherichia coli (12-70/308) 1044A (8) │ └─ Escherichia coli (12-70/308) 1125A (15) │ ┌─ Escherichia coli (8-75/310) IAI1 (1) ┌──────┤ ┌┴─ Escherichia coli (8-75/236) O55:H7 str. CB9615 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (8-75/250) M718 │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (8-75/297) 1827-70 (1) │ │ ┌───────────────────────┤└─ Escherichia coli (8-75/310) K12 (117) │ │ ┌───────┤ └─ Escherichia coli (8-71/75) TA280 │ │ │ └────────────────────┬─ Escherichia coli (4-76/308) K12 (95) │ │ ┌──────┤ └─ Escherichia coli (1-76/308) ATCC 8739 (1) │ │ │ └──────────────────── Escherichia coli (8-66/299) 1044A (25) │ └──┤ ┌────────────────────── Escherichia coli (8-81/302) IAI39 (1) ┌───┤ │ │ ┌─ Escherichia coli (6-66/308) K12 (125) │ │ └──┤ ┌┴─ Escherichia coli (6-66/308) MS 69-1 │ │ │ ┌───────────────┴─ Escherichia coli (6-66/308) O157:H7 str. EC4486 │ │ └─────┤ ┌─ Escherichia coli (9-83/223) 536 (4) │ │ └────────────┬──────────────┴─ Escherichia coli (12-96/315) CFT073 ┌┤ │ └──────────┬─ Escherichia coli (9-69/299) ETEC H10407 ││ │ └┬─ Escherichia coli (9-69/299) MS 185-1 ││ │ └─ Escherichia coli (9-69/299) K12 (126) ││ └───────────────────────────────────┬─ Escherichia coli (6-67/310) B354 ┌────┤│ └─ Escherichia coli (6-67/310) K12 (128) │ │└────────────────────────────── Escherichia coli (6-70/293) H591 (2) │ │ ┌──────────────────────────── Escherichia coli (17-79/318) TA206 │ └───┤ ┌─────────────────────────── Escherichia coli (11-79/299) FVEC1302 (5) │ │ ┌──────┴──────────────────────────────────── Escherichia coli (11-75/311) MS 119-7 │ └───────┬──┴──────────────────────── Escherichia coli (9-76/309) 53638 │ └────────────────────┬─ Escherichia coli (1-82/312) MS 115-1 │ └┬─ Escherichia coli (1-82/312) B088 │ └┬─ Escherichia coli (1-82/312) K12 (129) ┤ └┬─ Escherichia coli (1-82/312) O111:H- str. 11128 │ └─ fig|1040638.4.peg.1696 O104:H4 str. LB226692 │ ┌─ Escherichia coli (6-76/293) K12 (90) │ ┌┴─ Escherichia coli (6-76/141) OP50 │ ┌──────────────────────────────────┴─ Escherichia coli (6-76/293) MS 21-1 │ ┌─────────┴───────────────────────── Escherichia coli (6-76/130) 536 (24) │ │ ┌─ Escherichia coli (4-74/305) K12 (91) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (4-74/305) 536 (16) │ │ ┌────────────────────────┴─ fig|1040638.4.peg.3536 O104:H4 (4-74/305) str. LB226692 (8) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (6-80/302) K12 (97) └──┤ │ ┌┴─ Escherichia coli (6-80/302) MS 69-1 │ │ ┌─────────────────┴─ Escherichia coli (6-80/302) FVEC1302 (3) │ │ ┌──────┴──────────────────────────────── Escherichia coli (19-80/320) MS 146-1 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (6-73/297) 2362-75 (25) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (6-73/297) E2348/69 (1) └──┤ │ ┌┴─ Escherichia coli (6-73/297) FVEC1302 (6) │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (6-73/297) K12 (90) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (6-73/297) E22 (2) │ │ ┌──────────┤ └─ Escherichia coli (6-73/297) B171 (1) │ │ ┌────────────┤ └─ Escherichia coli (6-73/297) SMS-3-5 │ │ │ └───────┬─ Escherichia coli (12-77/294) IAI39 (1) │ │ │ └──┬─ fig|1040638.4.peg.2817 O104:H4 (12-77/294) str. LB226692 (2) └──┤ ┌─────┤ └┬─ Escherichia coli (17-82/299) E22 (2) │ │ │ └─ Escherichia coli (12-77/294) K12 (58) │ │ └────┬──────────────────────────── Escherichia coli (6-73/296) B7A (7) │ │ └──────────┬─ Escherichia coli (4-74/296) E22 (1) │ │ └─ Escherichia coli (4-74/296) K12 (103) │ │ ┌─ Escherichia coli (26-85/93) ED1a (1) │ │ ┌┴─ fig|6666666.5357.peg.2190 TY-2482 (5-76/317) strain (105) │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (5-76/317) BW2952 (6) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (26-97/338) B171 (3) [2] │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (32-97/338) 53638 (1) └─┤ ┌┤└─ Escherichia coli (4-69/310) HS (2) │ ┌───────────────────────────────┤└─ Escherichia coli (4-69/310) K12 │ │ └─ Escherichia coli (4-69/310) B354 │ ┌──────┤┌───────────────────────── Escherichia coli (24-85/101) MS 124-1 (1) │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (59-125/354) K12 (95) │ │ └───┬──────────────────────────┴─ Escherichia coli (12-78/307) O111:H- str. 11128 │ ┌──┤ └───────────────────────┬─ Escherichia coli (9-83/302) 1044A (26) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (9-83/302) E24377A (2) │ │ │ └─ Escherichia coli (9-83/302) MS 21-1 (2) │ │ └────────────┬─ Escherichia coli (4-63/299) TA280 └───┤ └─┬─ Escherichia coli (11-71/307) 042 (1) │ └┬─ Escherichia coli (3-63/299) 1044A (25) │ └─ Escherichia coli (3-63/299) K12 (65) │ ┌─────────────────────────────────────── Escherichia coli (3-72/317) K12 (127) │ │ ┌───────────────────────────────── Escherichia coli (3-75/279) K12 (132) └─────┤ │ ┌─ Escherichia coli (5-70/301) M718 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (5-70/301) 1044A (23) └────┤ ┌────────────────────────────┴┬─ Escherichia coli (5-70/301) 042 (1) │ ┌────┤ └─ Escherichia coli (5-70/301) B354 (11) │ │ └──────────────────────┬── Escherichia coli (5-67/305) O157:H7 str. EC4042 │ │ └─ Escherichia coli (5-67/305) K12 (121) └─┤ ┌─ Escherichia coli (20-76/314) 536 (35) │ ┌─────────┴─ Escherichia coli (23-76/311) K12 (25) │ ┌────────┴──────────────────────────── Escherichia coli (12-82/297) K12 (7) └───┤ ┌─ Escherichia coli (6-78/298) 101-1 (35) │ ┌┴─ Escherichia coli (6-78/301) F11 (1) └─────────┬─────────────────────────┴─ Escherichia coli (6-78/301) MS 69-1 └──────────────────┬─ Escherichia coli (7-78/310) 536 (4) └┬─ Escherichia coli (7-78/310) K12 (121) └┬─ Escherichia coli (7-78/310) O55:H7 str. CB9615 └┬─ Escherichia coli (7-75/99) O157:H7 str. EC4042 └─ Escherichia coli (7-77/310) MS 185-1
| Putative LysR-like transcriptional regulator | (11) |
| Hypothetical lysR-family transcriptional regulator YdhB | (8) |
| LysR family transcriptional regulator YnfL | (7) |
| LysR family transcriptional regulator YbhD | (7) |
| Transcriptional regulator, LysR family | (6) |
| Putative HTH-type transcriptional regulator yahB | (6) |
| Putative transcriptional regulator LYSR-type | (5) |
| Cyn operon transcriptional activator | (5) |
| Transcriptional regulator LysR family, yafC | (4) |
| Threonine catabolic operon transcriptional activator TdcA | (4) |
| LysR family transcriptional regulator YfeR | (3) |
| LysR family transcriptional regulator YcjZ | (3) |
| Regulatory protein (induces abgABT, used to catabolize p-aminobenzoyl-glutamate) | (3) |
| Xanthosine operon regulatory protein XapR, LysR family | (3) |
| LysR family transcriptional regulator YeiE | (3) |
| Putative transcriptional regulator | (3) |
| LysR family transcriptional regulator YdcI | (2) |
| Transcriptional regulator | (2) |
| Glycine cleavage system transcriptional activator GcvA | (2) |
| Nitrogen assimilation regulatory protein Nac | (2) |
| Others | (21) |