┌─ fig|1040638.4.peg.5637 O104:H4 (16-308/314) str. LB226692 ├─ Escherichia coli (16-308/314) 101-1 ├─ Escherichia coli (16-308/314) 55989 ├─ Escherichia coli (44-336/342) ATCC 8739 ├─ Escherichia coli (16-308/314) B str. REL606 ├─ Escherichia coli (16-308/314) B171 ├─ Escherichia coli (22-314/320) B354 ├─ Escherichia coli (16-308/314) B7A ├─ Escherichia coli (DE3 16-308/314) BL21(DE3) ├─ Escherichia coli (16-308/314) DH1 ├─ Escherichia coli (16-308/314) E110019 ├─ Escherichia coli (16-308/314) E22 ├─ Escherichia coli (16-308/314) E24377A ├─ Escherichia coli (16-308/314) ETEC H10407 ├─ Escherichia coli (16-308/314) FVEC1412 ├─ Escherichia coli (16-308/314) H736 ├─ Escherichia coli (16-308/314) HS ├─ Escherichia coli (22-314/320) IAI1 ├─ Escherichia coli (16-308/314) KO11 ├─ Escherichia coli (16-308/314) MS 107-1 ├─ Escherichia coli (16-308/314) MS 116-1 ├─ Escherichia coli (16-308/314) MS 124-1 ├─ Escherichia coli (16-308/314) MS 182-1 ├─ Escherichia coli (16-308/314) MS 196-1 ├─ Escherichia coli (16-308/314) MS 69-1 ├─ Escherichia coli (22-314/320) MS 84-1 ├─ Escherichia coli (16-308/314) O111:H- str. 11128 ├─ Escherichia coli (16-308/314) OP50 ├─ Escherichia coli (16-308/314) TA143 ├─ Escherichia coli (16-308/314) TA280 ├─ Escherichia coli (16-308/314) W ├─ Escherichia coli (16-308/314) W3110 ┌┼─ Escherichia coli (16-308/314) str. K-12 substr. MG1655 │├─ Escherichia coli (16-308/314) str. K-12 substr. MG1655 │├─ Escherichia coli (22-314/320) W │├─ Escherichia coli (16-308/314) UMN026 │├─ Escherichia coli (16-308/314) TA271 │├─ Escherichia coli (16-308/314) SE11 │├─ Escherichia coli (16-308/314) O26:H11 str. 11368 │├─ Escherichia coli (16-308/314) O103:H2 str. 12009 │├─ Escherichia coli (16-308/314) MS 78-1 │├─ Escherichia coli (16-308/314) MS 198-1 │├─ Escherichia coli (16-308/314) MS 187-1 │├─ Escherichia coli (16-308/314) MS 145-7 │├─ Escherichia coli (16-308/314) MS 119-7 │├─ Escherichia coli (16-308/314) MS 115-1 │├─ Escherichia coli (16-308/314) M718 │├─ Escherichia coli (16-308/314) K12 │├─ Escherichia coli (22-314/320) IAI1 │├─ Escherichia coli (16-308/314) HS │├─ Escherichia coli (22-314/320) H591 │├─ Escherichia coli (16-308/314) FVEC1302 │├─ Escherichia coli (16-308/314) EC4100B ┌┤├─ Escherichia coli (16-308/314) E24377A ││├─ Escherichia coli (16-308/314) E22 ││├─ Escherichia coli (16-308/314) E110019 ││├─ Escherichia coli (16-308/314) BW2952 ││├─ Escherichia coli (16-308/314) BL21 ││├─ Escherichia coli (16-308/314) B7A ││├─ Escherichia coli (16-308/314) B171 ││├─ Escherichia coli (75-367/373) B088 ││├─ Escherichia coli (16-308/314) ATCC 8739 ││├─ Escherichia coli (16-308/314) 55989 ││├─ Escherichia coli (16-308/314) 1827-70 ││└─ fig|6666666.5357.peg.1773 TY-2482 (22-314/320) strain ││ ┌─ Escherichia coli (22-314/320) O157:H7 str. EC869 ││┌┼─ Escherichia coli (22-314/320) O157:H7 str. FRIK966 │││└─ Escherichia coli (16-308/314) O157:H7 str. FRIK2000 │││┌─ Escherichia coli (16-308/314) 042 │││├─ Escherichia coli (16-308/314) 1125A │││├─ Escherichia coli (16-308/314) 536A │││├─ Escherichia coli (16-308/314) O157:H7 │││├─ Escherichia coli (16-308/314) O157:H7 EDL933 │└┤├─ Escherichia coli (16-308/314) O157:H7 str. EC4042 │ │├─ Escherichia coli (16-308/314) O157:H7 str. EC4076 ┌┤ │├─ Escherichia coli (16-308/314) O157:H7 str. EC4115 ││ │├─ Escherichia coli (16-308/314) O157:H7 str. EC4206 ││ │├─ Escherichia coli (16-308/314) O157:H7 str. EC4486 ││ │├─ Escherichia coli (16-308/314) O157:H7 str. EC508 ││ │├─ Escherichia coli (16-308/314) O157:H7 str. TW14359 ││ └┼─ Escherichia coli (16-308/314) O55:H7 str. CB9615 ││ ├─ Escherichia coli (16-308/314) O157:H7 str. TW14588 ││ ├─ Escherichia coli (16-308/314) O157:H7 str. Sakai ││ ├─ Escherichia coli (16-308/314) O157:H7 str. EC4501 ││ ├─ Escherichia coli (16-308/314) O157:H7 str. EC4401 ││ ├─ Escherichia coli (16-308/314) O157:H7 str. EC4196 ││ ├─ Escherichia coli (16-308/314) O157:H7 str. EC4113 ││ ├─ Escherichia coli (22-314/320) O157:H7 str. EC4045 ││ ├─ Escherichia coli (16-308/314) O157:H7 str. EC4024 ││ ├─ Escherichia coli (22-314/320) O157:H7 EDL933 ││ ├─ Escherichia coli (16-308/314) B185 ││ ├─ Escherichia coli (16-308/314) 1212A ││ ├─ Escherichia coli (16-308/314) 1044A ││ └─ Escherichia coli (44-336/342) 042 ││┌─ Escherichia coli (16-308/314) M605 │││┌─ Escherichia coli (16-308/314) H299 ││││┌─ Escherichia coli (22-314/320) 536 │└┤│├─ Escherichia coli (16-308/314) 83972 │ ││├─ Escherichia coli (16-308/314) APEC O1 ┌┤ ││├─ Escherichia coli (16-308/314) CFT073 ││ ││├─ Escherichia coli (44-336/342) E2348/69 ││ └┤├─ Escherichia coli (16-308/314) F11 ││ │├─ Escherichia coli (16-308/314) MS 185-1 ││ │├─ Escherichia coli (16-308/314) MS 45-1 ││ │├─ Escherichia coli (16-308/314) O127:H6 str. E2348/69 ││ │├─ Escherichia coli (16-308/314) S88 ││ │├─ Escherichia coli (16-308/314) TA206 ││ │├─ Escherichia coli (16-308/314) UTI89 ││ └┼─ Escherichia coli (22-314/320) WV_060327 ││ ├─ Escherichia coli (16-308/314) UTI89 ││ ├─ Escherichia coli (16-308/314) UM146 ││ ├─ Escherichia coli (16-308/314) SE15 ┌┤│ ├─ Escherichia coli (22-314/320) O83:H1 str. NRG 857C │││ ├─ Escherichia coli (16-308/314) NC101 │││ ├─ Escherichia coli (16-308/314) MS 200-1 │││ ├─ Escherichia coli (16-308/314) IHE3034 │││ ├─ Escherichia coli (16-308/314) F11 │││ ├─ Escherichia coli (16-308/314) CFT073 │││ ├─ Escherichia coli (44-336/342) APEC O1 ┌────────────────────────────────────────────────────────────┤││ ├─ Escherichia coli (16-308/314) ABU 83972 │ │││ ├─ Escherichia coli (22-314/320) 536 │ │││ └─ Escherichia coli (16-308/314) 2362-75 │ ││└─ Escherichia coli (16-308/314) MS 175-1 │ ││┌─ Escherichia coli (16-308/314) IAI39 │ │└┼─ Escherichia coli (16-308/314) SMS-3-5 ┌──────┤ │ └─ Escherichia coli (16-308/314) IAI39 │ │ └─ Escherichia coli (16-308/314) MS 21-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (25-317/317) SMS-3-5 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (25-317/317) 042 │ │ │┌┴─ Escherichia coli (25-317/317) 042 │ └──────────────────────────────────────────┤│ ┌─ Escherichia coli (25-317/317) FVEC1302 │ ││ ├─ Escherichia coli (25-317/317) IAI39 │ ││ ├─ Escherichia coli (25-317/317) MS 198-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (25-317/317) MS 69-1 │ └┤ ├─ Escherichia coli (25-317/317) TA280 │ │┌┼─ Escherichia coli (25-317/317) UMN026 │ ││├─ Escherichia coli (25-317/317) TA143 │ ││├─ Escherichia coli (25-317/317) MS 21-1 │ ││├─ Escherichia coli (25-317/317) IAI39 │ ││└─ Escherichia coli (25-317/317) FVEC1412 │ └┤┌─ Escherichia coli (25-317/317) B354 │ ││┌─ Escherichia coli (25-317/317) H299 │ │││ ┌─ Escherichia coli (25-317/317) 1044A │ │││ ├─ Escherichia coli (25-317/317) 1212A │ │││ ├─ Escherichia coli (25-317/317) B185 │ └┤│ ├─ Escherichia coli (25-317/317) O157:H7 EDL933 │ ││ ├─ Escherichia coli (25-317/317) O157:H7 str. EC4045 │ ││ ├─ Escherichia coli (25-317/317) O157:H7 str. EC4115 │ ││ ├─ Escherichia coli (25-317/317) O157:H7 str. EC4401 │ ││ ├─ Escherichia coli (25-317/317) O157:H7 str. EC869 │ ││ ├─ Escherichia coli (25-317/317) O157:H7 str. FRIK966 │ └┤ ├─ Escherichia coli (25-317/317) O157:H7 str. TW14359 │ │┌┼─ Escherichia coli (25-317/317) O55:H7 str. CB9615 │ ││├─ Escherichia coli (25-317/317) O157:H7 str. TW14588 │ ││├─ Escherichia coli (25-317/317) O157:H7 str. Sakai │ ││├─ Escherichia coli (25-317/317) O157:H7 str. FRIK2000 │ ││├─ Escherichia coli (25-317/317) O157:H7 str. EC4486 │ ││├─ Escherichia coli (25-317/317) O157:H7 str. EC4206 │ ││├─ Escherichia coli (25-317/317) O157:H7 str. EC4076 │ ││├─ Escherichia coli (25-317/317) O157:H7 str. EC4042 │ ││├─ Escherichia coli (25-317/317) O157:H7 │ ││├─ Escherichia coli (25-317/317) 536A │ └┤└─ Escherichia coli (25-317/317) 1125A │ │ ┌─ Escherichia coli (25-317/317) 101-1 │ │ ├─ Escherichia coli (25-317/317) BL21 │ │ ├─ Escherichia coli (25-317/317) MS 187-1 │ │┌┼─ Escherichia coli (25-317/317) OP50 │ ││├─ Escherichia coli (DE3 25-317/317) BL21(DE3) │ ││└─ Escherichia coli (25-317/317) B str. REL606 │ ││ ┌─ Escherichia coli (25-317/317) B171 │ ││ ├─ Escherichia coli (25-317/317) E22 │ ││ ┌┼─ Escherichia coli (25-317/317) O103:H2 str. 12009 │ └┤ │├─ Escherichia coli (25-317/317) E22 │ │┌┤└─ Escherichia coli (25-317/317) B171 │ ││└┬─ Escherichia coli (25-317/317) E24377A │ ││ └─ Escherichia coli (25-317/317) E24377A │ ││┌─ Escherichia coli (25-317/317) MS 115-1 │ │││ ┌─ Escherichia coli (25-317/317) B088 │ └┤│ ├─ Escherichia coli (25-317/317) H591 │ ││ ┌┼─ Escherichia coli (25-317/317) MS 119-7 │ ││ │├─ Escherichia coli (25-317/317) MS 107-1 │ ││┌┤└─ Escherichia coli (25-317/317) EC4100B │ ││││┌─ Escherichia coli (25-317/317) SE11 ┤ │││└┤┌─ fig|6666666.5357.peg.4708 TY-2482 (25-317/317) strain │ └┤│ └┼─ Escherichia coli (25-317/317) 55989 │ ││ ├─ Escherichia coli (25-317/317) 55989 │ ││ └─ fig|1040638.4.peg.5324 O104:H4 (25-317/317) str. LB226692 │ ││┌─ Escherichia coli (25-317/317) 53638 │ ││├─ Escherichia coli (25-317/317) ATCC 8739 │ ││├─ Escherichia coli (25-317/317) B7A │ ││├─ Escherichia coli (25-317/317) BW2952 │ ││├─ Escherichia coli (25-317/317) E110019 │ ││├─ Escherichia coli (25-317/317) ETEC H10407 │ └┤├─ Escherichia coli (25-317/317) HS │ │├─ Escherichia coli (25-317/317) IAI1 │ │├─ Escherichia coli (25-317/317) K12 │ │├─ Escherichia coli (25-317/317) MS 116-1 │ │├─ Escherichia coli (25-317/317) MS 145-7 │ │├─ Escherichia coli (25-317/317) MS 182-1 │ │├─ Escherichia coli (25-317/317) MS 78-1 │ │├─ Escherichia coli (25-317/317) O111:H- str. 11128 │ │├─ Escherichia coli (25-317/317) TA271 │ │├─ Escherichia coli (25-317/317) W │ │├─ Escherichia coli (25-317/317) str. K-12 substr. DH10B │ │├─ Escherichia coli (25-317/317) str. K-12 substr. DH10B │ │├─ Escherichia coli (25-317/317) str. K-12 substr. MG1655 │ └┼─ Escherichia coli (25-317/317) str. K-12 substr. MG1655 │ ├─ Escherichia coli (25-317/317) str. K-12 substr. DH10B │ ├─ Escherichia coli (25-317/317) str. K-12 substr. DH10B │ ├─ Escherichia coli (25-317/317) W3110 │ ├─ Escherichia coli (25-317/317) W │ ├─ Escherichia coli (25-317/317) O26:H11 str. 11368 │ ├─ Escherichia coli (25-317/317) MS 84-1 │ ├─ Escherichia coli (25-317/317) MS 196-1 │ ├─ Escherichia coli (25-317/317) MS 146-1 │ ├─ Escherichia coli (25-317/317) MS 124-1 │ ├─ Escherichia coli (25-317/317) KO11 │ ├─ Escherichia coli (25-317/317) IAI1 │ ├─ Escherichia coli (25-317/317) HS │ ├─ Escherichia coli (25-317/317) H736 │ ├─ Escherichia coli (25-317/317) E110019 │ ├─ Escherichia coli (25-317/317) DH1 │ ├─ Escherichia coli (25-317/317) B7A │ ├─ Escherichia coli (25-317/317) ATCC 8739 │ ├─ Escherichia coli (25-317/317) 53638 │ └─ Escherichia coli (25-317/317) 1827-70 │ ┌─ Escherichia coli APEC O1 │ ├─ Escherichia coli ED1a │ ├─ Escherichia coli UM146 │ ├─ Escherichia coli UTI89 │ ┌┼─ Escherichia coli (4-322/322) S88 │ │├─ Escherichia coli (4-322/322) APEC O1 │ │├─ Escherichia coli UTI89 │ │├─ Escherichia coli IHE3034 │ ┌┤└─ Escherichia coli ED1a │ ││┌─ Escherichia coli 536 │ ││├─ Escherichia coli F11 │ ││├─ Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C │ ┌┤└┼─ Escherichia coli TA206 │ ││ ├─ Escherichia coli MS 200-1 │ ││ ├─ Escherichia coli F11 │ ││ └─ Escherichia coli 536 └──────────────────────────────────────────────────────────┤└─ Escherichia coli SE15 │┌─ Escherichia coli MS 45-1 ││┌─ Escherichia coli M605 │││ ┌─ Escherichia coli (4-322/322) E2348/69 └┤│┌┴─ Escherichia coli 2362-75 │││ ┌─ Escherichia coli 83972 │││ ├─ Escherichia coli CFT073 │││ ├─ Escherichia coli MS 21-1 └┤│ ├─ Escherichia coli (4-322/322) CFT073 ││ ┌┼─ Escherichia coli (4-322/322) H299 ││ │├─ Escherichia coli NC101 ││ ┌┤├─ Escherichia coli MS 185-1 ││ ││└─ Escherichia coli ABU 83972 ││┌┤└─ Escherichia coli (1-318/319) WV_060327 ││││┌─ Escherichia coli IAI39 └┤│└┼─ Escherichia coli SMS-3-5 ││ └─ Escherichia coli IAI39 ││ ┌─ Escherichia coli TA280 ││┌┴─ Escherichia coli (4-322/322) TA143 │││ ┌─ Escherichia coli 1044A │││ ├─ Escherichia coli 1212A │││ ├─ Escherichia coli O157:H7 │││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 │││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 │││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 │││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 │││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 └┤│ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 ││ ┌┼─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 ││ ┌┤├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 ││ ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 ││ ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 ││ ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 ││ ││├─ Escherichia coli 536A ││ ┌┤│└─ Escherichia coli 1125A └┤ ││└┬─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ ││ └─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ ││┌─ Escherichia coli B185 │ │││ ┌─ Escherichia coli 53638 │ │└┤┌┴─ Escherichia coli 53638 │ │ ││┌─ Escherichia coli DH1 │ │ ││├─ Escherichia coli H736 │ │ └┤├─ Escherichia coli MS 116-1 │ │ │├─ Escherichia coli MS 196-1 │ ┌┤ │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B │ ││ │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │ ││ └┼─ Escherichia coli (4-322/322) MS 146-1 │ ││ ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │ ││ ├─ Escherichia coli W3110 │ ││ ├─ Escherichia coli MS 175-1 │ ││ ├─ Escherichia coli K12 │┌┤│ ├─ Escherichia coli ETEC H10407 ││││ └─ Escherichia coli BW2952 ││││┌─ Escherichia coli MS 182-1 │││└┼─ Escherichia coli MS 84-1 │││ ├─ Escherichia coli MS 78-1 │││ └─ Escherichia coli MS 124-1 ││└─ Escherichia coli EC4100B ││ ┌─ Escherichia coli 042 ││ ├─ Escherichia coli FVEC1412 └┤ ├─ Escherichia coli UMN026 │ ┌┼─ Escherichia coli (4-322/322) 042 │ │├─ Escherichia coli MS 198-1 │ ┌┤└─ Escherichia coli FVEC1302 │┌┤└─ Escherichia coli MS 69-1 ││└┬─ Escherichia coli IAI1 ││ └─ Escherichia coli IAI1 ││┌─ Escherichia coli MS 119-7 │││┌─ fig|6666666.5357.peg.1911 TY-2482 strain │││├─ Escherichia coli 1827-70 └┤│├─ Escherichia coli 55989 ││├─ Escherichia coli ATCC 8739 ││├─ Escherichia coli B171 ││├─ Escherichia coli B7A ││├─ Escherichia coli BL21 ││├─ Escherichia coli E110019 └┤├─ Escherichia coli E22 │├─ Escherichia coli E24377A │├─ Escherichia coli HS │├─ Escherichia coli MS 107-1 │├─ Escherichia coli MS 145-7 │├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │├─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │├─ Escherichia coli TA271 │├─ Escherichia coli W │├─ Escherichia coli (4-322/322) E24377A └┼─ Escherichia coli (4-322/322) M718 ├─ Escherichia coli (4-322/322) HS ├─ Escherichia coli (4-322/322) B354 ├─ Escherichia coli W ├─ Escherichia coli SE11 ├─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 ├─ Escherichia coli MS 187-1 ├─ Escherichia coli MS 115-1 ├─ Escherichia coli KO11 ├─ Escherichia coli H591 ├─ Escherichia coli E22 ├─ Escherichia coli E110019 ├─ Escherichia coli (DE3) BL21(DE3) ├─ Escherichia coli B7A ├─ Escherichia coli B171 ├─ Escherichia coli B str. REL606 ├─ Escherichia coli ATCC 8739 ├─ Escherichia coli 55989 ├─ Escherichia coli 101-1 └─ fig|1040638.4.peg.1597 O104:H4 str. LB226692
| Putative LysR-family transcriptional regulator YidZ | (127) |
| Probable transcriptional activator for leuABCD operon | (118) |
| LysR-family transcriptional regulator YbeF | (97) |
| Probable HTH-type transcriptional regulator leuO | (7) |
| Others | (6) |