┌─ fig|1040638.4.peg.3669 O104:H4 (9-339/342) str. LB226692 ├─ Escherichia coli (9-339/342) 042 ├─ Escherichia coli (9-339/342) 1044A ├─ Escherichia coli (9-339/342) 2362-75 ├─ Escherichia coli (9-339/342) 55989 ├─ Escherichia coli (9-339/342) B088 ├─ Escherichia coli (9-339/342) B171 ├─ Escherichia coli (9-339/342) B7A ├─ Escherichia coli (9-339/342) E22 ├─ Escherichia coli (9-339/342) E2348/69 ├─ Escherichia coli (9-339/342) E24377A ├─ Escherichia coli (9-339/342) FVEC1302 ├─ Escherichia coli (9-339/342) IAI1 ├─ Escherichia coli (9-339/342) IAI39 ├─ Escherichia coli (9-339/342) MS 107-1 ├─ Escherichia coli (9-339/342) MS 124-1 ├─ Escherichia coli (9-339/342) MS 182-1 ├─ Escherichia coli (9-339/342) MS 78-1 ├─ Escherichia coli (9-339/342) O103:H2 str. 12009 ├─ Escherichia coli (9-339/342) O157:H7 ├─ Escherichia coli (9-339/342) O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli (9-339/342) O157:H7 str. EC869 ├─ Escherichia coli (9-339/342) O157:H7 str. FRIK966 ├─ Escherichia coli (9-339/342) O157:H7 str. TW14588 ├─ Escherichia coli (9-339/342) SE11 ├─ Escherichia coli (9-339/342) TA280 ├─ Escherichia coli (9-339/342) W ┌┼─ Escherichia coli (9-339/342) W │├─ Escherichia coli (9-339/342) UMN026 │├─ Escherichia coli (9-339/342) SMS-3-5 │├─ Escherichia coli (9-339/342) O55:H7 str. CB9615 │├─ Escherichia coli (9-339/342) O157:H7 str. Sakai │├─ Escherichia coli (9-339/342) O157:H7 str. FRIK2000 │├─ Escherichia coli (9-339/342) O157:H7 str. EC4501 │├─ Escherichia coli (9-339/342) O157:H7 EDL933 │├─ Escherichia coli (9-339/342) O127:H6 str. E2348/69 │├─ Escherichia coli (9-339/342) MS 84-1 │├─ Escherichia coli (9-339/342) MS 198-1 │├─ Escherichia coli (9-339/342) MS 145-7 │├─ Escherichia coli (9-339/342) MS 119-7 │├─ Escherichia coli (9-339/342) KO11 │├─ Escherichia coli (9-339/342) IAI39 │├─ Escherichia coli (9-339/342) IAI1 │├─ Escherichia coli (9-339/342) EC4100B ┌┤├─ Escherichia coli (9-339/342) E24377A ││├─ Escherichia coli (9-339/342) E22 ││├─ Escherichia coli (9-339/342) B7A ││├─ Escherichia coli (9-339/342) B185 ││├─ Escherichia coli (9-339/342) B171 ││├─ Escherichia coli (9-339/342) 55989 ││├─ Escherichia coli (9-339/342) 536A ││├─ Escherichia coli (9-339/342) 1212A ││├─ Escherichia coli (9-339/342) 042 ││└─ fig|6666666.5357.peg.3940 TY-2482 (9-339/342) strain ││┌─ Escherichia coli (9-339/342) O157:H7 str. EC4024 ││├─ Escherichia coli (9-339/342) O157:H7 str. EC4045 ┌┤│├─ Escherichia coli (9-339/342) O157:H7 str. EC4113 │││├─ Escherichia coli (9-339/342) O157:H7 str. EC4196 │││├─ Escherichia coli (9-339/342) O157:H7 str. EC4401 │││├─ Escherichia coli (9-339/342) O157:H7 str. EC508 ││└┼─ Escherichia coli (9-339/342) O157:H7 str. TW14359 ││ ├─ Escherichia coli (9-339/342) O157:H7 str. EC4486 ││ ├─ Escherichia coli (9-339/342) O157:H7 str. EC4206 ││ ├─ Escherichia coli (9-339/342) O157:H7 str. EC4115 ││ ├─ Escherichia coli (9-339/342) O157:H7 str. EC4076 ││ ├─ Escherichia coli (9-339/342) O157:H7 str. EC4042 ┌┤│ └─ Escherichia coli (9-339/342) 1125A │││┌─ Escherichia coli (9-339/342) M718 ││└┤ ┌─ Escherichia coli (1-322/325) FVEC1412 ││ │┌┴─ Escherichia coli (1-322/325) TA271 ││ └┤┌─ Escherichia coli (9-339/342) MS 21-1 ││ └┤┌─ Escherichia coli (9-339/342) H299 ││ └┼─ Escherichia coli (9-339/342) MS 69-1 ││ └─ Escherichia coli (9-339/342) B354 ││ ┌─ Escherichia coli (9-339/342) E110019 ││┌┴─ Escherichia coli (9-339/342) E110019 ┌┤└┤┌─ Escherichia coli (9-339/342) 536 ││ │├─ Escherichia coli (9-339/342) F11 ││ └┼─ Escherichia coli (9-339/342) MS 200-1 ││ ├─ Escherichia coli (9-339/342) F11 ││ └─ Escherichia coli (9-339/342) 536 ││ ┌─ Escherichia coli (9-339/342) ED1a ││ ├─ Escherichia coli (9-339/342) NC101 ││┌┼─ Escherichia coli (9-339/342) WV_060327 │││├─ Escherichia coli (9-339/342) O83:H1 str. NRG 857C │└┤└─ Escherichia coli (9-339/342) ED1a │ │ ┌─ Escherichia coli (9-339/342) M605 ┌──────────────────────────────────────────────┤ │┌┴─ Escherichia coli (9-339/342) SE15 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (9-339/342) ABU 83972 │ │ │├─ Escherichia coli (9-339/342) CFT073 │ │ └┼─ Escherichia coli (9-339/342) MS 45-1 │ │ ├─ Escherichia coli (9-339/342) MS 185-1 │ │ ├─ Escherichia coli (9-339/342) CFT073 │ │ └─ Escherichia coli (9-339/342) 83972 │ │┌─ Escherichia coli (9-339/342) APEC O1 │ │├─ Escherichia coli (9-339/342) S88 │ │├─ Escherichia coli (9-339/342) UTI89 │ └┼─ Escherichia coli (9-339/342) UTI89 │ ├─ Escherichia coli (9-339/342) UM146 │ ├─ Escherichia coli (9-339/342) IHE3034 │ └─ Escherichia coli (9-339/342) APEC O1 ┌──┤ ┌─ Escherichia coli (4-318/346) B171 │ │ ├─ Escherichia coli (4-318/346) E22 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (4-318/346) O103:H2 str. 12009 │ │ │├─ Escherichia coli (4-318/346) E22 │ │ ┌───────────────────────────┤└─ Escherichia coli (4-318/346) B171 │ │ │ └─ Escherichia coli (4-318/346) O111:H- str. 11128 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (5-335/337) B088 │ │ │ ├─ Escherichia coli (18-348/350) B7A │ │ │ ├─ Escherichia coli (18-348/350) E110019 │ │ │ ├─ Escherichia coli (5-335/337) E24377A │ │ │ ├─ Escherichia coli (18-348/350) MS 145-7 │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli (5-335/337) MS 78-1 │ │ │ │├─ Escherichia coli (5-335/337) MS 182-1 │ │ │ │├─ Escherichia coli (18-348/350) EC4100B │ └──────────┤ │├─ Escherichia coli (18-348/350) E24377A │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (5-335/337) E110019 │ │ ││└─ Escherichia coli (5-335/337) B7A │ │ ││┌─ Escherichia coli (5-335/337) SMS-3-5 │ │ │└┤┌─ Escherichia coli (18-348/350) FVEC1412 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (18-348/350) UMN026 │ │ │ ├─ Escherichia coli (18-348/350) MS 198-1 │ │ │ └─ Escherichia coli (18-348/350) FVEC1302 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (18-348/350) IAI39 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (18-348/350) IAI39 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (18-348/350) O83:H1 str. NRG 857C │ └────────────────────────┤┌┴─ Escherichia coli (18-348/350) TA143 │ ││ ┌─ Escherichia coli (18-348/350) 536 │ ││ ├─ Escherichia coli (18-348/350) APEC O1 │ ││ ├─ Escherichia coli (5-335/337) F11 │ ││ ├─ Escherichia coli (18-348/350) IHE3034 │ ││ ├─ Escherichia coli (18-348/350) S88 │ ││ ├─ Escherichia coli (18-348/350) UTI89 │ ││ ┌┼─ Escherichia coli (18-348/350) UTI89 │ ││ │├─ Escherichia coli (18-348/350) UM146 │ ││ │├─ Escherichia coli (18-348/350) MS 200-1 │ ││ ┌┤├─ Escherichia coli (18-348/350) F11 │ └┤ ││├─ Escherichia coli (26-356/358) APEC O1 │ │ ┌┤│└─ Escherichia coli (18-348/350) 536 │ │ ││└─ Escherichia coli (18-348/350) NC101 │ │┌┤└─ Escherichia coli (18-348/350) MS 21-1 │ ││└─ Escherichia coli (18-348/350) MS 69-1 │ ││ ┌─ Escherichia coli (5-335/337) B171 │ ││ ├─ Escherichia coli (5-335/337) E22 │ ││ ├─ Escherichia coli (18-348/350) H591 │ ││ ├─ Escherichia coli (18-348/350) MS 119-7 │ ││ ┌┼─ Escherichia coli (18-348/350) TA271 │ ││ │├─ Escherichia coli (18-348/350) O103:H2 str. 12009 │ └┤ │├─ Escherichia coli (18-348/350) MS 107-1 │ │┌┤├─ Escherichia coli (5-335/337) E22 │ │││└─ Escherichia coli (5-335/337) B171 │ ││└┬─ Escherichia coli (5-335/337) 042 │ ││ └─ Escherichia coli (26-356/358) 042 │ ││ ┌─ Escherichia coli (18-348/350) IAI1 │ ││ ├─ Escherichia coli (18-348/350) KO11 │ ││ ├─ Escherichia coli (18-348/350) MS 84-1 │ ││ ┌┼─ Escherichia coli (18-348/350) W │ └┤ │├─ Escherichia coli (18-348/350) W │ │┌┤├─ Escherichia coli (18-348/350) MS 124-1 │ │││└─ Escherichia coli (18-348/350) IAI1 │ ││└─ Escherichia coli (18-348/350) B185 │ ││ ┌─ fig|1040638.4.peg.2577 O104:H4 (18-348/350) str. LB226692 │ ││ ├─ Escherichia coli (18-348/350) 55989 │ ││ ├─ Escherichia coli (18-348/350) MS 115-1 │ ││ ┌┼─ Escherichia coli (18-348/350) SE11 │ ││ │├─ Escherichia coli (18-348/350) 55989 │ └┤┌┤└─ fig|6666666.5357.peg.4361 TY-2482 (18-348/350) strain │ │││┌─ Escherichia coli (18-348/350) M718 │ ││└┤ ┌─ Escherichia coli (18-348/350) TA280 │ ││ └┬┴─ Escherichia coli (18-348/350) B354 │ ││ └┬─ Escherichia coli (18-348/350) O26:H11 str. 11368 │ ││ └─ Escherichia coli (18-348/350) O111:H- str. 11128 │ ││┌─ Escherichia coli (18-348/350) 1125A │ ││├─ Escherichia coli (18-348/350) 536A │ ││├─ Escherichia coli (5-335/337) O157:H7 EDL933 │ └┤├─ Escherichia coli (18-348/350) O157:H7 str. EC4024 │ │├─ Escherichia coli (18-348/350) O157:H7 str. EC4045 │ │├─ Escherichia coli (18-348/350) O157:H7 str. EC4113 │ │├─ Escherichia coli (5-335/337) O157:H7 str. EC4196 │ │├─ Escherichia coli (18-348/350) O157:H7 str. EC4401 │ │├─ Escherichia coli (18-348/350) O157:H7 str. EC4501 │ │├─ Escherichia coli (18-348/350) O157:H7 str. EC869 │ │├─ Escherichia coli (18-348/350) O157:H7 str. FRIK966 ┌────┤ │├─ Escherichia coli (18-348/350) O157:H7 str. TW14359 │ │ └┼─ Escherichia coli (18-348/350) O55:H7 str. CB9615 │ │ ├─ Escherichia coli (18-348/350) O157:H7 str. TW14588 │ │ ├─ Escherichia coli (18-348/350) O157:H7 str. Sakai │ │ ├─ Escherichia coli (18-348/350) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ ├─ Escherichia coli (18-348/350) O157:H7 str. EC508 │ │ ├─ Escherichia coli (5-335/337) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (18-348/350) O157:H7 str. EC4206 │ │ ├─ Escherichia coli (18-348/350) O157:H7 str. EC4115 │ │ ├─ Escherichia coli (5-335/337) O157:H7 str. EC4076 │ │ ├─ Escherichia coli (18-348/350) O157:H7 str. EC4042 │ │ ├─ Escherichia coli (18-348/350) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (5-335/337) O157:H7 │ │ ├─ Escherichia coli (18-348/350) 1212A │ │ └─ Escherichia coli (18-348/350) 1044A │ │ ┌─ fig|1040638.4.peg.2778 O104:H4 (4-331/331) str. LB226692 │ │ ├─ Escherichia coli (4-331/331) 55989 │ │ ├─ Escherichia coli (4-331/331) B171 │ │ ├─ Escherichia coli (4-331/331) E22 │ │ ├─ Escherichia coli (4-331/331) MS 78-1 │ │ ├─ Escherichia coli (25-352/352) B171 │ │ ├─ Escherichia coli (25-352/352) E22 │ │ ├─ Escherichia coli (25-352/352) KO11 │ │ ├─ Escherichia coli (25-352/352) MS 182-1 │ │ ├─ Escherichia coli (25-352/352) W │ │ ┌┼─ Escherichia coli (25-352/352) W │ │ │├─ Escherichia coli (25-352/352) O103:H2 str. 12009 │ │ │├─ Escherichia coli (25-352/352) MS 145-7 │ │ │├─ Escherichia coli (25-352/352) EC4100B │ │ │├─ Escherichia coli (25-352/352) B7A │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (70-397/397) B088 │ │ ││├─ Escherichia coli (4-331/331) MS 107-1 │ │ ││├─ Escherichia coli (4-331/331) B7A │ │ ││├─ Escherichia coli (4-331/331) 55989 │ │ ││└─ fig|6666666.5357.peg.3862 TY-2482 (4-331/331) strain │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (4-331/331) SE11 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (25-352/352) 2362-75 │ │ ││ ┌┼─ Escherichia coli (35-362/362) E2348/69 │ │ ││┌┤└─ Escherichia coli (25-352/352) H299 │ │ │││└─ Escherichia coli (3-317/317) O127:H6 str. E2348/69 │ │ ┌┤└┤┌─ Escherichia coli (4-331/331) 536 │ │ ││ │├─ Escherichia coli (4-331/331) F11 │ │ ││ └┼─ Escherichia coli (4-331/331) MS 200-1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (4-331/331) F11 │ │ ││ └─ Escherichia coli (4-331/331) 536 │ │ │└─ Escherichia coli (25-352/352) B354 │ │ │┌─ Escherichia coli (4-331/331) E24377A │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (25-352/352) E110019 │ │ ││├─ Escherichia coli (25-352/352) IAI1 │ │ ││├─ Escherichia coli (25-352/352) MS 116-1 │ │ ││├─ Escherichia coli (25-352/352) MS 124-1 │ │ ││├─ Escherichia coli (25-352/352) MS 84-1 │ │ ││├─ Escherichia coli (25-352/352) O26:H11 str. 11368 │ │ │└┼─ Escherichia coli (66-393/393) E110019 │ │ │ ├─ Escherichia coli (25-352/352) TA271 │ │ ┌┤ ├─ Escherichia coli (25-352/352) O111:H- str. 11128 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (25-352/352) MS 175-1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (25-352/352) MS 119-7 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (25-352/352) IAI1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (25-352/352) H591 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (4-331/331) TA280 │ │ ││ └─ Escherichia coli (4-331/331) E24377A │ │ ││┌─ Escherichia coli (4-331/331) MS 198-1 │ │ │└┼─ Escherichia coli (25-352/352) UMN026 │ │ │ ├─ Escherichia coli (25-352/352) FVEC1302 │ │ │ └─ Escherichia coli (4-331/331) FVEC1412 │ │ │┌─ Escherichia coli (4-331/331) 1212A │ │ ┌─────────────────────────────────────────────────┤├─ Escherichia coli (4-331/331) O157:H7 │ │ │ │├─ Escherichia coli (4-331/331) O157:H7 str. EC4024 │ │ │ │├─ Escherichia coli (4-331/331) O157:H7 str. EC4045 │ │ │ │├─ Escherichia coli (4-331/331) O157:H7 str. EC4196 │ │ │ │├─ Escherichia coli (4-331/331) O157:H7 str. EC4401 │ │ │ │├─ Escherichia coli (4-331/331) O157:H7 str. EC869 │ │ │ │├─ Escherichia coli (4-331/331) O157:H7 str. TW14588 │ │ │ │├─ Escherichia coli (25-352/352) MS 187-1 │ │ │ │├─ Escherichia coli (25-352/352) O157:H7 EDL933 │ │ │ │├─ Escherichia coli (25-352/352) O157:H7 str. EC4115 │ │ │ │├─ Escherichia coli (25-352/352) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │ │├─ Escherichia coli (25-352/352) O157:H7 str. TW14359 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (70-397/397) O157:H7 str. EC4486 │ │ │ ├─ Escherichia coli (25-352/352) O55:H7 str. CB9615 │ │ │ ├─ Escherichia coli (25-352/352) O157:H7 str. Sakai │ └───┤ ├─ Escherichia coli (25-352/352) O157:H7 str. EC4501 │ │ ├─ Escherichia coli (25-352/352) O157:H7 str. EC4113 │ │ ├─ Escherichia coli (25-352/352) 1044A │ │ ├─ Escherichia coli (25-352/352) M718 │ │ ├─ Escherichia coli (4-331/331) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ ├─ Escherichia coli (4-331/331) O157:H7 str. EC508 │ │ ├─ Escherichia coli (4-331/331) O157:H7 str. EC4206 │ │ ├─ Escherichia coli (4-331/331) O157:H7 str. EC4076 │ │ ├─ Escherichia coli (4-331/331) O157:H7 str. EC4042 │ │ ├─ Escherichia coli (4-331/331) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (4-331/331) 536A │ │ └─ Escherichia coli (4-331/331) 1125A │ │ ┌─ Escherichia coli (8-332/356) MS 116-1 │ │ ┌─────────────────┴─ Escherichia coli (8-332/356) H736 │ │ ┌──┴───────────────────────── Escherichia coli (7-330/358) TA206 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (6-329/360) SMS-3-5 │ └───────────────────┤ │┌─ Escherichia coli (6-331/360) MS 21-1 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (6-329/360) FVEC1302 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (6-329/360) MS 198-1 │ └────────────────────┤│┌┼─ Escherichia coli (6-329/360) UMN026 │ │││└─ Escherichia coli (6-329/360) FVEC1412 │ │││ ┌─ Escherichia coli (6-331/360) 1827-70 │ │││ ├─ Escherichia coli (9-334/363) ATCC 8739 │ │││ ├─ Escherichia coli (6-331/360) B str. REL606 │ └┤│ ├─ Escherichia coli (6-331/360) BL21 ┌───┤ ││ ├─ Escherichia coli (DE3 6-331/360) BL21(DE3) │ │ ││ ├─ Escherichia coli (6-331/360) ETEC H10407 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (6-331/360) H736 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (6-331/360) MS 116-1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (6-331/360) MS 124-1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (6-331/360) MS 175-1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (6-331/360) MS 196-1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (6-331/360) OP50 │ │ └┤ ├─ Escherichia coli (6-331/360) TA271 │ │ │ ├─ Escherichia coli (6-331/360) str. K-12 substr. DH10B │ │ │ ├─ Escherichia coli (6-331/360) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │┌┼─ Escherichia coli (6-331/360) str. K-12 substr. MG1655 │ │ ││├─ Escherichia coli (6-331/360) str. K-12 substr. DH10B │ │ ││├─ Escherichia coli (6-331/360) W3110 │ │ ││├─ Escherichia coli (6-331/360) SE11 │ │ ││├─ Escherichia coli (6-331/360) MS 84-1 │ │ ││├─ Escherichia coli (6-331/360) MS 187-1 │ │ ││├─ Escherichia coli (6-331/360) MS 146-1 │ │ ││├─ Escherichia coli (6-331/360) MS 119-7 │ │ ││├─ Escherichia coli (9-334/363) K12 │ │ ││├─ Escherichia coli (6-331/360) H591 │ │ ││├─ Escherichia coli (6-331/360) DH1 │ │ └┤├─ Escherichia coli (DE3 6-331/360) BL21(DE3) │ │ │├─ Escherichia coli (6-331/360) BL21 │ │ │├─ Escherichia coli (6-331/360) ATCC 8739 │ │ │└─ Escherichia coli (6-331/360) 53638 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (6-331/360) E24377A │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (9-334/363) E24377A │ │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (6-331/360) HS │ │ │┌┤ └─ Escherichia coli (9-334/363) HS │ │ ││└┬─ Escherichia coli (6-329/360) MS 69-1 │ │ ││ └─ Escherichia coli (6-329/360) B354 │ │ ││┌─ Escherichia coli (6-329/360) M605 │ │ │││ ┌─ Escherichia coli (6-329/360) 536 │ │ └┤│ ├─ Escherichia coli (6-329/360) APEC O1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (6-329/360) IHE3034 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (6-329/360) S88 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (6-329/360) UTI89 │ │ ││ ┌┼─ Escherichia coli (6-329/360) UTI89 │ │ ││ │├─ Escherichia coli (6-329/360) UM146 │ │ └┤ │├─ Escherichia coli (6-329/360) MS 200-1 │ │ │┌┤├─ Escherichia coli (9-332/363) APEC O1 │ │ │││└─ Escherichia coli (6-329/360) 536 │ │ ││└─ Escherichia coli (6-329/360) H299 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (6-329/360) 83972 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (6-329/360) ED1a │ │ ││ ├─ Escherichia coli (6-329/360) MS 185-1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (6-329/360) NC101 │ │ ││ ┌┼─ Escherichia coli (6-329/360) SE15 │ │ └┤ │├─ Escherichia coli (6-329/360) MS 45-1 │ │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (6-329/360) ED1a │ │ │ ││└─ Escherichia coli (6-329/360) ABU 83972 │ │ │┌┤└─ Escherichia coli (6-329/360) TA206 │ │ ││└─── Escherichia coli (6-329/360) CFT073 │ │ ││┌─ Escherichia coli (6-331/360) O83:H1 str. NRG 857C │ │ │││ ┌─ Escherichia coli (6-331/360) B185 │ │ │││ ├─ Escherichia coli (6-331/360) M718 │ │ │││ ├─ Escherichia coli (6-331/360) O157:H7 EDL933 │ │ └┤│ ├─ Escherichia coli (6-331/360) O157:H7 str. EC4045 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (6-331/360) O157:H7 str. EC4115 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (6-331/360) O157:H7 str. EC4401 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (6-331/360) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (6-331/360) O157:H7 str. Sakai │ │ ││ ├─ Escherichia coli (6-331/360) O157:H7 str. TW14588 ┌────┤ │ └┤ ├─ Escherichia coli (6-331/360) W │ │ │ │┌┼─ Escherichia coli (6-331/360) W │ │ │ ││├─ Escherichia coli (6-331/360) O55:H7 str. CB9615 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (6-331/360) O157:H7 str. TW14359 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (6-331/360) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (9-334/350) O157:H7 str. EC869 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (6-331/360) O157:H7 str. EC4206 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (9-334/343) O157:H7 str. EC4076 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (6-331/360) O157:H7 EDL933 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (9-334/363) O157:H7 │ │ │ ││└─ Escherichia coli (6-331/360) KO11 │ │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (6-329/360) 2362-75 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (6-329/360) IAI39 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (6-329/360) O127:H6 str. E2348/69 │ │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli (6-329/360) TA280 │ │ │ │ │├─ Escherichia coli (6-329/360) IAI39 │ │ │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (9-332/363) E2348/69 │ │ │ │ │└┬─ Escherichia coli (9-332/363) 042 │ │ │ │┌┤ └─ Escherichia coli (9-332/363) 042 │ │ │ ││└┬─ Escherichia coli (6-329/360) TA143 │ │ │ ││ └┬─ Escherichia coli (6-324/344) O157:H7 str. EC4486 │ │ │ ││ └─ Escherichia coli (9-326/326) O157:H7 str. EC4113 │ │ │ └┤ ┌─ fig|1040638.4.peg.5358 O104:H4 (6-331/360) str. LB226692 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (6-331/360) 55989 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (6-331/360) O111:H- str. 11128 │ │ │ │┌┼─ Escherichia coli (6-331/360) O26:H11 str. 11368 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (6-331/360) 55989 │ │ │ └┤└─ fig|6666666.5357.peg.1942 TY-2482 (6-331/360) strain │ │ │ │┌─ Escherichia coli (6-331/360) MS 115-1 │ │ │ ││┌─ Escherichia coli (6-331/360) IAI1 │ │ │ └┤├─ Escherichia coli (6-331/360) MS 145-7 │ │ │ │├─ Escherichia coli (6-331/360) MS 78-1 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (6-331/360) O103:H2 str. 12009 │ │ │ ├─ Escherichia coli (6-331/360) MS 182-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (6-331/360) IAI1 │ │ │ └─ Escherichia coli (6-331/360) B088 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (13-339/344) ABU 83972 │ │ │ ├─ Escherichia coli (22-348/353) APEC O1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (13-339/344) CFT073 │ │ │ ├─ Escherichia coli (13-339/344) M605 │ │ │ ├─ Escherichia coli (13-339/344) S88 │ │ │ ├─ Escherichia coli (13-339/344) UM146 │ │ └──────────────────────────────┼─ Escherichia coli (13-339/344) UTI89 │ │ ├─ Escherichia coli (13-339/344) UTI89 │ │ ├─ Escherichia coli (13-339/344) SE15 │ │ ├─ Escherichia coli (13-339/344) MS 45-1 │ │ ├─ Escherichia coli (13-339/344) IHE3034 │ │ ├─ Escherichia coli (22-348/353) CFT073 │ │ ├─ Escherichia coli (13-339/344) APEC O1 │ │ └─ Escherichia coli (13-339/344) 83972 │ │ ┌─ Escherichia coli (12-341/341) ED1a │ │ ┌┴─ Escherichia coli (12-341/341) ED1a │ │ │ ┌─ Escherichia coli (12-341/341) MS 69-1 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli SE15 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (12-341/341) M605 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (12-341/341) MS 115-1 │ │ │┌┤┌─ Escherichia coli (14-343/343) E2348/69 │ │ ││└┼─ Escherichia coli (12-341/341) O127:H6 str. E2348/69 │ │ ││ └─ Escherichia coli (12-341/341) 2362-75 │ │ ││ ┌─ fig|1040638.4.peg.1350 O104:H4 str. LB226692 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (12-341/341) 55989 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (12-341/341) B7A │ │ ││ ┌┼─ Escherichia coli MS 145-7 │ └───────────────────────┤│ │├─ Escherichia coli B7A │ ││┌┤├─ Escherichia coli (12-341/341) 55989 │ ││││└─ fig|6666666.5357.peg.4011 TY-2482 strain │ │││└┬─ Escherichia coli MS 146-1 │ │││ └─ Escherichia coli H736 │ │││┌─ Escherichia coli (12-341/341) 042 │ │││├─ Escherichia coli 1044A │ │││├─ Escherichia coli 1212A │ │││├─ Escherichia coli (12-341/341) 536 │ │││├─ Escherichia coli (12-341/341) 53638 │ │││├─ Escherichia coli (12-341/341) 83972 │ │││├─ Escherichia coli (12-341/341) APEC O1 │ └┤│├─ Escherichia coli (14-343/343) ATCC 8739 │ ││├─ Escherichia coli (12-341/341) B str. REL606 │ ││├─ Escherichia coli (12-341/341) B171 │ ││├─ Escherichia coli B185 │ ││├─ Escherichia coli BL21 │ ││├─ Escherichia coli (12-341/341) BW2952 │ ││├─ Escherichia coli (12-341/341) CFT073 │ ││├─ Escherichia coli (12-341/341) E110019 │ ││├─ Escherichia coli (12-341/341) E22 │ ││├─ Escherichia coli E24377A │ ││├─ Escherichia coli (12-341/341) EC4100B │ ││├─ Escherichia coli (12-341/341) F11 │ ││├─ Escherichia coli (12-341/341) FVEC1302 │ ││├─ Escherichia coli (12-341/341) H299 │ ││├─ Escherichia coli (12-341/341) HS │ ││├─ Escherichia coli IAI1 │ ││├─ Escherichia coli (12-341/341) IAI39 │ ││├─ Escherichia coli (12-341/341) IHE3034 │ ││├─ Escherichia coli KO11 │ └┤├─ Escherichia coli MS 107-1 │ │├─ Escherichia coli MS 119-7 │ │├─ Escherichia coli MS 175-1 │ │├─ Escherichia coli (12-341/341) MS 185-1 │ │├─ Escherichia coli (12-341/341) MS 196-1 ┤ │├─ Escherichia coli (12-341/341) MS 200-1 │ │├─ Escherichia coli (12-341/341) MS 45-1 │ │├─ Escherichia coli MS 84-1 │ │├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ │├─ Escherichia coli (12-341/341) O157:H7 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 │ │├─ Escherichia coli (12-341/341) O157:H7 str. EC4486 │ │├─ Escherichia coli (12-341/341) O157:H7 str. EC508 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai │ │├─ Escherichia coli (12-341/341) O157:H7 str. TW14588 │ │├─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 │ │├─ Escherichia coli OP50 │ │├─ Escherichia coli (12-341/341) SE11 │ │├─ Escherichia coli (12-341/341) TA143 │ │├─ Escherichia coli (12-341/341) TA271 │ │├─ Escherichia coli (12-341/341) UMN026 │ │├─ Escherichia coli UTI89 │ │├─ Escherichia coli W │ │├─ Escherichia coli (12-341/341) WV_060327 │ │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B │ └┼─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │ ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) str. K-12 substr. DH10B │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) W3110 │ ├─ Escherichia coli W │ ├─ Escherichia coli UTI89 │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) TA280 │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) TA206 │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) SMS-3-5 │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) S88 │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) O83:H1 str. NRG 857C │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) O26:H11 str. 11368 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) O157:H7 str. EC4501 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) O157:H7 str. EC4196 │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) O157:H7 str. EC4113 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) O157:H7 str. EC4024 │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) O157:H7 EDL933 │ ├─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) NC101 │ ├─ Escherichia coli MS 78-1 │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) MS 21-1 │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) MS 198-1 │ ├─ Escherichia coli MS 187-1 │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) MS 182-1 │ ├─ Escherichia coli MS 124-1 │ ├─ Escherichia coli MS 116-1 │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) M718 │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) K12 │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) IAI39 │ ├─ Escherichia coli IAI1 │ ├─ Escherichia coli HS │ ├─ Escherichia coli H591 │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) FVEC1412 │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) F11 │ ├─ Escherichia coli ETEC H10407 │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) E24377A │ ├─ Escherichia coli E22 │ ├─ Escherichia coli E110019 │ ├─ Escherichia coli DH1 │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) CFT073 │ ├─ Escherichia coli (DE3) BL21(DE3) │ ├─ Escherichia coli B354 │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) B171 │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) B088 │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) ATCC 8739 │ ├─ Escherichia coli (14-343/343) APEC O1 │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) ABU 83972 │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) 536A │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) 53638 │ ├─ Escherichia coli (12-341/341) 536 │ ├─ Escherichia coli 1125A │ ├─ Escherichia coli 101-1 │ └─ Escherichia coli (14-343/343) 042 │ ┌─ Escherichia coli (7-340/356) 101-1 │ ├─ Escherichia coli (7-340/356) BL21 │ ├─ Escherichia coli (15-348/364) CFT073 │ ├─ Escherichia coli (7-340/356) M718 │ ┌───┼─ Escherichia coli (7-340/356) OP50 │ │ ├─ Escherichia coli (7-340/356) MS 187-1 │ │ ├─ Escherichia coli (7-340/356) CFT073 │ ┌────────────────────┤ ├─ Escherichia coli (DE3 7-340/356) BL21(DE3) │ │ │ └─ Escherichia coli (7-340/356) B str. REL606 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (30-361/390) MS 21-1 │ │ └───┤┌─ Escherichia coli (30-361/390) MS 69-1 │┌──────────────────────────────────────┤ └┤┌─ Escherichia coli (30-361/390) FVEC1412 ││ │ └┼─ Escherichia coli (7-338/367) UMN026 ││ │ ├─ Escherichia coli (30-361/390) MS 198-1 ││ │ └─ Escherichia coli (7-338/367) FVEC1302 ││ └────────────── Escherichia coli (7-337/352) O157:H7 str. EC4024 ││ ┌────────────────────────────────────────────── Escherichia coli (8-332/334) MS 115-1 └┤ │ ┌─ Escherichia coli (4-327/327) MS 124-1 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (4-327/327) MS 84-1 │ │ │ ┌─ fig|1040638.4.peg.2229 O104:H4 (4-327/327) str. LB226692 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-327/327) 55989 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-327/327) B7A │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-327/327) E22 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-327/327) E24377A └──────────┤ │ ├─ Escherichia coli (4-327/327) EC4100B │ │ ├─ Escherichia coli (4-327/327) IAI1 │ │ ├─ Escherichia coli (4-327/327) MS 107-1 │ │ ├─ Escherichia coli (4-327/327) MS 145-7 │ │ ├─ Escherichia coli (4-327/327) MS 78-1 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (4-327/327) SE11 │ │ │├─ Escherichia coli (4-327/327) O103:H2 str. 12009 │ │ │├─ Escherichia coli (4-327/327) MS 182-1 └──────────────────────────────────────┤ │├─ Escherichia coli (4-327/327) MS 119-7 │ │├─ Escherichia coli (4-327/327) IAI1 │ │├─ Escherichia coli (4-327/327) H591 │┌┤├─ Escherichia coli (4-327/327) E24377A │││├─ Escherichia coli (4-327/327) E22 │││├─ Escherichia coli (4-327/327) B7A │││├─ Escherichia coli (4-327/327) 55989 │││└─ fig|6666666.5357.peg.4455 TY-2482 (4-327/327) strain ││└┬─ Escherichia coli (4-327/327) B171 ││ └─ Escherichia coli (4-327/327) B171 ││┌─ Escherichia coli (4-327/327) TA271 │││ ┌─ Escherichia coli (4-327/327) 101-1 │││ ├─ Escherichia coli (4-327/327) BL21 │││ ├─ Escherichia coli (4-327/327) BW2952 │││ ├─ Escherichia coli (4-327/327) E110019 └┤│ ├─ Escherichia coli (4-327/327) ETEC H10407 ││ ├─ Escherichia coli (4-327/327) K12 ││ ├─ Escherichia coli (4-327/327) MS 116-1 ││ ├─ Escherichia coli (4-327/327) MS 187-1 ││ ├─ Escherichia coli (4-327/327) O26:H11 str. 11368 ││ ├─ Escherichia coli (4-327/327) W ││ ├─ Escherichia coli (4-327/327) str. K-12 substr. DH10B ││ ┌┼─ Escherichia coli (4-327/327) str. K-12 substr. MG1655 ││ │├─ Escherichia coli (4-327/327) str. K-12 substr. MG1655 ││ │├─ Escherichia coli (4-327/327) W3110 ││ │├─ Escherichia coli (4-327/327) W ││ │├─ Escherichia coli (4-327/327) MS 196-1 └┤ │├─ Escherichia coli (4-327/327) MS 146-1 │ │├─ Escherichia coli (4-327/327) KO11 │┌┤├─ Escherichia coli (4-327/327) H736 │││├─ Escherichia coli (4-327/327) E110019 │││├─ Escherichia coli (4-327/327) DH1 │││├─ Escherichia coli (DE3 4-327/327) BL21(DE3) │││└─ Escherichia coli (4-327/327) B str. REL606 │││ ┌─ Escherichia coli (4-327/327) 53638 │││┌┴─ Escherichia coli (4-327/327) 53638 ││└┤┌─ Escherichia coli (4-327/327) O111:H- str. 11128 ││ ││┌─ Escherichia coli (4-327/327) ATCC 8739 ││ └┤├─ Escherichia coli (4-327/327) HS ││ │├─ Escherichia coli (4-327/327) IAI39 ││ └┼─ Escherichia coli (4-327/327) IAI39 ││ ├─ Escherichia coli (4-327/327) HS ││ ├─ Escherichia coli (4-327/327) ATCC 8739 ││ └─ Escherichia coli (16-339/339) 1827-70 ││ ┌─ Escherichia coli (4-327/327) 042 └┤ ├─ Escherichia coli (4-327/327) FVEC1302 │ ├─ Escherichia coli (4-327/327) MS 198-1 │ ┌┼─ Escherichia coli (4-327/327) UMN026 │ │├─ Escherichia coli (4-327/327) TA143 │┌┤├─ Escherichia coli (4-327/327) FVEC1412 │││└─ Escherichia coli (4-327/327) 042 ││└┬─ Escherichia coli (4-327/327) MS 69-1 ││ └─ Escherichia coli (4-327/327) B185 ││ ┌─ Escherichia coli (4-327/327) 1044A ││ ├─ Escherichia coli (4-327/327) 1212A ││ ├─ Escherichia coli (4-327/327) O157:H7 ││ ├─ Escherichia coli (4-327/327) O157:H7 str. EC4042 ││ ├─ Escherichia coli (4-327/327) O157:H7 str. EC4076 ││ ├─ Escherichia coli (4-327/327) O157:H7 str. EC4115 ││ ├─ Escherichia coli (4-327/327) O157:H7 str. EC4206 ││ ├─ Escherichia coli (4-327/327) O157:H7 str. EC4486 ││ ├─ Escherichia coli (4-327/327) O157:H7 str. EC508 └┤ ├─ Escherichia coli (4-327/327) O157:H7 str. FRIK2000 │ ├─ Escherichia coli (4-327/327) O157:H7 str. Sakai │ ├─ Escherichia coli (4-327/327) O157:H7 str. TW14588 │ ┌┼─ Escherichia coli (4-327/327) O55:H7 str. CB9615 │ │├─ Escherichia coli (4-327/327) O157:H7 str. TW14359 │ │├─ Escherichia coli (4-327/327) O157:H7 str. FRIK966 │ │├─ Escherichia coli (4-327/327) O157:H7 str. EC869 │ │├─ Escherichia coli (4-327/327) O157:H7 str. EC4501 │ │├─ Escherichia coli (4-327/327) O157:H7 str. EC4401 │┌┤├─ Escherichia coli (4-327/327) O157:H7 str. EC4196 │││├─ Escherichia coli (4-327/327) O157:H7 str. EC4113 │││├─ Escherichia coli (4-327/327) O157:H7 str. EC4045 │││├─ Escherichia coli (4-327/327) O157:H7 str. EC4024 └┤│├─ Escherichia coli (4-327/327) 536A ││└─ Escherichia coli (4-327/327) 1125A │└┬─ Escherichia coli (4-327/327) O157:H7 EDL933 │ └─ Escherichia coli (4-327/327) O157:H7 EDL933 │┌─ Escherichia coli (4-327/327) M718 └┤┌─ Escherichia coli (4-327/327) MS 115-1 └┤┌─ Escherichia coli (4-327/327) B354 └┤┌─ Escherichia coli (4-327/327) TA280 ││ ┌─ Escherichia coli (4-327/327) 536 └┤┌┴─ Escherichia coli (4-327/327) 536 ││┌─ Escherichia coli (4-327/327) NC101 └┤│ ┌─ Escherichia coli (4-327/327) F11 ││ ├─ Escherichia coli (4-327/327) MS 200-1 ││ ┌┼─ Escherichia coli (4-327/327) MS 21-1 └┤ ┌┤└─ Escherichia coli (4-327/327) F11 │┌┤└─ Escherichia coli (4-327/327) H299 ││└─ Escherichia coli (4-327/327) O83:H1 str. NRG 857C ││ ┌─ Escherichia coli (4-327/327) 83972 ││ ├─ Escherichia coli (4-327/327) CFT073 └┤ ├─ Escherichia coli (4-327/327) MS 185-1 │┌┼─ Escherichia coli (4-327/327) MS 45-1 ││├─ Escherichia coli (4-327/327) CFT073 ││└─ Escherichia coli (4-327/327) ABU 83972 └┤ ┌─ Escherichia coli (4-327/327) 2362-75 │┌┼─ Escherichia coli (4-327/327) O127:H6 str. E2348/69 ││└─ Escherichia coli (4-327/327) E2348/69 ││ ┌─ Escherichia coli (4-327/327) ED1a └┤┌┼─ Escherichia coli (4-327/327) TA206 ││└─ Escherichia coli (4-327/327) ED1a ││┌─ Escherichia coli (4-327/327) APEC O1 └┤├─ Escherichia coli (4-327/327) M605 │├─ Escherichia coli (4-327/327) SE15 │├─ Escherichia coli (4-327/327) UTI89 └┼─ Escherichia coli (4-327/327) WV_060327 ├─ Escherichia coli (4-327/327) UTI89 ├─ Escherichia coli (4-327/327) UM146 ├─ Escherichia coli (4-327/327) S88 ├─ Escherichia coli (4-327/327) IHE3034 └─ Escherichia coli (4-327/327) APEC O1
| Transcriptional (co)regulator CytR | (130) |
| Evolved beta-D-galactosidase transcriptional repressor | (127) |
| Transcriptional repressor of the lac operon | (111) |
| Maltose regulon regulatory protein MalI (repressor for malXY) | (99) |
| AscBF operon repressor | (89) |
| Sucrose specific transcriptional regulator CscR, LacI family | (77) |
| Transcriptional regulator, LacI family | (28) |
| Mgl repressor and galactose ultrainduction factor GalS, HTH-type transcriptional regulator | (6) |
| Putative transcriptional regulator | (1) |
| hypothetical protein | (1) |
| Sucrose operon repressor ScrR, LacI family | (1) |
| Others | (12) |