┌─ Escherichia coli (10-438/452) 2362-75 ├─ Escherichia coli (10-438/452) ABU 83972 ├─ Escherichia coli (10-438/452) CFT073 ├─ Escherichia coli (10-438/452) E2348/69 ├─ Escherichia coli (10-438/452) ED1a ├─ Escherichia coli (10-438/452) MS 45-1 ├─ Escherichia coli (10-438/452) O127:H6 str. E2348/69 ├─ Escherichia coli (10-438/452) TA206 ┌┼─ Escherichia coli (10-438/452) WV_060327 │├─ Escherichia coli (10-438/452) UM146 │├─ Escherichia coli (10-438/452) O83:H1 str. NRG 857C │├─ Escherichia coli (10-438/452) NC101 │├─ Escherichia coli (10-438/452) MS 185-1 ┌┤├─ Escherichia coli (10-438/452) ED1a ││├─ Escherichia coli (10-438/452) CFT073 ││├─ Escherichia coli (10-438/452) APEC O1 ┌──────────────────┤│└─ Escherichia coli (10-438/452) 83972 │ │└┬─ Escherichia coli (5-438/452) M605 │ │ └─ Escherichia coli (5-438/452) SE15 │ └┬─ Escherichia coli (10-438/452) MS 200-1 ┌────────┤ └─ Escherichia coli (10-438/452) F11 │ │ ┌─ Escherichia coli (11-411/418) 53638 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (8-408/415) 53638 │ └─────────────────────────────────────────────────────────┤┌─ Escherichia coli (8-408/415) NC101 │ ││ ┌─ Escherichia coli (8-408/415) APEC O1 │ └┤ ├─ Escherichia coli (11-411/418) CFT073 │ │┌┼─ Escherichia coli (8-408/415) S88 │ ││├─ Escherichia coli (8-408/415) CFT073 │ └┤└─ Escherichia coli (11-411/418) APEC O1 │ │┌─ Escherichia coli (8-408/415) MS 200-1 │ ││ ┌─ Escherichia coli (8-408/415) H299 │ └┤ ├─ Escherichia coli (8-408/415) MS 182-1 │ │┌┼─ Escherichia coli (8-408/415) MS 84-1 │ └┤└─ Escherichia coli (8-408/415) MS 124-1 │ │┌─ Escherichia coli (8-408/415) MS 107-1 │ └┤┌─ Escherichia coli (8-408/415) 536 │ └┼─ Escherichia coli (8-408/415) F11 │ ├─ Escherichia coli (11-411/418) F11 │ └─ Escherichia coli (8-408/415) 536 │ ┌─ Escherichia coli (10-432/444) 101-1 │ ├─ Escherichia coli (10-432/444) 1125A │ ├─ Escherichia coli (10-432/444) 1827-70 │ ├─ Escherichia coli (10-432/444) 53638 │ ├─ Escherichia coli (10-432/444) ATCC 8739 │ ├─ Escherichia coli (10-432/444) B str. REL606 │ ├─ Escherichia coli (DE3 10-432/444) BL21(DE3) │ ├─ Escherichia coli (10-432/444) DH1 │ ├─ Escherichia coli (10-432/444) E110019 │ ├─ Escherichia coli (10-432/444) K12 │ ├─ Escherichia coli (10-432/444) MS 116-1 │ ├─ Escherichia coli (10-432/444) MS 146-1 │ ├─ Escherichia coli (10-432/444) MS 196-1 │ ├─ Escherichia coli (10-432/444) O157:H7 │ ├─ Escherichia coli (10-432/444) O157:H7 EDL933 │ ├─ Escherichia coli (10-432/444) O157:H7 str. EC4042 │ ├─ Escherichia coli (10-432/444) O157:H7 str. EC4076 │ ├─ Escherichia coli (10-432/444) O157:H7 str. EC4115 │ ├─ Escherichia coli (10-432/444) O157:H7 str. EC4206 │ ├─ Escherichia coli (10-432/444) O157:H7 str. EC4486 │ ├─ Escherichia coli (10-432/444) O157:H7 str. EC508 │ ├─ Escherichia coli (10-432/444) O157:H7 str. FRIK2000 │ ├─ Escherichia coli (10-432/444) O157:H7 str. Sakai │ ├─ Escherichia coli (10-432/444) O157:H7 str. TW14588 │ ├─ Escherichia coli (10-432/444) W3110 │ ├─ Escherichia coli (10-432/444) str. K-12 substr. MG1655 │ ┌┼─ Escherichia coli (10-432/444) str. K-12 substr. MG1655 │ │├─ Escherichia coli (10-432/444) str. K-12 substr. DH10B │ │├─ Escherichia coli (10-432/444) O55:H7 str. CB9615 │ │├─ Escherichia coli (10-432/444) O157:H7 str. TW14359 │ │├─ Escherichia coli (10-432/444) O157:H7 str. FRIK966 │ │├─ Escherichia coli (10-432/444) O157:H7 str. EC869 │ │├─ Escherichia coli (10-432/444) O157:H7 str. EC4501 │ │├─ Escherichia coli (10-432/444) O157:H7 str. EC4401 │ │├─ Escherichia coli (10-432/444) O157:H7 str. EC4196 │ │├─ Escherichia coli (10-432/444) O157:H7 str. EC4113 │ │├─ Escherichia coli (10-432/444) O157:H7 str. EC4045 │ │├─ Escherichia coli (10-432/444) O157:H7 str. EC4024 │ │├─ Escherichia coli (10-432/444) O157:H7 EDL933 │ ┌┤├─ Escherichia coli (10-432/444) MS 84-1 │ ││├─ Escherichia coli (10-432/444) MS 187-1 │ ││├─ Escherichia coli (10-432/444) MS 124-1 │ ││├─ Escherichia coli (10-432/444) M718 │ ││├─ Escherichia coli (10-432/444) H736 │ ││├─ Escherichia coli (10-432/444) E110019 │ ││├─ Escherichia coli (10-432/444) BW2952 │ ┌┤│├─ Escherichia coli (10-432/444) BL21 │ │││├─ Escherichia coli (10-432/444) ATCC 8739 │ │││├─ Escherichia coli (10-432/444) 536A │ │││├─ Escherichia coli (10-432/444) 53638 │ │││├─ Escherichia coli (10-432/444) 1212A │ │││└─ Escherichia coli (10-432/444) 1044A │ ││└─ Escherichia coli (10-432/444) MS 115-1 │ │└─ Escherichia coli (10-432/444) B185 │ │┌─ Escherichia coli (1-423/435) B088 │ ││┌─ Escherichia coli (10-432/459) B7A │ ││├─ fig|6666666.5357.peg.2622 TY-2482 (10-432/444) strain │ ┌┤│├─ Escherichia coli (10-432/444) 2362-75 │ │││├─ Escherichia coli (10-432/444) 55989 │ │││├─ Escherichia coli (10-432/444) B171 │ │││├─ Escherichia coli (10-432/444) B7A │ │││├─ Escherichia coli (10-432/444) E22 │ │││├─ Escherichia coli (10-432/444) E24377A │ │││├─ Escherichia coli (10-432/444) ETEC H10407 │ │││├─ Escherichia coli (10-432/444) FVEC1412 │ │││├─ Escherichia coli (10-432/444) H591 │ │││├─ Escherichia coli (10-432/444) HS │ │└┤├─ Escherichia coli (10-432/444) IAI1 │ │ │├─ Escherichia coli (10-432/444) M605 │ │ │├─ Escherichia coli (10-432/444) MS 119-7 │ │ │├─ Escherichia coli (10-432/444) MS 182-1 │ │ │├─ Escherichia coli (10-432/444) MS 21-1 │ │ │├─ Escherichia coli (10-432/444) O103:H2 str. 12009 │ │ │├─ Escherichia coli (10-432/444) O26:H11 str. 11368 │ │ │├─ Escherichia coli (10-432/444) SE11 │ │ │├─ Escherichia coli (10-432/444) SMS-3-5 │ │ │├─ Escherichia coli (10-432/444) TA271 │ │ │├─ Escherichia coli (10-432/444) UMN026 │ │ │├─ Escherichia coli (10-432/444) W │ │ │├─ Escherichia coli (23-445/457) 042 │ │ └┼─ Escherichia coli (23-445/457) E2348/69 │ │ ├─ Escherichia coli (10-432/444) WV_060327 │ ┌┤ ├─ Escherichia coli (10-432/444) W │ ││ ├─ Escherichia coli (10-432/444) TA280 │ ││ ├─ Escherichia coli (10-432/444) TA143 │ ││ ├─ Escherichia coli (10-432/444) SE15 │ ││ ├─ Escherichia coli (10-432/444) O83:H1 str. NRG 857C │ ││ ├─ Escherichia coli (10-432/444) O111:H- str. 11128 │ ││ ├─ Escherichia coli (10-432/444) MS 78-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (10-432/444) MS 198-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (10-432/444) MS 145-7 │ ││ ├─ Escherichia coli (10-432/444) MS 107-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (10-432/444) KO11 │ ││ ├─ Escherichia coli (10-432/444) IAI1 │ ││ ├─ Escherichia coli (10-432/444) HS │ ││ ├─ Escherichia coli (10-432/444) H299 │ ┌┤│ ├─ Escherichia coli (10-432/444) FVEC1302 ┤ │││ ├─ Escherichia coli (10-432/444) EC4100B │ │││ ├─ Escherichia coli (10-432/444) E24377A │ │││ ├─ Escherichia coli (10-432/444) E22 │ │││ ├─ Escherichia coli (10-432/444) B354 │ │││ ├─ Escherichia coli (10-432/444) B171 │ │││ ├─ Escherichia coli (10-432/444) 55989 │ │││ ├─ Escherichia coli (10-432/444) 042 │ │││ ├─ fig|1040638.4.peg.2984 O104:H4 (10-432/444) str. LB226692 │ │││ └─ Escherichia coli (10-432/459) B7A │ ││└─ Escherichia coli (10-432/444) MS 69-1 │ ││ ┌─ Escherichia coli (10-432/444) IAI39 │ ││┌┴─ Escherichia coli (10-432/444) IAI39 │ │└┤┌─ Escherichia coli (10-432/444) IHE3034 │ ┌┤ ││ ┌─ Escherichia coli (10-432/444) UTI89 │ ││ └┤┌┴─ Escherichia coli (10-432/444) UTI89 │ ││ ││┌─ Escherichia coli (10-432/444) ABU 83972 │ ││ ││├─ Escherichia coli (10-432/444) CFT073 │ ││ └┤├─ Escherichia coli (10-432/444) MS 45-1 │ ││ │├─ Escherichia coli (10-432/444) S88 │ ││ │├─ Escherichia coli (23-445/457) APEC O1 │ ││ └┼─ Escherichia coli (23-445/457) CFT073 │ ┌┤│ ├─ Escherichia coli (10-432/444) UM146 │ │││ ├─ Escherichia coli (10-432/444) NC101 │ │││ ├─ Escherichia coli (10-432/444) MS 185-1 │ │││ ├─ Escherichia coli (10-432/444) APEC O1 │ │││ └─ Escherichia coli (10-432/444) 83972 │ ││└─ Escherichia coli (10-432/444) TA206 │ ┌─────────────────────────────────┤│┌─ Escherichia coli (10-432/444) 536 │ │ ││├─ Escherichia coli (10-432/444) F11 │ │ │└┼─ Escherichia coli (10-432/444) MS 200-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (10-432/444) F11 │ │ │ └─ Escherichia coli (10-432/444) 536 │ │ └┬─ Escherichia coli (10-432/444) ED1a │ │ └─ Escherichia coli (10-432/444) ED1a │ │ ┌─ Escherichia coli 1044A │ │ ├─ Escherichia coli 1212A │ │ ├─ Escherichia coli B185 │ │ ├─ Escherichia coli DH1 │ │ ├─ Escherichia coli ETEC H10407 │ │ ├─ Escherichia coli H736 │ │ ├─ Escherichia coli MS 107-1 │ │ ├─ Escherichia coli MS 119-7 │ │ ├─ Escherichia coli MS 175-1 │ │ ├─ Escherichia coli MS 21-1 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 │ │ ├─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │ │ ├─ Escherichia coli TA271 │ │ ├─ Escherichia coli W │ │ ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │ │ ┌┼─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │ │ │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B │ │ │├─ Escherichia coli TA280 │ │ │├─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli MS 69-1 │ │ ││├─ Escherichia coli MS 196-1 │ │ ││├─ Escherichia coli MS 146-1 │ │ ││├─ Escherichia coli MS 116-1 │ │ ││├─ Escherichia coli KO11 │ │ ││├─ Escherichia coli H299 │ │ ┌┤│├─ Escherichia coli E110019 │ │ │││├─ Escherichia coli BW2952 │ │ │││├─ Escherichia coli 536A │ │ │││└─ Escherichia coli 1125A │ │ ┌┤│└┬─ Escherichia coli IAI39 │ │ │││ └─ Escherichia coli IAI39 │ │ ││└─ Escherichia coli M718 │ │ ┌┤└─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │ ││┌─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │ │ │││ ┌─ Escherichia coli (1-455/461) EC4100B │ │ │└┤ ┌┴─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4486 │ │ │ │┌┴─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli IAI1 │ │ │ └┤┌┴─ Escherichia coli IAI1 │ │ │ ││┌─ Escherichia coli E110019 │ │ │ ││├─ Escherichia coli K12 │ │ │ └┤├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 │ │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 │ │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai │ │ │ │├─ Escherichia coli W │ │ ┌┤ └┼─ Escherichia coli W3110 │ │ ││ ├─ Escherichia coli SMS-3-5 │ │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966 │ │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 │ │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 │ │ ││ ├─ Escherichia coli H591 │ │ ││ └─ Escherichia coli B354 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli 1827-70 │ │ ││ ┌┴─ Escherichia coli HS │ │ ││┌┴─ Escherichia coli HS │ │ │││ ┌─ Escherichia coli B str. REL606 │ │ │││ ├─ Escherichia coli (DE3) BL21(DE3) │ │ │││┌┼─ Escherichia coli MS 187-1 │ │ │└┤│└─ Escherichia coli BL21 │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli ATCC 8739 │ │ │ ││ ├─ Escherichia coli B7A │ │ │ ││ ├─ Escherichia coli E22 │ │ │ ││ ├─ Escherichia coli MS 145-7 │ │ │ └┤ ┌┼─ Escherichia coli MS 84-1 │ │ │ │ │├─ Escherichia coli E24377A │ │ │ │┌┤├─ Escherichia coli E22 │ │ │ │││└─ Escherichia coli B171 │ │ ┌┤ ││└┬─ Escherichia coli 53638 │ │ ││ ││ └─ Escherichia coli 53638 │ │ ││ ││┌─ fig|6666666.5357.peg.659 TY-2482 strain │ │ ││ └┤├─ Escherichia coli 55989 └────────────┤ ││ │├─ Escherichia coli ATCC 8739 │ ││ │├─ Escherichia coli B7A │ ││ │├─ Escherichia coli MS 115-1 │ ││ │├─ Escherichia coli MS 182-1 │ ││ │├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ ││ └┼─ Escherichia coli SE11 │ ││ ├─ Escherichia coli MS 78-1 │ ││ ├─ Escherichia coli MS 124-1 │ ││ ├─ Escherichia coli E24377A │ ││ ├─ Escherichia coli B171 │ ││ ├─ Escherichia coli 55989 │ ││ ├─ Escherichia coli 101-1 │ ││ └─ fig|1040638.4.peg.1278 O104:H4 str. LB226692 │ ││ ┌─ Escherichia coli 536 │ ││┌┴─ Escherichia coli 536 │ │││ ┌─ Escherichia coli F11 │ ┌┤││ ├─ Escherichia coli MS 200-1 │ ││││ ├─ Escherichia coli S88 │ ││└┤ ├─ Escherichia coli TA143 │ ││ │┌┼─ Escherichia coli UTI89 │ ││ ││├─ Escherichia coli UTI89 │ ││ ││├─ Escherichia coli SE15 │ ││ ││├─ Escherichia coli NC101 │ ││ └┤└─ Escherichia coli IHE3034 │ ││ │ ┌─ Escherichia coli APEC O1 │ ││ │ ├─ Escherichia coli M605 │ ││ │ ┌┼─ Escherichia coli UM146 │ ││ │┌┤└─ Escherichia coli F11 │ ││ └┤└─ Escherichia coli (18-489/489) APEC O1 │ ││ │┌─ Escherichia coli (18-489/489) CFT073 │ ││ └┤┌─ Escherichia coli MS 185-1 │ ┌┤│ └┤┌─ Escherichia coli ABU 83972 │ │││ └┼─ Escherichia coli MS 45-1 │ │││ ├─ Escherichia coli CFT073 │ │││ └─ Escherichia coli 83972 │ │││┌─ Escherichia coli TA206 │ ││└┤ ┌─ Escherichia coli ED1a │ ││ │┌┴─ Escherichia coli ED1a │ ││ └┤ ┌─ Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C │ ││ └┬┴─ Escherichia coli WV_060327 │ ┌────────────────────────────────┤│ └┬─ Escherichia coli 2362-75 │ │ ││ └┬─ Escherichia coli (18-489/489) E2348/69 │ │ ││ └─ Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 │ │ ││┌─ Escherichia coli FVEC1302 │ │ ││├─ Escherichia coli MS 198-1 │ │ │└┼─ Escherichia coli UMN026 │ │ │ ├─ Escherichia coli FVEC1412 │ │ │ └─ Escherichia coli 042 │ │ └─ Escherichia coli (18-489/489) 042 │ │ ┌─ Escherichia coli (1-457/461) 1827-70 │ │ ├─ Escherichia coli (1-457/461) 53638 │ │ ├─ Escherichia coli (1-457/461) BL21 │ │ ├─ Escherichia coli (1-457/461) BW2952 │ │ ├─ Escherichia coli (1-457/461) EC4100B │ │ ├─ Escherichia coli (1-457/461) H736 │ │ ├─ Escherichia coli (1-457/461) HS │ │ ├─ Escherichia coli (1-457/461) MS 116-1 │ │ ├─ Escherichia coli (1-457/461) MS 146-1 │ │ ├─ Escherichia coli (1-457/461) MS 196-1 │ │ ├─ Escherichia coli (1-457/461) W3110 │ │ ├─ Escherichia coli (1-457/461) str. K-12 substr. DH10B │ │ ┌┼─ Escherichia coli (1-457/461) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │├─ Escherichia coli (1-457/461) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │├─ Escherichia coli (1-457/461) str. K-12 substr. DH10B │ │ │├─ Escherichia coli (1-457/461) MS 84-1 │ │ │├─ Escherichia coli (1-457/461) MS 187-1 │ │ │├─ Escherichia coli (1-457/461) MS 124-1 │ │ │├─ Escherichia coli (1-457/461) K12 │ │ │├─ Escherichia coli (1-457/461) HS │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (1-457/461) ETEC H10407 │ │ ││├─ Escherichia coli (1-457/461) DH1 │ │ ││├─ Escherichia coli (DE3 1-457/461) BL21(DE3) │ │ ││├─ Escherichia coli (1-457/461) B str. REL606 │ │ ││└─ Escherichia coli (1-457/461) 53638 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-457/461) 042 │ │ ││ ┌┼─ Escherichia coli (1-457/461) TA143 │ │ ┌┤│┌┤└─ Escherichia coli (1-457/461) 042 │ │ ││└┤└─ Escherichia coli (1-457/461) B354 │ │ ││ │┌─ Escherichia coli (1-457/461) FVEC1412 │ │ ││ └┼─ Escherichia coli (1-457/461) UMN026 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-457/461) MS 198-1 │ │ ││ └─ Escherichia coli (1-457/461) FVEC1302 │ │ │└┬─ Escherichia coli (1-457/461) ATCC 8739 │ │ │ └─ Escherichia coli (1-457/461) ATCC 8739 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-457/461) IAI39 │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli (1-457/461) M718 │ │ ┌┤ ┌┤└─ Escherichia coli (1-457/461) IAI39 │ │ ││┌┤└─ Escherichia coli (1-457/461) H299 │ │ │││└┬─ Escherichia coli (1-457/461) SMS-3-5 └──┤ │││ └┬─ Escherichia coli (1-457/461) SE15 │ │││ └─ Escherichia coli (1-457/461) M605 │ │││┌─ Escherichia coli (1-457/461) 536 │ │││├─ Escherichia coli (1-457/461) ABU 83972 │ │││├─ Escherichia coli (1-457/461) APEC O1 │ │││├─ Escherichia coli (1-457/461) CFT073 │ │└┤├─ Escherichia coli (1-457/461) ED1a │ │ │├─ Escherichia coli (1-457/461) F11 │ │ │├─ Escherichia coli (1-457/461) MS 185-1 │ │ │├─ Escherichia coli (1-457/461) MS 21-1 │ │ │├─ Escherichia coli (1-457/461) MS 69-1 │ │ │├─ Escherichia coli (1-457/461) O83:H1 str. NRG 857C │ ┌┤ │├─ Escherichia coli (1-457/461) TA206 │ ││ │├─ Escherichia coli (1-457/461) UTI89 │ ││ └┼─ Escherichia coli (1-457/461) UTI89 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-457/461) UM146 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-457/461) S88 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-457/461) NC101 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-457/461) MS 45-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-457/461) MS 200-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-457/461) IHE3034 │ ┌───────────────────────┤│ ├─ Escherichia coli (1-457/461) F11 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-457/461) ED1a │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-457/461) CFT073 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-457/461) APEC O1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-457/461) 83972 │ │ ││ └─ Escherichia coli (1-457/461) 536 │ │ │└┬─ Escherichia coli (1-457/461) 2362-75 │ │ │ └─ Escherichia coli (1-457/461) O127:H6 str. E2348/69 │ │ └─ Escherichia coli (1-457/461) E2348/69 │ │ ┌─ Escherichia coli (8-439/441) 536 │ │ ├─ Escherichia coli (8-439/441) CFT073 │ │ ├─ Escherichia coli (8-439/441) F11 │ │ ├─ Escherichia coli (8-439/441) MS 200-1 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (8-439/441) NC101 │ │ │├─ Escherichia coli (8-439/441) F11 │ │ │├─ Escherichia coli (8-439/441) CFT073 │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (8-439/441) 536 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (8-439/441) ED1a │ │ │└┬┴─ Escherichia coli (8-439/441) ED1a │ │ │ └┬─ Escherichia coli (8-439/441) ABU 83972 │ │ │ └─ Escherichia coli (8-439/441) 83972 │ │ ┌┤ ┌─ Escherichia coli (8-439/441) 2362-75 │ │ ││ ┌┼─ Escherichia coli (8-439/441) O127:H6 str. E2348/69 │ │ ││ ┌┤└─ Escherichia coli (8-439/441) E2348/69 │ │ ││┌┤└─ Escherichia coli (8-439/441) WV_060327 │ │ │││└─ Escherichia coli (8-439/441) SE15 │ │ │└┤ ┌─ Escherichia coli (8-439/441) O83:H1 str. NRG 857C │ │ ┌┤ │┌┴─ Escherichia coli (8-439/441) TA206 │ │ ││ └┤┌─ Escherichia coli (8-439/441) APEC O1 └────┤ ││ └┼─ Escherichia coli (8-439/441) S88 │ ││ ├─ Escherichia coli (8-439/441) IHE3034 │ ││ └─ Escherichia coli (8-439/441) APEC O1 │ ││┌─ Escherichia coli (8-439/441) B354 │ ┌┤└┤┌─ Escherichia coli (8-439/441) MS 69-1 │ ││ └┤┌─ Escherichia coli (8-439/441) FVEC1412 │ ││ │├─ Escherichia coli (8-439/441) TA143 │ ││ └┼─ Escherichia coli (8-439/441) UMN026 │ ││ ├─ Escherichia coli (8-439/441) MS 198-1 │ ┌┤│ └─ Escherichia coli (8-439/441) FVEC1302 │ ││└┬─ Escherichia coli (8-439/441) M605 │ ││ └┬─ Escherichia coli (8-439/441) SMS-3-5 │ ┌┤│ └┬─ Escherichia coli (8-439/441) IAI39 │ │││ └─ Escherichia coli (8-439/441) IAI39 │ ┌┤│└─ Escherichia coli (8-439/441) H299 │ ││└─ Escherichia coli (8-439/441) TA280 │ │└┬─ Escherichia coli (8-439/441) 042 │ │ └─ Escherichia coli (8-439/441) 042 │ │ ┌─ fig|1040638.4.peg.1034 O104:H4 (8-439/441) str. LB226692 │ │ ├─ Escherichia coli (8-439/441) 55989 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (8-439/441) 55989 │ │ ┌┤└─ fig|6666666.5357.peg.3452 TY-2482 (8-439/441) strain │ │ │└┬─ Escherichia coli (8-439/441) O26:H11 str. 11368 │ │┌┤ └─ Escherichia coli (8-439/441) O111:H- str. 11128 │ ││└┬─ Escherichia coli (8-439/441) E110019 │ ││ └─ Escherichia coli (8-439/441) E110019 │ ││ ┌─ Escherichia coli (8-439/441) 1044A │ ││ ├─ Escherichia coli (8-439/441) O157:H7 │ ││ ├─ Escherichia coli (8-439/441) O157:H7 str. EC4024 └────────────────────┤│ ├─ Escherichia coli (8-439/441) O157:H7 str. EC4045 ││ ├─ Escherichia coli (8-439/441) O157:H7 str. EC4113 ││ ├─ Escherichia coli (8-439/441) O157:H7 str. EC4196 ││ ├─ Escherichia coli (8-439/441) O157:H7 str. EC4401 ││ ├─ Escherichia coli (8-439/441) O157:H7 str. EC4501 ││ ├─ Escherichia coli (8-439/441) O157:H7 str. EC869 ││ ├─ Escherichia coli (8-439/441) O157:H7 str. FRIK966 ││ ├─ Escherichia coli (8-439/441) O157:H7 str. TW14359 ││ ┌┼─ Escherichia coli (8-439/441) O157:H7 str. TW14588 ││ │├─ Escherichia coli (8-439/441) O157:H7 str. Sakai ││ │├─ Escherichia coli (8-439/441) O157:H7 str. FRIK2000 ││ │├─ Escherichia coli (8-439/441) O157:H7 str. EC508 ││ │├─ Escherichia coli (8-439/441) O157:H7 str. EC4486 ││ │├─ Escherichia coli (8-439/441) O157:H7 str. EC4206 ││ ┌┤├─ Escherichia coli (8-439/441) O157:H7 str. EC4115 ││ ││├─ Escherichia coli (8-439/441) O157:H7 str. EC4076 └┤ ││├─ Escherichia coli (8-439/441) O157:H7 str. EC4042 │ ││├─ Escherichia coli (8-439/441) O157:H7 EDL933 │ ┌┤│└─ Escherichia coli (8-439/441) 1125A │ ││└┬─ Escherichia coli (8-439/441) 536A │ ┌┤│ └─ Escherichia coli (8-439/441) 1212A │ ││└─ Escherichia coli (8-439/441) O157:H7 EDL933 │ │└─ Escherichia coli (8-439/441) O55:H7 str. CB9615 │┌┤┌─ Escherichia coli (8-439/441) MS 115-1 ││││┌─ Escherichia coli (8-439/441) ATCC 8739 ││└┤├─ Escherichia coli (8-439/441) B str. REL606 ││ │├─ Escherichia coli (DE3 8-439/441) BL21(DE3) ││ └┼─ Escherichia coli (8-439/441) MS 187-1 ││ ├─ Escherichia coli (8-439/441) ETEC H10407 ││ ├─ Escherichia coli (8-439/441) BL21 ││ ├─ Escherichia coli (8-439/441) ATCC 8739 ││ └─ Escherichia coli (8-439/441) 101-1 ││ ┌─ Escherichia coli (8-439/441) B088 ││ ├─ Escherichia coli (8-439/441) B171 ││ ├─ Escherichia coli (8-439/441) E22 ││ ├─ Escherichia coli (8-439/441) IAI1 ││ ┌┼─ Escherichia coli (8-439/441) O103:H2 str. 12009 ││ │├─ Escherichia coli (8-439/441) MS 107-1 └┤ │├─ Escherichia coli (8-439/441) IAI1 │ ┌┤├─ Escherichia coli (8-439/441) E22 │ ││└─ Escherichia coli (8-439/441) B171 │ ┌┤└─ Escherichia coli (8-439/441) EC4100B │ ││ ┌─ Escherichia coli (8-439/441) B185 │ │└┬┴─ Escherichia coli (8-439/441) M718 │ │ └┬─ Escherichia coli (8-439/441) TA271 │┌┤ └┬─ Escherichia coli (8-439/441) SE11 │││ └┬─ Escherichia coli (8-439/441) HS │││ └─ Escherichia coli (8-439/441) HS │││┌─ Escherichia coli (8-439/441) E24377A ││└┼─ Escherichia coli (8-439/441) MS 78-1 ││ ├─ Escherichia coli (8-439/441) MS 182-1 ││ └─ Escherichia coli (8-439/441) E24377A ││ ┌─ Escherichia coli (8-439/441) B7A └┤ ├─ Escherichia coli (8-439/441) H591 │ ├─ Escherichia coli (8-439/441) MS 119-7 │ ├─ Escherichia coli (8-439/441) MS 145-7 │ ├─ Escherichia coli (8-439/441) W │┌┼─ Escherichia coli (8-439/441) W ││├─ Escherichia coli (8-439/441) MS 84-1 ││├─ Escherichia coli (8-439/441) MS 124-1 ││├─ Escherichia coli (8-439/441) KO11 └┤└─ Escherichia coli (8-439/441) B7A │ ┌─ Escherichia coli (8-439/441) 53638 │┌┴─ Escherichia coli (8-439/441) 53638 ││┌─ Escherichia coli (8-439/441) BW2952 ││├─ Escherichia coli (8-439/441) H736 └┤├─ Escherichia coli (8-439/441) MS 116-1 │├─ Escherichia coli (8-439/441) MS 175-1 │├─ Escherichia coli (8-439/441) W3110 │├─ Escherichia coli (8-439/441) str. K-12 substr. DH10B └┼─ Escherichia coli (8-439/441) str. K-12 substr. MG1655 ├─ Escherichia coli (8-439/441) str. K-12 substr. MG1655 ├─ Escherichia coli (8-439/441) str. K-12 substr. DH10B ├─ Escherichia coli (8-439/441) MS 196-1 ├─ Escherichia coli (8-439/441) MS 146-1 ├─ Escherichia coli (8-439/441) K12 ├─ Escherichia coli (8-439/441) DH1 └─ Escherichia coli (8-439/441) 1827-70
| Nitrogen regulation protein NR(I) | (129) |
| Putative sensory histidine kinase YfhA | (128) |
| Response regulator of zinc sigma-54-dependent two-component system | (125) |
| Acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC | (70) |
| Phosphoglycerate transport system transcriptional regulatory protein PgtA | (18) |
| Putative c4-dicarboxylate transport transcriptional Regulatory protein | (17) |
| Two-component response regulator | (3) |
| Putative transcriptional regulator | (1) |
| Sigma-54 dependent DNA-binding response regulator | (1) |
| Others | (6) |