fig|1040638.4.peg.1272   Escherichia coli O104:H4 str. LB226692     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHSASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|6666666.5357.peg.653   Escherichia coli TY-2482     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHSASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|344610.7.peg.2335   Escherichia coli 53638     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHSASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|585055.6.peg.4361   Escherichia coli 55989     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHSASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|585055.8.peg.4364   Escherichia coli 55989     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHSASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|340184.6.peg.4822   Escherichia coli B7A     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHSASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|340185.4.peg.2490   Escherichia coli E22     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHSASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|562.375.peg.131   Escherichia coli EC4100B     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHSASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|656408.3.peg.4330   Escherichia coli H591     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHSASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|656414.3.peg.4392   Escherichia coli H736     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHSASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|585034.4.peg.3950   Escherichia coli IAI1     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHSASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|585034.5.peg.3947   Escherichia coli IAI1     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHSASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|595495.4.peg.3557   Escherichia coli KO11     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHSASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|679207.4.peg.4186   Escherichia coli MS 107-1     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHSASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|679206.4.peg.3458   Escherichia coli MS 119-7     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHSASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|679205.4.peg.1851   Escherichia coli MS 124-1     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHSASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|679204.3.peg.4876   Escherichia coli MS 145-7     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHSASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|573235.3.peg.4866   Escherichia coli O26:H11 str. 11368     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHSASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|656443.3.peg.4810   Escherichia coli TA271     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHSASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|566546.3.peg.3962   Escherichia coli W     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHSASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|566546.4.peg.4105   Escherichia coli W     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHSASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|362663.8.peg.4101   Escherichia coli 536     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHGVSGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|362663.9.peg.4117   Escherichia coli 536     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHGVSGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|655817.3.peg.4553   Escherichia coli ABU 83972     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHGVSGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|405955.13.peg.4329   Escherichia coli APEC O1     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHGVSGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|199310.1.peg.4709   Escherichia coli CFT073     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHGVSGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|199310.4.peg.4513   Escherichia coli CFT073     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHGVSGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|585397.7.peg.4554   Escherichia coli ED1a     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHGVSGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|585397.9.peg.4551   Escherichia coli ED1a     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHGVSGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|340197.5.peg.4169   Escherichia coli F11     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHGVSGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|714962.3.peg.4364   Escherichia coli IHE3034     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHGVSGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|656417.3.peg.4765   Escherichia coli M605     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHGVSGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|753642.3.peg.2025   Escherichia coli NC101     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHGVSGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|685038.3.peg.3932   Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHGVSGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|585035.6.peg.4227   Escherichia coli S88     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHGVSGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|656440.3.peg.4402   Escherichia coli TA206     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHGVSGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|869729.3.peg.4195   Escherichia coli UM146     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHGVSGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|364106.7.peg.4333   Escherichia coli UTI89     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHGVSGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|364106.8.peg.4335   Escherichia coli UTI89     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHGVSGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|562.376.peg.1477   Escherichia coli WV_060327     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHGVSGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|585057.4.peg.3250   Escherichia coli IAI39     MLVPDVAYPARKFNRLHFYRWPDKHGASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|439855.10.peg.4376   Escherichia coli SMS-3-5     MLVPDVAYPARKFNRLHFYRWPDKHGASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|656437.3.peg.4345   Escherichia coli TA143     MLVPDVAYPARKFNRLHFYRWPDKHGASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|670897.3.peg.5038   Escherichia coli 2362-75     MLVPDMAYPARKFNRLQFYRWPDKHGVSGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|656419.3.peg.4954   Escherichia coli M718     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHGASGIADFFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|550677.3.peg.4435   Escherichia coli B354     MLVPDVAYPARKFNRLHFYRWPDKQGASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|656393.3.peg.5049   Escherichia coli H299     MLVPDVAYPARKFNRLHFYRWPDKQGASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|431946.3.peg.3864   Escherichia coli SE15     MLVPDVAYPARKFNRLHFYRWPDKQGASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|656444.3.peg.5201   Escherichia coli TA280     MLVPDVAYPARKFNRLHFYRWPDKQGASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|585396.4.peg.4849   Escherichia coli O111:H- str. 11128       MPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHSASGITDLFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|656379.3.peg.5094   Escherichia coli FVEC1302     MLVPDVAYPARKFNRLHFYRWPDKQGASGITELFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|656380.3.peg.4991   Escherichia coli FVEC1412     MLVPDVAYPARKFNRLHFYRWPDKQGASGITELFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|585056.7.peg.4552   Escherichia coli UMN026     MLVPDVAYPARKFNRLHFYRWPDKQGASGITELFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|316401.4.peg.4688   Escherichia coli ETEC H10407     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHGASGIADFFFRSIKNAPVITDWGG 
fig|749548.3.peg.3622   Escherichia coli MS 196-1     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHSASGITDLFFRPIKNAPVITD    
fig|216592.1.peg.4653   Escherichia coli 042     MLVPDVAYPVRKFNRLHFYRWPDKQGASGITELFFRPIKNAPVITDWGG 
fig|749546.3.peg.737   Escherichia coli MS 185-1     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHGVSGITDLFFRPIKNAPVITD    
fig|749527.3.peg.1921   Escherichia coli MS 21-1     MLVPDVAYPARKFNRLHFYRWPDKHGASGITDLFFRPIKNAPVITD    
fig|562.371.peg.1965   Escherichia coli 1044A       MPDVAYPAHKFNRLQFYRWPDKHGASGITDLSFRPIKNAPVITDWGG 
fig|562.373.peg.2529   Escherichia coli 1125A       MPDVAYPAHKFNRLQFYRWPDKHGASGITDLSFRPIKNAPVITDWGG 
fig|562.372.peg.3747   Escherichia coli 1212A       MPDVAYPAHKFNRLQFYRWPDKHGASGITDLSFRPIKNAPVITDWGG 
fig|562.374.peg.3519   Escherichia coli 536A       MPDVAYPAHKFNRLQFYRWPDKHGASGITDLSFRPIKNAPVITDWGG 
fig|155864.8.peg.4755   Escherichia coli O157:H7 EDL933       MPDVAYPAHKFNRLQFYRWPDKHGASGITDLSFRPIKNAPVITDWGG 
fig|444454.5.peg.3878   Escherichia coli O157:H7 str. EC4024       MPDVAYPAHKFNRLQFYRWPDKHGASGITDLSFRPIKNAPVITDWGG 
fig|444449.5.peg.3335   Escherichia coli O157:H7 str. EC4042       MPDVAYPAHKFNRLQFYRWPDKHGASGITDLSFRPIKNAPVITDWGG 
fig|444448.5.peg.2090   Escherichia coli O157:H7 str. EC4045       MPDVAYPAHKFNRLQFYRWPDKHGASGITDLSFRPIKNAPVITDWGG 
fig|444453.5.peg.2231   Escherichia coli O157:H7 str. EC4076       MPDVAYPAHKFNRLQFYRWPDKHGASGITDLSFRPIKNAPVITDWGG 
fig|444450.8.peg.5172   Escherichia coli O157:H7 str. EC4115       MPDVAYPAHKFNRLQFYRWPDKHGASGITDLSFRPIKNAPVITDWGG 
fig|444447.5.peg.2254   Escherichia coli O157:H7 str. EC4206       MPDVAYPAHKFNRLQFYRWPDKHGASGITDLSFRPIKNAPVITDWGG 
fig|478004.5.peg.2305   Escherichia coli O157:H7 str. EC4401       MPDVAYPAHKFNRLQFYRWPDKHGASGITDLSFRPIKNAPVITDWGG 
fig|478008.5.peg.1975   Escherichia coli O157:H7 str. EC869       MPDVAYPAHKFNRLQFYRWPDKHGASGITDLSFRPIKNAPVITDWGG 
fig|637388.3.peg.542   Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000       MPDVAYPAHKFNRLQFYRWPDKHGASGITDLSFRPIKNAPVITDWGG 
fig|570506.3.peg.3135   Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966       MPDVAYPAHKFNRLQFYRWPDKHGASGITDLSFRPIKNAPVITDWGG 
fig|386585.9.peg.4997   Escherichia coli O157:H7 str. Sakai       MPDVAYPAHKFNRLQFYRWPDKHGASGITDLSFRPIKNAPVITDWGG 
fig|544404.4.peg.4982   Escherichia coli O157:H7 str. TW14359       MPDVAYPAHKFNRLQFYRWPDKHGASGITDLSFRPIKNAPVITDWGG 
fig|749537.3.peg.2662   Escherichia coli MS 115-1 (1-50/58)     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHSASGITDLFFRPIKNAPPPTLFWGG
fig|749533.3.peg.3919   Escherichia coli MS 84-1 (1-42/44)     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHSASGITDLFFRPIKNAP        
fig|749532.3.peg.2893   Escherichia coli MS 78-1 (1-40/46)     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHSASGITDLFFRPIKN          
fig|749540.3.peg.4705   Escherichia coli MS 146-1 (1-40/41)     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHSASGITDLFFRPIKN          
fig|749550.3.peg.2740   Escherichia coli MS 200-1 (1-42/44)     MLVPDVAYPARKFNRLQFYRWPDKHGVSGITDLFFRPIKNAP        
fig|749531.3.peg.3353   Escherichia coli MS 69-1 (1-42/44)     MLVPDVAYPARKFNRLRFYRWPDKHGVSGITDLFFRPIKNAP        
fig|749549.3.peg.1141   Escherichia coli MS 198-1 (1-42/44)     MLVPDVAYPARKFNRLHFYRWPDKQGASGITELFFRPIKNAP        
Consen1   Primary consensus     MLvPDVAYPArKFNRLqFYRWPDKhgaSGITDLfFRPIKNAPVITDWGG 
Consen2   Secondary consensus       m       h     h       qsv      s                

Consensus 1 (when a gap)
Conservative difference
Consensus 2 (when a gap)
Nonconservative diff.
Other character