Alignment colored by consensus

fig\|340184.6.peg.4820	Escherichia coli B7A (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHVVKNKAIPNN`
fig\|670897.3.peg.5040	Escherichia coli 2362-75 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|216593.1.peg.4684	Escherichia coli E2348/69 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|574521.7.peg.4254	Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|550672.3.peg.3931	Escherichia coli B088 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|331111.3.peg.2004	Escherichia coli E24377A (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|656408.3.peg.4328	Escherichia coli H591 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|679207.4.peg.4184	Escherichia coli MS 107-1 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|679206.4.peg.3456	Escherichia coli MS 119-7 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|679205.4.peg.1849	Escherichia coli MS 124-1 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|749533.3.peg.3917	Escherichia coli MS 84-1 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|656443.3.peg.4808	Escherichia coli TA271 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|340197.3.peg.3993	Escherichia coli F11 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFIFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|753642.3.peg.2027	Escherichia coli NC101 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFIFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|344610.3.peg.2307	Escherichia coli 53638 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|550676.3.peg.4067	Escherichia coli B185 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|331112.3.peg.3814	Escherichia coli HS (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|431946.3.peg.3862	Escherichia coli SE15 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|656444.3.peg.5199	Escherichia coli TA280 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFAFHAVKNKAIPNN`
fig\|358709.5.peg.4959	Escherichia coli 101-1 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|481805.3.peg.4473	Escherichia coli ATCC 8739 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|340186.3.peg.1157	Escherichia coli E110019 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|340185.3.peg.2354	Escherichia coli E22 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|340185.4.peg.2492	Escherichia coli E22 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|749537.3.peg.2648	Escherichia coli MS 115-1 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|637912.3.peg.2335	Escherichia coli OP50 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|316385.5.peg.3989	Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|573235.3.peg.4868	Escherichia coli O26:H11 str. 11368 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMIFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|585035.6.peg.4225	Escherichia coli S88 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMVFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|364106.7.peg.4331	Escherichia coli UTI89 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMVFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|364106.8.peg.4333	Escherichia coli UTI89 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMVFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|562.371.peg.1967	Escherichia coli 1044A (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|562.372.peg.3749	Escherichia coli 1212A (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|83334.1.peg.4759	Escherichia coli O157:H7 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|444454.5.peg.3877	Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|444449.5.peg.3333	Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|478004.5.peg.2303	Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|478005.5.peg.2155	Escherichia coli O157:H7 str. EC4486 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|478008.5.peg.1972	Escherichia coli O157:H7 str. EC869 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|570506.3.peg.3133	Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|386585.9.peg.4995	Escherichia coli O157:H7 str. Sakai (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|701177.3.peg.4664	Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|199310.1.peg.4708	Escherichia coli CFT073 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMVFIFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|199310.4.peg.4510	Escherichia coli CFT073 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMVFIFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|216592.1.peg.4655	Escherichia coli 042 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHEVKNKTIPNN`
fig\|216592.3.peg.4389	Escherichia coli 042 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHEVKNKTIPNN`
fig\|550677.3.peg.4433	Escherichia coli B354 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHEVKNKTIPNN`
fig\|749531.3.peg.3351	Escherichia coli MS 69-1 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHEVKNKTIPNN`
fig\|656393.3.peg.5047	Escherichia coli H299 (42-80/80)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHEVKNKTIPSN`
fig\|585055.6.peg.4359	Escherichia coli 55989 (23-61/61)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHVVKNKAIPNN`
fig\|585055.8.peg.4362	Escherichia coli 55989 (23-61/61)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHVVKNKAIPNN`
fig\|679204.3.peg.4878	Escherichia coli MS 145-7 (23-61/61)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHVVKNKAIPNN`
fig\|344610.7.peg.2338	Escherichia coli 53638 (23-61/61)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|585057.4.peg.3252	Escherichia coli IAI39 (23-61/61)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHVVKNKAIPNN`
fig\|585057.6.peg.3258	Escherichia coli IAI39 (23-61/61)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHVVKNKAIPNN`
fig\|749545.3.peg.3788	Escherichia coli MS 182-1 (23-61/61)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|340197.5.peg.4167	Escherichia coli F11 (23-61/61)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFIFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|439855.10.peg.4374	Escherichia coli SMS-3-5 (23-61/61)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFIFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|585396.4.peg.4847	Escherichia coli O111:H- str. 11128 (23-61/61)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMIFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|562.374.peg.3517	Escherichia coli 536A (23-61/61)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|344601.5.peg.5055	Escherichia coli B171 (23-61/61)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|536056.3.peg.4389	Escherichia coli DH1 (23-61/61)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|340186.5.peg.1197	Escherichia coli E110019 (23-61/61)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|585395.4.peg.4513	Escherichia coli O103:H2 str. 12009 (23-61/61)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|478007.5.peg.5353	Escherichia coli O157:H7 str. EC508 (23-61/61)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|637388.3.peg.540	Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 (23-61/61)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|511145.12.peg.3972	Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 (23-61/61)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|511145.6.peg.3954	Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 (23-61/61)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|405955.13.peg.4327	Escherichia coli APEC O1 (23-61/61)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMVFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|656380.3.peg.4989	Escherichia coli FVEC1412 (23-61/61)	`VDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHEVKNKTIPNN`
fig\|749527.3.peg.1919	Escherichia coli MS 21-1 (23-61/61)	`VDNFVHKFFTSLLIYYHAFYSMMFIFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|316401.4.peg.4686	Escherichia coli ETEC H10407	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMLVFVFHAVKSKAIPDN`
fig\|670888.3.peg.2363	Escherichia coli 1827-70	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|331111.12.peg.4603	Escherichia coli E24377A	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|331112.6.peg.3978	Escherichia coli HS	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|585034.4.peg.3948	Escherichia coli IAI1	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|585034.5.peg.3945	Escherichia coli IAI1	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|656419.3.peg.4952	Escherichia coli M718	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|749532.3.peg.2891	Escherichia coli MS 78-1	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|409438.11.peg.4316	Escherichia coli SE11	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|1040638.4.peg.1270	Escherichia coli O104:H4 str. LB226692	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHVVKNKAIPNN`
fig\|595495.4.peg.3559	Escherichia coli KO11	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHVVKNKAIPNN`
fig\|566546.3.peg.3964	Escherichia coli W	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHVVKNKAIPNN`
fig\|566546.4.peg.4103	Escherichia coli W	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHVVKNKAIPNN`
fig\|362663.8.peg.4099	Escherichia coli 536	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFIFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|362663.9.peg.4115	Escherichia coli 536	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFIFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|585397.7.peg.4552	Escherichia coli ED1a	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFIFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|585397.9.peg.4549	Escherichia coli ED1a	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFIFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|749550.3.peg.2738	Escherichia coli MS 200-1	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFIFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|562.376.peg.1479	Escherichia coli WV_060327	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFIFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|714962.3.peg.4362	Escherichia coli IHE3034	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMVFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|685038.3.peg.3930	Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMVFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|656440.3.peg.4400	Escherichia coli TA206	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMVFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|869729.3.peg.4193	Escherichia coli UM146	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMVFVFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|525281.3.peg.3435	Escherichia coli 83972	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMVFIFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|655817.3.peg.4551	Escherichia coli ABU 83972	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMVFIFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|656417.3.peg.4763	Escherichia coli M605	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMVFIFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|749546.3.peg.710	Escherichia coli MS 185-1	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMVFIFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|749528.3.peg.1258	Escherichia coli MS 45-1	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMVFIFVFHAVKNKAIPNN`
fig\|562.373.peg.2527	Escherichia coli 1125A	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|481805.6.peg.4453	Escherichia coli ATCC 8739	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|413997.3.peg.3930	Escherichia coli B str. REL606	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|511693.5.peg.3948	Escherichia coli BL21	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|469008.4.peg.4337	Escherichia coli BL21(DE3)	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|595496.3.peg.3856	Escherichia coli BW2952	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|562.375.peg.133	Escherichia coli EC4100B	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|656379.3.peg.5092	Escherichia coli FVEC1302	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHEVKNKTIPNN`
fig\|656414.3.peg.4389	Escherichia coli H736	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|749538.3.peg.1632	Escherichia coli MS 116-1	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|749540.3.peg.4702	Escherichia coli MS 146-1	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|749547.3.peg.3662	Escherichia coli MS 187-1	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|749548.3.peg.3619	Escherichia coli MS 196-1	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|749549.3.peg.1139	Escherichia coli MS 198-1	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHEVKNKTIPNN`
fig\|155864.8.peg.4753	Escherichia coli O157:H7 EDL933	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|444448.5.peg.2088	Escherichia coli O157:H7 str. EC4045	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|444453.5.peg.2229	Escherichia coli O157:H7 str. EC4076	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|444452.5.peg.3290	Escherichia coli O157:H7 str. EC4113	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|444450.8.peg.5170	Escherichia coli O157:H7 str. EC4115	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|444451.5.peg.3153	Escherichia coli O157:H7 str. EC4196	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|444447.5.peg.2252	Escherichia coli O157:H7 str. EC4206	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|478006.5.peg.5422	Escherichia coli O157:H7 str. EC4501	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|544404.4.peg.4980	Escherichia coli O157:H7 str. TW14359	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|502346.5.peg.1827	Escherichia coli O157:H7 str. TW14588	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
fig\|656437.3.peg.4343	Escherichia coli TA143	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHEVKNKTIPNN`
fig\|585056.7.peg.4550	Escherichia coli UMN026	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHEVKNKTIPNN`
fig\|316385.7.peg.4073	Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B	`MDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMMFVFVFHAVKNKSIPNN`
Consen1	Primary consensus	`vDNFVHKLFTSLLIYYHAFYSMmFvFVFHaVKNKaIPNN`
Consen2	Secondary consensus	`m v i e s`

Consensus 1 (when a gap)

Conservative difference

Consensus 2 (when a gap)

Nonconservative diff.

Other character