┌─ Escherichia coli (3-228/238) 042 ├─ Escherichia coli (3-228/238) 1044A ├─ Escherichia coli (3-228/238) 1212A ├─ Escherichia coli (3-228/238) 53638 ├─ Escherichia coli (3-228/238) ATCC 8739 ├─ Escherichia coli (3-228/238) B185 ├─ Escherichia coli (3-228/238) BW2952 ├─ Escherichia coli (3-228/238) ETEC H10407 ├─ Escherichia coli (3-228/238) FVEC1412 ├─ Escherichia coli (3-228/238) IAI39 ├─ Escherichia coli (3-228/238) K12 ├─ Escherichia coli (3-228/238) MS 146-1 ├─ Escherichia coli (3-228/238) MS 196-1 ├─ Escherichia coli (3-228/238) MS 21-1 ├─ Escherichia coli (3-228/238) O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli (3-228/238) O157:H7 str. EC4024 ├─ Escherichia coli (3-228/238) O157:H7 str. EC4045 ├─ Escherichia coli (3-228/238) O157:H7 str. EC4113 ├─ Escherichia coli (3-228/238) O157:H7 str. EC4196 ├─ Escherichia coli (3-228/238) O157:H7 str. EC4401 ├─ Escherichia coli (3-228/238) O157:H7 str. EC4501 ├─ Escherichia coli (3-228/238) O157:H7 str. EC869 ├─ Escherichia coli (3-228/238) O157:H7 str. FRIK966 ├─ Escherichia coli (3-228/238) O157:H7 str. TW14359 ├─ Escherichia coli (3-228/238) O55:H7 str. CB9615 ├─ Escherichia coli (3-228/238) W3110 ├─ Escherichia coli (3-228/238) str. K-12 substr. MG1655 ├─ Escherichia coli (56-281/291) B088 ┌┼─ Escherichia coli (56-281/291) str. K-12 substr. DH10B │├─ Escherichia coli (3-228/238) str. K-12 substr. MG1655 │├─ Escherichia coli (3-228/238) str. K-12 substr. DH10B │├─ Escherichia coli (3-228/238) SMS-3-5 │├─ Escherichia coli (3-228/238) O157:H7 str. TW14588 │├─ Escherichia coli (3-228/238) O157:H7 str. Sakai │├─ Escherichia coli (3-228/238) O157:H7 str. FRIK2000 │├─ Escherichia coli (3-228/238) O157:H7 str. EC508 │├─ Escherichia coli (3-228/238) O157:H7 str. EC4486 │├─ Escherichia coli (3-228/238) O157:H7 str. EC4206 │├─ Escherichia coli (3-228/238) O157:H7 str. EC4115 │├─ Escherichia coli (3-228/238) O157:H7 str. EC4076 │├─ Escherichia coli (3-228/238) O157:H7 str. EC4042 │├─ Escherichia coli (3-228/238) O157:H7 EDL933 ┌┤├─ Escherichia coli (3-228/238) O157:H7 ││├─ Escherichia coli (3-228/238) MS 198-1 ││├─ Escherichia coli (3-228/238) MS 175-1 ││├─ Escherichia coli (3-228/238) MS 116-1 ││├─ Escherichia coli (3-228/238) IAI39 ││├─ Escherichia coli (3-228/238) H736 ││├─ Escherichia coli (3-228/238) FVEC1302 ││├─ Escherichia coli (3-228/238) DH1 ││├─ Escherichia coli (3-228/238) B7A ││├─ Escherichia coli (3-228/238) ATCC 8739 ┌┤│├─ Escherichia coli (3-228/238) 536A │││├─ Escherichia coli (3-228/238) 53638 │││├─ Escherichia coli (3-228/238) 1125A │││└─ Escherichia coli (3-228/238) 042 ││└┬─ Escherichia coli (3-228/238) MS 69-1 ┌───────────────────────────┤│ └┬─ fig|6666666.5357.peg.692 TY-2482 (3-228/238) strain │ ││ └┬─ Escherichia coli (3-228/238) E110019 │ ││ └┬─ Escherichia coli (3-228/238) E22 │ ││ └─ Escherichia coli (3-228/238) B171 │ │└─ Escherichia coli (3-228/238) E24377A │ └┬─ Escherichia coli (3-228/238) 1827-70 │ └┬─ Escherichia coli (3-228/238) HS │ └┬─ Escherichia coli (3-228/238) TA143 │ └─ Escherichia coli (3-228/238) B354 │ ┌─ Escherichia coli (3-228/232) MS 21-1 ┌─────────────┤ ├─ Escherichia coli (3-228/232) SMS-3-5 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (3-228/232) TA143 │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (3-228/232) MS 69-1 │ │ │└┬─ Escherichia coli (3-228/232) IAI39 │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (3-228/232) IAI39 │ │ │└┬─ Escherichia coli (3-228/232) 1827-70 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (3-228/239) HS │ │ │ └─ Escherichia coli (3-228/239) HS │ │ │ ┌─ Escherichia coli (3-228/232) O111:H- str. 11128 │ └──────────────────────────────────┤┌┴─ Escherichia coli (3-228/232) O26:H11 str. 11368 │ ││ ┌─ Escherichia coli (3-228/232) MS 124-1 │ ││┌┴─ Escherichia coli (3-228/232) MS 84-1 │ │││┌─ fig|6666666.5357.peg.2862 TY-2482 (3-228/232) strain │ │││├─ Escherichia coli (3-228/232) 55989 │ │││├─ Escherichia coli (3-228/232) ABU 83972 │ └┤│├─ Escherichia coli (3-228/232) APEC O1 │ ││├─ Escherichia coli (3-228/232) B7A │ ││├─ Escherichia coli (3-228/232) CFT073 │ ││├─ Escherichia coli (3-228/232) E110019 │ ││├─ Escherichia coli (3-228/232) E22 │ ││├─ Escherichia coli (3-228/232) E24377A │ ││├─ Escherichia coli (3-228/232) EC4100B │ └┤├─ Escherichia coli (3-228/232) IAI1 │ │├─ Escherichia coli (3-228/232) IHE3034 │ │├─ Escherichia coli (3-228/232) MS 107-1 │ │├─ Escherichia coli (3-228/232) MS 182-1 │ │├─ Escherichia coli (3-228/232) MS 45-1 │ │├─ Escherichia coli (3-228/232) NC101 ┌───────┤ │├─ Escherichia coli (3-228/232) O83:H1 str. NRG 857C │ │ │├─ Escherichia coli (3-228/232) SE11 │ │ │├─ Escherichia coli (3-228/232) TA271 │ │ │├─ Escherichia coli (3-228/232) UTI89 │ │ │├─ Escherichia coli (3-228/232) W │ │ └┼─ Escherichia coli (3-228/232) W │ │ ├─ Escherichia coli (3-228/232) UTI89 │ │ ├─ Escherichia coli (3-228/232) UM146 │ │ ├─ Escherichia coli (3-228/232) TA206 │ │ ├─ Escherichia coli (3-228/232) S88 │ │ ├─ Escherichia coli (3-228/232) O103:H2 str. 12009 │ │ ├─ Escherichia coli (3-228/232) MS 78-1 │ │ ├─ Escherichia coli (3-228/232) MS 185-1 │ │ ├─ Escherichia coli (3-228/232) MS 145-7 │ │ ├─ Escherichia coli (3-228/232) KO11 │ │ ├─ Escherichia coli (3-228/232) IAI1 │ │ ├─ Escherichia coli (3-228/232) H591 │ │ ├─ Escherichia coli (3-228/232) E24377A │ │ ├─ Escherichia coli (3-228/232) E22 │ │ ├─ Escherichia coli (3-228/232) E110019 │ │ ├─ Escherichia coli (3-228/232) CFT073 │ │ ├─ Escherichia coli (3-228/232) B7A │ │ ├─ Escherichia coli (3-228/232) B088 │ │ ├─ Escherichia coli (3-228/232) APEC O1 │ │ ├─ Escherichia coli (3-228/232) 83972 │ │ ├─ Escherichia coli (3-228/232) 55989 │ │ └─ fig|1040638.4.peg.4293 O104:H4 (3-228/232) str. LB226692 │ └───────────────────────────────────────── Escherichia coli (7-232/240) SE15 ┌────┤ ┌─ Escherichia coli (30-262/265) 1044A │ │ ├─ Escherichia coli (30-262/265) 1212A │ │ ├─ Escherichia coli (8-240/243) MS 115-1 │ │ ├─ Escherichia coli (30-262/265) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (8-240/243) O157:H7 str. EC4024 │ │ ├─ Escherichia coli (8-240/243) O157:H7 str. EC4045 │ │ ├─ Escherichia coli (8-240/243) O157:H7 str. EC4113 │ │ ├─ Escherichia coli (8-240/243) O157:H7 str. EC4196 │ │ ├─ Escherichia coli (30-262/265) O157:H7 str. EC4401 │ │ ├─ Escherichia coli (8-240/243) O157:H7 str. EC4501 │ │ ├─ Escherichia coli (30-262/265) O157:H7 str. EC869 │ │ ├─ Escherichia coli (8-240/243) O157:H7 str. FRIK966 │ │ ├─ Escherichia coli (8-240/243) O157:H7 str. TW14359 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (8-240/243) O55:H7 str. CB9615 │ │ │├─ Escherichia coli (8-240/243) O157:H7 str. TW14588 │ │ │├─ Escherichia coli (30-262/265) O157:H7 str. Sakai │ │ │├─ Escherichia coli (8-240/243) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ │├─ Escherichia coli (8-240/243) O157:H7 str. EC508 │ │ │├─ Escherichia coli (8-240/243) O157:H7 str. EC4486 │ │ │├─ Escherichia coli (8-240/243) O157:H7 str. EC4206 │ │ │├─ Escherichia coli (8-240/243) O157:H7 str. EC4115 │ │ │├─ Escherichia coli (30-262/265) O157:H7 str. EC4076 │ │ │├─ Escherichia coli (30-262/265) O157:H7 str. EC4042 │ │ │├─ Escherichia coli (8-240/243) O157:H7 EDL933 │ │ │├─ Escherichia coli (8-240/243) O157:H7 │ │ │├─ Escherichia coli (8-240/243) 536A │ │ │└─ Escherichia coli (8-240/243) 1125A │ └──────────────────────────────────────────────────────┤┌─ Escherichia coli (30-262/265) OP50 │ ││┌─ fig|6666666.5357.peg.1254 TY-2482 (8-240/243) strain │ ││├─ Escherichia coli (8-240/243) 042 │ ││├─ Escherichia coli (8-240/243) 1827-70 │ ││├─ Escherichia coli (8-240/243) 53638 │ ││├─ Escherichia coli (8-240/243) 55989 │ ││├─ Escherichia coli (8-240/243) ATCC 8739 │ ││├─ Escherichia coli (8-240/243) B088 │ ││├─ Escherichia coli (8-240/243) B171 │ ││├─ Escherichia coli (8-240/243) B7A │ ││├─ Escherichia coli (DE3 8-240/243) BL21(DE3) │ ││├─ Escherichia coli (8-240/243) DH1 │ ││├─ Escherichia coli (8-240/243) E110019 │ ││├─ Escherichia coli (8-240/243) E22 │ ││├─ Escherichia coli (30-262/265) E24377A │ └┤├─ Escherichia coli (8-240/243) ETEC H10407 │ │├─ Escherichia coli (8-240/243) H736 │ │├─ Escherichia coli (8-240/243) HS │ │├─ Escherichia coli (30-262/265) IAI1 │ │├─ Escherichia coli (8-240/243) KO11 │ │├─ Escherichia coli (30-262/265) MS 116-1 ┤ │├─ Escherichia coli (8-240/243) MS 124-1 │ │├─ Escherichia coli (8-240/243) MS 146-1 │ │├─ Escherichia coli (8-240/243) MS 187-1 │ │├─ Escherichia coli (8-240/243) MS 84-1 │ │├─ Escherichia coli (8-240/243) O111:H- str. 11128 │ │├─ Escherichia coli (8-240/243) SE11 │ │├─ Escherichia coli (8-240/243) TA271 │ │├─ Escherichia coli (8-240/243) W │ │├─ Escherichia coli (30-262/265) str. K-12 substr. DH10B │ │├─ Escherichia coli (8-240/243) str. K-12 substr. MG1655 │ └┼─ Escherichia coli (8-240/243) str. K-12 substr. MG1655 │ ├─ Escherichia coli (8-240/243) str. K-12 substr. DH10B │ ├─ Escherichia coli (8-240/243) W3110 │ ├─ Escherichia coli (8-240/243) W │ ├─ Escherichia coli (8-240/243) TA143 │ ├─ Escherichia coli (30-262/265) O26:H11 str. 11368 │ ├─ Escherichia coli (8-240/243) O103:H2 str. 12009 │ ├─ Escherichia coli (8-240/243) MS 196-1 │ ├─ Escherichia coli (8-240/243) MS 175-1 │ ├─ Escherichia coli (8-240/243) MS 145-7 │ ├─ Escherichia coli (8-240/243) MS 119-7 │ ├─ Escherichia coli (8-240/243) M718 │ ├─ Escherichia coli (8-240/243) K12 │ ├─ Escherichia coli (30-262/265) IAI1 │ ├─ Escherichia coli (30-262/265) HS │ ├─ Escherichia coli (8-240/243) H591 │ ├─ Escherichia coli (8-240/243) EC4100B │ ├─ Escherichia coli (8-240/243) E24377A │ ├─ Escherichia coli (30-262/265) E22 │ ├─ Escherichia coli (30-262/265) E110019 │ ├─ Escherichia coli (8-240/243) BW2952 │ ├─ Escherichia coli (8-240/243) BL21 │ ├─ Escherichia coli (30-262/265) B7A │ ├─ Escherichia coli (30-262/265) B171 │ ├─ Escherichia coli (8-240/243) B str. REL606 │ ├─ Escherichia coli (30-262/265) ATCC 8739 │ ├─ Escherichia coli (8-240/243) 55989 │ ├─ Escherichia coli (30-262/265) 53638 │ ├─ Escherichia coli (8-240/243) 101-1 │ ├─ Escherichia coli (30-262/265) 042 │ └─ fig|1040638.4.peg.1943 O104:H4 (8-240/243) str. LB226692 │ ┌─ Escherichia coli (13-227/250) H591 │ ┌─┼─ Escherichia coli (13-227/250) TA271 │ ┌─────────────────────────────────────────────────────────────┤ └─ Escherichia coli (13-227/250) MS 119-7 │ │ └─ Escherichia coli (13-227/250) H299 │ │ ┌─ Escherichia coli 536 │ │ ├─ Escherichia coli ED1a │ │ ├─ Escherichia coli F11 │ │ ├─ Escherichia coli F11 └───┤ ┌┼─ Escherichia coli MS 200-1 │ │├─ Escherichia coli F11 │ │├─ Escherichia coli F11 │ │├─ Escherichia coli ED1a │ │└─ Escherichia coli 536 │ │┌─ Escherichia coli SMS-3-5 └─────────────────────────────────────────────────────┤│ ┌─ Escherichia coli 53638 ││┌┴─ Escherichia coli 53638 │││ ┌─ Escherichia coli IAI39 │││┌┴─ Escherichia coli IAI39 ││││ ┌─ Escherichia coli (4-244/244) 042 ││││ ├─ fig|6666666.5357.peg.2269 TY-2482 strain ││││ ├─ Escherichia coli 101-1 └┤││ ├─ Escherichia coli 55989 │││ ├─ Escherichia coli ATCC 8739 │││ ├─ Escherichia coli B str. REL606 │││ ├─ Escherichia coli B171 │││ ├─ Escherichia coli B7A │││ ├─ Escherichia coli BL21 │││ ├─ Escherichia coli BW2952 │││ ├─ Escherichia coli E110019 └┤│ ├─ Escherichia coli E22 ││ ├─ Escherichia coli E24377A ││ ├─ Escherichia coli EC4100B ││ ├─ Escherichia coli H736 ││ ├─ Escherichia coli IAI1 ││ ├─ Escherichia coli KO11 ││ ├─ Escherichia coli MS 115-1 ││ ├─ Escherichia coli MS 124-1 ││ ├─ Escherichia coli MS 146-1 ││ ├─ Escherichia coli MS 182-1 ││ ├─ Escherichia coli MS 196-1 ││ ├─ Escherichia coli MS 78-1 ││ ├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 ││ ├─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 ││ ├─ Escherichia coli SE11 └┤ ├─ Escherichia coli W3110 │ ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │┌┼─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 ││├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B ││├─ Escherichia coli TA280 ││├─ Escherichia coli OP50 ││├─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 ││├─ Escherichia coli MS 84-1 ││├─ Escherichia coli MS 69-1 ││├─ Escherichia coli MS 187-1 ││├─ Escherichia coli MS 175-1 ││├─ Escherichia coli MS 145-7 ││├─ Escherichia coli MS 116-1 ││├─ Escherichia coli MS 107-1 ││├─ Escherichia coli K12 ││├─ Escherichia coli IAI1 ││├─ Escherichia coli ETEC H10407 ││├─ Escherichia coli E24377A ││├─ Escherichia coli E22 ││├─ Escherichia coli E110019 ││├─ Escherichia coli DH1 ││├─ Escherichia coli (DE3) BL21(DE3) ││├─ Escherichia coli B7A ││├─ Escherichia coli B354 ││├─ Escherichia coli B171 ││├─ Escherichia coli ATCC 8739 ││├─ Escherichia coli 55989 ││├─ Escherichia coli 1827-70 └┤├─ Escherichia coli 042 │└─ fig|1040638.4.peg.1147 O104:H4 str. LB226692 │ ┌─ Escherichia coli (4-244/244) CFT073 │ ├─ Escherichia coli 2362-75 │ ├─ Escherichia coli ABU 83972 │ ├─ Escherichia coli MS 185-1 │ ├─ Escherichia coli SE15 │ ┌┼─ Escherichia coli WV_060327 │ │├─ Escherichia coli MS 45-1 │ │├─ Escherichia coli CFT073 │ ┌┤├─ Escherichia coli 83972 │ ││└─ Escherichia coli (4-244/244) E2348/69 │ ┌┤└─ Escherichia coli MS 21-1 │ │└─ Escherichia coli M605 │ ┌┤ ┌─ Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C │ ││┌┴─ Escherichia coli NC101 │ │└┤┌─ Escherichia coli S88 │ │ │├─ Escherichia coli UTI89 │ ┌┤ └┼─ Escherichia coli UTI89 │ ││ ├─ Escherichia coli UM146 │ ││ └─ Escherichia coli IHE3034 │┌┤└┬─ Escherichia coli APEC O1 │││ └─ Escherichia coli (4-244/244) APEC O1 │││┌─ Escherichia coli H299 ││└┤┌─ Escherichia coli FVEC1412 ││ │├─ Escherichia coli TA143 ││ └┼─ Escherichia coli UMN026 └┤ ├─ Escherichia coli MS 198-1 │ └─ Escherichia coli FVEC1302 │ ┌─ Escherichia coli H591 │┌┼─ Escherichia coli TA271 ││└─ Escherichia coli MS 119-7 ││ ┌─ Escherichia coli HS └┤┌┴─ Escherichia coli HS ││ ┌─ Escherichia coli B185 ││┌┴─ Escherichia coli M718 │││┌─ Escherichia coli 1125A └┤│├─ Escherichia coli 536A ││├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 └┤├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 │├─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 └┼─ Escherichia coli W ├─ Escherichia coli W ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai ├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4486 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli O157:H7 ├─ Escherichia coli 1212A └─ Escherichia coli 1044A
| Transcriptional regulator PhnF | (130) |
| Transcriptional regulator of fructoselysine utilization operon FrlR | (87) |
| HTH-type transcriptional regulator YidP | (62) |
| Transcriptional regulator, GntR family | (51) |
| Hypothetical transcriptional regulator yidP | (6) |
| Fatty acyl responsive regulator | (4) |
| Transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon | (1) |
| Others | (7) |