┌─ Escherichia coli (6-184/196) 042   
                                    ├─ Escherichia coli (6-184/196) ATCC 8739   
                                    ├─ Escherichia coli (6-184/196) B str. REL606   
                                    ├─ Escherichia coli (6-184/196) BL21   
                                    ├─ Escherichia coli (6-184/196) BW2952   
                                    ├─ Escherichia coli (6-184/196) CFT073   
                                    ├─ Escherichia coli (6-184/196) FVEC1302   
                                    ├─ Escherichia coli (6-184/196) H299   
                                    ├─ Escherichia coli (6-184/196) MS 198-1   
                                    ├─ Escherichia coli (6-184/196) MS 69-1   
                                    ├─ Escherichia coli (6-184/196) MS 84-1   
                                    ├─ Escherichia coli (6-184/196) O83:H1 str. NRG 857C   
                                    ├─ Escherichia coli (6-184/196) UMN026   
                                    ├─ Escherichia coli (6-184/196) WV_060327   
                                    ├─ Escherichia coli (6-184/196) str. K-12 substr. DH10B   
                                   ┌┼─ Escherichia coli (6-184/196) str. K-12 substr. MG1655   
                                   │├─ Escherichia coli (6-184/196) str. K-12 substr. MG1655   
                                   │├─ Escherichia coli (6-184/196) str. K-12 substr. DH10B   
                                   │├─ Escherichia coli (6-184/196) W3110   
                                   │├─ Escherichia coli (6-184/196) TA143   
                                   │├─ Escherichia coli (6-184/196) O55:H7 str. CB9615   
                                   │├─ Escherichia coli (6-184/196) MS 78-1   
                                   │├─ Escherichia coli (6-184/196) MS 21-1   
                                   │├─ Escherichia coli (6-184/196) K12   
                                   │├─ Escherichia coli (6-184/196) FVEC1412   
                                  ┌┤├─ Escherichia coli (6-184/196) DH1   
                                  ││├─ Escherichia coli (6-184/196) CFT073   
                                  ││├─ Escherichia coli (DE3 6-184/196) BL21(DE3)   
                                  ││├─ Escherichia coli (6-184/196) B7A   
                                  ││├─ Escherichia coli (6-184/196) ATCC 8739   
                                  ││└─ Escherichia coli (6-184/196) 042   
                                  ││ ┌─ Escherichia coli (6-184/196) MS 187-1   
                                  ││┌┴─ Escherichia coli (6-184/196) M718   
                                  │││  ┌─ Escherichia coli (6-184/196) E110019   
                                  │││  ├─ Escherichia coli (6-184/196) IAI1   
                                 ┌┤└┤ ┌┼─ Escherichia coli (6-184/196) O26:H11 str. 11368   
                                 ││ │┌┤└─ Escherichia coli (6-184/196) IAI1   
                                 ││ ││└─ Escherichia coli (6-184/196) SE11   
                                 ││ └┤┌─ Escherichia coli (6-184/196) H736   
                                 ││  │├─ Escherichia coli (6-184/196) HS   
                                 ││  │├─ Escherichia coli (6-184/196) MS 182-1   
                                 ││  └┼─ Escherichia coli (6-184/196) S88   
                                 ││   ├─ Escherichia coli (6-184/196) MS 115-1   
                                 ││   ├─ Escherichia coli (6-184/196) HS   
                                ┌┤│   └─ Escherichia coli (6-184/196) APEC O1   
                                ││└┬─ Escherichia coli (6-184/196) 101-1   
                                ││ └┬─ Escherichia coli (6-184/196) MS 119-7   
                                ││  └─ Escherichia coli (6-184/196) MS 107-1   
                                ││ ┌─ Escherichia coli (3-184/196) 1827-70   
                                ││ ├─ Escherichia coli (3-184/196) BL21   
                                ││┌┼─ Escherichia coli (3-184/196) TA271   
                                │││├─ Escherichia coli (DE3 3-184/196) BL21(DE3)   
                                │││└─ Escherichia coli (3-184/196) B str. REL606   
                                │└┤┌─ Escherichia coli (6-184/196) EC4100B   
                                │ ││┌─ Escherichia coli (3-184/196) BW2952   
                                │ ││├─ Escherichia coli (3-184/196) EC4100B   
                              ┌─┤ └┤├─ Escherichia coli (3-184/196) KO11   
                              │ │  │├─ Escherichia coli (3-184/196) W   
                              │ │  │├─ Escherichia coli (3-184/196) str. K-12 substr. DH10B   
                              │ │  │├─ Escherichia coli (3-184/196) str. K-12 substr. MG1655   
                              │ │  └┼─ Escherichia coli (3-184/196) str. K-12 substr. MG1655   
                              │ │   ├─ Escherichia coli (3-184/196) str. K-12 substr. DH10B   
                              │ │   ├─ Escherichia coli (3-184/196) W3110   
                              │ │   ├─ Escherichia coli (3-184/196) W   
                            ┌─┤ │   ├─ Escherichia coli (3-184/196) K12   
                            │ │ │   ├─ Escherichia coli (3-184/196) DH1   
                            │ │ │   └─ Escherichia coli (3-184/196) 101-1   
                            │ │ └┬─ Escherichia coli (6-184/196) E24377A   
                            │ │  └─ Escherichia coli (6-184/196) E24377A   
                            │ │    ┌─ Escherichia coli (6-192/196) E110019   
                            │ │   ┌┴─ Escherichia coli (6-192/196) E110019   
              ┌─────────────┤ └───┤┌─ Escherichia coli (6-192/196) B171   
              │             │     │├─ Escherichia coli (6-192/196) E22   
              │             │     └┼─ Escherichia coli (6-192/196) O103:H2 str. 12009   
              │             │      ├─ Escherichia coli (6-192/196) E22   
              │             │      ├─ Escherichia coli (6-192/196) B185   
          ┌───┤             │      └─ Escherichia coli (6-192/196) B171   
          │   │             └─ Escherichia coli (6-184/196) ED1a   
          │   │                ┌─ Escherichia coli (5-181/186) MS 115-1   
          │   │               ┌┴─ Escherichia coli (5-181/186) MS 78-1   
          │   │               │  ┌─ Escherichia coli (5-185/185) UTI89   
          │   └───────────────┤ ┌┴─ Escherichia coli (5-185/185) UTI89   
          │                   │┌┴─ Escherichia coli (5-185/185) UM146   
          │                   ││┌── Escherichia coli (5-185/185) EC4100B   
          │                   └┤│   ┌─ Escherichia coli (22-208/212) 1044A   
          │                    ││   ├─ Escherichia coli (22-208/212) 1212A   
          │                    ││   ├─ Escherichia coli (22-208/212) O157:H7 str. EC4206   
          │                    └┤  ┌┼─ Escherichia coli (1-187/191) O157:H7 EDL933   
          │                     │  │├─ Escherichia coli (1-187/191) O157:H7   
          │                     │  │├─ Escherichia coli (22-208/212) 536A   
          │                     │  │└─ Escherichia coli (22-208/212) 1125A   
     ┌────┤                     │  │┌─ Escherichia coli (5-185/189) O157:H7 str. EC4024   
     │    │                     └──┤├─ Escherichia coli (5-185/189) O157:H7 str. EC4045   
     │    │                        │├─ Escherichia coli (5-185/189) O157:H7 str. EC4113   
     │    │                        │├─ Escherichia coli (5-185/189) O157:H7 str. EC4196   
     │    │                        │├─ Escherichia coli (5-185/189) O157:H7 str. EC4486   
     │    │                        │├─ Escherichia coli (5-185/189) O157:H7 str. EC508   
     │    │                        │├─ Escherichia coli (5-185/189) O157:H7 str. TW14359   
     │    │                        └┼─ Escherichia coli (5-185/189) O157:H7 str. TW14588   
     │    │                         ├─ Escherichia coli (5-185/189) O157:H7 str. Sakai   
     │    │                         ├─ Escherichia coli (5-185/189) O157:H7 str. EC4501   
     │    │                         ├─ Escherichia coli (5-185/189) O157:H7 str. EC4401   
     │    │                         ├─ Escherichia coli (5-185/189) O157:H7 str. EC4115   
┌────┤    │                         ├─ Escherichia coli (5-185/189) O157:H7 str. EC4076   
│    │    │                         ├─ Escherichia coli (5-185/189) O157:H7 str. EC4042   
│    │    │                         └─ Escherichia coli (5-185/189) O157:H7 EDL933   
│    │    └───────────┬──────── Escherichia coli (6-185/190) NC101   
│    │                └───────┬─ Escherichia coli (6-185/189) O127:H6 str. E2348/69   
│    │                        └─ Escherichia coli (6-185/189) E2348/69   
│    │                        ┌─ Escherichia coli (2-180/183) B171   
│    │                       ┌┴─ Escherichia coli (2-180/183) B171   
│    │                  ┌────┴── Escherichia coli (4-180/183) MS 115-1   
│    │             ┌────┴───┬─ Escherichia coli (4-179/182) MS 196-1   
│    │      ┌──────┤        └─ Escherichia coli (4-179/182) E24377A   
│    │      │      └──────── Escherichia coli (1-174/184) H736   
│    └──────┤                                                   ┌─ Escherichia coli (6-197/208) O157:H7   
│           │                                ┌──────────────────┴─ Escherichia coli (6-197/208) O157:H7 EDL933   
│           └────────────────────────────────┤                  ┌─ Escherichia coli (12-205/214) MS 69-1   
│                                            │              ┌───┴─ Escherichia coli (12-205/214) MS 175-1   
│                                            └────┬─────────┴─── Escherichia coli (12-205/220) MS 145-7   
│                                                 └────────────────┬─ Escherichia coli (5-213/213) E24377A   
│                                                                  └┬─ Escherichia coli (7-192/192) B7A   
│                                                                   └─ Escherichia coli (5-213/213) B7A   
│                                   ┌─ fig|1040638.4.peg.108 O104:H4 str. LB226692   
│                                   ├─ Escherichia coli 042   
│                                   ├─ Escherichia coli B171   
│                                   ├─ Escherichia coli FVEC1412   
│                                   ├─ Escherichia coli MS 124-1   
│                                   ├─ Escherichia coli MS 175-1   
│                                   ├─ Escherichia coli MS 196-1   
│                                ┌──┼─ Escherichia coli UMN026   
┤                                │  ├─ Escherichia coli MS 84-1   
│                                │  ├─ Escherichia coli MS 182-1   
│                                │  ├─ Escherichia coli MS 145-7   
│               ┌────────────────┤  ├─ Escherichia coli H299   
│               │                │  ├─ Escherichia coli B171   
│               │                │  ├─ Escherichia coli 042   
│               │                │  └─ fig|6666666.5357.peg.3398 TY-2482 strain   
│           ┌───┤                └┬─── Escherichia coli (1-185/186) MS 124-1   
│           │   │                 └──┬─ Escherichia coli APEC O1   
│           │   │                    └─ Escherichia coli APEC O1   
│           │   └───────┬─────────── Escherichia coli (4-177/179) TA280   
│    ┌──────┤           └──┬──────────── Escherichia coli (4-182/185) O157:H7 str. EC4024   
│    │      │              └──── Escherichia coli (4-181/183) B7A   
│    │      │                         ┌──── Escherichia coli (32-206/210) str. K-12 substr. DH10B   
│    │      └─────────────────────────┤   ┌─ Escherichia coli (5-179/185) 55989   
│    │                                │ ┌─┴─ Escherichia coli (5-179/185) ED1a   
│    │                                └─┤ ┌─ Escherichia coli (5-183/185) MS 21-1   
│    │                                  │┌┴─ Escherichia coli (5-183/185) MS 69-1   
│    │                                  └┤┌─ Escherichia coli (17-191/205) O157:H7 str. EC4486   
│    │                                   ││┌─ Escherichia coli (5-183/185) 101-1   
│    │                                   └┤├─ Escherichia coli (5-183/185) MS 116-1   
│    │                                    │├─ Escherichia coli (5-183/185) MS 182-1   
│    │                                    └┼─ Escherichia coli (5-183/185) MS 78-1   
│    │                                     ├─ Escherichia coli (5-183/185) MS 200-1   
│    │                                     ├─ Escherichia coli (5-183/185) MS 175-1   
│    │                                     ├─ Escherichia coli (5-183/185) MS 107-1   
│    │                                     └─ fig|1040638.4.peg.457 O104:H4 (5-183/185) str. LB226692   
│    │                        ┌─ Escherichia coli (4-182/188) MS 124-1   
└────┤            ┌───────────┴─ Escherichia coli (4-182/188) MS 84-1   
     │        ┌───┴───────────────── Escherichia coli (3-187/207) MS 119-7   
     │        │                          ┌─ Escherichia coli (48-221/226) E22   
     │        │                       ┌──┴─ Escherichia coli (4-177/182) H736   
     │        │        ┌──────────────┴──── Escherichia coli (4-177/187) ETEC H10407   
     │        │        │                ┌─ Escherichia coli (3-178/195) E110019   
     │        │        │                ├─ Escherichia coli (9-184/201) E110019   
     │        │        │                ├─ Escherichia coli (3-178/199) SE11   
     │        │        │               ┌┼─ Escherichia coli (3-178/199) UTI89   
     │        │        │               │├─ Escherichia coli (3-178/199) UTI89   
     │        │        │               │├─ Escherichia coli (3-178/199) IHE3034   
     │        │        │              ┌┤└─ Escherichia coli (3-178/195) TA206   
     │        │        │              ││┌─ Escherichia coli (5-180/197) B7A   
     │        │        │              │└┼─ Escherichia coli (3-178/195) B354   
     │        │        │             ┌┤ └─ Escherichia coli (3-178/195) ETEC H10407   
     │        │        │             ││┌─ Escherichia coli (3-178/196) B171   
     │        │        │             │└┼─ Escherichia coli (9-184/202) B171   
     │        │        │            ┌┤ └─ Escherichia coli (3-178/196) B171   
     └────────┤        │            ││┌─ Escherichia coli (3-178/199) O103:H2 str. 12009   
              │        │            │└┼─ Escherichia coli (9-184/205) B171   
              │        │            │ └─ Escherichia coli (3-178/199) B171   
              │        │         ┌──┤     ┌─ Escherichia coli (3-177/193) E24377A   
              │        │         │  │     ├─ Escherichia coli (3-177/197) B171   
              │        │         │  │  ┌──┼─ Escherichia coli (3-177/197) M605   
              │        │         │  │  │  └─ Escherichia coli (3-177/193) W   
              │        │         │  └──┤      ┌─ Escherichia coli (3-178/186) 536A   
              │        │         │     │      ├─ Escherichia coli (3-178/186) O157:H7 str. EC4501   
              │        │         │     │      ├─ Escherichia coli (3-178/186) O157:H7 str. FRIK966   
              │        │         │     └──────┼─ Escherichia coli (3-178/186) O157:H7 str. TW14588   
              │        │         │            ├─ Escherichia coli (3-178/186) O157:H7 str. Sakai   
              │        │         │            ├─ Escherichia coli (3-178/186) O157:H7 str. FRIK2000   
              │        │     ┌───┤            ├─ Escherichia coli (3-178/186) O157:H7   
              │        │     │   │            └─ Escherichia coli (3-178/186) 1044A   
              │        │     │   │   ┌─ Escherichia coli (3-178/199) 2362-75   
              │        │     │   │   ├─ Escherichia coli (3-178/199) E22   
              └────────┤     │   │  ┌┼─ Escherichia coli (3-178/199) E22   
                       │     │   │ ┌┤└─ Escherichia coli (3-178/199) E22   
                       │     │   │ │└─ Escherichia coli (11-186/198) 2362-75   
                       │     │   │┌┤┌─ Escherichia coli (3-178/199) O157:H7 str. FRIK2000   
                       │     │   ││└┼─ Escherichia coli (3-178/199) O157:H7 str. FRIK966   
                       │     │   └┤ └─ Escherichia coli (3-178/199) O157:H7 str. EC869   
                       │     │    │┌─ Escherichia coli (2-178/199) MS 198-1   
                       │     │    ││ ┌─ Escherichia coli (67-243/264) O127:H6 str. E2348/69   
                       │    ┌┤    └┤┌┼─ Escherichia coli (2-178/199) O55:H7 str. CB9615   
                       │    ││     ││└─ Escherichia coli (5-181/202) E2348/69   
                       │    ││     └┤ ┌─ Escherichia coli (5-181/193) 53638   
                       │    ││      │┌┴─ Escherichia coli (2-178/190) 53638   
                       │    ││      └┤┌─ Escherichia coli (2-178/190) B7A   
                       │    ││       └┤┌─ Escherichia coli (2-178/190) E22   
                       │    ││        └┼─ Escherichia coli (2-178/190) E22   
                       │    ││         └─ Escherichia coli (57-233/245) TA271   
                       │    ││ ┌─ Escherichia coli (3-177/188) ED1a   
                       │    ││┌┴─ Escherichia coli (3-177/188) ED1a   
                       │    │││   ┌─ Escherichia coli (18-192/203) E2348/69   
                       │    │││  ┌┴─ Escherichia coli (18-192/203) O127:H6 str. E2348/69   
                       │    │└┤ ┌┴─ Escherichia coli (18-192/203) 2362-75   
                       │    │ │┌┴┬─ Escherichia coli (3-177/188) H591   
                       │    │ ││ └─ Escherichia coli (3-177/188) TA206   
                       │    │ └┤ ┌─ Escherichia coli (5-179/190) ATCC 8739   
                       │    │  │┌┴─ Escherichia coli (3-177/188) ATCC 8739   
                       │    │  ││┌─ Escherichia coli (3-177/188) EC4100B   
                       │    │  └┤├─ Escherichia coli (3-177/188) TA143   
                       │    │   │├─ Escherichia coli (3-177/188) W   
                       │    │   └┼─ Escherichia coli (3-177/188) W   
                       │    │    ├─ Escherichia coli (3-177/188) TA280   
                       │    │    ├─ Escherichia coli (3-177/188) KO11   
                       │    │    └─ Escherichia coli (3-177/188) MS 115-1   
                       └────┤    ┌─ Escherichia coli (3-177/197) O157:H7 str. EC4024   
                            │    ├─ Escherichia coli (3-177/197) O157:H7 str. EC4045   
                            │    ├─ Escherichia coli (3-177/197) O157:H7 str. EC4076   
                            │    ├─ Escherichia coli (3-177/197) O157:H7 str. EC4113   
                            │    ├─ Escherichia coli (3-177/197) O157:H7 str. EC4196   
                            │    ├─ Escherichia coli (3-177/197) O157:H7 str. EC4401   
                            │   ┌┼─ Escherichia coli (3-177/197) O157:H7 str. TW14359   
                            │   │├─ Escherichia coli (3-177/197) O157:H7 str. EC508   
                            │   │├─ Escherichia coli (3-177/197) O157:H7 str. EC4206   
                            │   │├─ Escherichia coli (3-177/197) O157:H7 str. EC4115   
                            │  ┌┤├─ Escherichia coli (3-177/197) O157:H7 str. EC4076   
                            │  ││├─ Escherichia coli (3-177/197) O157:H7 str. EC4045   
                            │  ││└─ Escherichia coli (3-177/197) O157:H7 str. EC4042   
                            │  ││┌─ Escherichia coli (3-177/197) O157:H7 str. FRIK2000   
                            │ ┌┤└┼─ Escherichia coli (3-177/197) O157:H7 str. FRIK966   
                            │ ││ └─ Escherichia coli (3-177/197) O157:H7 str. EC869   
                            │ ││┌─ Escherichia coli (3-177/197) W   
                            │┌┤└┼─ Escherichia coli (3-177/197) W   
                            │││ └─ Escherichia coli (3-177/197) KO11   
                            │││ ┌─ Escherichia coli (3-177/197) B7A   
                            ││└┬┴─ Escherichia coli (3-177/197) B7A   
                            ││ └┬─ Escherichia coli (3-177/197) B185   
                            ││  └┬─ Escherichia coli (3-177/197) MS 198-1   
                            ││   └┬─ Escherichia coli (3-177/197) H591   
                            └┤    └─ Escherichia coli (3-177/197) MS 182-1   
                             │     ┌─ Escherichia coli (2-177/192) 2362-75   
                             │┌────┼─ Escherichia coli (8-183/198) O127:H6 str. E2348/69   
                             ││    └─ Escherichia coli (8-183/198) E2348/69   
                             ││  ┌─ Escherichia coli (3-177/184) 1212A   
                             ││  ├─ Escherichia coli (3-177/184) O157:H7 str. EC869   
                             ││ ┌┼─ Escherichia coli (3-177/184) O157:H7 str. FRIK966   
                             ││ │├─ Escherichia coli (3-177/184) O157:H7 str. FRIK2000   
                             └┤ │└─ Escherichia coli (3-177/184) 536A   
                              │ │     ┌─ Escherichia coli (3-177/184) DH1   
                              │ │     ├─ Escherichia coli (3-177/184) W3110   
                              │ │    ┌┼─ Escherichia coli (3-177/184) str. K-12 substr. MG1655   
                              │ │    │├─ Escherichia coli (3-177/184) str. K-12 substr. MG1655   
                              │ │   ┌┤└─ Escherichia coli (3-177/184) K12   
                              │ │   │└┬─ Escherichia coli (3-177/184) M718   
                              └─┤  ┌┤ └─ Escherichia coli (3-177/184) M605   
                                │  ││ ┌─ Escherichia coli (3-177/184) 101-1   
                                │  │└┬┴─ Escherichia coli (15-189/196) MS 69-1   
                                │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (15-189/196) B088   
                                │ ││  └─ Escherichia coli (15-189/196) MS 78-1   
                                │┌┤└─ Escherichia coli (3-177/184) MS 119-7   
                                ││└─ Escherichia coli (3-177/182) O55:H7 str. CB9615   
                                ││ ┌─ Escherichia coli (3-177/184) E22   
                                ││┌┼─ Escherichia coli (3-177/184) E22   
                                └┤│└─ Escherichia coli (3-177/184) E22   
                                 ││ ┌─ Escherichia coli (3-177/184) ETEC H10407   
                                 ││ ├─ Escherichia coli (3-177/184) F11   
                                 ││┌┼─ Escherichia coli (3-177/184) F11   
                                 └┤│└─ Escherichia coli (3-177/184) MS 107-1   
                                  ││┌─ Escherichia coli (15-189/196) O157:H7 str. EC4486   
                                  ││├─ Escherichia coli (3-177/184) 1125A   
                                  ││├─ Escherichia coli (3-177/184) O157:H7   
                                  ││├─ Escherichia coli (3-177/184) O157:H7 str. EC4024   
                                  └┤├─ Escherichia coli (3-177/184) O157:H7 str. EC4045   
                                   │├─ Escherichia coli (3-177/184) O157:H7 str. EC4113   
                                   │├─ Escherichia coli (3-177/184) O157:H7 str. EC4196   
                                   │├─ Escherichia coli (3-177/184) O157:H7 str. EC4401   
                                   │├─ Escherichia coli (3-177/184) O157:H7 str. EC508   
                                   │├─ Escherichia coli (3-177/184) O157:H7 str. TW14359   
                                   └┼─ Escherichia coli (3-177/184) O157:H7 str. TW14588   
                                    ├─ Escherichia coli (3-177/184) O157:H7 str. Sakai   
                                    ├─ Escherichia coli (3-177/184) O157:H7 str. EC4501   
                                    ├─ Escherichia coli (3-177/184) O157:H7 str. EC4206   
                                    ├─ Escherichia coli (3-177/184) O157:H7 str. EC4115   
                                    ├─ Escherichia coli (3-177/184) O157:H7 str. EC4076   
                                    ├─ Escherichia coli (3-177/184) O157:H7 str. EC4042   
                                    ├─ Escherichia coli (3-177/184) O157:H7 EDL933   
                                    ├─ Escherichia coli (3-177/184) 536A   
                                    ├─ Escherichia coli (3-177/184) 1044A   
                                    └─ Escherichia coli (15-189/196) O157:H7 EDL933   
  
DNA-invertase (156)
putative resolvase (40)
Transposon resolvase (32)
Resolvase/integrase Bin (17)
Resolvase for Tn21 (14)
Phage DNA invertase (8)
resolvase (6)
Resolvase (6)
Putative resolvase (4)
Rac prophage; predicted site-specific recombinase (4)
putative DNA-invertase (4)
COG1961: Site-specific recombinases, DNA invertase Pin homologs (1)
site-specific recombinase resolvase family protein PinR (1)
Recombinase (1)
Hypothetical resolvase (1)
Transposon Tn501 resolvase (1)
putative transposon resolvase (1)
Others (3)